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大脑不是精神上的！人类生物中的神经元和免疫细胞加工
在过去的几十年中，已经做出了明显的努力，以了解大脑中神经机制为心理和认知过程的基础。本文认为，理解人类认知本质的前途有希望的方法是从关注神经基础上的普遍图片中缩小。它考虑了神经元如何与其他类型的细胞（例如免疫）协同起作用，以弥补整个人类有机体的生物学自我组织和适应性行为。我们专门将免疫细胞加工作为关键参与者，以补充神经元加工，以在不断变化的环境中实现成功的自组织和适应人体的适应。我们概述了关于“基础认知”的理论工作和经验证据，挑战了只有大脑中的神经元细胞具有“学习”或“认知”的独家能力的观念。对细胞而不是神经的关注，大脑加工强调了一种观念，即环境中对浮动的敏感反应需要精心制作的生物生物体多个组织水平上的多个细胞和身体系统的编排。因此，认知可以看作是分布在一系列复杂的蜂窝（例如，神经元，免疫等）和网络系统中的动态信息处理的多尺度网络，在整个身体上工作，而不仅仅是在大脑中。最终，本文旨在基于根本性的说法，即不应仅将认知单独用于一个系统，即大脑中的神经系统，无论后者多么复杂。
使用蛋白质语言模型在模型生物中解码蛋白质组功能信息
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2024年2月15日发布的此版本中显示此版本的版权持有人的预印本。 https://doi.org/10.1101/2024.02.14.580341 doi：Biorxiv Preprint
通过新型基因组技术开发的欧盟法律的状态
***********波兰科学院法学研究所，波兰。作者宣布，这项研究是在没有任何商业或财务关系的情况下进行的，这些关系可能被解释为潜在的利益冲突。这项工作得到了根特大学，比利时，布鲁塞尔，比利时的Vrije Universiteit，瑞典战略环境研究基金会（MISTRA），通过Mistra Biotech公共研究计划以及生物技术与生物学科学研究委员会（BBSRC）通过Grant BB/P013511/1 The Johnses Center。作者热烈地感谢以下同事对本文的早期草案的非常有价值的评论和建议：汉斯·乔治·迪德勒（Hans-Georg Dederer），戴维·汉堡（David Hamburger），塞伦·马克·詹森（Soeren Mark Jensen），海伦·马克拉德（Helen Marquard）和伊娃·斯托格（EvaStöger）。适用通常的免责声明。
回顾具有潜在应用在水产养殖中的光合海洋生物的抗菌肽
摘要：水产养殖产量处于创纪录的水平，估计在未来几年中会增加。但是，这种产量可能会受到病毒，细菌和寄生虫产生的传染病的负面影响，从而导致鱼类死亡率和经济损失。抗菌肽（AMP）是很小的植物，可能有望替代抗生素，因为它们是动物对各种病原体的第一道防线，并且没有负面影响。它们还显示了其他抗氧化剂或免疫调节功能等其他功能，这使它们成为水产养殖的强大替代品。此外，AMP在天然来源中高度可用，并且已经用于牲畜农业和食品行业。光合海洋生物可以在各种环境条件下以及在极具竞争性的环境下生存，这要归功于它们的柔性代谢。出于这个原因，这些生物代表了一种强大的生物活性分子来源，即包括AMP在内的营养素和药物。因此，在这项研究中，我们回顾了来自光合海洋生物体的AMP的当前知识，并分析了它们是否适合在水产养殖中使用。
转基因生物：调整监管框架以适应不断发展的基因组编辑技术
摘要 生物体基因改造已成为农业、工业和生物医学应用研究和开发的一项繁荣活动。自第一批通过转基因技术获得的转基因产品进入市场以来，已经过去了三十年。世界各地的监管框架未能跟上新技术、监测和安全问题的步伐。新的基因组编辑技术为基因改造的开发和使用开辟了新途径，给这些框架带来了压力。在这里，我们讨论了生物体/转基因生物定义的含义、获取这些生物体的不断发展的基因组编辑工具以及世界各地的监管框架如何考虑到这些技术，重点是农作物。最后，我们将本综述扩展到商业作物之外，以解决生物体在食品工业、生物医学应用和气候变化解决方案中的用途。关键词：生物医学、气候变化、食品、转基因生物 (GMO)、新育种技术 (NBT)、监管框架、转基因
将基因组编辑生物作为转基因生物进行监管会对农业、社会和经济产生负面影响
7 月 25 日，欧洲法院 (ECJ) 裁定，通过 CRISPR 等现代诱变方式获得的生物体不属于欧盟转基因立法的豁免范围。因此，基因组编辑生物体必须遵守欧盟转基因立法的严格条件。这与法院总检察长在今年 1 月发表的意见形成了鲜明对比，该意见建议作出相反的裁决。我们对法院纯粹基于过程的立法解释感到遗憾，并得出结论，欧盟转基因立法没有正确反映当前的科学知识状态。通过精准育种进行简单和有针对性的基因组编辑且不含有外来基因的生物体至少与通过传统育种技术衍生的生物体一样安全。因此，我们呼吁所有欧洲当局迅速对这一裁决作出回应，并修改立法，使含有此类编辑的生物不受《转基因指令》规定的约束，而是属于适用于传统育种品种的监管制度。从长远来看，应彻底修订《转基因指令》，以正确反映生物技术的科学进步。欧洲和全球农业必须变得更加可持续的原因有很多。农业实践给我们的环境带来压力，我们面临着不断增长的人口（到 2050 年估计将增加到 100 亿张嘴要养活），气候变化给农作物带来了越来越大的挑战——2018 年夏季的气候测量强调了这一信息的紧迫性。时间是我们没有的奢侈品。减少农业对环境的影响并使农业适应不断变化的气候势在必行。例如，对快速变化和更恶劣环境更具耐受性的作物对于未来粮食生产方法的成功至关重要。为了应对这样的挑战并有效实现粮食生产目标，我们需要利用所有可用的知识和技术手段，因此也需要新技术，特别是生物技术。该领域的最新突破之一是精准育种，这是一种基于基因组编辑的创新作物育种方法。通过精准育种开发的作物可以帮助农民减少化肥和杀虫剂等投入。精准育种还可以考虑到特定地区的环境因素，使作物适应特定区域。例如拥有抗旱植物意味着无需增加耕地面积就能提高农作物产量。
微生物与线虫：通过拮抗生物对生物防治的见解，以控制根结线虫
摘要：root-inkot nematodes（meloidogyne spp。）是久坐的内寄生虫，在全球农作物上造成严重的经济损失。由于欧盟在甲胺的应用中的规定，现在至关重要的是发现对线虫管理的环保控制策略。生物防治是一种安全可靠的方法来管理这些多晶金线虫。生物防治剂不仅控制着这些寄生线虫，而且还改善了植物的生长并诱导植物对各种生物胁迫的全身耐药性。种类繁多的生物，例如细菌，真菌，病毒和原生动物，生活在其自然模式下，作为线虫拮抗剂。各种评论文章总体上讨论了生物防治在线虫管理中的作用，但是对根结线虫生物防治的特定综述尚未详细详细介绍。因此，这篇评论通过讨论其重要的已知拮抗剂，作用方式和相互作用来重点关注根结线虫的生物控制。
Genewatch UK对Defra对基因编辑的消除管制的咨询的回应
2021年1月，英国政府食品和农村事务部（DEFRA）发表了一项提议，以削弱法规，以便某些类型的未标记的遗传修饰（GM）植物（GM）植物，动物和食物可以在英格兰生产，并在环境中生产，而没有适当的风险评估或任何公众的信息，就可以在环境和食物链中生产食物链。1咨询的第一部分的重点是使用一组新的基因工程技术创建的转基因生物，称为基因编辑。这种反应是对Defra咨询的第一个（基因编辑）部分。咨询的第二部分（此处未解决）涵盖了其他GMO的进一步放松管制。Defra在大流行期间在线咨询，当许多没有互联网联系的人无法参加，其他人（例如，关键工人和家庭教育的人）将没有时间。因此，在许多人无法发表意见的时候，政府正在提议对英国饮食以及对环境的食物进行重大变化。这些提案对粮食和农业领域的企业具有重大影响，但许多其他部门都可以释放基因编辑的生物，违反大多数国家的监管标准，例如林业和赛马。政府的提议（仅覆盖英格兰）尚未正确考虑，并提出了需要解决的许多重要问题。下面突出显示以下问题：
宿主操纵、基因编辑和非传统模型生物：行为研究的新前沿？
就已知的生物多样性和生活方式而言，昆虫和寄生虫主宰着生物圈。因此，昆虫在许多宿主-寄生虫系统中发挥作用，要么作为寄生虫，要么作为宿主，或者两者兼而有之。此外，许多此类系统涉及适应性寄生虫诱导的宿主表型变化（通常是行为或形态），这通常称为宿主操纵。虽然在过去几十年中已经描述了许多宿主操纵系统，但支撑宿主表型变化的近因机制仍然很大程度上未知。鉴于宿主-寄生虫系统密切的共同进化历史，梳理宿主操纵中涉及的复杂生化反应网络需要整合各种互补技术。从这个角度来看，我们强调宿主操纵的多学科研究的重要性，例如高通量测序方法（基因组学和转录组学）以寻找在操纵事件期间激活的候选机制。然后，我们认为基因编辑技术，特别是 CRISPR-Cas9 系统，是测试候选机制在寄生虫和宿主中功能作用的有效方法。最后，鉴于迄今为止发现的独特宿主-寄生虫系统的多样性，确实有巨大的潜力来创建新的非传统模型系统，从而大大扩展我们测试行为和行为调节基本方面的能力。
评论文章 C1 气体发酵产乙酸底盘生物的遗传和代谢工程挑战
石油和石油资源的开采和利用以及将其转化为基本燃料和化学品，对环境产生了严重影响，导致全球变暖和气候变化。此外，化石燃料是有限的资源，很快就会短缺。因此，研究工作越来越侧重于开发化学品和燃料生产的可持续替代品。在这种情况下，依赖微生物的生物过程引起了特别的兴趣。例如，产乙酸菌使用 Wood-Ljungdahl 途径以单碳 C1 气体（CO 2 和 CO）作为唯一碳源生长，并产生有价值的产品，如醋酸盐或乙醇。因此，这些自养生物可用于大规模发酵过程，从丰富的温室气体中生产工业相关化学品。此外，最近已经开发出遗传工具，通过合成生物学方法改进这些底盘生物。本综述将重点介绍遗传和代谢改造产乙酸菌的挑战。它将首先讨论这些生物体中成功进行 DNA 转移的物理和生化障碍。然后将介绍目前为几种产乙酸菌开发的遗传工具，这些工具对于菌株工程巩固和扩大其产品目录至关重要。最后将介绍用于代谢工程目的的最新工具应用，这些工具允许重新定向代谢通量或生产非天然化合物。