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Triphala对黄色鲈鱼（Perca Flavescens）的生长，免疫，相关基因表达和肠形态的影响
当前的研究评估了饮食中补充Triphala（TR）对黄色鲈鱼（Perca flavescens）生长表现，免疫反应，相关基因表达和肠组织学结构的影响。实验设计包括四个组：一个对照组（0％TR/ kg饮食）和三个TREP养育组，有2、4和6％/千克饮食，持续四个星期，每组分配为三份，每组30条鱼类。采样包括每种复制中的三条鱼，以评估免疫反应和基因表达。的发现表明，Triphala显着改善了生长量，免疫球蛋白M（IgM）水平，溶菌酶活性和一氧化氮（NO）活性，最显着（P <0.05）的结果为6％TR/KG饮食组。TR组还显示出葡萄糖和皮质醇浓度显着降低，而6％TR/kg饮食组的值最低。TRON-COMPORATY组显示出显着上调的表达（p <0.05）[胰岛素样生长因子1（IGF-1）]和免疫[alpha 2巨蛋白（A2M），血清淀粉样蛋白A（SAA）（SAA）和补体C3（CCC3）（CCC3）]基因中的基因组合6％，该基因是6％的6％。此外，肠形态的组织学分析表明，绒毛长度以剂量依赖性方式增加，应对其他增强的参数。当前的结果认可Triphala掺入黄色鲈鱼耕作的积极影响，作为增强生长性能，免疫反应，相关基因表达和肠组织学的安全选择。
HOA - 毛细管 - 脑结构分段 - pdf
简介本手册的目的是介绍对成像数据的可靠和准确的神经解剖学分割的程序。这些过程使用3D Slicer软件平台，其中已经开发了特定的分割模块。该模块基于基于MRI的体积形态学或体积的创始人（Caviness。等，1999）。 体积形态计量学始于1987年的形态分析中心（CMA）马萨诸塞州综合医院（MGH），后来用于验证自由度自动化体积方法学（Fischl等，2002，2004）。 原始的基于MRI的体积分析的CMA方法使用了一个名为CardViews的自定义设计的软件平台。 为卡片视图开发的工具和程序，这些工具和过程融合了半自动化和手动编辑，已作为特定的神经分组模块改编为3D切片机环境。 该模块设计为与本手册中描述的程序一起使用，以执行皮层大脑结构的半自动化和手动编辑。 基于MRI的体积分割的神经解剖学和计算原理术语分割一词在神经解剖学和基于MRI的计算处理中具有不同的含义。 分割通常是构成构成感兴趣区域（ROI）的一组元素（例如细胞或体素）的划分，并分配了识别标签向该区域。 在神经解剖学中，分割涉及直接可视化大脑区域的描述和鉴定，这些区域使用结构性的生物学标准标记。等，1999）。体积形态计量学始于1987年的形态分析中心（CMA）马萨诸塞州综合医院（MGH），后来用于验证自由度自动化体积方法学（Fischl等，2002，2004）。原始的基于MRI的体积分析的CMA方法使用了一个名为CardViews的自定义设计的软件平台。为卡片视图开发的工具和程序，这些工具和过程融合了半自动化和手动编辑，已作为特定的神经分组模块改编为3D切片机环境。该模块设计为与本手册中描述的程序一起使用，以执行皮层大脑结构的半自动化和手动编辑。基于MRI的体积分割的神经解剖学和计算原理术语分割一词在神经解剖学和基于MRI的计算处理中具有不同的含义。分割通常是构成构成感兴趣区域（ROI）的一组元素（例如细胞或体素）的划分，并分配了识别标签向该区域。在神经解剖学中，分割涉及直接可视化大脑区域的描述和鉴定，这些区域使用结构性的生物学标准标记。相比之下，在MRI分析中，使用与成像相关的标准在计算机生成的图像上对大脑结构的描述和鉴定进行了识别。基于MRI的分割的最终目标是将图像切入与神经解剖结构相对应的体素的识别分组。
大脑
许多功能和结构神经影像学研究要求从 MRI 扫描的图像强度值开始对不同的大脑结构进行精确的形态分割。当前基于自动（多）图谱的分割策略通常对难以分割的大脑结构缺乏准确性，而且由于这些方法依赖于图谱与扫描图谱的对齐，因此可能需要较长的处理时间。另外，最近部署基于卷积神经网络 (CNN) 的解决方案的方法能够直接分析扫描仪外的数据。然而，当前基于 CNN 的解决方案将测试体积分割成 2D 或 3D 块，然后独立处理。此过程会导致全局上下文信息的丢失，从而对分割准确性产生负面影响。在这项工作中，我们设计并测试了一种优化的端到端 CNN 架构，该架构使全局空间信息的利用在计算上易于处理，从而可以一次处理整个 MRI 体积。我们采用弱监督学习策略，利用由 947 张扫描仪外（3 Tesla T1 加权 1mm 各向同性 MP-RAGE 3D 序列）MR 图像组成的大型数据集。生成的模型能够在几秒钟内产生准确的多结构分割结果。与最先进的技术相比，不同的定量测量表明我们的解决方案具有更高的准确性。此外，通过一项涉及专家神经科学家的随机调查，我们表明主观判断有利于我们的解决方案，而广泛采用的基于图谱的软件则更胜一筹。
纳米级人类整个大脑的形态学的文章
摘要：尽管尚未获得整个人脑的纳米级数据集，并且尚未构建纳米级人类整个脑图集，但神经影像学和高性能计算方面的巨大进展使得它们在非差异的未来中是可行的。要构建人类的整个脑纳米级地图集，存在一些挑战，在这里，我们解决了两个，即纳米级在纳米级的大脑建模和纳米级脑图的设计。引入了一种新的纳米级神经元格式，以描述必要的数据和能力，以对整个人脑建模纳米级，从而对突触器和连接组进行计算。纳米级脑图的设计涵盖了设计原理，内容，体系结构，导航，功能和用户界面。引入了三种新型设计原理，以支持导航，勘探和计算，即微神经/纳米级神经解剖学的总体神经解剖学导航；可移动且可缩放的采样量，以进行导航和探索；以及在平行二线模式下进行的纳米级数据处理，该模式利用并行性，这是由神经解剖学的分解导致的，这些神经解剖结构分解为结构和区域，以及分解为神经元和突触中的纳米神经解剖结构，从而实现了分布式结构，从而实现了纳米级尺寸的分布式结构和连续增强。该地图集的众多应用可以考虑在校对和持续的多站点扩展之间，再到探索，形态和网络相关的分析以及知识发现。据我所知，这是第一个提出的神经元形态纳米级模型，也是第一次在纳米级设计人类全脑图集的尝试。
使用机载 LiDAR 和多元分析对凡尔登战场（法国）进行战争地形测绘和分类
摘要：士兵作为高效的推土机，在最近关于人类世地貌学的辩论中，可以被视为景观变化的重要地貌驱动因素。由军事活动产生的“极地形态”与一组大小和几何形状各异的人造地貌相对应。它们在第一次世界大战凡尔登战场（法国）尤为常见，该战场是西线最大的消耗战之一。那场战役中的炮击和防御阵地的建设极大地改变了地貌，造成了数以千计的弹坑、掩体和炮位，改变了中、微地形。本文提出了一种创新方法，利用机载 LiDAR 在整个战场上获取的数字地形模型 (DTM)，对这些小规模冲突引起的地貌（不包括战壕等线性特征）进行详尽清点。使用 Kohonen 的自组织映射 (SOM) 和分层凝聚聚类 (HAC) 进行形态分析，以量化和分类大量战争地貌。这种组合方法可以绘制超过一百万个地貌，这些地貌可分为八种不同的形状，包括弹坑和各种士兵制造的地貌（即掩体、炮位等）。使用现场观察进行的检测质量评估表明，该算法成功分类了 93% 的弹坑和 74% 的人类建造的地貌。最后，所制作的图像数据库和地图系列将帮助考古学家和林业工作者更好地管理凡尔登历史遗址，该遗址如今被约 10,000 公顷的大森林覆盖。© 2019 John Wiley & Sons, Ltd.
肠道菌群耗竭延迟了体细胞神经发育，并损害神经肌肉联合
摘要肠道菌群负责人类健康中的重要功能。已经描述了肠道菌群与其他器官之间通过神经，内分泌和免疫途径之间的几个通信轴，并且肠道菌群组成的扰动与新兴疾病数量的发作和进展有关。在这里，我们分析了周围根神经节（DRG）和新生儿和年轻小鼠的骨骼肌肉，具有以下肠道菌群状态：a）无细菌（a）gnotobirotic，gnotobirotic，gnotobirotic s gnotobirotic seplatigy complatial gnotobirotic，用12个特定的肠道细菌菌株（Oligobiobiot）选择性地定居微生物群（CGM）。立体和形态计量学分析表明，肠道菌群的缺失会损害体细胞中间神经的发展，从而导致直径较小和甲基化轴突，以及较小的无叶子纤维。因此，DRG和坐骨神经转录组分析强调了一组差异表达的发育和髓鞘基因。有趣的是，Neuregulin1（NRG1）的III型同工型（已知是Schwann细胞髓鞘化至关重要的神经元信号）在年轻的成年GF小鼠中过表达，因此，转录因子早期生长反应2（EGR2）的表达，是由Schwann细胞表达的，由Schwann细胞表达的基本基因在Myelination Onserination Onserations of Myelination of Myelination of Myelination。最后，GF状态导致组织学萎缩性骨骼肌，神经肌肉连接的形成受损以及相关基因的失调表达。总而言之，我们首次证明了肠道微生物群调节对躯体周围神经系统的适当发展及其与骨骼肌的功能联系，从而表明存在一种新颖的“肠道微生物群 - 外周神经系统轴”。
案例研究
洞穴的建模在不断发展，经典的建模工具正在为更精确和更实用的新技术所取代，实际上，科学家越来越多地使用3D建模来改善洞穴的表示，在这项研究中，我们使用了激光仪和照明，在3D代表中占据了3D代表的越来越多的位置。他们的简单性有利于记录和建模洞穴的顶形态以及内在的复杂性的详细表示。作为位于摩洛哥省省省的Kef El Baroud洞穴的地貌研究的一部分，进行了两种建模方法，这是一项通过LaserGrammetry和洞穴的照相测量的数字调查。及其顶形形态。这项研究是由二氧化构测距仪的地形调查完成的。还进行了电断层扫描的地球物理贡献。3D陆地激光扫描技术由Leica RTC 345扫描仪进行。这些测量结果使得可以重建副型形态的进化阶段及其与局部地貌学及其结构元素的关系。一项电断层扫描研究与其他测量值结合在一起，不仅可以根据电阻率梯度划定洞穴的壁，而且还可以检测洞穴下可能存在构成含水层的裂缝区域的可能存在。现场测量被整合到数字模型的形态分析中，这允许大量观察结果。调查还可以将结果与反射摄像机和宽角镜进行的摄影镜的结果进行比较，从而使范围的编辑软件及其在范围内启用了我们的精确范围。摄影测量法，这是洞穴的地貌研究的有趣手段。
PDF：在镍和镉胁迫条件下，植物生长指标上局部合成 ACC 脱氨酶的细菌的测定
评估从重金属污染土壤中分离出的 26 种细菌产生 1-氨基环丙烷-1-羧酸 (ACC) 脱氨酶的能力，证实了它们在减少重金属胁迫条件下的重要作用。26 种细菌分离株中有 8 种对 ACC 脱氨酶的产生呈阳性。分离株 #11 通过产生 α-酮丁酸 (102 µM/mg 蛋白质/小时) 具有最高的酶活性。此外，具有多种有利特性的 ACC 脱氨酶产生、根部定植、非致病性细菌也是选择，包括地衣芽孢杆菌 10 (#10)、铜绿假单胞菌 18 (#18)、肠杆菌 11Uz (#11) 和阴沟肠杆菌 Uz_5 (#5)。用悬浮液 #11 处理小麦品种“Chillaki”种子，在金属胁迫条件下，种子发芽率和生长强度 (22%) 显著提高。在严重金属胁迫下生长的植物经悬浮液 #11 处理后，结果显示与对照处理相比，植物生长指标和总叶绿素含量显著改善。此外，在小麦种子中，用肠杆菌 11Uz 悬浮液处理后，脯氨酸、过氧化氢酶和 SOD 活性上升。结果支持使用 ACC 脱氨酶产生肠杆菌 11Uz (#11) 来减轻压力，因为它可以通过其抗氧化系统保护小麦植物免受重金属胁迫。关键词：本地细菌、小麦种子、金属胁迫条件、ACC 脱氨酶、肠杆菌、抗性、脯氨酸、SOD、CAT、发芽率、生长强度 主要发现：具有植物生长刺激特性的 ACC 脱氨酶合成细菌对镍和镉阳离子表现出最高的抗性。选择细菌成功研究了在镍和镉胁迫条件下生长的小麦植株的形态特征和叶绿素含量。细菌在缓解镍和镉胁迫条件方面表现突出。
人类早期脑器官发育的形态动力学
脑器官可以对人脑发育的机械研究，并提供了在不受约束的发育系统中探索自我组织的机会。在这里，我们在荧光标记的人类诱导的多能干细胞产生的无引导的脑类器官上建立了长期的实时光片显微镜，这可以跟踪器官发育的数周的数周来跟踪Tis-Sue形态，细胞行为和亚细胞特征。我们提供了一种新型的双通道，多摩萨克和多蛋白标记策略，融合了一种计算反复运动方法，以同时量化有机体发育中的不同亚细胞特征。我们跟踪肌动蛋白，微管蛋白，质膜，核和核包膜动力学，并在组织状态过渡期间（包括神经上皮诱导，成熟，亮度，亮度和脑部调节）的细胞形态和对齐变化。基于成像和单细胞转录组模态，我们发现发育神经上皮内的腔膨胀和细胞形型组成与涉及细胞外基质（ECM）路径调节剂和机械素的基因的调节程序的调节有关。我们表明，外的矩阵增强了管腔膨胀以及脑形成，并且在没有外源基质的情况下生长的无引导器官会改变形态，随着神经犯罪和尾巴化的组织认同的增加。总的来说，我们的工作为研究人脑形态动力学提供了新的攻击，并支持一种观点，即在大脑区域化过程中，矩阵挂钩的机械感应动力学起着核心作用。矩阵诱导的区域引导和管腔形态发生与Wnt和Hippo（YAP1）信号通路有关，包括对Wnt配体分泌介质（WLS）的空间限制诱导，标志着非远程脑脑脑区域的最早出现。
自动化的高含量基于微生物行为多样性和分布的表征
背景微生物发展了复杂的系统以响应环境信号。特定分子的梯度改变了微生物行为和环境中的分布。微电位工具现在采用基于自动图像的方法来分析在小时尺度上受控环境中微生物物种的瞬时分布和运动行为，并在某种程度上模仿了宏观条件。此类技术已被采用用于主要针对单个物种的研究。现在必须开发出类似的多功能方法，以针对微生物群落和环境之间的多重和复杂相互作用的特征进行开发。结果，我们为响应环境驱动器的合成混合微生物悬浮液的物种特异性行为提供了一种全面的分步方法。通过使用自动图像分析方法来解决可访问的微流体设备，我们评估了三种形态学上不同的胎尿种物种（phytophthora parasitica，vorticella sicella microstoma，肠杆菌，肠杆菌）对potassium梯度驱动程序的行为反应。使用Trackmate插件算法，我们进行了形态计量学，然后进行运动分析以表征每个微型物种对驱动器的反应。这种方法使我们能够确认这三个物种的不同形状特征，并同时表征了它们对驾驶员的特殊运动适应以及它们的共同交互动力学。结论获得的结果证明了该方法在高空间和时间尺度上筛选混合物种悬架动力学的可行性。通过增加悬浮液的复杂性，可以集成这种方法以支持常规的OMICS方法，从而有助于表征主要驱动因素在微生物群体 - 宿主 - 环境接口之间的运行方式。在目前的进步中，该方法可以整合筛选策略，例如，用于生物防治剂评估，启发基于微栖息地的共殖化的可能的有益性 - 病原相互作用。