antoea物种在陆地和水生环境中都是无处不在的细菌,并且已经在动物,昆虫和人类中分离出来,尽管31种公认的物种(1)中的大多数都与植物相关(2)。先前在人类感染中报道的pantoea物种包括P. groclomer- Ans,P。ananatis,P。Brenneri,P。Calida,P。Comcpicua,P。dispersa,P。Eucrina和P. septica; P. groclomerans是最常见的(2)。P。Stewartii是Stewart在甜玉米和玉米中的枯萎病因,于1890年代后期首次被发现。研究人员根据宿主范围提出了2个亚种,基于宿主范围:Stewartii和Indologenes(3)。与Stewartii的亚种不同,亚种元素对玉米是非致病性的,而是在其他具有农艺意义的农作物中引起疾病,例如Foxtail Mil-Let-Let,Pearl Millet和洋葱。由于这种生物体(尤其是Stewartii的亚种)对经济上关键的作物构成风险,因此许多国家将P. stewartii归类为隔离有机体(4,5)。
摘要:亚马逊雨林是物种数量和众多的近卫生关系中的超多样性生态系统。为了表征占主导地位和经济重要的亚马逊物种,巴西坚果树(Bertholletia Excelsa Bonpl。),在基因组水平上,从单个个体的叶子中引发了高覆盖的长阅读测序数据。基因组组装揭示了一个意外的发现:两个可以分配给染色体的圆形重叠群和pantoea stewartii菌株的质粒。比较基因组学表明,该菌株属于独立元素亚种,并与从新热带棕榈bactris gasipaes kunth的患病叶片中分离出的其他菌株高度同步。对致病性相关基因的研究揭示了质粒中没有整个III型分泌系统基因簇,质粒否则与已知在Dracaena Sanderiana Mast中引起疾病的分离物的质粒高度相似。相反,检测到与植物生长有关的几种基因,包括参与吲哚-3-乙酸(IAA)产生的基因,磷酸盐溶解和辅助载体的生物合成。总而言之,我们报告了未经培养的Stewartii亚种的基因组。与巴西坚果树相关的植物菌株,并可能是植物生长的细菌。
博士项目建议书:开发具有特定微生物生物刺激素联盟(MBC)的生物活性肥料(BAF),以促进更可持续的农业和更绿色的经济,减少化学肥料的使用 PIGNI GIACOMO 8 10 18 Non ammesso PaGIPa:参与发病机制的泛菌基因
氢氧化铜是一种广谱铜杀菌剂,通常用于控制作物真菌和细菌性疾病。除了控制靶向病原体外,氢氧化铜还可能影响植物层生态系统中其他非靶向微生物。在施用杀菌剂后的四个时间点(在喷涂之前和5、10和15天之前),通过使用Illumina高通量测序技术和生物学工具研究了患病和健康的烟草微生物微生物对氢氧化铜应激的反应。结果表明,健康群体的微生物组社区比疾病组更受影响,而真菌群落比细菌群落更敏感。疾病组中最常见的属是替代植物,波兰菌,cladosporium,pantoea,ralstonia,pseudomonas和sphinghomonas;在健康组中,这些是替代人,cladosporium,symmetrospora,ralstonia和pantoea。喷涂后,健康和患病组的真菌群落的α多样性在5天后下降,然后显示出越来越多的趋势,健康组在15天时显着增加。健康和患病群体中细菌群落的α多样性在15天时增加,而健康的组有显着差异。在健康和患病的叶片的真菌群落中,替代品和cladosporium的相对丰度降低了,而波动脉症,stagonosporopsis,Symmetroppora,Epicoccum和Phoma的相对丰度则增加。Pantoea的相对丰度首先减少,然后增加,而Ralstonia,Pseudomonas和Sphingomonas的相对丰度首先增加,然后在健康和患病的叶片的细菌群落中减少。虽然氢氧化铜降低了致病真菌替代性和cradosporium的相对丰度,但它也导致有益细菌(例如放线菌和Pantoea)的降低,并增加了潜在的病原体,例如波里米亚和稳定性。用氢氧化铜处理后,患病组的代谢能力得到了改善,而健康组的代谢能力得到了显着抑制,随着应用时间的延长,代谢活性逐渐恢复。结果揭示了在氢氧化铜应激下,微生物群落组成和健康和患病的烟草的代谢功能的变化,为未来对植物层的微生态保护的研究提供了理论基础。
微生物对植物病的控制是指生物控制。在这项研究中,三种细菌菌株pantoea groclomerans b1,serratia plymuthica b2和proteus mirabilis b3是最初从饮用水来源分离出的细菌菌株,埃及埃及的El-Gharbia省的饮用水。孤立的细菌菌株的起源包含三种饮用水来源:尼罗河,水龙头和地面。这种水产养殖具有细菌的商业化产生了经济利润,而水含有细菌产生的拮抗材料对土壤传播的真菌产生不利影响。这些水源在农业中非常重要,尤其是在灌溉作物时。在体外,pantoea grogmerans b1,serratia plymuthica b2和proteus mirabilis b3检查了其针对土壤传播的真菌根源索拉尼的拮抗活性,这是几种工厂的幼苗湿润的真菌。serratia plymuthica b2表现出对真菌生长的高水平。另外,评估了三种细菌菌株的生产裂解酶(几丁质酶,β-1,3 - 葡萄糖酶),铁质酸(SA)和氢氰化氢(HCN)。所有拮抗材料生产分别记录了菌株B2和B1的高级值。观察到了三种细菌菌株对R. solani的拮抗潜力与其ß-1,3 - 葡萄糖酶,SA和HCN的水平之间的最高关系。提到的细菌菌株的抗真菌代谢产物被认为有助于这些细菌的拮抗活性。
2.4。我们希望澄清一下,我们2022年9月26日的在线发现指出,“ IP-PA1”一词并未以某种方式表示贸易来源。而是以描述性的方式使用了术语“ IP-PA1”来指代来自Pantoea groglomerans的脂多糖1。我们还对Google Scholar进行了新的搜索(搜索是在提交日期之前使用搜索参数进行的),并指出IP-PA1在其他文章(似乎是由与申请人隶属申请人隶属的研究人员撰写的)中使用的,以描述性的方式参考脂多糖。我们认为,Google Scholar的结果表明,相关科学界的研究人员对IP-PA1的潜在利益和应用有很大的兴趣,他们将IP-PA1视为描述性术语,而不是贸易来源的指标。
摘要:陆地生态系统在土壤抵抗组的形成和抗生素耐药细菌的传播中起着至关重要的作用。对各种陆地生态系统中的土壤微生物群落,其结构,完整性和抗生素耐药性(AR)水平进行了全面研究。总共从研究的生态系统中分离出389个主要细菌菌株,其中57个对抗生素具有抗性,抗生素耐药性水平超过70%。原始森林的土壤微生物组的特征是抗生素抗性的细菌含量较低。只有两个物种,蜡状芽孢杆菌和pantoea凝集群显示出对抗生素的高耐药性。在药用植物的农业生态系统的土壤中,在106种细菌菌株中,在13种中发现了对抗生素的高度耐药性。已经确定,抗生素抗性细菌的数量在被Enro floxacin污染的农业生态系统的土壤中最高。在190个测试的细菌菌株中,有42个(22%)的特征是高水平的抗生素耐药性。因此,土壤生态系统是抗生素耐药菌形成和扩散的关键联系,这对人类是一种潜在的危险。为了降低人类AR的风险,必须采取适当的措施来管理土壤微生物组并避免用抗生素污染土壤的污染。
无花果果实是生物活性化合物的重要来源,例如类黄酮,苯甲醛,生物碱,萜类化合物和苯酚,它们是抗菌无花果果实作为类黄酮的来源,具有抗生素活性,与内部生物学植物的作用不可分割,使得内属菌丝的作用不可分割。研究包括内生细菌在内的微生物的多样性并不容易,因为环境中有99%的微生物是不可培养的物种,因此需要进行分析,能够研究而没有称为宏观概念的内生细菌的多样性。这项研究的目的是确定在这些内生细菌中有用的无花果水果和预测基因中内生细菌的多样性。研究方法指的是无花果组织DNA提取,16S rRNA基因扩增,电泳,下一代测序和使用操作分类学单元进行分析的研究方法。The results of species-level endophytic bacterial diversity obtained on Fig fruit (Ficus carica L.) varieties Gren Yordan are Weissella ghanensis, Weissella paramesenteroides, Ralstonia pickettii, Leuconostoc citreum, Pantoea stewartii, Gluconobacter cerinus, Lactococcus lactis.
culex quinquefasciatus蚊子是西尼罗河病毒,登革热病毒和裂谷谷发烧病毒等人畜共患病原体的重要媒介。尽管它们在病原体传播中的作用,但对非洲这些蚊子的全面微生物组研究受到限制,大多数研究都集中在其中肠微生物组上。这项研究通过分析非洲CX的总微生物组来解决这一差距。使用元基因组下一代测序(MNGS)的Quinquefasciatus。该研究产生了71,817和29,908读,读取了CX。Quinquefasciatus和微生物分别识别146个不同的微生物。细菌是最普遍的,所有微生物的占85.6%(125/146),其次是病毒(8.2%,12/146),真菌(4.8%,7/146)和其他真核生物生物(1.4%,2/146)。经常检测到的属包括Rickettsia sp。,Wolbachia sp。,Erwinia sp。,肠球菌Sp。,Pantoea sp。和Providencia sp。Providencia rettgeri,CX的Wolbachia内共生体。Quinque fasciatus和Rickettsia tabaci的内共生体是最丰富的物种之一。值得注意的是,大约7.4%的鉴定微生物是已知的人类病原体。本研究提供了CX的微生物组的概述。quinquefasciatus,突出了共生,共生和致病性微生物,其中一些可能对微生物操纵策略控制蚊子和蚊子 - 传播病原体有用。
摘要:许多芽孢杆菌属物种因能够产生可防止疾病生长的抗菌肽而对植物有益。在本研究中,我们研究了芽孢杆菌3-19菌株及其衍生物在靶向基因组编辑后的拮抗活性。利用CRISPR-Cas9系统特异性地失活了芽孢杆菌3-19基因组中的两个具有抗菌作用的肽基因——芽孢杆菌素 (bac) 和细菌素 (bact),以及编码孢子形成西格玛因子的sig F基因。由于芽孢杆菌3-19基因组中靶基因的失活,对蜡状芽孢杆菌和布伦纳泛菌的抗菌活性降低,其中对芽孢杆菌素的影响明显。当 bac 、 bact 和 sig F 基因失活时,培养物的生长动态发生变化,并且变异菌株的蛋白水解活性较低。通过失活 sig F 基因获得了 B. pumilus 3-19 的无孢子突变体。已经证明,bacilysin 在 B. pumilus 3-19 对土壤微生物的拮抗作用的形成中起着独特的作用。