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表征两个卫星DNA家族在卵形植物病原体植物质体的基因组中
卫星DNA是一类重复序列，在大多数真核生物中的串联重复单元中都组织起来。长期以来被视为selfh dNA，现在提出了卫星序列有助于基因组完整性。尽管由于基因组数据的匮乏和组装高度保守的卫星阵列而尚未在卵菌中研究卫星DNA，但尚未在卵菌中研究卫星DNA。却获得有关卵菌病原体基因组的结构和演变的知识，对于理解适应其环境的机制以及提出有效的疾病控制策略至关重要。phytophthora寄生虫基因组的从头组装是一种重要的卵植物病原体，导致鉴定了几个串联重复的序列的家族，大小，拷贝数和序列保守序列变化。其中，两个大量的家庭，指定为PPSAT1和PPSAT2，显示了卫星DNA的典型特征，并被统称为PPSAT。这两个卫星家族的长度，序列，组织，基因组环境和进化动力学不同。PPSAT1，但不是PPSAT2，呈现了Oomycetes中的同源物。这一观察结果以及PPSAT家族的转录本的表征表明，这些卫星DNA家族可能在这一重要的病原体中起着保守的作用。
遗传工程的美国栗子简介
美国研究人员要求批准在野外种植一种抗疾病的美国栗树。他们称这树称为“亲爱的58”。他们提议使用该GE树代替或“恢复”已被枯萎病（Cryphonectria parasitica）广泛破坏的美国栗子物种。但是，通过基因工程“恢复”了美国栗子的希望有很大的风险，并可能威胁到加拿大和美国正在努力通过支持更高的枯萎病的现有树木的繁殖较高的树木来恢复野生美国栗子的数十年的努力，这些树木使用非ge的方法来培养较高的枯萎病和繁殖树。
自动化的高含量基于微生物行为多样性和分布的表征
背景微生物发展了复杂的系统以响应环境信号。特定分子的梯度改变了微生物行为和环境中的分布。微电位工具现在采用基于自动图像的方法来分析在小时尺度上受控环境中微生物物种的瞬时分布和运动行为，并在某种程度上模仿了宏观条件。此类技术已被采用用于主要针对单个物种的研究。现在必须开发出类似的多功能方法，以针对微生物群落和环境之间的多重和复杂相互作用的特征进行开发。结果，我们为响应环境驱动器的合成混合微生物悬浮液的物种特异性行为提供了一种全面的分步方法。通过使用自动图像分析方法来解决可访问的微流体设备，我们评估了三种形态学上不同的胎尿种物种（phytophthora parasitica，vorticella sicella microstoma，肠杆菌，肠杆菌）对potassium梯度驱动程序的行为反应。使用Trackmate插件算法，我们进行了形态计量学，然后进行运动分析以表征每个微型物种对驱动器的反应。这种方法使我们能够确认这三个物种的不同形状特征，并同时表征了它们对驾驶员的特殊运动适应以及它们的共同交互动力学。结论获得的结果证明了该方法在高空间和时间尺度上筛选混合物种悬架动力学的可行性。通过增加悬浮液的复杂性，可以集成这种方法以支持常规的OMICS方法，从而有助于表征主要驱动因素在微生物群体 - 宿主 - 环境接口之间的运行方式。在目前的进步中，该方法可以整合筛选策略，例如，用于生物防治剂评估，启发基于微栖息地的共殖化的可能的有益性 - 病原相互作用。