线粒体在真核细胞的生命周期中起着至关重要的作用。但是,我们仍然不知道它们的超微结构(例如内膜的cristae)如何动态发展以调节这些基本功能,以响应外部条件或与其他细胞成分相互作用。尽管高分辨率的荧光显微镜与最近开发的创新探针可以揭示该结构组织,但它们的长期,快速和实时3D成像仍然具有挑战性。为了解决这个问题,我们开发了一个称为DeepCristae的卷积神经网络,以恢复低空间分辨率显微镜图像中的线粒体cristae。我们的网络是使用专门为Cristae修复设计的新型损失从2D Sted图像训练的。为了有效地增加训练集的大小,我们还开发了一个以线粒体区域为中心的随机图像贴片采样。为了评估deepcristae,使用我们得出的指标来进行定量评估,我们通过关注线粒体和cristae像素而不是像往常一样在整个图像上进行了定量评估。根据所示的使用条件,DeepCristae在广泛的显微镜模态(刺激的发射耗尽(STED),Live-SR,Airyscan和Lattice Light片显微镜下都很好地工作。它最终是在与内托/溶酶体膜相互作用期间的线粒体网络动力学的上下文中应用的。
Monforte de Lemos,3-5。pabellón11。Planta 0,28029西班牙马德里; 19 Inserm umrs1166,ICAN - 索邦大学心脏代谢与营养学院,心脏病学研究所,皮蒂·萨尔佩特里尔医院,91 Boulevard del'Hôpital,75013 BOULEVARD deL'Hôpital,75013 Paris,法国巴黎; 20 MASTRICHT大学心血管研究学院生理学系,MASTRICHT大学,Minderbroedersberg 4-66211 LK Maastricht,荷兰; 21人类遗传学研究所,遗传流行病学研究所,WWUMünster,Albert-Schweitzer-Campus 1,D3,Domagkstraße3,48149Münster,德国; 22遗传流行病学和统计遗传学的心血管研究学院,马斯特里赫特大学,Universiteitssingel 50,6229 Er Maastricht,荷兰; 23德国沃兹堡大学药理学与毒理学研究所,沃尔兹堡大学9,97078Würzburg,德国; 24形态学和电子显微镜系,分子神经生物学中心,汉堡 - 埃潘多夫大学医学中心,Martinistraße52,20246年,德国汉堡;和25 Leibniz-InstitutFürAnalytischeWissenschaften-ISAS-E.V。
结果:共鉴定出 135 种独特的线粒体 DNA 单倍型,分为 105 个单倍群,单倍型多样性值为 0.9993。整个线粒体基因组的鉴别能力计算为 0.9574,而仅分析控制区时为 0.8936。观察到的大多数单倍群是东亚谱系所特有的,包括 D4、D5 和 F1。人群比较显示,现代山东汉族与来自黄河和西辽河流域的古代人群有遗传联系。此外,山东汉族在其发展过程中可能融合了大量来自其他地区的母系血统。山东汉族的人口扩张估计发生在大约 9,000 年前,相当于新石器时代,这是一个文化和技术发展显著的时期。
单个细胞的线粒体DNA(mtDNA)的测序已在本地人类样品和临床标本中解析了克隆性和谱系。先前的工作表明,杂质mtDNA变体可用于描述造血的克隆性,但它们重建细胞系统发育的能力有限。但是,Weng等人的最新报告。 通过描述据报道解决高分辨率系统发育树的细胞之间的空前数量的共享mtDNA变体来挑战当前范式。 我们重新审查了Weng等人的主张,并确定了有关这种前所未有的联系的两个主要关注点。 首先,在每个细胞的单个分子中检测到细胞之间的共享变体,其次,这些变体在mtDNA分子的边缘富集了10-20倍,使人联想到其他测序方法中报道的文物。 此外,我们的分析表明,修剪低支撑和可能的人造mtDNA变体几乎消除了所有报道的系统发育结构。 因此,我们强烈警告不要使用依赖最小证据的mtDNA变体工作流,包括Weng等人在Weng等人中引入的计算管道,因为具有高连接性和较低证据的变体可能是导致假系统发电的构建的伪像。但是,Weng等人的最新报告。通过描述据报道解决高分辨率系统发育树的细胞之间的空前数量的共享mtDNA变体来挑战当前范式。我们重新审查了Weng等人的主张,并确定了有关这种前所未有的联系的两个主要关注点。首先,在每个细胞的单个分子中检测到细胞之间的共享变体,其次,这些变体在mtDNA分子的边缘富集了10-20倍,使人联想到其他测序方法中报道的文物。此外,我们的分析表明,修剪低支撑和可能的人造mtDNA变体几乎消除了所有报道的系统发育结构。因此,我们强烈警告不要使用依赖最小证据的mtDNA变体工作流,包括Weng等人在Weng等人中引入的计算管道,因为具有高连接性和较低证据的变体可能是导致假系统发电的构建的伪像。
参考文献1。Allen Je和Al。SCI Transl Med。2013; 5(171):1717; 2。 rb冻结和al。 Pharmacol's。 2021; 100:372-387; 3。 ns疯狂和al。 nat公社。 2019; 10:5221; 4。 Ishizawa J和Al。 癌细胞。 2019; 35:721-737 E9; 5。 PR仪式和Al。 ACS头。 2019; 14:1020-1029; 6。 chi as和al。 j神经。 2019; 145(1):97-105; 7。 theeler bj和al。 J Clin Oncol.2020; 8。 vv prabhu和al。 歌手res。 2020; 80(16_supplementary):5688-5688; 9。 Wagner J和Al。 循环单元。 2017; 16:1790-1799; 10。 Staley A和Al。 AM J Singing Res。 2021; 11(11):5374-5387; 11。 张Y和Al。 Oncol Front。 2020; 10:57141; 12。 Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。2013; 5(171):1717; 2。rb冻结和al。Pharmacol's。2021; 100:372-387; 3。ns疯狂和al。nat公社。2019; 10:5221; 4。 Ishizawa J和Al。 癌细胞。 2019; 35:721-737 E9; 5。 PR仪式和Al。 ACS头。 2019; 14:1020-1029; 6。 chi as和al。 j神经。 2019; 145(1):97-105; 7。 theeler bj和al。 J Clin Oncol.2020; 8。 vv prabhu和al。 歌手res。 2020; 80(16_supplementary):5688-5688; 9。 Wagner J和Al。 循环单元。 2017; 16:1790-1799; 10。 Staley A和Al。 AM J Singing Res。 2021; 11(11):5374-5387; 11。 张Y和Al。 Oncol Front。 2020; 10:57141; 12。 Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。2019; 10:5221; 4。Ishizawa J和Al。癌细胞。2019; 35:721-737 E9; 5。 PR仪式和Al。 ACS头。 2019; 14:1020-1029; 6。 chi as和al。 j神经。 2019; 145(1):97-105; 7。 theeler bj和al。 J Clin Oncol.2020; 8。 vv prabhu和al。 歌手res。 2020; 80(16_supplementary):5688-5688; 9。 Wagner J和Al。 循环单元。 2017; 16:1790-1799; 10。 Staley A和Al。 AM J Singing Res。 2021; 11(11):5374-5387; 11。 张Y和Al。 Oncol Front。 2020; 10:57141; 12。 Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。2019; 35:721-737 E9; 5。PR仪式和Al。ACS头。2019; 14:1020-1029; 6。 chi as和al。 j神经。 2019; 145(1):97-105; 7。 theeler bj和al。 J Clin Oncol.2020; 8。 vv prabhu和al。 歌手res。 2020; 80(16_supplementary):5688-5688; 9。 Wagner J和Al。 循环单元。 2017; 16:1790-1799; 10。 Staley A和Al。 AM J Singing Res。 2021; 11(11):5374-5387; 11。 张Y和Al。 Oncol Front。 2020; 10:57141; 12。 Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。2019; 14:1020-1029; 6。chi as和al。j神经。2019; 145(1):97-105; 7。 theeler bj和al。 J Clin Oncol.2020; 8。 vv prabhu和al。 歌手res。 2020; 80(16_supplementary):5688-5688; 9。 Wagner J和Al。 循环单元。 2017; 16:1790-1799; 10。 Staley A和Al。 AM J Singing Res。 2021; 11(11):5374-5387; 11。 张Y和Al。 Oncol Front。 2020; 10:57141; 12。 Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。2019; 145(1):97-105; 7。theeler bj和al。J Clin Oncol.2020; 8。vv prabhu和al。歌手res。2020; 80(16_supplementary):5688-5688; 9。Wagner J和Al。循环单元。2017; 16:1790-1799; 10。 Staley A和Al。 AM J Singing Res。 2021; 11(11):5374-5387; 11。 张Y和Al。 Oncol Front。 2020; 10:57141; 12。 Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。2017; 16:1790-1799; 10。Staley A和Al。AM J Singing Res。2021; 11(11):5374-5387; 11。张Y和Al。Oncol Front。 2020; 10:57141; 12。 Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。Oncol Front。2020; 10:57141; 12。Tucker K和Al。 AM J Singing Res。 2022; 12(2):521-536; 13。 vv prabhu和al。 Clins Ress。 2019; 25:2305-2313; 14。 Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。Tucker K和Al。AM J Singing Res。2022; 12(2):521-536; 13。vv prabhu和al。Clins Ress。2019; 25:2305-2313; 14。Jassal B和Al。 九十res。 2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。Jassal B和Al。九十res。2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。2020 JAN 8; 48(D1):D498-D503。
带有检查点抑制剂的抽象背景免疫疗法,尤其是那些针对编程的死亡受体1(PD-1)/PD-1配体(PD-L1)的免疫疗法,越来越多地被认为是恶性肿瘤的高度有希望的治疗方式。然而,限制了免疫检查点阻滞治疗在治疗胶质母细胞瘤(GBM)中的效率。因此,必须扩大我们对GBM免疫逃逸(IE)背后的分子机制的理解。进行蛋白质芯片分析以在PD-1抑制剂敏感或抗性GBM中异常表达的OMA1蛋白筛选。在此,采用了公共数据库和生物信息学分析来研究OMA1和PD-L1关系。然后,通过不同的实验方法在初级GBM细胞系中验证了这种预测的关系。在免疫抑制中研究OMA1背后的分子机制,采用了一系列实验方法,包括蛋白质印迹,共免疫沉淀(CO-IP),质谱法(MS),免疫荧光,免疫荧光,免疫组织,免疫组织化学和QRT-PCR。结果我们的发现表明,OMA1竞争性结合HSPA9以诱导线粒体并介导GBM的IE。来自TCGA的数据表明OMA1与免疫抑制之间存在显着相关性。OMA1促进了GBM患者的原代细胞中的PD-L1水平。接下来,在GBM原代细胞上进行的Co-IP和MS的结果表明OMA1与HSPA9相互作用并诱导线粒体。OMA1不仅通过增加线粒体DNA释放,还通过激活CGAS插入来促进CGAS插入活性。最终,已经发现OMA1通过调节PD-1结合和PD-L1介导的T细胞毒性来诱导GBM中的免疫逃避。结论OMA1/HSPA9/CGAS/PD-L1轴在我们的研究中被阐明为GBM中新鉴定的免疫治疗靶标。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未获得同行评审证书)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权所有,该版本发布于2025年1月9日。 https://doi.org/10.1101/2025.01.08.631915 doi:biorxiv Preprint
为了做到这一点,至关重要的是,所有员工都应该互相分享他们认为我们的理由是我们的理由,以及我们为社会提供的价值,然后我们所有的部门聚集在一起并挑战解决各种问题。By linking our Purpose Statement— “We will solve issues facing the earth and peoples' lives through Sumitomo Seika's ‘Chemistry'”—to specific tasks and issues in each department during employees' daily working activities, we strive to ensure that employees are always aware of our mission to utilize our technologies to deliver products that contribute to the
Kari和她的团队还在研究细胞骨骼(称为细胞骨架)在调节线粒体动力学中的作用。细胞骨架有助于维持线粒体和其他细胞成分的形状和运动。“众所周知,线粒体动力学取决于哺乳动物和酵母中的细胞骨架,但对于D. discoideum中的细胞骨架在动力学中的作用并不了解,” Kari解释说。“为了确定这种作用,我们需要分析线粒体动力学过程中细胞骨架和线粒体之间的相互作用。”通过使用活细胞成像,研究人员可以观察细胞骨架如何实时与线粒体相互作用。这种方法使他们能够更好地理解这些相互作用中的破坏如何影响线粒体功能并导致细胞疾病。
亨廷顿氏病(HD)主要影响大脑,导致混合运动障碍,认知能力下降和行为异常。它还引起涉及骨骼肌的外周表型。线粒体DYS功能已在HD模型的组织中报道,包括骨骼肌,以及来自HD患者的淋巴细胞和成纤维细胞浮雕。突变的亨廷顿蛋白(Muthtt)表达会损害线粒体质量控制并加速线粒体衰老。在这里,我们获得了新鲜的人类骨骼肌,这是一种有线后组织,自出生以来,在生理水平上表达突变的HTT等位基因,以及HTT CAG重复膨胀突变携带者的原代细胞系,并匹配健康的志愿者,以检查人类HD中是否存在这种线粒体表型。使用超深线粒体DNA(mtDNA)测序,我们显示了影响氧化性PHOS磷酸化的mtDNA突变的积累。组织蛋白质组学表明MTDNA维持的障碍,线粒体生物发生的增加,氧化磷酸化效率较低(较低的复合物I和IV活性)。在全长muthtt中表明了原代人细胞系,裂变诱导的线粒体应激导致正常的线粒体。相比之下,高水平的N末端Muthtt片段的Ex压缩促进了线粒体裂变,导致线粒体裂变较慢,动态线粒体较低。由于体细胞核HTT CAG不稳定性引起的高水平Muthtt片段的表达会影响线粒体网络动力学和线粒体,从而导致致病性mtDNA突变。我们表明,突变体HTT的终生表达引起的线粒体表型,指示新鲜的有丝分裂后人类骨骼肌的mtDNA不稳定性。因此,基因组不稳定性可能不限于核DNA,在核DNA中,它会导致在诸如纹状体神经元之类的特别脆弱细胞中HTT CAG重复长度的体细胞扩张。除了针对因果突变的努力外,促进线粒体健康可能是治疗HD等DNA不稳定性疾病的互补性层次。