目前,淋巴瘤的治疗已经进入了精密医学时代,CD30作为跨膜蛋白,已成为帮助诊断和制定淋巴瘤治疗计划的重要标志。该蛋白在各种类型的淋巴瘤中广泛表达,可以通过核因子K B(NF-K B),有丝分裂原激活的蛋白激酶(MAPK)和其他途径发挥作用,并最终导致CD30表达的上调,从而使肿瘤细胞具有生存优势。brentuximab vedotin(BV)作为靶向CD30的抗体 - 药物缀合物(ADC),是CD30+淋巴瘤患者中最明显提高生存率的首批新药之一。但是,CD30的生物学功能尚未完全阐明。因此,本综述强调了CD30介导的肿瘤促进机制和调节CD30表达的分子因子。我们希望对CD30生物学有更好的了解将为临床治疗提供新的见解,并改善淋巴瘤患者的生存和生活质量。
请引用本文:Toda and Okamoto,(2020)。通过将大分子直接递送到水稻卵细胞和受精卵中的基因表达和基因组编辑系统,Bio-protocol 10 (14): e3681。DOI:10.21769/BioProtoc.3681。
两种 OGG1 调节剂均减少了 KBrO 3 诱导的 AP 位点(图 2G),我们发现 TH5487 的 DNA 链断裂(γH2AX)更少(图 2H),表明 OGG1 糖基化酶活性受损会导致 AP 位点数量减少。相反,我们发现 TH10785 的 DNA 链断裂(γH2AX)更多(图 2H),证实 TH10785 在细胞中的催化活性会导致 DNA 链断裂。总之,这些结果表明 TH10785 激活的 OGG1 具有新的细胞作用,即比 8-oxoG 更倾向于 AP 位点。接下来,我们测试了 TH10785 在细胞中诱导 β,δ 消除的程度。我们假设同时刺激 β,δ-消除和阻断 PNKP1 活性应会使系统因未修复的 DNA 单链断裂而超载(图 1A)。因此,在单独暴露于 OGG1 抑制剂或激活剂(图 3A、图 S26)和类似化合物(表 S6 和图 3B)或与 PNKP1i 联合使用的 U2OS 细胞中,使用标记物 γH2AX 和 53BP1 通过 IF 测量 DDR。我们发现 PNKP1 抑制剂只有与引起体外 β,δ-裂解酶活性的 OGG1 激活剂联合使用时才会诱导强 DDR。为了评估这种因果关系,我们使用 RNA 测序监测转录变化,发现 PNKP1i 与 TH10785 联合使用(而非单独使用)会诱导识别和修复 DNA 双链断裂的关键参与者的转录显着上调(图 3C)。此外,TH10785 与 PNKP1 抑制相结合时细胞活力降低,但 TH5487 则不会降低(图 3D 和 3E)。这些结果表明,TH10785 激活 OGG1 β,δ-裂解酶活性在体外和细胞内均会发生,并且 PNKP1 对于避免 DNA 损伤的积累和随之而来的细胞死亡至关重要。总之,我们提出了一种新概念,即通过酶导向的小分子催化剂诱导 OGG1 β,δ-裂解酶活性,结合到酶的活性位点(图 3F、S27 和 S28)。TH10785 的存在引起的新催化功能更倾向于 AP 位点而不是 8-oxoG,并在体外和细胞内产生 PNKP1 依赖性。改善或重新规划处理氧化性DNA损伤的修复途径对许多疾病(如炎症、癌症、阿尔茨海默氏症或衰老)具有重要意义,这里概述的概念允许以新的方式控制和重新规划修复途径(24)。
在这里,我们提出了一种用于全面PAM表征的新型细胞分析,该测定忠实地报告了人类细胞中不同DCAS蛋白的PAM要求。These assays enable accurate detection of greatly expanded PAM profiles for our lead dCas effectors (dCasONYX, dCasRUBY, dCas- TOPAZ), enabling the efficient targeting of disease-causing genes.These assays enable ongoing engineering and character- ization of our novel dCas in relevant genomic contexts to facili- tate their translation to therapeutics.总的来说,我们介绍了在我们的宝石表观遗传编辑平台的核心优化紧凑和精确的CAS分子的工作,并证明了它们广泛的效用,这是治疗患者中棘手疾病的主要进步。
免疫细胞功能,增加肿瘤对免疫治疗的敏感性(6,7)。小分子抑制剂利用其免疫调节特性,可以优化治疗结果,改善患者反应,为推进癌症治疗提供新的机会(8)。在癌症免疫治疗中,使用小分子抑制剂作为佐剂的概念涉及利用这些药物的免疫调节作用来增强免疫治疗的有效性。例如,小分子抑制剂可以调节肿瘤微环境,增强免疫细胞功能,增加肿瘤对免疫治疗的敏感性,并获得更好的治疗结果(9-11)。在癌症治疗中使用小分子抑制剂作为佐剂是一个快速发展和扩大的领域。通过研究小分子抑制剂如何与免疫疗法相互作用,优化治疗方案,预测患者对治疗的反应,可以为未来的癌症治疗提供更多的机会和改进。在这篇综合评论中,我们深入探讨了小分子抑制剂作为癌症免疫治疗辅助剂的不断发展的作用,探索了它们的作用机制、临床应用以及改善治疗结果的潜力。
1。重组质粒设计7 2。初始质粒提取7 3。消化和连接7 4。转换8 5。质粒提取,纯化和DNA测序8 6。蛋白质表达8 7。蛋白质纯化9
摘要:调节性非蛋白编码 RNA 发挥着各种复杂的生物学功能。之前,我们证明了人类非编码库 RNA1-1 (vtRNA1-1) 在抑制几种癌细胞系的内在和外在凋亡方面的作用。然而,在分子水平上,vtRNA1-1 的功能仍不完全清楚。在这里,我们创建了 HeLa 敲除细胞系,结果表明,在没有 vtRNA1-1 的情况下,长期饥饿会引发细胞凋亡水平升高,但在 vtRNA1-3 敲除细胞中则不会。mRNome 的下一代深度测序确定了 PI3K / Akt 通路和 ERK1 / 2 MAPK 级联,这两个重要的信号传导轴,在饥饿介导的细胞死亡条件下,在没有 vtRNA1-1 的情况下会受到错误调节。 vtRNA1-1 突变体的表达表明,vtRNA1-1 中心域的 24 个核苷酸的短片段对于成功维持抗凋亡性至关重要。本研究描述了人类 vtRNA1-1 对饥饿诱导的程序性细胞死亡的细胞信号传导依赖性贡献。
血红素合成酶铁胆管酶(FECH)的活性与多种疾病有关。特别是它是眼睛中新血管化的介体,因此是预防失明的有吸引力的治疗靶标。但是,尚无类似药物的直接FECH抑制剂。在这里,我们着手使用高吞吐量筛选方法来鉴定FECH的小分子抑制剂作为潜在的治疗铅,以鉴定有效的FECH活性抑制剂。一类三唑吡啶甲酮的结构活性关系研究产生了类似药物的FECH抑制剂。这些化合物抑制细胞中的FECH,结合共晶结构中的活性位点,在多种体外测定中具有抗血管生成。这些有希望的化合物之一是脉络膜新生血管形成的小鼠模型中的抗血管生成。这项基础工作可能是新的治疗剂不仅对眼部新血管形成的基础,而且还可以抗击以Fech活动为特征的其他疾病。
肠道轴的作用已成为自闭症谱系障碍(ASD;自闭症)的重要组成部分,因为许多自闭症患者经历了影响情绪和行为的胃肠道症状。ASD是根据社会互动和沟通的困难以及重复和/或限制性行为诊断出的,这些行为会对日常生活产生重大影响。尽管许多自闭症患者在各个领域都具有出色的技能,但大约30%的自闭症患者需要为日常生活提供大量支持,并减少了获得教育和卫生服务以及一般社区的机会。必须确定肠道和脑神经元网络中的分子途径,以有助于设计新的治疗方法。本期特刊要求进行研究,描述综合症和罕见的遗传变异,基因环境相互作用以及影响自闭症中肠道脑轴的潜在生物学机制,如临床前和临床研究所证明。