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病例报告：EDA 基因剪接位点突变导致少汗性外胚层发育不良，出现特应性皮炎样皮肤表现
少汗性外胚层发育不良 (HED) 是一种罕见疾病。患有 HED 的患者从小就表现出头发稀疏、牙齿发育不良和无汗症，以及特应性皮炎样皮肤表现。我们报告了一名 20 岁的男性 HED 患者，他患有特应性皮炎样皮肤，经度匹鲁单抗成功治疗。基因分析发现 EDA 基因中存在剪接突变，NG_009809.2 (NM_001399.5):c.793 + 3A > C r.742_ 793del p.Pro248Ilefs Ter15，这是以前从未报道过的。该患者因全身瘙痒加剧而到我们科室就诊。根据皮疹的分布，患者被诊断为特应性皮炎并开始使用度匹鲁单抗。治疗第三个月皮疹减轻。dupilumab 在治疗与 Th2 免疫相关的遗传性皮肤病方面的潜力是已知的。尽管皮疹与 HED 的特应性皮炎样皮肤表现或独立的特应性皮炎有关尚不清楚，但 dupilumab 可能是治疗伴有特应性皮炎皮肤的 HED 的候选药物。
影响肌肉发育的斑马鱼突变体的全转录组数据分析
骨骼肌收缩肌纤维的形成是一个复杂过程，若受到干扰则会导致肌营养不良。在此，我们提供了三种不同斑马鱼突变体的 mRNAseq 数据集，这些突变体在胚胎发生过程中影响肌肉组织。这些突变体包括肌球蛋白折叠伴侣 unc45b (unc45b/)、热休克蛋白 90aa1.1 (hsp90aa1.1/) 和乙酰胆碱酯酶 (ache/) 基因。在受精后 72 小时 (hpf) 对这三个突变体进行了重复实验中的转录组分析，并对 unc45b/ 进行了另外两个发育时间 (24 hpf 和 48 hpf)。通过层次聚类分析了总共 20 个样本以查找差异基因表达。本研究的数据支持 Etard 等人的观察结果。 (2015) [1] ( http://dx.doi.org/10.1186/s13059-015-0825-8 ) 肌球蛋白折叠失败会激活骨骼肌中独特的转录程序，该程序与应激肌肉细胞中诱导的程序不同。 & 2016 作者。由 Elsevier Inc. 出版。这是一篇根据 CC BY 许可协议开放获取的文章 ( http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ )。
腺嘌呤碱基编辑器介导的常见和严重 IVS1-110 (G>A) 地中海贫血突变的纠正
1 法国巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所染色质和发育过程中基因调控实验室；2 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗临床研究中心；3 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所人类淋巴造血实验室；4 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗系；5 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所生物信息学平台；6 意大利米兰圣拉斐尔科学研究所 (IRCCS) 里维埃拉与克拉特雷松基因治疗研究所 (SR-TIGET)； 7 生命健康圣拉斐尔大学，米兰，意大利
当前针对突变体p53
癌症疗法已尝试针对转录因子p53，这个基因也被描述为“基因组的守护者”数十年。然而，由于几个因素，该方法面临着许多临床效率的障碍：p53的突变发生在几乎所有人类癌症中，突变是癌症的，并且相关的基因组变化授予突变体p53具有与野生型P53相关的致癌潜力。已经出现了许多新的治疗剂，以靶向突变体p53。这些药物可以广泛地分为六类：病毒方法，p53途径的直接修改器，p53途径的表观遗传修饰者，合成致死药物，结构性反应激素，结构性反应剂和免疫激活疫苗。即使这些策略也得到了有限的成功。完全绕过p53可能是杀死肿瘤细胞的下一个途径，无论p53的突变模式如何。
一种基于测序的定量细胞内环境中细菌基因缺失突变体的方法
下一代测序 (NGS) 的进步大大加速了微生物学研究创新方法的发展。在本研究中，我们提出了一种新方法来量化细胞内环境中基因缺失突变体的净存活率。该方法基于标准化的 Illumina 基因组 DNA 短读测序，无需在每个缺失突变体上使用特定的选择标记。验证结果表明，该方法可以准确量化混合突变体的加标池中的突变体，与基于 CFU 测定的预期值相比没有统计学上显着差异（ p > 0.05）。此外，该方法还用于量化巨噬细胞中的 S . Gallinarum 突变体。将六个突变体和一个对照菌株混合在一个池中，并让其感染 HD11 细胞 2 小时。结果与之前的研究结果一致，为混合突变体感染在功能基因鉴定中的可行性提供了证据。值得注意的是，该方法的简单性和标准化植根于标准全基因组测序协议，使其可在各个实验室中轻松实施。
靶向 CDK4/Cyclin D 界面的钉合肽与 Abemaciclib 联合使用可抑制 KRAS 突变肺癌生长
CDK4/细胞周期蛋白 D 激酶是开发抗癌疗法的一个有吸引力的药理学靶点，特别是对于 KRAS 突变的肺癌患者，这些患者预后不良，目前尚无可用的靶向疗法。尽管已经开发出几种 ATP 竞争性 CDK4 抑制剂用于抗癌治疗，但它们的特异性和有效性有限。方法：作为 ATP 竞争性抑制剂的替代品，我们设计了一种钉合肽来靶向 CDK4 和细胞周期蛋白 D 之间的主要界面，并表征了其物理化学性质和与细胞周期蛋白 D1 结合的亲和力。结果：我们证实了肺癌患者的 CDK4/细胞周期蛋白 D 水平与 KRAS 突变之间存在正相关性。钉合肽能迅速有效地进入细胞，抑制肺癌细胞中的 CDK4 激酶活性和增殖。小鼠肺内给药可使其在原位肺肿瘤中保留，并与 Abemaciclib 联合使用时完全抑制其生长。结论：针对 CDK4 和细胞周期蛋白 D 之间主要界面的钉合肽为肺癌患者提供了有希望的治疗前景。
髓系恶性肿瘤中的 RAS 突变：以新见解和治疗视角重新审视旧问题
NRAS 和 KRAS 激活点突变存在于 10 – 30% 的髓系恶性肿瘤中，并且通常与增殖表型相关。RAS 突变具有等位基因特异性结构和生化特性，具体取决于热点突变，从而导致不同的生物学后果。鉴于它们在大多数髓系恶性肿瘤中的亚克隆性质，它们的克隆结构以及与其他驱动基因改变的协同模式可能会对髓系恶性肿瘤的预后和治疗产生直接的因果影响。总体而言，RAS 突变往往与慢性和急性髓系恶性肿瘤的不良临床结果有关。最近的几种预后评分系统已纳入 RAS 突变状态。虽然 RAS 突变并不总是作为独立的预后因素，但它们会显著影响疾病进展和生存。然而，它们的临床意义取决于突变类型、疾病背景和所采用的治疗方法。最近的证据还表明，RAS 突变会导致对靶向治疗产生耐药性，尤其是 FLT3、IDH1/2 或 JAK2 抑制剂以及维奈克拉-阿扎胞苷组合。研究针对 RAS 通路内多个轴（包括上游和下游成分）的新型治疗策略和组合是一个活跃的研究领域。直接 RAS 抑制剂在实体瘤患者中的成功应用，让人们重新燃起希望，相信这一进展将转化为血液系统恶性肿瘤患者的治疗。在这篇综述中，我们重点介绍了过去十年间骨髓恶性肿瘤中 RAS 突变的关键见解，包括其流行率和分布、协同遗传事件、克隆结构和动态、预后意义和治疗靶向性。
RAS 突变和个性化癌症治疗
缩写 Adeno，腺癌；AE，不良事件；CRC，结直肠癌；CUP，原发部位不明的癌症；DCR，疾病控制率；dMMR，错配修复缺陷；EGFR，表皮生长因子受体；EHC，肝外胆管癌；FDA，食品药品管理局；GI-neuro，胃肠神经内分泌；HER2，人类表皮生长因子受体 2；IHC，肝内胆管癌；m，中位数；MDS-MPN，骨髓增生异常-骨髓增生性肿瘤；MOA，作用方式；MSI，微卫星不稳定性；NCCN，国家综合癌症网络；NGS，下一代测序；NSCLC，非小细胞肺癌；ORR，客观缓解率；PDAC，胰腺导管腺癌；PD-L1，程序性死亡配体 1； SOC，标准治疗；Sq，鳞状；TMB，肿瘤突变负担；TRAE，治疗相关不良事件；TTR，缓解时间。
太空飞行中的躯体突变分析
加速突变分析工作流程。This diagram illustrates the integration of NVIDIA Parabricks (a GPU-accelerated genomics toolkit) and GATK4 (Genome Analysis Toolkit version 4) with open-source workflow frameworks like Nextflow (a data-driven workflow management system), WDL (Workflow Description Language), and Toil (a scalable workflow engine) for high-performance, customizable genomic analysis pipeline.支持工具包括samtools（序列对齐/地图工具），bcftools（二进制对齐/地图和变体呼叫格式工具）和fastQC（用于高通量序列数据的质量控制工具）。利用GPU（图形处理单元）和容器化可增强可扩展性和可重复性。
突变在癌症发展中的作用以及......
癌症突变可分为种系突变和体细胞突变。种系突变是遗传的，存在于身体的每个细胞中，通常会增加个体患某些癌症的倾向（例如乳腺癌中的 BRCA 突变）。相比之下，体细胞突变在人的一生中由于环境因素（例如接触烟草烟雾、紫外线辐射或化学致癌物）而发生在特定细胞中。虽然种系突变会导致家族性癌症综合征，但体细胞突变在散发性癌症中更为常见 [3]。