本指南包括针对合成或天然衍生的单链或双链 ONT 的建议,这些 ONT 具有天然或经过修饰的主链或核苷结构,可增加或减少蛋白质的表达和/或功能。所包括的寡核苷酸的例子有反义寡核苷酸、小干扰 RNA、microRNA、转移 RNA、诱饵和适体。免疫刺激性寡核苷酸(例如,通过 Toll 样受体起作用的 CpG 基序)和 CBER 监管产品(例如,DNA/RNA 疫苗、病毒递送的 ONT、信使 RNA 和用于基因编辑的 RNA)不包括在内。如果寡核苷酸本身属于本指南的范围,则包括与其他类型分子(例如,糖类、脂质、肽、抗体)结合的寡核苷酸。
有效提取药物分析物是药物代谢和药代动力学(DMPK)研究的关键方面。这长期用于小分子,仍然适用于寡核苷酸的生物分析。寡核苷酸药物及其代谢产物必须在生物流体和组织样品中进行定量。最新的寡核苷酸药物都经过广泛修饰和共轭。这些修改后的残基和共轭部分会使提取恢复和可重复性复杂化。在这项工作中,我们报告了有关如何实现改进提取的几个关键见解。使用弱阴离子交换(WAX)基于微板的固相萃取(SPE)设备来研究溶剂辅助蛋白酶K样品预处理的方案。直接注射LC-MS定量已证明了所有三种反义寡核苷酸(ASOS)的定量。
并促进寡核苷酸有效载荷的吸收和内化。通过将抗体的细胞和组织选择性与基于寡核苷酸的方法的选择性和效率相结合,Avidity Biosciences 的研究人员已经证明了调节
9:30-9:45 | Sara Spaziani,Tania Caputo-基因疗法的新领域:创新的多模式成像技术(荧光/拉曼),用于自由和纳米卫生员封装的寡核苷酸序列的亚细胞定位9:30-9:45 | Sara Spaziani,Tania Caputo-基因疗法的新领域:创新的多模式成像技术(荧光/拉曼),用于自由和纳米卫生员封装的寡核苷酸序列的亚细胞定位
缩写:AASLD,美国肝病研究协会;ALT,丙氨酸氨基转移酶;ASO,反义寡核苷酸;CAM,衣壳组装调节剂;cccDNA,共价闭合环状DNA;ChAdOx1-HBV/MVA-HBV,编码多种 HBV 抗原的黑猩猩腺病毒和改良痘苗安卡拉病毒载体;CHB,慢性乙型肝炎感染;EASL,欧洲肝脏研究协会;ETV,恩替卡韦;GalNac 共轭 LNA SSO,N-乙酰半乳糖胺共轭锁核酸单链寡核苷酸;HBcrAg,乙型肝炎核心相关抗原;HBeAg,乙型肝炎 BE 抗原;HBsAg,乙型肝炎表面抗原;HBV,乙型肝炎病毒;HCC,肝细胞癌;IFN,干扰素; MDSC,髓系抑制细胞;NA,核苷(酸)类似物;NAP,核酸聚合物;NK 细胞,自然杀伤细胞;NTCP,牛磺胆酸钠共转运多肽;PD-1,程序性死亡受体-1;PDL-1,程序性细胞死亡配体-1;pegIFN α,聚乙二醇化干扰素α;pgRNA,前基因组RNA;siRNA,小干扰RNA;STOP,S-抗原运输抑制寡核苷酸聚合物;TAF,替诺福韦艾拉酚胺;TCR,T 细胞受体;TDF,富马酸替诺福韦二吡呋酯;TGF,转化生长因子;TLR,Toll 样受体。
1的图,来自:Barbour等人。ASN年会2024年; 1。 Chiu等。 前疫苗。 2021; 12:638309; 2。 Yeo等。 Pediatr Nephrol 2018:33:763-777; 3.Hladunewich等。 ionis-fb-lrx,一种反义寡核苷酸,用于补充IgA肾病的补充因子B。 ERA 2024摘要#388; 4。 ionis新闻稿2022:https://ir.ionispharma.com/news-releases/news-release-details/ionis-presents-presents-pressent-posisity-phase-phase-phase-phase-phase-pata-patients-iga-iga-nephropathy; ASO =反义寡核苷酸; fb =因子B; Igan = Iga肾病; CFB =补体因子B; mRNA = Messenger RNA; MOA =行动方式; UPCR =尿蛋白/肌酐比; SC =皮下; Q4W =每4周一次; Gn =肾小球肾炎; ASO因子B与Ionis Pharmaceuticals合作ASN年会2024年; 1。Chiu等。 前疫苗。 2021; 12:638309; 2。 Yeo等。 Pediatr Nephrol 2018:33:763-777; 3.Hladunewich等。 ionis-fb-lrx,一种反义寡核苷酸,用于补充IgA肾病的补充因子B。 ERA 2024摘要#388; 4。 ionis新闻稿2022:https://ir.ionispharma.com/news-releases/news-release-details/ionis-presents-presents-pressent-posisity-phase-phase-phase-phase-phase-pata-patients-iga-iga-nephropathy; ASO =反义寡核苷酸; fb =因子B; Igan = Iga肾病; CFB =补体因子B; mRNA = Messenger RNA; MOA =行动方式; UPCR =尿蛋白/肌酐比; SC =皮下; Q4W =每4周一次; Gn =肾小球肾炎; ASO因子B与Ionis Pharmaceuticals合作Chiu等。前疫苗。2021; 12:638309; 2。Yeo等。 Pediatr Nephrol 2018:33:763-777; 3.Hladunewich等。 ionis-fb-lrx,一种反义寡核苷酸,用于补充IgA肾病的补充因子B。 ERA 2024摘要#388; 4。 ionis新闻稿2022:https://ir.ionispharma.com/news-releases/news-release-details/ionis-presents-presents-pressent-posisity-phase-phase-phase-phase-phase-pata-patients-iga-iga-nephropathy; ASO =反义寡核苷酸; fb =因子B; Igan = Iga肾病; CFB =补体因子B; mRNA = Messenger RNA; MOA =行动方式; UPCR =尿蛋白/肌酐比; SC =皮下; Q4W =每4周一次; Gn =肾小球肾炎; ASO因子B与Ionis Pharmaceuticals合作Yeo等。Pediatr Nephrol 2018:33:763-777; 3.Hladunewich等。ionis-fb-lrx,一种反义寡核苷酸,用于补充IgA肾病的补充因子B。ERA 2024摘要#388; 4。ionis新闻稿2022:https://ir.ionispharma.com/news-releases/news-release-details/ionis-presents-presents-pressent-posisity-phase-phase-phase-phase-phase-pata-patients-iga-iga-nephropathy; ASO =反义寡核苷酸; fb =因子B; Igan = Iga肾病; CFB =补体因子B; mRNA = Messenger RNA; MOA =行动方式; UPCR =尿蛋白/肌酐比; SC =皮下; Q4W =每4周一次; Gn =肾小球肾炎; ASO因子B与Ionis Pharmaceuticals合作
摘要 从寡核苷酸定向诱变 (ODM) 到 CRISPR 系统,基因组编辑工具都使用合成寡核苷酸进行核苷酸的靶向交换。目前,大多数基因组编辑方案依赖于具有体细胞克隆变异和植物再生限制的体外细胞或组织培养系统。因此,我们在此报告了一种用于优化 ODM 的替代植物细胞测试系统,该系统基于将寡核苷酸溶液注射到单倍体玉米幼苗的顶端分生组织区域。使用 5′-荧光素标记的寡核苷酸,我们检测到合成 DNA 分子在茎尖分生组织细胞和叶原基维管束中的积累。为了沉默或敲低体细胞中的八氢番茄红素去饱和酶基因,将带有 TAG 终止密码子的 41 碱基长的单链寡核苷酸注射到玉米幼苗中。我们检测到长出的 M1 幼苗长出了带有白色条纹或浅绿色的叶子。白色条纹的共聚焦显微镜显示,除了叶绿素荧光缺乏的组织区域外,白色条纹中还存在含叶绿素的细胞。对白色条纹的 DNA 样本进行 Ion Torrent 测序表明,八氢番茄红素去饱和酶基因中的 TAG 终止密码子的读取频率为 0.13–1.50%。在将寡核苷酸分子注射到玉米幼苗的茎尖分生组织区域后,出现褪绿异常支持了寡核苷酸分子的诱变性质。所述方案为在幼苗早期阶段表征具有不同化学性质的诱变寡核苷酸的功能以及在植物水平上测试各种处理组合的效率提供了基础。
底漆是一种短的合成寡核苷酸,用于从PCR到DNA测序的许多分子技术。这些引物的设计是具有一个序列,该序列是模板或靶DNA区域的反向补体,我们希望将底漆退火。
DNA由于其高密度和耐力而成为长期数据存储的有前途的候选者。当今DNA存储中的主要挑战是合成的成本。在这项工作中,我们提出了复合图案,该框架工作使用预制基序的混合物作为构建块,以通过缩放逻辑密度来降低合成成本。为了撰写数据,我们会引入桥寡核苷酸组装,这是一种基于复合基序合成寡核体的酶结扎技术。对于序列数据,我们引入了直接的寡核苷酸测序,这是一种基于纳米孔的技术,用于序列寡核苷,而无需组装和扩增。为了解码数据,我们引入了Motif-Search,这是一个新颖的共识呼叫者,尽管合成和测序误差,但仍提供准确的重建。使用所提出的方法,我们提出了一个端到端实验,其中我们以84位/循环的逻辑密度存储文本“ Helloworld”(14-42×改进了对象。)