表1。内容是由领先的科学家和小儿肿瘤学家开发的。它包含一个大型易位/融合面板,用于97个基因,具有超过1,700个融合同工型变体,在儿童肉瘤和白血病中发生了更多的综合性。它还包括针对82个目标的DNA面板,具有全面覆盖相关突变的目标,44个具有全外显子覆盖率(特别是肿瘤supressor基因)和24个CNV靶标。
操作理论。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。7概述。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。7样品和库准备。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。8模板准备和测序。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。8数据分析。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。8数据分析。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。8结果。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。9
Genexus™ 集成测序仪 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 Genexus™ 模板条 3B - GX5™ 和 4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 Genexus™ 测序试剂盒 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ... ................. ...
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宫颈癌、食道癌、肾癌、白血病、黑色素瘤、胰腺癌、肉瘤和肺癌。此外,在 365 例肺癌中发现了上调的 ENO2,包括腺癌、鳞状细胞癌和 LCLC。随后,我们使用 Kaplan-Meier Plotter 数据库分析了 ENO2 在肺癌中的预后潜力。Kaplan-Meier Plotter 数据库是一个广泛应用的在线数据库,用于预测基因表达与肿瘤预后之间的相关性,它拥有 3,452 份肺癌样本的可靠信息。我们的研究结果发现,ENO2 水平与肺癌的总生存期呈负相关。也就是说,ENO2 水平升高预后不良。后来的亚组分析得出结论,ENO2 在肺腺癌患者的预后潜力更为明显。
图3。HRR途径研究,具有oncomine综合测定法。(a)42 HRR途径基因覆盖在Comcomine综合测定法中。(b)oncomine综合测定以及样本级别LOH估计值(y轴)与在相同的FFPE样品上的正交测试(X轴),Oncoscan测定法(X轴)相关。测试样品集由来自各种固体组织类型的FFPE样品组成。Pearson相关(R)显示为关联度量。(c)比较HRR途径中21个基因的基因级LOH精度(一致性定义为在Oncoscan分析和Comcomine综合测定Plus中具有LOH的21个基因的比例),在克隆样品中具有89%的平均精度为89%)。内部研发数据。
3。Heeke S,Benzaquen J,Long-Mira E等。 (2019)“使用离子oncomine™TML和FoundationOne™测定法与常规临床FFPE组织样品比较肿瘤突变负担,以预测肺癌和黑色素瘤患者的持久临床益处 - 一种多元分析,将PD-L1和CD8⁺评估整合。” 2019年3月29日至4月3日,佐治亚州亚特兰大,2019年3月29日至4月3日,美国癌症研究年会。 https://cancerres.aacrjournals.org/content/79/13_supplement/4889Heeke S,Benzaquen J,Long-Mira E等。(2019)“使用离子oncomine™TML和FoundationOne™测定法与常规临床FFPE组织样品比较肿瘤突变负担,以预测肺癌和黑色素瘤患者的持久临床益处 - 一种多元分析,将PD-L1和CD8⁺评估整合。” 2019年3月29日至4月3日,佐治亚州亚特兰大,2019年3月29日至4月3日,美国癌症研究年会。 https://cancerres.aacrjournals.org/content/79/13_supplement/4889
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摘要 - 目的:我们研究了乳腺癌中CDK和预后的表达。材料和方法:吞噬数据库检查了乳腺癌中的CDK基因表达。使用Kaplan-Meier绘图师分析了怀里恶性增长患者CDK的先见优先价值。在GEPIA数据库中分析了肿瘤分期中CDK的表达变化。使用KEGG数据集分析了CDK在DNA复制和细胞周期中的作用。使用CBIOPORTAL数据库,研究了乳腺癌中CDK基因表达与CDK之间的关联。Encori数据库用于研究针对CDK的miRNA。结果:oncomine数据表明,乳腺癌患者中CDK1,CDK5和CDK20的表达被上调,而CDK2和CDK6中的mRNA表达水平降低,CDK3,CDK4和CDK7〜19不是表达数据。GEPIA数据库的结果表明,CDK1,CDK2,CDK4,CDK5,CDK5,CDK7,CDK8和CDK20在乳腺癌组织中的表达水平大于正常组织,并且CDK1和CDK5的表达水平明显差异,而前者中的CDK3和CDK1的表达水平则低于latter latter latter的表达水平。Kaplan-Meier绘图仪数据显示,CDK1,CDK3,CDK4和CDK20与乳腺癌个体的沮丧的预后有关,而CDK8中的mRNA水平与生存后的进展有关。结论:CDK1,CDK2C,CDK4,CDK5,CDK7,CDK8和CDK20可以用作乳腺癌患者的分子标记,或通过靶向CDK来作为乳腺癌治疗的潜在靶标。
背景。靶向药物改善了部分非小细胞肺癌 (NSCLC) 的治疗结果。通过新一代测序 (NGS) 进行分子分析可以筛查组织和血浆中的多种基因变异,但关于其可行性和在现实临床实践中的影响的数据有限。方法。前瞻性纳入连续转诊至我们机构以获得 VISION 试验 (NCT02864992) 潜在资格的晚期 NSCLC 患者。他们已经用标准方法进行了筛查,排除了 EGFR/ALK/ROS-1 阳性病例。使用覆盖 73 个基因的 Guardant360 测试和覆盖 59 个基因的 Oncomine Focus Assay 在血浆和组织中进行 NGS。结果。该研究纳入了 235 名患者。在 209 例 (88.9%) 病例的血浆中进行 NGS;其中 78 例 (37.3%) 也在组织中进行了评估; 26 例(11.1%)仅对组织进行了分析。一半的组织样本被视为