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神经电路选择性，多路复用的药理学靶向前额叶皮层预测基因座神经元驱动抗伤害感受
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本于2024年8月28日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.06.08.598059 doi：biorxiv preprint
![基于多核纤维的太空分层多路复用网络的深增强学习RMSCA [邀请教程]](/simg/a/a7dc23a2ed6945ae588b3a67352e043368864ba0.webp)
基于多核纤维的太空分层多路复用网络的深增强学习RMSCA [邀请教程]
对网络能力的不断升级的要求催化了太空层多路复用（SDM）技术的采用。随着多核光纤（MCF）制造的持续进展，基于MCF的SDM网络被定位为可行且有前途的解决方案，可在多维光学网络中实现更高的传输能力。然而，借助基于MCF的SDM网络提供的广泛网络资源带来了传统路由，调制，频谱和核心分配（RMSCA）方法的挑战，以实现适当的性能。本文提出了一种基于基于MCF的弹性光网（MCF-eons）的深钢筋学习（DRL）的RMSCA方法。在解决方案中，具有基本网络信息和碎片感知奖励函数的新型状态表示旨在指导代理学习有效的RMSCA策略。此外，我们采用了一种近端策略优化算法，该算法采用动作面膜来提高DRL代理的采样效率并加快培训过程。用两个不同的网络拓扑评估了所提出的算法的性能，其交通负荷不同，纤维具有不同数量的核心。结果证实，所提出的算法在将服务阻断概率降低约83％和51％方面优于启发式方法和最先进的基于DRL的RMSCA算法。此外，提出的算法可以应用于具有和没有核心切换功能的网络，并且具有与现实世界部署要求兼容的推理复杂性。
使用硬件感知准局部策略降低多路复用量子中继器中的经典通信成本
未来的量子网络将具有配备多个量子存储器的节点，从而允许多路复用 14 和纠缠蒸馏策略，以提高交付率并减少端到端 15 纠缠分发的等待时间。在这项工作中，我们引入了用于多路复用量子中继器 16 链的准局部策略。在完全局部策略中，节点仅根据对自身状态的了解做出决策。在我们的 17 准局部策略中，节点增加了对中继器链状态的了解，但不一定是 18 完整的全局知识。我们的策略利用了这样的观察结果：对于节点必须做出的大多数决策 19，它们只需要掌握有关它们所属链的连接区域的信息，而不是整个 20 链。通过这种方式，我们不仅获得了优于局部策略的性能，而且还降低了全局知识策略固有的经典 21 通信 (CC) 成本。我们的策略在实际相关的参数范围内也优于众所周知的、被广泛研究的嵌套净化和加倍交换策略。我们还仔细研究了纠缠蒸馏的作用。通过分析和数值结果，我们确定了蒸馏有意义且有用的参数范围。在这些范围内，我们还解决了以下问题：“我们应该先蒸馏再交换，还是反之亦然？”最后，为了提供进一步的实用指导，我们提出了一种基于多路复用的中继器链的实验实现，并通过实验演示了关键元素，即高维双光子频率梳。然后，我们通过对两个具体内存平台（即稀土离子和金刚石空位）的模拟结果，评估了我们基于多路复用的策略在这种真实网络中的预期性能。
报告变异效应多重分析的最低限度信息和指南。
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多路复用时分辨荧光共振能量转移超高通量筛选测定法，用于靶向SMAD4 – SMAD3 – DNA复合物
转化的生长因子-BETA（TGFβ）信号通路在建立免疫抑制性肿瘤微环境中起着至关重要的作用，使抗TGFβ剂成为癌症免疫疗法的重要领域。然而，针对上游细胞因子和受体的当前抗TGFβ药物的临床翻译仍然具有挑战性。因此，小分子抑制剂的发展特异性靶向TGFβ途径的下游主调节器SMAD4，将采取一种替代方法，具有明显的抗TGFβ信号传导的替代方法。在这项研究中，我们介绍了在超高通量筛选（UHTS）1536孔板格式中基于细胞裂解物的多路复用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）测定。该测定法可以同时监测SMAD4和SMAD3之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用，以及SMADS及其共识DNA结合基序之间的蛋白质-DNA相互作用。多路复用的TR-FRET分析表现出高灵敏度，从而使单氨基酸分辨率下的Smad4-Smad3-DNA复合物进行了动态分析。此外，多路复用的UHTS分析证明了筛选小分子抑制剂的鲁棒性。通过对FDA批准的生物活性化合物库进行试验筛选，我们将gambogic Acid和Gambogenic Acodic鉴定为潜在的HIT化合物。这些概念验证的发现强调了我们优化的多重TR-FRET平台的大规模筛选的实用性，以发现针对SMAD4-SMAD3 – DNA复合物作为新型抗TGFβ信号剂的小分子抑制剂。
高型物质的读取级甲基化模式提取...
DNA甲基化的异常变化与癌变的早期阶段有关。确定循环肿瘤DNA（CTDNA）中这些表观遗传变化可以揭示潜在的生物标志物来早期诊断各种癌症。然而，分析此类数据会带来生物信息学挑战，因为在检测活检样本中低丰度的CTDNA信号方面缺乏灵敏度，这些ctDNA信号通常被包含数百个目标区域的库的复杂性所淹没。读取水平的甲基化分析有望由于稀有信号的广泛覆盖范围和高灵敏度，因此有望进行更深入的DNA甲基化检测。但是，由于缺乏能够生成适合基准科学家和专业生物信息学家的可解释报告的标准化工作流的缺乏，这种方法受到了阻碍。在这里，我们提出了一个生物信息学工作流，该工作流程检查下一代测序（NGS）数据并表征扩增子的读取级甲基化模式。与当前可用的其他工具相比，我们的方法旨在与高型，大规模的目标测定法一起使用。它有效地消除了从测序副产品（例如False CpG调用，二聚体和脱靶比对）得出的不希望的噪声。此外，为了容纳最新的NGS平台生成的大量数据，该工作流程可以并行处理与基于云的基于云和本地计算资源兼容的样品。此工作流程提供了DNA甲基化模式的全面可视化，并报告了读取水平的甲基化在“模式为a-a-a-a-feature”表中。在此表中，每个样品的扩增子层型单倍型（图案）的出现表示为“特征列”，并与实验中发现的所有模式一起汇总。这些读取级别的模式以及其他信息可用于开发机器学习算法，以重复收获真正的预测特征，并在预测癌症诊断时惩罚混淆信号。
用于多重 dropout 筛选的基准化、高效 prime 编辑平台 4
(E) 来自 StopPR 筛选的基因水平生长表型（计算为第 14 天每个基因绝对最强的两个 stop 287 epegRNA 的平均表型）由 CRISPRi 表型（如先前在 K562 细胞中确定）分组。54 个体 p 值分别为 288 1.13E-3（重度 vs. 中度）、4.00E-12（中度 vs. 轻度）和 < 2.62E-14（重度 vs. 轻度）来自 ANOVA 和 Tukey 事后分析（** 289 p < 0.01，*** p < 0.001）。标出了本分析中使用的全套 epegRNA 的中位数和四分位距 (IQR)。须线 290 延伸 1.5*IQR 超过上四分位数和下四分位数。虚线表示表型截止（Z < -2）。291
多重RPA和CRISPR-CAS12A系统，用于快速且具有成本效益的抗碳青霉苯甲酸杆菌baumannii
（Fursova等，2023），菌血症（Hong等，2023; Nutman等，2023）和与呼吸机相关的肺炎（Riddles and Judge，2023）。值得注意的是，鲍曼尼曲霉最常见于重症监护病房（ICU）和重症患者，在这些患者中，感染对器官衰竭和脓毒症产生了显着贡献，代表了患者死亡的主要原因（Blanco等，2018; Seok等，2021）。碳青霉烯类历史上一直是控制A. baumannii感染的一线药物。然而，在过去的几十年中，这类药物的广泛使用，再加上鲍曼尼a。baumannii的内在耐药性和获得的抗药性特征，从而导致了受碳苯二甲酸苯甲酸甲抗体引起的感染的升级，这是由碳苯二甲酸苯丙胺的抗苯甲酸抗菌素（crab）（crab）（Raible等，2017年）。这种抗性特征表现出广泛的抗菌耐药性，进一步提高了其发病率和死亡率（Hamidian and Nigro，2019年）。目前，只有有限数量的药物，例如多粘蛋白和Tigecycline，可用于管理感染（Abdul-Mutakabbir等人，2021年）。螃蟹在世界卫生组织的病原体优先级清单中持有“优先级1：批判性”的名称，这表示对全球公共卫生的严重威胁（Tacconelli等，2018）。在马里兰州进行的一项调查，涉及482例机械通风患者的调查显示，鲍曼尼a。30.7％的感染率为30.7％，螃蟹占88例（59.5％）（Harris等，2023）。此外，一项调查报告了几乎所有临床或非临床蟹阳性患者的环境中的螃蟹载荷类似（Schechner等，2023）。因此，预防和控制螃蟹感染的及时有效策略对于限制其对医院获得的感染和死亡率的影响至关重要。
快速综合征PCR的潜在价值用于诊断天然和假体关节感染：一项现实世界证据研究
Pascus Stephanie 1 , Noble 2 , Syronine Ahmat 4 , Sharon Amit 6 , Rachel Annett Barriett 10 , Mario Berth 11 , Bondi 12 : Daniel Goldenberger 16 , Andrej Golle 23 , Juna O. Groonrouos 24 , Peter, St. Hoffmann Karahan 28 , Laura Laura 10 , Laurde Lee Host 21:22 , Caroline Louis 30 ,罗伯特·J·米尔本（Robert J. Milburn）4，卢克·S·P·摩尔（Luke S. Trebe Wouthuyzen-Bakker 40，Brianne Couturier 2和Florence Allland
用于基于DNA的SARS-COV-2基因的基于DNA的多路复用检测
在由SARS-COV-2触发的全局COVID-19大流行之后，需要快速，特定和具有成本效益的护理诊断解决方案的需求仍然是至关重要的。尽管Covid-19不再是公共卫生紧急情况，但该疾病仍会构成全球威胁，导致死亡，并且随着新变体的风险而发生变化，导致案件和死亡引起新的激增。在这里，我们迫切需要SARS-COV-2的快速，成本效益和护理诊断解决方案。我们提出了一个基于多重DNA的传感平台，该平台利用喷墨打印的纳米结构金电极和一个喷墨打印的无电池无电池近场通信（NFC）电位，用于对两个SARS-COV-2基因，ORF1AB和N Gene的同时定量检测。基于RNA-DNA夹层结构的形成的检测策略导致高度特异性的电化学输出。喷墨打印的纳米结构金电极提供了较大的表面积，可有效结合并提高灵敏度。喷墨打印的无电池NFC PotentioStat可以通过智能手机应用程序进行快速测量和实时数据分析，从而使平台可访问和便携。具有速度（5分钟），简单性，灵敏度（低PM范围，〜450％信号增益）和成本效益的优势，提出的平台是护理点诊断和高通量分析的有希望的替代方案，可补充COVID-19的诊断工具基。