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数据库和本体论论坛：从公共数据库和科学文献中构建知识图，以在化学物质之间提取关联a
动机：代谢组学研究旨在报告与特定实验条件有关的代谢特征（代谢物清单）。这些签名在识别生物标志物或个体的分类中具有重要作用，但是它们的生物学和生理解释仍然是一个挑战。为了支持这项任务，我们介绍了论坛：知识图（kg），提供了基于生命科学数据库和科学文献存储库的化学物质与生物医学概念之间关系的语义表示。结果：在生物学数据上使用语义网络框架使我们能够将基于本体论的推理应用于实体之间的新关系。我们表明，这些新关系提供了不同水平的抽象，并可以为新假设打开道路。我们使用富集分析估算每个提取关系，明确或推断的统计相关性，并将它们实例化为KG中的新知识，以支持结果解释/进一步的查询。可用性和实现：浏览和下载提取的关系的Web接口，以及直接探测整个论坛kg的SPARQL端点，可在https：//forum-webapp.semantic-metabolo mics.fr上获得。可以在https://github.com/emetabohub/forum-疾病中获得复制Triplestore所需的代码。联系人：clement.frainay@inrae.fr补充信息：补充数据可从BioInformatics在线获得。