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SARS-COV-2，胡椒温和的斑点病毒和crassphage的纵向和定量粪便脱落动力学

在2019年冠状病毒病（COVID-19）中出现了基于废水的流行病学（WBE），这是一种可扩展且广泛适用的方法，用于社区级别监测感染性疾病负担。缺乏严重急性呼吸综合征2（SARS-COV-2）的高分辨率粪便脱落数据限制了我们将WBE测量与疾病负担联系起来的能力。在这项研究中，我们提出了SARS-COV-2 RNA的纵向，定量的粪便脱落数据，以及常用的粪便指标胡椒轻度斑驳病毒（PMMOV）RNA和Crass-like-Phage（Crassphage）DNA。来自48个SARS-COV-2感染者的脱落轨迹表明，SARS-COV-2 RNA粪便脱落的高度个性化的动态过程。提供了至少三个跨越超过14天的粪便样品的个体，有77％的个体有一个或多个样品对SARS-COV-2 RNA呈阳性。，我们在所有个体的至少一个样本中检测到PMMOV RNA，总体上96％（352/367）的样本中检测到了PMMOV RNA。crassphage DNA，并在所有样品的48％（179/371）中检测到。所有个体的粪便中PMMOV和Crassphage的几何平均浓度均为8.7×10 4