基于 CRISPR/Cas9 的基因编辑的引入大大加速了治疗性基因组编辑。然而,CRISPR/Cas9 蛋白的脱靶 DNA 切割阻碍了其临床转化,从而阻碍了其作为可编程基因组编辑工具的广泛使用。尽管已经开发出具有更好错配识别能力的 Cas9 变体,但它们的靶向 DNA 切割率明显较低。在这里,我们将来自新凶手弗朗西斯菌 (FnCas9) 的更特异性的天然 Cas9 与最广泛使用的 SpCas9 蛋白的动力学进行了比较。对两种 Cas9 蛋白的游离形式和 gRNA 结合形式进行了长期原子 MD 模拟,并比较了它们的域重排和与 gRNA 的结合亲和力,以揭示 FnCas9 蛋白特异性增强的可能原因。与 SpCas9 相比,FnCas9 与 gRNA 的结合亲和力更大、域静电更大、波动性更大,这可以解释其特异性增强和对错配的容忍度更低。
产品描述:Akron的重组NLS-SPCAS9-NLS(CAS9)核酸酶解决方案均遵循所有相关的辅助材料指南。下游纯化过程使用多步矫正方法,不使用亲和力标签,以最大程度地减少外源杂质,并确保提供高度纯化和活性的物质以进行进一步的制造应用。Akron的Cas9核酸酶是单链,162 kDa,非糖基化的DNA核酸内切酶,在大肠杆菌中表达。氨基酸序列来自链球菌链球菌,蛋白质结构已通过在蛋白质的N-和C-末端添加核定位序列(NLS)改变了蛋白质结构。将NLS添加到蛋白质结构中确保您的RNP复合物有效地导入细胞核。
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摘要:CRISPR-Cas9技术的出现彻底改变了基础和转化生物医学研究。为了使Cas9核酸酶发挥基因组编辑活性,通常将源自猿猴病毒40(SV40)T抗原的核定位信号(NLS)作为基因融合体安装,以引导细胞内的Cas9蛋白进入细胞核。值得注意的是,先前的研究表明,多个SV40 NLS融合可以提高Cas9衍生的基因组编辑和碱基编辑工具的靶向活性。此外,多NLS融合可以以组成性表达和直接递送Cas9-引导RNA核糖核蛋白(RNP)复合物的形式增加Cas9的细胞内活性。然而,NLS融合与细胞内Cas9活性之间的关系尚不完全清楚,包括活性对NLS融合数量或组织的依赖性。在本研究中,我们构建并纯化了一组在蛋白质的 N 端或 C 端含有 1 至 4 个 NLS 重复序列的化脓性链球菌 Cas9 (SpCas9) 变体,并系统地分析了多 NLS 融合对 SpCas9 RNPs 活性的影响。我们发现,多 NLS 融合可以提高脂质转染或核转染 Cas9 RNPs 的细胞内活性。重要的是,多 NLS 融合可以增强 SpCas9 RNPs 在原代细胞、干细胞/祖细胞和小鼠胚胎中的基因组编辑活性。
马萨诸塞州波士顿的波士顿儿童医院的蜂窝和分子医学计划B哈佛医学院儿科,马萨诸塞州波士顿02115; C病理学系,哈佛医学院,马萨诸塞州波士顿,马萨诸塞州02115,D Lab Medicine和Stem Cell计划,波士顿儿童医院,波士顿,马萨诸塞州02115; E中国医学科学院血液和血液疾病医院实验血液学的国家主要实验室,中国医学科学院和北京联合医学院,中国300020;贝丝以色列执事医学中心,哈佛医学院,马萨诸塞州波士顿,02115; G,马萨诸塞州波士顿,波士顿儿童医院医学系新生儿医学和表观遗传学计划的G分区,马萨诸塞州02115; h马萨诸塞州波士顿哈佛医学院的细胞生物学系02115; I Laboratorio deNeuroinmunobiología,Dewartamento de Medicina分子Y Bioprocesos,Instituto deBiotecnología,梅西哥62210 Cuernavaca,México的NacionalAutónomadeMéxico; JenéRachouInstitute,Oswaldo Cruz Foundation,30190-002 Belo Horizonte,巴西; k北京北京北京大学生物信息学中心,生命科学学院;北北京北京北京大学统计科学中心
锝化学的进展促进了新型99mTc放射性药物的开发;另一方面,探测器技术的发展和影像设备中重建算法的进步使得SPECT的空间分辨率更接近PET,而灵敏度并没有降低[27]。这些进展为SPECT/CT技术带来了新的发展机遇。此外,纳米抗体探针的最佳成像时间也与半衰期完美一致
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寡核苷酸和基于序列的试剂 PCR 引物 本研究 从 IDT ssODN 合成 Ittiprasert 等人,2019 年和本研究 Ultramer DNA Oligos, 从 IDT 合成向导 RNA Ittiprasert 等人,2019 年和本研究 从 IDT 合成 化学品、酶和其他试剂 Alt-R® CRISPR-Sp HiFi Cas9 酶 V3 Integrated DNA Technologies 1081060 Alt-R® CRISPR-AsCas12a 酶 V3 Integrated DNA Technologies 1081068 DNAzol® ES 试剂 Molecular Research Center DN127 RNAzol® RT 试剂 Molecular Research Center RN190 Opti-MEM FisherScientific Gibco™ 31985062 DMEM FisherScientific 88364 胎牛血清 FisherScientific Gibco™ 26140079 100x 青霉素-链霉素-两性霉素 B FisherScientific SV30079.01 NucleoSpin® 凝胶和 PCR 纯化 Takara 740609
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