为罹患极为罕见、高度侵袭性肿瘤(如高级别神经内分泌宫颈癌 (NETc))的患者寻找新的有效治疗方式仍然是一项尚未得到满足的医疗需求。通过对大量 NETc 患者进行综合全外显子组和 RNA 测序分析,我们确定了反复突变的基因和改变的细胞内信号传导细胞通路,为靶向治疗提供了应用。使用两个完全测序的患者来源的异种移植瘤(ERBB2/PIK3CA/AKT 通路发生改变),我们发现 copanlisib (PIK3CAi)、阿法替尼 (pan - HERi) 和 elimusertib (ATRi) 单药治疗以及 copanlisib/阿法替尼和 copanlisib/elimusertib 的组合可显著抑制 NETc PDX 生长。我们的综合基因分析结合体内临床前验证实验表明,大量高级别 NETc 可能从靶向药物的重新利用中受益。
携带 BRAF V 600 突变的转移性黑色素瘤患者可以用 BRAF 和 MEK 抑制剂(BRAFi/ MEKi)联合治疗,但不可避免地会产生先天和获得性耐药性。预测患者对靶向治疗的反应对于指导临床决策至关重要。我们在此描述了一种高效的患者来源异种移植模型的开发,该模型适用于患者黑色素瘤活检,使用禽胚胎作为宿主(AVI-PDX TM )。在这个体内范例中,我们描述了一种在胚胎皮肤内快速且可重复的患者样本肿瘤植入,保留了关键的分子和表型特征。我们表明,在这些 AVI-PDX TM 中可以可靠地模拟对 BRAFi/MEKi 的敏感性和耐药性,以及与其他药物的协同作用。我们进一步提供概念证明,AVI-PDX TM 在几天内模拟黑色素瘤患者对 BRAFi/MEKi 的反应多样性,因此将其定位为设计个性化药物检测和评估新型组合策略的有价值的工具。
摘要背景:卵巢癌最初对一线化疗有反应。不幸的是,它经常复发并对现有疗法产生耐药性,晚期和复发性卵巢癌的存活率低得令人无法接受。因此,我们假设通过将顺铂化疗与 SW IV-134(一种针对癌症的肽模拟物和细胞死亡诱导剂)相结合,有可能实现更持久的治疗反应。SW IV-134 是一种最近开发的小分子缀合物,将 sigma-2 配体与内在死亡途径激活剂 SMAC(第二线粒体胱天蛋白酶激活剂)的肽类似物(模拟物)连接起来。sigma-2 受体在卵巢癌中过度表达,缀合物的 sigma-2 配体部分促进癌症选择性。缀合物的效应部分有望与顺铂化疗产生协同作用,癌症选择性有望降低假定的脱靶毒性。方法:卵巢癌细胞系分别用顺铂、SW IV-134 和顺铂联合治疗。使用发光细胞活力测定法确定治疗效果。测量 Caspase-3/7、-8 和 -9 活性作为死亡途径激活的补充指标。研究了人类卵巢癌的同基因小鼠模型和患者来源的异种移植 (PDX) 模型对 SW IV-134 和顺铂单药治疗以及联合治疗的反应。以肿瘤生长率和存活率为主要指标来衡量治疗效果。在尸检时评估潜在的药物相关毒性。结果:与体外单一药物相比,联合治疗在多种细胞系中始终优于单一药物。使用发光和基于流式细胞术的检测系统确认了肿瘤细胞死亡的预期机制,例如 caspase 激活。联合治疗在卵巢癌的同基因和基于 PDX 的小鼠模型中均被证明具有优越性。最值得注意的是,在患者来源的卵巢癌异种移植模型中,联合治疗使所有研究动物的已建立肿瘤完全消退。结论:SW IV-134 与顺铂化疗联合使用是一种有前途的治疗选择,值得进一步进行临床前开发和评估,作为晚期卵巢癌女性的治疗方法。关键词:Sigma-2 受体、Sigma-2/SMAC 药物偶联物、顺铂、联合治疗、卵巢癌
摘要背景:卵巢癌最初对一线化疗有反应。不幸的是,它经常复发并对现有疗法产生耐药性,晚期和复发性卵巢癌的存活率低得令人无法接受。因此,我们假设通过将顺铂化疗与 SW IV-134(一种针对癌症的肽模拟物和细胞死亡诱导剂)相结合,有可能实现更持久的治疗反应。SW IV-134 是一种最近开发的小分子缀合物,将 sigma-2 配体与内在死亡途径激活剂 SMAC(第二线粒体胱天蛋白酶激活剂)的肽类似物(模拟物)连接起来。sigma-2 受体在卵巢癌中过度表达,缀合物的 sigma-2 配体部分促进癌症选择性。缀合物的效应部分有望与顺铂化疗产生协同作用,癌症选择性有望降低假定的脱靶毒性。方法:卵巢癌细胞系分别用顺铂、SW IV-134 和顺铂联合治疗。使用发光细胞活力测定法确定治疗效果。测量 Caspase-3/7、-8 和 -9 活性作为死亡途径激活的补充指标。研究了人类卵巢癌的同基因小鼠模型和患者来源的异种移植 (PDX) 模型对 SW IV-134 和顺铂单药治疗以及联合治疗的反应。以肿瘤生长率和存活率为主要指标来衡量治疗效果。在尸检时评估潜在的药物相关毒性。结果:与体外单一药物相比,联合治疗在多种细胞系中始终优于单一药物。使用发光和基于流式细胞术的检测系统确认了肿瘤细胞死亡的预期机制,例如 caspase 激活。联合治疗在卵巢癌的同基因和基于 PDX 的小鼠模型中均被证明具有优越性。最值得注意的是,在患者来源的卵巢癌异种移植模型中,联合治疗使所有研究动物的已建立肿瘤完全消退。结论:SW IV-134 与顺铂化疗联合使用是一种有前途的治疗选择,值得进一步进行临床前开发和评估,作为晚期卵巢癌女性的治疗方法。关键词:Sigma-2 受体、Sigma-2/SMAC 药物偶联物、顺铂、联合治疗、卵巢癌
背景:晚期软组织肉瘤 (STS) 患者预后不佳,且有效的治疗选择很少。同源重组修复 (HRR) 通路缺陷会积累 DNA 修复错误和基因突变,从而导致肿瘤发生。BRCAness 描述的是缺乏种系 BRCA1/2 突变且存在 HRR 缺陷 (HRD) 的肿瘤。然而,STS 中 BRCAness 的特征仍然很大程度上未知。因此,本研究旨在利用全外显子组测序 (WES) 探索 STS 中 BRCAness 的基因组和分子图谱,以找到 STS 治疗的潜在靶点。方法:对来自中山大学附属第一医院的 22 个 STS 样本进行 WES,以揭示可能的基因组和分子特征。然后使用来自 Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据库的 224 个 STS 样本的数据和体外数据验证这些特征。对 BRCAness 的潜在生物标志物进行分析。在 STS 细胞系、细胞系来源的异种移植瘤 (CDX) 和患者来源的异种移植瘤 (PDX) 中评估了 STS 的靶向药物敏感性和化疗药物的联合疗法筛选。结果:与 30 种癌症体细胞突变特征相比,使用非负矩阵分解在 22 个 STS 样本中确定了 HRD 特征的高余弦相似度 (0.75)。单核苷酸多态性表明 22 个 STS 样本中 BRCA1/2 的突变率较低(分别为 11.76% 和 5.88%)。然而,拷贝数变异分析显示染色体普遍不稳定性;此外,54.55% 的 STS 样本(12/22)携带 BRCAness 性状。随后,在来自 TCGA 和体外的 224 个 STS 样本中也检测到了相似的基因组和分子特征。聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)-1 可能是 HRD 和治疗反应的一个有希望的反映。此外,PAR 形成水平被发现与 PARP-1 相关。随后,确定 STS 细胞系对 PARP 抑制剂(PARPi)尼拉帕尼敏感。此外,基于五种常见 PARPis 的筛选试验和阿霉素、异环磷酰胺、达卡巴嗪和替莫唑胺(TMZ)的组合试验,尼拉帕尼和 TMZ 在 STS 细胞系中具有最强的协同作用。尼拉帕尼和 TMZ 组合的协同作用和安全性也在 CDX 和 PDX 中得到证实。
摘要:横纹肌肉瘤(RMS)是儿童中最常见的软组织肉瘤。高级和转移性疾病患者的预后仍然很差,幸存者承受着长期副作用的负担。因此,需要更有效,更毒性的疗法。表面蛋白是基于抗体的疗法的理想靶标,例如双科抗体,抗体 - 药物缀合物或嵌合抗原受体(CAR)T细胞。RMS的特定表面目标很少。 在这里,我们基于表面/膜蛋白的差异离心富集进行了表面体系,并通过LC-MS在六个融合阳性(FP)RMS细胞系,Five Five融合 - 阴性(FN)RMS RMS RMS RMS和三个RMS患者患者患者患者衍生的Xenogogrofts(PDX)上进行检测。 在三个RMS组中总共检测到699个蛋白质。 基于表达水平和与正常MRC-5细胞和成肌细胞表达的比较,然后进行统计分析,突出了已知的RMS靶标,例如FGFR4,NCAM1和CD276/B7-H3,并揭示了AGRL2,JAM3,JAM3,JAM3,MEGF10,MEGF10,GPC4,gpc4,CADM2,CADM2,CADM2,cadm2,rem nime。 在RMS组织中研究了 L1CAM的表达,并在80%以上的肺泡RMS肿瘤中观察到了强L1CAM表达,这使其成为基于抗体RMS抗体疗法的可行靶标。RMS的特定表面目标很少。在这里,我们基于表面/膜蛋白的差异离心富集进行了表面体系,并通过LC-MS在六个融合阳性(FP)RMS细胞系,Five Five融合 - 阴性(FN)RMS RMS RMS RMS和三个RMS患者患者患者患者衍生的Xenogogrofts(PDX)上进行检测。在三个RMS组中总共检测到699个蛋白质。基于表达水平和与正常MRC-5细胞和成肌细胞表达的比较,然后进行统计分析,突出了已知的RMS靶标,例如FGFR4,NCAM1和CD276/B7-H3,并揭示了AGRL2,JAM3,JAM3,JAM3,MEGF10,MEGF10,GPC4,gpc4,CADM2,CADM2,CADM2,cadm2,rem nime。L1CAM的表达,并在80%以上的肺泡RMS肿瘤中观察到了强L1CAM表达,这使其成为基于抗体RMS抗体疗法的可行靶标。
患有DS的儿童还表现出由于CHE Maperapy后的感染和毒性而引起的治疗相关死亡率增加,复发后的累积风险更高,而复发后的累积较低。4这种情况强调了开发更有效和目标疗法以改善这些弱势儿童的生存和护理质量的迫切需求,这些弱势儿童的生存率和质量通常与21三体疾病有关的额外的共同辅助性,这使他们的临床管理变得复杂。靶向方法和免疫疗法对小儿白血病的有希望的结果。5因此,需要开发新的DS-ALL模型来快速提高药物发现并完善现有的治疗策略。我们最近建立了所有患者衍生的异种移植物(PDX),并证明,使用MEK抑制剂与常规治疗相结合的DS-ALL中靶向的靶向躯体改变具有改善这些儿童预后的可能性。6靶向由21染色体副本副本引起的剂量敏感机制也是一个深入研究的领域。7-9因此,使用EHT1610或其直接靶标FOXO1和STAT3对染色体21激酶DYRK1A的抑制作用在体外和体内都显示出有希望的细胞毒性作用。8
sfRon 激酶是卵巢癌的重要治疗靶点,可显著促进肿瘤生长和疾病进展。我们推断,抑制 sfRon 通路的多激酶可能是实现持续抗肿瘤反应的有效策略,同时可防止治疗耐药性。我们对体外 sfRon 信号传导进行了详细分析,并证明 S6K1 是 sfRon 表达卵巢肿瘤中多激酶靶向策略的关键组成部分。我们选择了 AD80 化合物,该化合物靶向 sfRon 通路内的几种激酶,包括 AKT 和 S6K1,并将其功效与选择性靶向 sfRon 或 PI3 激酶的抑制剂进行了比较。使用人类卵巢异种移植和临床相关的患者来源异种移植 (PDX),我们证明单药 AD80 的体内治疗比标准化疗(顺铂/紫杉醇)或 BMS777607 直接抑制 sfRon 激酶的效果更佳。我们的研究结果表明,表达 sfRon 的卵巢肿瘤最有效的治疗方法是同时靶向 AKT 和 S6K1 的多激酶抑制剂,例如 AD80,这可产生长期抗肿瘤反应并防止转移发展。
* 通讯作者:Kimberly Stegmaier 博士(Kimberly_stegmaier@dfci.harvard.edu),丹娜法伯癌症研究所,450 Brookline Avenue,波士顿,MA 02215,电话 617-632-4438。^ 这些作者对这项工作做出了同等贡献。# 当前地址:默克研究实验室,33 Avenue Louis Pasteur,波士顿,MA 02115 作者贡献 SL 和 CL 构思了这项研究,设计和进行了实验,分析了数据,解释了结果并撰写了手稿。NKS 和 BKAS 设计并进行了实验,分析了数据并解释了结果。AR 和 AC 进行了体内研究,分析了数据并解释了结果。NVD、GK 和 STY 设计了 CRISPR 库。NVD 协助进行 DepMap 数据分析。STY 协助进行条形码实验并解释结果。 MK、CW、SM 和 BA 提供技术协助、分析数据并解释结果。TNM 和 JR 协助进行 BH3 分析实验、分析数据并解释结果。JDM 和 AL 提供资源支持和智力投入。FP 协助进行筛选数据分析。LL 和 MW 提供 PDX 资源并协助开发 PDX-Cas9 模型。JT 和 KS 构思了这项研究、设计了实验、解释了结果、监督并资助了这项研究。所有作者都阅读、编辑并批准了最终稿件。
图 3.左图:体内疗效研究总结。上述所有研究中的剂量范围为每日 2 至 4 mg/kg,通过口服管饲法给药。肿瘤生长抑制 (TGI) 使用公式 TGI = [1 - (TVt f - TVt 0 ) / (TVc f - TVc 0 )] × 100% 计算,其中 TVt f 为最后一天或最后一天治疗组的平均肿瘤体积 (TV),TVt 0 为治疗第 0 天治疗组的平均 TV,TVc f 为最后一天或最后一天对照组的平均 TV,TVc 0 为治疗第 0 天对照组的平均 TV。回归确定为最终肿瘤体积或生物发光读数小于研究开始时肿瘤体积或生物发光读数的动物百分比。右图:皮下植入的 HCC4006 通过口服管饲 (PO) 每天治疗一次 (QD),持续 28 天。用卡尺测量肿瘤,并在指定日期对小鼠进行称重。使用动物的最终肿瘤体积计算完全缓解 (CR),如果测量结果小于 30mm 3 则视为完全缓解。LoF,功能丧失;PDX,患者来源的异种移植;CDX,细胞系来源的异种移植;IC,颅内。