ThomasGpGrünewald1,2,3,*,Marta Alonso 4,Sofia Avnet 5,Ana Banito 6,Stefan Burdach 7,Florencia Cidre-Aranaz 1,Gemma Di Pompo 5,Martin Distle 8,Martin Distle 8,Heathclifif Dordo dort dort dort dort diren diren diarin diren dira diare diare diare diare diare diena, Javier Garcia-Castro 10,LauraGonzález-González10,Agamemnon E Grigoriadis 11,Merve Kasan 1,Christian Koelsche 3,Manuela Kramumbholz 12,Fernando Lecanda 13 Claudia Madrigal-Xquivel 15,ÁlvaroMoles-Molina 10,Julian Musa 1,16,Shunya Ohmura 1,Benjamin Ory 17,Miguel Pereira-Silva 18,Silva 18,Silva 18,Silva 18,Francesca Perut 5 Nada al Shabani 15,Shabnam Shaabani 22,Kristina Shiavone 15,Snehadri Sinha 23,Eleni M Tomazou 8,Marcel Trautmann 24,Maria Vela 25,Yvone MH Versleijen-Jenkers 26,Julia Visgauss 27,Marta,Marta,Marta Zalacain 14,Sebastian J Schober 7,Andrej Lissat 28,William R English 15,Nicola Baldini 5,29,**&Dominique Heymann 15,30,***
分子动力学旨在模拟原子的物理运动,以便采样Boltzmann – Gibbs的概率度量和相关的轨迹,并使用Monte Carlo估计值来计算宏观特性[1,17]。执行这些数值模拟时的主要困难之一是标准化:该系统倾向于将其捕获在相空间的某些区域,通常在目标概率度量的局部最大值附近。在这种情况下,从一个亚稳态到另一个状态的过渡在复杂的系统中特别感兴趣,因为它们表征例如结晶或酶促反应。与分子时间尺度相比,这些反应长期尺度发生,因此对逼真的罕见事件的模拟在计算上很难。
Emanuele Penocchio,1.6, *艾哈迈德·巴希尔(Ahmad Bachir),2.6 Alberto Credi,3.4 Raymond Dean Astamian,2.5, *和Giulio Ragazzon 2.7, * 1 * 1, * 1, * 1, * 1, * 1, * 1,埃文斯顿西北大学,60208,60208,USA 2 CNRS,8 All'E Gaspard Monge,67000 Strasbourg,法国3氏族中心激活的纳米结构,有机合成与骨质阶级研究所,国家研究委员会,通过Gobetti 101,40129 Boologna,意大利意大利意大利40129工业化学局40129' 40136意大利博洛尼亚5物理与天文学系,缅因州奥罗诺大学,ME 04469,使用6这些作者的贡献Equilly 7 Lead Contact *通信 *通信:Emanuele.penocchio@northwestern.edu(E.P.),astumian@maine.edu(R.D.A. ),girls@unist.fr(g.r。) https://doi.org/10.1016/j.chempr.2024.07.038),girls@unist.fr(g.r。)https://doi.org/10.1016/j.chempr.2024.07.038
随着年龄的增长,我们的大脑随着我们的年龄增长:我们发现学习新事物更加困难,而我们的记忆偶尔会使我们失败。,但有时症状可能不那么无害。衰老是神经退行性疾病(例如帕金森氏症和阿尔茨海默氏症)的危险因素,在神经细胞中,神经细胞特别快速地死亡。重要的大脑功能令人难以挽回地丢失,因为与皮肤细胞不同,人体一旦死亡就无法替代。
1欧洲分子生物学实验室,惠康基因组校园,欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI),欣克斯顿,欣克斯顿,CB10 1SD,英国,2克里姆比尔研究所,数据科学疾病数据科学发现中心,大学卫生网络,大学健康网络,5KD-407,5KD-407,Leonard Avenitute,Torontoe,Toronto,30。 UCLA, Los Angeles, CA 90095, USA, 4 Department of Biology, University of Rome Tor Vergata, Via della Ricerca Scientifica, Rome, 00133, Italy, 5 Department of Biology, Ecology and Earth Sciences, Università della Calabria, Rende, 87036, Italy, 6 Providence John Wayne Cancer Institute, Department of Translational Molecular, Santa Monica, CA 90404, USA, 7 Univ Lyon, University Claude Bernard Lyon 1, INSA Lyon, CPE, Institute of Molecular and Supramolecular Chemistry and Biochemistry (ICBMS), UMR 5246, F-69622 Villeurbanne, 69622, France, 8 Department of Molecular, Cell and Developmental Biology, UCLA, Los Angeles, CA美国90095和90095,多伦多多伦多大学医学生物物理学和计算机科学系
响应对抗生素抗性的日益关注以及抗生素发现中传统方法的局限性,我们引入了一种基于机器学习的方法,名为MFAGCN。这种方法通过将三种类型的分子指纹(MACC,PubChem和ECFP)与分子图表示作为输入特征,以特定于分子官能团的重点来预测分子的抗菌功效。MFAGCN结合了一种注意机制,将不同权重分配给来自不同相邻节点的信息的重要性。在两个公共数据集上使用基线模型的比较实验证明了MFAGCN的出色性能。此外,我们对训练和测试集中的功能组分布进行了分析,以验证模型的预测。此外,还进行了已知抗生素的结构相似性分析,以防止重新发现已建立的抗生素。这种方法使研究人员能够快速筛选具有有效抗菌特性的分子,并促进影响抗菌性能的官能团,从而为进一步的抗生素发育提供了宝贵的见解。
"In this study, conducted in collaboration with clinical doctors from Dublin City University and the Trinity College Dublin's St James's Hospital (Ireland) and researchers from IRB Barcelona, we found that mtRNA synthetases (proteins that synthetize the mitochondrial complexes) play a relevant role in the defects observed in mitochondrial respiration, since its decrease involves the decrease in synthesis of specific呼吸链复合物的亚基,因此是与较大的活性氧(ROS),尤其是一氧化氮产生的线粒体功能障碍。
该协议详细介绍了海洋大藻类组织的高分子量DNA提取。海洋大量藻类包含各种独特的细胞壁成分,包括硫酸化的多糖和多酚。这些成分通常与高分子量(HMW)DNA共同流行,并导致文库准备和测序结果减少。该方案融合了聚乙烯 - 丙烯吡啶酮(PVPP)和β-莫咖啡乙醇(BME),以减少多酚污染,并以乙酸钾(KOAC)(KOAC)的早期盐盐措施来解决多糖。该方案在很大程度上是从牛津纳米孔HMW DNA从拟南芥叶片中提取的,该叶子叶结合了QIAGEN血液和细胞培养DNA MIDI KIT进行柱清洁。DNA产品通常需要在洗脱后进行额外的清理,我们建议所有HMW应用的Bluepippin 15KB尺寸选择。
1。中国Shaanxi省Xian Jiotong University,Shaanxi Province,Xian Jiotong大学医学校园。 2。 药学院,伊拉克Ahl Al Bayt University Kerbala。 3。 伊朗医学科学大学医学院医学院Hazrat-e Rasool综合医院内科学系,伊朗,伊朗。 4。 生物技术系生物科学技术学院,伊斯法汉大学,伊斯法罕,伊朗。 5。 输血研究中心,伊朗输血组织(IBTO),伊朗德黑兰的输血医学研究与教育研究所。 6。 盟军医学科学学院重症监护护理的讲师,伊拉姆伊拉姆医学科学大学Ayatollah Taleghani医院,伊拉姆,伊拉姆,伊拉姆医学科学院。 7。 伊朗AHVAZ AHVAZ JUNDISHAPUR医学院医学院内科学系,伊朗。 *通讯作者:Hadi Rezaeeyan,输血研究中心,伊朗Tehran的伊朗输血组织(IBTO)输血医学研究和教育研究所。 电子邮件:hadi.rezaeeyan@yahoo.com。 OrcID ID:0000-0002-9116-8719收到:2023年12月19日接受:2024年6月18日摘要背景:卵泡淋巴瘤(FL)是非霍奇金淋巴瘤的一种常见形式,其特征是源发任中心内的B-Cell生长异常。 研究表明,基因和分子途径在FL的发病机理中的作用。 但是,尚未确定发病机理的主要因素。中国Shaanxi省Xian Jiotong University,Shaanxi Province,Xian Jiotong大学医学校园。2。药学院,伊拉克Ahl Al Bayt University Kerbala。3。伊朗医学科学大学医学院医学院Hazrat-e Rasool综合医院内科学系,伊朗,伊朗。4。生物技术系生物科学技术学院,伊斯法汉大学,伊斯法罕,伊朗。5。输血研究中心,伊朗输血组织(IBTO),伊朗德黑兰的输血医学研究与教育研究所。6。盟军医学科学学院重症监护护理的讲师,伊拉姆伊拉姆医学科学大学Ayatollah Taleghani医院,伊拉姆,伊拉姆,伊拉姆医学科学院。7。伊朗AHVAZ AHVAZ JUNDISHAPUR医学院医学院内科学系,伊朗。 *通讯作者:Hadi Rezaeeyan,输血研究中心,伊朗Tehran的伊朗输血组织(IBTO)输血医学研究和教育研究所。 电子邮件:hadi.rezaeeyan@yahoo.com。 OrcID ID:0000-0002-9116-8719收到:2023年12月19日接受:2024年6月18日摘要背景:卵泡淋巴瘤(FL)是非霍奇金淋巴瘤的一种常见形式,其特征是源发任中心内的B-Cell生长异常。 研究表明,基因和分子途径在FL的发病机理中的作用。 但是,尚未确定发病机理的主要因素。伊朗AHVAZ AHVAZ JUNDISHAPUR医学院医学院内科学系,伊朗。*通讯作者:Hadi Rezaeeyan,输血研究中心,伊朗Tehran的伊朗输血组织(IBTO)输血医学研究和教育研究所。电子邮件:hadi.rezaeeyan@yahoo.com。OrcID ID:0000-0002-9116-8719收到:2023年12月19日接受:2024年6月18日摘要背景:卵泡淋巴瘤(FL)是非霍奇金淋巴瘤的一种常见形式,其特征是源发任中心内的B-Cell生长异常。研究表明,基因和分子途径在FL的发病机理中的作用。但是,尚未确定发病机理的主要因素。因此,在这项研究中,使用系统生物学方法评估了与FL发病机理相关的基因和分子途径。材料和方法:在这项研究(生物信息学分析)中,GSE32018数据库用于数据分析。该数据库是从基因表达综合(GEO)中提取的。该数据库的样本为36,其中包括正常样品和FL样品。为此,有23例FL,13例是健康的样本。蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)以显示DEG之间的相互作用。字符串软件用于此目的。关联。用于数据分析的标准包括对数折叠的变化大于一个和p <0.05。结果:评估和分析数据后,结果表明对照和FL样品之间确定了866 deg。在FL样品中有231例加强调节和635例下调病例。PPI网络和中心基因分析鉴定了7个集线基因,包括RPL37A,MRPS7,RPS14,RPS28,RPL34,RPL34,RPS20和RPS3。根据结果,HSA-MIR-191-5P与miRNA中的HUB基因相互作用最高,而KDM5A之间的相互作用最多。结论:识别基因和分子途径可以有效地设计治疗策略并防止FL细胞的增殖,从而增加患者的生存率。关键字:卵泡淋巴瘤;分子遗传学;生物信息学简介卵泡淋巴瘤(FL)是非霍奇金淋巴瘤的一种常见形式,其特征是生发中心内B细胞生长异常(1)。尽管在诊断和治疗FL方面取得了重大进展,但对于推动其开发的基本分子因素尚无全面研究
Raffone A.,Working A.,Raimondo D.,Neola D.,M.M.,Saint A.和Al。 (2022)。 淋巴结侵袭性侵入性癌:预后因素独立性强烈地分子签名。 165(1),192-197 [10.1016/j.ygyno.202.01.013]Raffone A.,Working A.,Raimondo D.,Neola D.,M.M.,Saint A.和Al。(2022)。淋巴结侵袭性侵入性癌:预后因素独立性强烈地分子签名。165(1),192-197 [10.1016/j.ygyno.202.01.013]