三阴性乳腺癌 (TNBC) 预后不良,主要是因为它们对化疗有耐药性。已知这种耐药性与 BCL-2 家族蛋白(即 BCL-xL、MCL-1 和 BCL-2)中某些抗凋亡成员的表达升高有关。这些蛋白通过结合和隔离抑制促凋亡蛋白活化来调节细胞死亡,并且可以被 BH3 模拟物选择性拮抗。然而,BCL-xL、MCL-1 和 BCL-2 对 TNBC 细胞对化疗敏感性的个体影响,以及它们受癌症相关成纤维细胞 (CAFs) 的调节,癌症相关成纤维细胞是肿瘤基质的主要成分,也是治疗耐药性的关键因素,这仍有待阐明。使用基因编辑或 BH3 模拟物抑制 TNBC 细胞系 MDA-MB-231 中的抗凋亡 BCL-2 家族蛋白,我们发现 BCL-xL 和 MCL-1 通过补偿机制促进癌细胞存活。该细胞系对化疗的敏感性有限,与 TNBC 患者观察到的临床耐药性一致。我们阐明了 BCL-xL 在治疗反应中起着关键作用,因为它的消耗或药理抑制提高了化疗效果。此外,BCL-xL 表达与患者来源的肿瘤中的化疗耐药性有关,其中其药理抑制增强了体外对化疗的反应。在癌细胞和 CAF 的共培养模型中,我们观察到即使在 BCL-xL 表达降低使癌细胞更易受化疗影响的情况下,与 CAF 接触的癌细胞也会对化疗表现出降低的敏感性。因此,CAF 在乳腺癌细胞中发挥着显著的促存活作用,即使在通过联合化疗和缺乏主要化学抗性因素 BCL-xL 而极易导致细胞死亡的环境中也是如此。
三阴性乳腺癌 (TNBC) 仍然是复发率和死亡率最高的乳腺癌亚型。TNBC 的治疗可能具有挑战性,因为该疾病具有不同的分子亚型。有各种治疗方案可供选择,例如化疗、免疫疗法、放射疗法和手术。化疗是这些方案中最常见的。化疗的严重副作用严重限制了其使用。长期毒性会影响大多数乳腺癌幸存者,显著降低他们的生活质量。免疫疗法会引起多种毒性作用,称为免疫相关不良事件 (IRAE)。这就需要寻找治疗三阴性乳腺癌的替代方法。该领域越来越多的研究集中在基于从天然来源获得的化合物的单一或联合疗法上。姜黄素、白藜芦醇和表没食子儿茶素-3-没食子酸酯等天然产物,具有其作用机制和抗肿瘤特性,是众多研究的主题。
长链非编码 RNA 是包括免疫反应在内的生物过程的重要调节因子。lncRNA 的免疫调节功能主要在小鼠模型中得到揭示,而对 lncRNA 在人类免疫反应中的了解有限。在这里,我们鉴定出 lncRNA LUCAT1,它在受脂多糖和其他先天免疫刺激刺激的人类髓系细胞中上调。在髓系细胞中靶向删除 LUCAT1 会增加响应 LPS 的 I 型干扰素刺激基因的表达。相反,增加 LUCAT1 表达会导致可诱导的 ISG 反应降低。在活化细胞中,LUCAT1 在细胞核中富集,并与染色质结合。此外,LUCAT1 通过与细胞核中的 STAT1 相互作用来限制干扰素刺激基因的转录。总之,我们的研究强调了 lncRNA LUCAT1 作为诱导后反馈调节因子的作用,其功能是抑制人类细胞的免疫反应。
三阴性乳腺癌 (TNBC) 不太可能对激素疗法和抗 HER2 靶向疗法产生反应。TNBC 过度表达 EGFR 并表现出 PI3K/AKT/mTOR 信号通路的组成性激活。我们假设同时阻断 EGFR 和 mTOR 可能是治疗 TNBC 的潜在治疗策略。我们研究了 mTOR 抑制剂依维莫司与 EGFR 酪氨酸激酶抑制剂吉非替尼联合在有或没有 PI3K/AKT/mTOR 信号通路激活突变的 TNBC 细胞中的抗肿瘤活性。我们证明依维莫司和吉非替尼在 PI3K 和 PTEN 突变的 CAL-51 细胞系中诱导协同生长抑制,但在 PTEN 缺陷的 HCC-1937 细胞系中没有诱导协同生长抑制。抗增殖作用与 mTOR 和 P70S6K 磷酸化的协同抑制以及 CAL-51 细胞系中 4E-BP1 活性的显著降低有关。我们还表明,联合疗法显著抑制了该细胞系的细胞周期进程并增加了细胞凋亡。基因和蛋白质表达分析表明,联合治疗后细胞周期调节因子显著下调。总之,这些结果表明,mTOR 和 EGFR 的双重抑制可能是治疗 PI3K 激活突变的 TNBC 的有效方法。
NMF包装。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。4 .fcnnls。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5高级-NMF。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。6汇总。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。7 aheatmap。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。7算法,NMFLIST方法。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。12算法-NMF。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。13基础。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。17巴斯科人。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。22底座。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。23个吻。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。26 canfit。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。26比较nmf。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。27连接性。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。30共识,NMFITX1方法。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。32共识,nmffitxn方法。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。32共识。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。33 Cophcor。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。33 Cophcor。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>34偏差。 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本文探讨了合成生物学方法可能对负排放技术(NETS)产生的影响。合成生物学既改变又创建了受自然启发的生物途径,该途径是由大自然启发的,开发了将温室气体隔离为工业有用的化学物质,例如生物量和碳酸钙。然而,由于硬限制(在生物学)和“软”限制(社会和经济成本)的结合,合成生物学在实施和扩大生产时会遇到困难。此外,网络以及一般的生态系统技术是气候技术的运作,其中即使在受控条件下,将设计的生物体释放到环境中,因此对伦理难题的思想不足。在本文中,在通过生态系统技术缓解气候变化的背景下,我们对网络的合成生物学方法提供了一种技术和道德评估。
1 艾克斯马赛大学,INSERM,IRD,SESSTIM,健康与医学信息处理经济与社会科学,ISSPAM,13385 马赛,法国; andrea.gosset@inserm.fr(AG); marie.nishimwe@inserm.fr(MLN); mayadiallo2008@yahoo.fr(马来西亚); pmcarrieri@aol.com (PMC) 2 巴斯德研究所新发疾病流行病学组,75015 巴黎,法国; lucas.deroo@hec.ca (LD); muriel.vray@pasteur.fr(MV); yusuke.shimakawa@pasteur.fr (YS)3 VITROME,媒介-热带和地中海感染,IRD-UCAD 汉恩校区,达喀尔 CP 18524,塞内加尔; aldiouma.diallo@ird.fr(广告); el-hadj.ba@ird.fr(欧洲卫生局); Cheikh.Sokhna@ird.fr (CS) 4 VITROME,Aix Marseille Univ,IRD,SSAS,IHU-MI,AP-HM,13385 马赛,法国 5 巴斯德研究所传染病流行病学部,达喀尔 BP 220,塞内加尔 6 INSERM,75013 巴黎,法国 * 通信地址:sylvie.boyer@inserm.fr;电话:+33-41-373-2272
多药革兰氏阴性细菌感染在全球范围内引起明显的发病率和死亡率。这些病原体很容易获得抗菌耐药性(AMR),进一步强调了它们的临床意义。第三代耐甲状腺孢菌素和耐碳苯甲状腺菌(例如,大肠杆菌和克雷伯斯氏菌SPP),抗多药的铜绿假单胞菌,铜绿假单胞菌,以及耐碳酸苯甲酸杆菌的抗碳酸盐症,并已识别为识别的问题,并且已经识别出了问题。在响应中,已经开发了几种旨在快速检测AMR的新诊断技术,包括生化,分子,基因组和蛋白质组学技术。过去十年还看到了多种抗生素的许可,这些抗生素改变了这些具有挑战性的感染的治疗景观。
在真核生物中,DNA主要通过缠绕组蛋白核心而获得高度紧凑的结构。DNA自然缠绕在组蛋白核心周围形成1.7个左手超螺旋,导致染色质中形成负超螺旋。在转录过程中,在聚合酶后方产生的负超螺旋可能在触发核小体重组中发挥作用。为了阐明超螺旋如何影响DNA缠绕组蛋白核心的动力学,我们开发了一个新模型来模拟DNA和组蛋白之间复杂的相互作用。我们的模拟表明,正超螺旋和负超螺旋DNA都能够缠绕在组蛋白核心周围以采用核小体构象。值得注意的是,我们的研究结果证实了在核小体缠绕过程中对负超螺旋DNA的强烈偏好,并且揭示了负超螺旋的旋转和扭曲都有利于缠绕组蛋白的DNA的形成。此外,对同一 DNA 模板上的多个核小体的模拟表明,核小体倾向于在原始核小体附近组装。这一对核小体自发形成的理解进展可能有助于深入了解染色质组装的复杂动力学以及控制染色质结构和功能的基本机制。
虽然最近的空间生物学创新推动了对组织组织如何改变疾病的新见解,但以通用且可扩展的方式解释这些数据集仍然是一个挑战。用于发现组织组织中条件特定差异的计算工作流程通常依赖于成对比较或无监督的聚类。在许多情况下,这些方法在计算上是昂贵的,缺乏统计严格,并且对低流行的细胞壁细分市场不敏感,这些细胞壁细分市场仍然高度歧视和预测患者的结果。在这里,我们提出了乳蛋饼 - 一种自动化,可扩展性和统计上健壮的方法,可用于发现在空间区域,纵向样本或临床患者群体中差异富集的细胞壁细分市场。与现有方法相反,乳蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白原将局部利基检测与可解释的统计建模相结合,使用图形邻域来检测差异富集的细胞壁细分市场,即使在较低的患病率下也是如此。在人类组织的硅模型和空间蛋白质组学成像中,我们证明了乳蛋饼可以准确地检测出少于20%的患者样品的频率为0.5%的条件特异性细胞壁细分市场,从而超过了下一个最佳方法,该方法需要患者患者的患病率为60%才能进行检测。为了验证我们的方法并了解肿瘤结构如何影响三重阴性乳腺癌(TNBC)的复发风险,我们使用蛋饼全面介绍了多中心的空间蛋白质组学群体中的肿瘤微环境,这些蛋白质组学同类群体由原发性手术切除术组成,由314例患者分析了200万个细胞,分析了500万个患者。我们发现了始终富集在肿瘤微环境的关键区域的细胞壁细分市场,包括肿瘤免疫边界和细胞外基质重塑区域,以及与患者的统计相关的壁细分市场,包括复发状态和复发性无效生存。大多数差异壁ni(74.2%)是针对未复发并形成富含肿瘤和肿瘤细胞单核细胞,巨噬细胞,APC和CD8T细胞的强大互连网络的患者。相比之下,复发的患者的相互作用网络明显稀疏,并且在B细胞,CD68巨噬细胞和中性粒细胞中富集。我们使用两个独立人群验证了这些发现,观察了相似的细胞相互作用和预测能力。总的来说,这些结果表明,生产性抗肿瘤免疫反应的显着,普遍的特征是由与肿瘤和基质细胞的先天和适应性免疫之间的结构参与网络所定义的,而不是由任何特定的细胞群体。,我们已在https://github.com/jranek/quiche中免费提供作为用户友好的开源Python软件包。