猪肠道菌群在猪的健康和生产性表现中起着至关重要的作用,影响了营养吸收,饲料转化效率以及最终的生产盈利能力。除了是消化的主要部位外,肠子还容纳了猪最大的免疫器官,那里的微生物群落对于整体幸福感至关重要。在仔猪阶段,肠道菌群经历了动态进化,逐渐适应宿主环境。这种可塑性提供了从早期阶段进行干预和优化其组成的机会,从而增强了动物健康和发展。在此过程的关键因素中,饮食纤维起着基本作用,因为肠道菌群的发酵直接影响其组成和功能,尤其是在远端小肠,结肠和直肠。在此过程中产生的短链脂肪酸不仅为肠细胞提供连续的能量,还可以调节免疫反应,防止感染并导致人体的体内平衡,从而促进健康的生长。尽管在理解宿主 - 微生物群相互作用方面取得了进步,但仍未就肠道微生物群的最佳平衡或健康微生物群的精确定义达成明确的共识。当前的研究旨在确定调节胃肠道菌群及其生理和免疫功能的因素。未来的发现将有助于制定策略以恢复外部干扰(例如压力,抗生素使用或感染)后肠道稳态,从而提高生产率,降低与压力相关的影响并预防猪产量中的疾病。
图1:A)Porphyran重复部分的化学结构。硫酸化二糖 - 卟啉二糖 - 可以在D-半乳糖的位置呈现甲基,给出甲基化和未甲基化的卟啉成分。通过生物合成期间L-乳糖残基的脱硫/环化获得的琼脂糖单位是相应甲基化的。b)B。plebieus porphyran pul的组织。基于先前的转录组分析,将PUL分为三个段(PUL -PORA,-POR B和-PORC)。当在Porphyran存在下生长B. plebieus时,将BACPLE_01692到BACPLE_01699基因(称为Pul-Pora)被中度上调。这与基因的两个相邻簇:BACPLE_01668到BACPLE_01689(PUL-PORC)和BACPLE_01700到BACPLE_01706(PUL-PORB),它们被高度上调(比PUL-PORA多10倍)[16]。在(1)[16],(2)[17],[18]和(4)本研究中确定酶功能。
几项研究记录了EDS个体肠道微生物群组成的改变。例如,神经性厌食症的患者通常表现出微生物多样性降低和有益细菌和有害细菌之间的失衡。这种营养不良与肠道通透性,炎症和新陈代谢改变有关,这可能会进一步加剧厌食症的症状,包括焦虑,强迫症和饱腹感信号传导。同样,患有暴饮暴食障碍和神经性贪食症的个体已经显示出与炎症增加和肠脑信号受损相关的菌群谱[3]。
背景:多环芳烃(PAHS)具有环境和公共卫生的关注,并导致皮肤不良属性,例如过早的皮肤老化和色素疾病。但是,关于慢性城市PAH污染物在皮肤微生物群中的潜在作用的信息很少。鉴于皮肤微生物群在健康和不良的皮肤表型以及PAH和皮肤特性之间的关系中具有作用,我们假设PAH的暴露可能与皮肤微生物群的变化有关。在这项研究中,来自中国两个城市的200多个中国人的皮肤菌群具有不同的PAH曝光水平,其特征是细菌和真菌扩增子和shot弹枪宏基因组学测序。结果:皮肤遗址和城市是改变微生物群落及其组装过程的强大参数。降低细菌 - 真菌微生物网络结构完整性和稳定性与皮肤条件(痤疮和头皮屑)有关。多变量分析揭示了丙酸杆菌和马拉西亚的丰富性与宿主特性和污染物暴露水平之间的关联。香农多样性的增加与剂量依赖性的PAH的暴露水平相关。shot弹枪元基因组学分析样品(n = 32)的PAH的个体的样本(n = 32)进一步强调了量化的PAH和减少皮肤分子的丰富性与口腔细菌的增加之间的关联。功能分析确定了PAH的水平与代谢和其他途径的微生物基因之间的关联,具有潜在的重要性在宿主 - 微生物相互作用以及芳香族化合物的降解中。结论:这项研究的结果证明了与PAH的长期暴露水平相关的皮肤微生物群的组成和功能能力的变化。这项研究的发现将有助于制定利用微生物群保护皮肤免受污染物的策略。
a Department of Gastrointestinal Surgery, North Hospital, Public Assistance-Marseille Hospitals, Aix-Marseille Univ., Chemin des Bourrely, 13015 Marseille, France B Sorbonne University, UMR CNRS 8001, LPSM, 75005 Paris, France C Sorbonne University, Inserm, Saint-Antoine research center, CRSA, AP-HP, Hospital, Gastroenterology Department, F-75012巴黎,法国D胃肠病学系MICI和养分援助,法国E Univ。通讯作者:哈里·索科尔(Harry Sokol),医学博士,博士,胃肠病学服务,圣坦医院,184 Rue du Faubourg Saint-Antoine,75571 Paris Cedex,法国12。电话:+33 1 49 28 31 62;传真:+33 1 49 28 31 88;电子邮件:harry.sokol@aphp.frLille,Inserm,Chu Lille,U1286炎症转化研究,F-59000,法国F-59000,法国F-59000胃肠病学系,里昂SUD医院,Lyon Sud医院,Hospices de Lyon和Inserm U1111,Ciri,Ciri,Ciri,Lyon,法国Gastrolance gastroterologely deconcy法国艾米斯大学艾米斯大学医院,法国尼斯2号ARchet 2,法国J Digestive,肿瘤学和内分泌手术系Artoenterology系的肝胃肠病学系,巴黎大学,巴黎大学,巴黎大学,法国大学,法国大学,法国大学,法国大学,法国医院Huiez医院,里尔大学里尔市Chru,北法国,法国里尔,法国M手术部,里昂SUD医院,康复医院,康复医院,里昂,里昂,法国里昂。 (PACEMM)法国巴黎FHU,法国胃肠病学系,AP-HP,圣路易斯医院,法国Sorbonne Sorbonne University,AP-HP,AP-HP,AP-HP,SANT ANTOINE医院,F-75012,PARIS,SUDPARIS,SUDPARIS,PARIS,PARAS,PARAS,PARAS BBA UMICHANN的SUDPARIS,PARIS INDERIDE INDER IDER IDERACHIC(PARISE) Aix-Marseille Univ/University Gustave Eiffel, Boulevard Pierre Dramard, Marseille, France V Center for Surgical Teaching and Research (Cercle), Aix-Marseille Univ, Boulevard Pierre Dramard, Marseille, UMR1319 MICHALIS & AGROPARISTECH, JOUY EN JOSAS, FRANCE *THERE AUTHORS Contributed EQUALLY TO THIS Study.
摘要 - 人类肠道拥有一个复杂而多样的细菌群落,称为肠道菌群。尽管存在大多数成年人共有的系统发育核心,但这种微生物群在一生中稳定。肠道微生物群对宿主生理学的影响很大程度上是使用无毛动物研究的,使用这些动物模型的研究表明,脂质对宿主生理学的影响是依赖于微生物群的。在小鼠中的研究还表明,高脂饮食会迅速和可重复改变肠道微生物组。在人类中,饮食中的脂肪干预并没有导致对菌群组成的强烈和一致的修改。尽管如此,已经反复发现了总脂肪摄入量与降低微生物群之间的关联。有趣的是,不同类型的脂肪对微生物群产生不同甚至相反的影响。同时,肠道菌群能够转化进入结肠的脂质,包括脂肪酸或胆固醇,从而导致产生具有潜在健康影响的代谢物。
摘要牛呼吸道疾病(BRD)是牛奶行业中最常见和最昂贵的疾病之一,对全球粮食安全和该行业的经济稳定产生了重大不利影响。牛呼吸道微生物组与健康和疾病密切相关,可以在治疗BRD时提供替代治疗的见解。like特异性的微生物组群落,将上呼吸道和下呼吸道的表面定居,由动态和复杂的生态系统组成。呼吸生态系统中的不平衡与BRD之间的相关性已成为热门研究主题。因此,我们总结了BRD的发病机理和临床迹象以及呼吸菌群的改变。当前的研究技术和健康呼吸道中的微生物组的生物地球化学也得到了回顾。我们讨论了驻留微生物和病原体定植的过程以及宿主的免疫反应。尽管在某种程度上已经揭示了微生物群和BRD之间的关联,但解释了BRD与呼吸微生物营养不良有关的发展可能会成为即将进行的研究的方向,这将使我们能够更好地理解呼吸道微生物组的重要性及其对动物健康和性能的贡献。关键字:牛,牛呼吸道疾病,菌群,生物地理学,宿主微生物相互作用,肺炎
抽象背景:磷是所有生物体中必不可少的营养素,目前,由于其全球稀缺,磷从排泄物产生的环境影响以及由于其以植物中的植物形式存储而引起的消化率较低。在家禽中,磷利用受到回肠菌群和宿主遗传学的组成的影响。在我们的研究中,我们分析了宿主遗传学对回肠菌群组成的影响,以及回肠细菌属的相对丰度与日本鹌鹑中磷的相对丰度与磷利用和相关定量性状的关系。用4K基因组的单核苷酸多态性(SNP)对758个鹌鹑的F2交叉进行了基因分型,并使用靶扩增子测序对回肠菌群的组成进行了表征。遗传性,并针对可遗传的属进行了宿主的定量性状基因座(QTL)链接映射。使用结构方程模型估算了细菌属和定量性状之间的表型和遗传相关性以及递归关系。采用基因组最佳线性无偏预测(GBLUP)和微生物(M)BLUP全息素选择方法,用于评估基于宿主基因组和基于ileum Microbobiota组成的可遗传的磷利用的繁殖可行性。结果:在检查的59个细菌属中,有24个显示出显着的遗传力(名义P≤0.05),范围从0.04到0.17。对于这些属,绘制了六个全基因组显着的QTL。发现了显着的递归效应,从而通过鹌鹑回肠中的微生物群组成来支持间接宿主遗传对宿主定量性状的影响。交叉验证的微生物和基因组预测准确性证实了微生物组成和宿主遗传学对宿主定量性状的强烈影响,因为基于基于传统的微生物介导的成分的GBLUP精确度与基于基于基因组范围Snps的常规GBLUP的精确度相似。结论:我们的结果表明,宿主遗传学对回肠微生物群的组成产生了显着影响,并证实了回肠微生物群的宿主遗传学和组成对宿主的定量性状有影响。这提供了基于宿主基因组和回肠菌群组成的可遗传部分改善磷利用的可能性。
Beghetti I.,Barone M.,Turroni S.,Biagi E.,Sansavini A.,Brigidi P.等。 (2022)。 早期肠道菌群和早产儿的神经发育:双歧杆菌的任何作用? 欧洲儿科杂志,181(4),1773-1777 [10.1007/s00431-021-04327-1]。Beghetti I.,Barone M.,Turroni S.,Biagi E.,Sansavini A.,Brigidi P.等。(2022)。早期肠道菌群和早产儿的神经发育:双歧杆菌的任何作用?欧洲儿科杂志,181(4),1773-1777 [10.1007/s00431-021-04327-1]。
引言高血压个体通常表现出与正常人的微生物多样性和丰富性相比(1)。这种条件是由香农指数的减少和Firmicutes/ Bacteroidetes比率的增加表示的,这是肠道菌群不平衡的标志(2)。高血压个体倾向于具有较高的革兰氏阴性细菌,尤其是来自家族的细菌植物和否定性(3),并且革兰氏阳性细菌的丰度较低,例如来自Ruminocococacaceae和Lachnospireceae家族的细菌,这些细菌因产生短脂肪酸(4)而闻名。高血压个体的肠道菌群的特征是短链脂肪酸产生细菌(例如杆菌和prevotella)的降低,以及炎症相关细菌(例如乳乳杆菌)的增加(5)。同时,高血压个体通常表现出炎症细胞因子和高脂血症的水平升高,这与肠道菌群改变有关(6)。肠道菌群组成也受饮食模式的影响。高血压个体可能有不同的饮食习惯,这会导致观察到的肠道菌群差异(7)。这些差异表明,肠道菌群在高血压的发展和进展中起着至关重要的作用,针对肠道菌群的干预措施可能对管理高血压有益(8)。在这次微型综述中,我们旨在讨论肠道菌群营养不良对高血压加剧的潜在影响。