1. 简介................. ... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 2. 计算浮现势....................................................................................................................................................................................................................13 2.1. 符号....................................................................................................................................................................................................................................................................13 2.2. 使用配分函数的表达式.................................................................................................................................... ................................................................................................................................................................................................. 14 2.3. 积分表达式....................................................................................................................................................................................... .................................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. .................................................................................................................................. . ... 24 4. 对新出现的潜力的估计. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ... .................................................................................................................................................................................37 5.2. 等价收费的情况....................................................................................................................................................................38 5.3. 等价收费的情况....................................................................................................................................................................................38 . ....................................................................39 附录 A. 定理 1.4 的证明.......................................................................................................................................................................43
简介皮肤黑色素瘤 (cuMM) 仅占所有皮肤癌的 4%。然而,它却是 80% 皮肤癌死亡的罪魁祸首,是所有原发性皮肤肿瘤类型中最致命的。在过去的几十年里,全球浅肤色人群中的 cuMM 发病率稳步上升。美国国家癌症研究所监测、流行病学和最终结果计划 (SEER) 数据库将皮肤黑色素瘤排在 2024 年发病率的第 5 位,估计它将占美国所有新癌症病例的 5% [1]。而根据世界卫生组织 (WHO) 的统计数据,在波兰,2022 年 cuMM 是男性和女性中第 16 种最常见的癌症类型 [2]。尽管在大多数欧洲国家,黑色素瘤发病率仍然大幅上升,但在澳大利亚等几个高风险国家,由于有效的公共卫生运动和防晒霜可及性的提高,黑色素瘤发病率已报告下降/稳定[3]。
少汗性外胚层发育不良 (HED) 是一种罕见疾病。患有 HED 的患者从小就表现出头发稀疏、牙齿发育不良和无汗症,以及特应性皮炎样皮肤表现。我们报告了一名 20 岁的男性 HED 患者,他患有特应性皮炎样皮肤,经度匹鲁单抗成功治疗。基因分析发现 EDA 基因中存在剪接突变,NG_009809.2 (NM_001399.5):c.793 + 3A > C r.742_ 793del p.Pro248Ilefs Ter15,这是以前从未报道过的。该患者因全身瘙痒加剧而到我们科室就诊。根据皮疹的分布,患者被诊断为特应性皮炎并开始使用度匹鲁单抗。治疗第三个月皮疹减轻。dupilumab 在治疗与 Th2 免疫相关的遗传性皮肤病方面的潜力是已知的。尽管皮疹与 HED 的特应性皮炎样皮肤表现或独立的特应性皮炎有关尚不清楚,但 dupilumab 可能是治疗伴有特应性皮炎皮肤的 HED 的候选药物。
1 法国巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所染色质和发育过程中基因调控实验室;2 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗临床研究中心;3 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所人类淋巴造血实验室;4 法国巴黎巴黎公立医院内克尔儿童医院生物治疗系;5 法国巴黎巴黎城市大学 INSERM UMR1163 想象研究所生物信息学平台;6 意大利米兰圣拉斐尔科学研究所 (IRCCS) 里维埃拉与克拉特雷松基因治疗研究所 (SR-TIGET); 7 生命健康圣拉斐尔大学,米兰,意大利
NRAS 和 KRAS 激活点突变存在于 10 – 30% 的髓系恶性肿瘤中,并且通常与增殖表型相关。RAS 突变具有等位基因特异性结构和生化特性,具体取决于热点突变,从而导致不同的生物学后果。鉴于它们在大多数髓系恶性肿瘤中的亚克隆性质,它们的克隆结构以及与其他驱动基因改变的协同模式可能会对髓系恶性肿瘤的预后和治疗产生直接的因果影响。总体而言,RAS 突变往往与慢性和急性髓系恶性肿瘤的不良临床结果有关。最近的几种预后评分系统已纳入 RAS 突变状态。虽然 RAS 突变并不总是作为独立的预后因素,但它们会显著影响疾病进展和生存。然而,它们的临床意义取决于突变类型、疾病背景和所采用的治疗方法。最近的证据还表明,RAS 突变会导致对靶向治疗产生耐药性,尤其是 FLT3、IDH1/2 或 JAK2 抑制剂以及维奈克拉-阿扎胞苷组合。研究针对 RAS 通路内多个轴(包括上游和下游成分)的新型治疗策略和组合是一个活跃的研究领域。直接 RAS 抑制剂在实体瘤患者中的成功应用,让人们重新燃起希望,相信这一进展将转化为血液系统恶性肿瘤患者的治疗。在这篇综述中,我们重点介绍了过去十年间骨髓恶性肿瘤中 RAS 突变的关键见解,包括其流行率和分布、协同遗传事件、克隆结构和动态、预后意义和治疗靶向性。
缩写 Adeno,腺癌;AE,不良事件;CRC,结直肠癌;CUP,原发部位不明的癌症;DCR,疾病控制率;dMMR,错配修复缺陷;EGFR,表皮生长因子受体;EHC,肝外胆管癌;FDA,食品药品管理局;GI-neuro,胃肠神经内分泌;HER2,人类表皮生长因子受体 2;IHC,肝内胆管癌;m,中位数;MDS-MPN,骨髓增生异常-骨髓增生性肿瘤;MOA,作用方式;MSI,微卫星不稳定性;NCCN,国家综合癌症网络;NGS,下一代测序;NSCLC,非小细胞肺癌;ORR,客观缓解率;PDAC,胰腺导管腺癌;PD-L1,程序性死亡配体 1; SOC,标准治疗;Sq,鳞状;TMB,肿瘤突变负担;TRAE,治疗相关不良事件;TTR,缓解时间。
加速突变分析工作流程。This diagram illustrates the integration of NVIDIA Parabricks (a GPU-accelerated genomics toolkit) and GATK4 (Genome Analysis Toolkit version 4) with open-source workflow frameworks like Nextflow (a data-driven workflow management system), WDL (Workflow Description Language), and Toil (a scalable workflow engine) for high-performance, customizable genomic analysis pipeline.支持工具包括samtools(序列对齐/地图工具),bcftools(二进制对齐/地图和变体呼叫格式工具)和fastQC(用于高通量序列数据的质量控制工具)。利用GPU(图形处理单元)和容器化可增强可扩展性和可重复性。
癌症突变可分为种系突变和体细胞突变。种系突变是遗传的,存在于身体的每个细胞中,通常会增加个体患某些癌症的倾向(例如乳腺癌中的 BRCA 突变)。相比之下,体细胞突变在人的一生中由于环境因素(例如接触烟草烟雾、紫外线辐射或化学致癌物)而发生在特定细胞中。虽然种系突变会导致家族性癌症综合征,但体细胞突变在散发性癌症中更为常见 [3]。
基于循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的分子分析正在通过多基因下一代测序 (NGS) 面板在晚期癌症患者的临床实践中迅速获得关注。然而,临床结果仍然描述不详,需要通过对血浆 ctDNA 中检测到基因组改变的患者进行个性化治疗来进一步验证。在这里,我们描述了通过 ctDNA 液体活检检测 InVisionFirst ® -Lung 在血浆中发现可操作改变的致癌成瘾晚期 NSCLC 患者的结果、3 个月时的疾病控制率 (DCR) 和无进展生存期 (PFS)。对 81 名晚期 NSCLC 患者进行了汇总回顾性分析,这些患者具有预测对目前 FDA 批准药物有反应的所有类型的改变:致敏常见 EGFR 突变(78%,n = 63)和 T790M(73%,46/63)、ALK / ROS1 基因融合(17%,n = 14)和 BRAF V600E 突变(5%,n = 4)。所有患者均通过先前的组织基因组分析确认了液体活检中检测到的可操作驱动改变,并且所有患者都接受了个性化治疗。在接受匹配靶向治疗的 82 名患者中,10% 为一线患者,41% 为二线患者,49% 为二线以上患者。 73% (46/63) 的患者在 TKI 复发时被检测到获得性 T790M,所有潜在患者 (34/46) 均根据 ctDNA 结果开始奥希替尼治疗。81 名可评估患者的 3 个月 DCR 为 86%。中位 PFS 为 14.8 个月 (12.1-22.9 个月)。基线 ctDNA 等位基因驱动基因分数与个性化治疗的反应率无关 (p = 0.29)。ctDNA 分子分析是一种准确可靠的工具,可用于检测晚期 NSCLC 患者中临床相关的分子改变。靶向治疗的临床结果支持将基于扩增子的 NGS ctDNA 分析液体活检用于晚期 NSCLC 患者的一线和复发检测。
检测 BRAF V595E 突变的存在有助于以下适应症:• 筛查易感品种的早期发现(见下文)• 应通过分析自发尿液(沉淀物)避免侵入性取样。• 在病理组织学和细胞学诊断可疑的情况下(样本质量差,炎症和肿瘤图像重叠),可以避免重复侵入性取样。• 在选定的 BRAF 阳性病例中进行靶向治疗(例如索拉非尼;Chon 等人,2024 年)