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使用数据搜索特定靶标的肽粘合剂 - 1标题：来自... 的生成全脑动力学模型 一种新型的人类多能干细胞基因激活系统将IGFBP2鉴定为造血祖细胞生产的介体，体外 用生成人工智能解锁从头抗体设计 活化的植物NRC4免疫受体形成六聚体抵抗 异常的非典型NF-κB信号传导重新编程表观基因组景观，以驱动多发性骨髓瘤的致癌转录组 雄性大鼠的可卡因敏化需要激活雌激素受体 上下文样本：通过样本和相关元数据收集支持欧洲生物多样性的参考基因组
在大约1.4亿31蛋白序列上预估计的生成蛋白语言模型在方向上进行了微调，以生成具有所需32个特性和结合特异性的肽。随后的多级结构屏幕 - 33 ins-33将肽候选肽的合成分布空间定期降低至34个识别真实的高质量样品，即在Sil-35 ICO阶段处于潜在的肽粘合剂。与分子动力学模拟配对，需要在湿lab实验中验证的候选36的数量从超过37220万降至16。这些电势粘合剂的特征是增强的酵母38显示器，以确定表达水平和与目标的结合亲和力。39个结果表明，只有十几个候选者需要表征以获得40种具有理想结合强度和结合特异性的肽粘合剂。总体而言，这项41个工作基于生成的42 ne-Guage模型实现了高效且低成本的肽设计，从而将从头蛋白设计的速度提高到了前所未有的43级。提议的管道是可自定义的，即适合于仅修饰的44个多个蛋白质家族的快速设计。45
氨基酸组成驱动肽聚集
图1：使用在线UV模块收集的分析数据可实现数据驱动的方法进行合成分析。a）AFPS可以精确监测反应动力学，这与序列的聚集有关。b）在线紫外线痕迹中的聚集被特征在于脱落峰的扩大。聚集通过以下公式计算的聚合因子来量化：AF = WN - HN。wn：最大高度的一半，正常为第一个峰，wn：峰高到第一个峰。如果AF> 20，则将序列视为汇总。c）聚集是由生长的肽链之间的β-呈驱动的。d）利用合成过程中收集的在线紫外线数据，以预测聚集的发生和单个氨基酸的贡献。
肽融合提高主要编辑效率 1
Prime editing 是一种基于 CRISPR 的“搜索和替换”技术，可在没有双链断裂 (DSB) 或供体 DNA 模板 1 的情况下，在哺乳动物细胞中介导靶向 32 插入、删除和所有可能的碱基对碱基转换。Prime editing 34 酶 (PE2) 由与工程逆转录酶 (RT) 融合的 SpCas9 切口酶组成。35 PE2 通过 Prime editing 向导 RNA (pegRNA) 被招募到目标位点，该 RNA 除了标准基因组靶向间隔区和 SpCas9 结合发夹结构外，还包含 3' 序列，37 该序列充当融合 RT 的模板，以在一条切口 DNA 链上合成编程的 DNA 序列。当细胞 DNA 修复机制修复断裂的链时，这种 RT-39 延伸片段会与未编辑的片段竞争，而编辑后的序列有时会取代基因组中的原始序列 1,2。41
针对肽域设计新颖的双重
在37°C。 孵育30分钟后，将细胞用冰冷的PBS洗涤三次，以停止肽样品的内在化。 要观察新设计的纳米颗粒的线粒体靶向能力，将细胞与mito-tracker（绿色; 1 µm）进一步孵育20分钟，并用冰冷的PBS将三分之一洗涤，以观察与线粒体的样品共定位。 此外，对于核染色研究，将相同的细胞用Hoechst-33258处理，再孵育20分钟，然后用PBS洗涤三次。 接下来，使用caspase-3活性染色试剂盒（Solarbio®Co.，Ltd。北京，中国）评估caspase-3的活性。 将细胞用5 µM CASP-3试剂盒（AC-DEVD-PNA）染色30分钟，用冰冷的PBS洗涤两次。 此测定基于的检测在37°C。孵育30分钟后，将细胞用冰冷的PBS洗涤三次，以停止肽样品的内在化。要观察新设计的纳米颗粒的线粒体靶向能力，将细胞与mito-tracker（绿色; 1 µm）进一步孵育20分钟，并用冰冷的PBS将三分之一洗涤，以观察与线粒体的样品共定位。此外，对于核染色研究，将相同的细胞用Hoechst-33258处理，再孵育20分钟，然后用PBS洗涤三次。接下来，使用caspase-3活性染色试剂盒（Solarbio®Co.，Ltd。北京，中国）评估caspase-3的活性。将细胞用5 µM CASP-3试剂盒（AC-DEVD-PNA）染色30分钟，用冰冷的PBS洗涤两次。此测定基于
个性化肽的随机III期试验...
抗原（HLA）−A24阳性患者患有castration抗性前列腺癌（CRPC），多西他赛化学疗法失败。在日本的68个医疗中心进行了这项随机，双盲，安慰剂控制的，第三阶段试验。患者以2：1的比例随机分配以接受PPV或安慰剂。根据先前存在的肽特异性免疫球蛋白G水平或相应的安慰剂选择的12种仓库肽中的四个在每周6剂中以6剂为单位注射，然后每两周两次注射30剂，直到30剂剂量直至疾病进展。主要终点是总生存期（OS）。通过完整的分析集进行了疗效分析。在2013年8月至2016年4月之间，随机分配了310名患者，并分析了306名患者。基线特征在组之间平衡。带有PPV的估计中值OS为16.1个月[95％的置换间隔（CI），13-18.2]，安慰剂[危险比（HR），1.04，95％CI，0.80 −1.37; p = 0.77]。≥3级不良事件均在41％的两组中观察到。对亚组之间的治疗组效应的分析显示，在<64％中性粒细胞的患者中，OS的HRS较低（HR，0.55，95％CI，0.33-0.93; p = 0.03）或≥26％的淋巴细胞（HR，0.70，95％CI = 0.52％，0.52-22；PPV在多西他赛化学疗法后CRPC患者的HLA -A24阳性患者中没有延长OS。亚组分析表明，基线时中性粒细胞比例较低或较高比例的淋巴细胞的患者可以通过PPV治疗获得生存益处。
利用合成树突状肽靶向 G-四链体 DNA
G-四链体 (G4) 是一种非规范的 DNA/RNA 结构，在 DNA 复制、 1 a 重组、 1 b 转录调控、 1 c 维持基因组稳定性 1 d 和衰老中发挥重要作用。 1 e G4 形成序列遍布整个人类基因组，但它们在端粒、 2 a 免疫球蛋白转换区 2 b 和原癌基因启动子中最为普遍。 2 c 端粒酶活性在大多数人体细胞中受到抑制，干细胞和淋巴细胞除外， 3 a 但在大多数肿瘤细胞中上调。 3 b 未折叠的单链 DNA 是最佳端粒酶活性所必需的；而 G-四联体的形成会抑制端粒酶活性。 4 因此，G4 结构被认为是阻止
1 基于表位的嵌合肽疫苗设计……
** 通信至：16 17 M. Anwar Hossain，博士 18 教授 19 微生物学系 20 达卡大学，孟加拉国达卡 21 电子邮件：hossaina@du.ac.bd 22 或者，23 Drs.马里兰州Mizanur Rahaman 24 助理教授 25 微生物学系 26 达卡大学，孟加拉国达卡 27 电子邮件：razu002@du.ac.bd 28 29 30 31 32
RNA指导的肽合成，跨越了nick循环
https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2024-b2651 orcid：https：//orcid.org/0000-0001-6558-8712 content content content content note contect contem许可证：CC由4.0
肽药物：癌症免疫疗法的新方向
癌症免疫疗法已成为癌症治疗的一种有希望的方法，被认为是手术干预，放疗，化学疗法和靶向治疗后的主要进步。免疫治疗药物的临床使用，尤其是靶向免疫检查点的抗体药物，显着增加了1。与仅针对肿瘤细胞的传统抗肿瘤药物不同，这些药物具有独特的作用机理，因为它们抑制了多种细胞类型的蛋白质 - 蛋白质相互作用，例如PD-1/ PD-L1阻断可能会在T细胞，肿瘤细胞，巨噬细胞，巨噬细胞和树突状细胞之间发挥作用（图1）。然而，在存在免疫介导的不良反应的情况下，及时戒断抗体疗法会带来很大的挑战，因为它们的分子量很高和长期寿命。大多数小分子化学药物的细胞摄取通常是可行的，但可能伴有脱靶效应。肽疗法占据了治疗剂光谱中单克隆抗体疗法和小分子化学药物之间的中间位置。肽具有明显的优势，包括明显的选择性，尤其是针对细胞表面的药物靶标，稳健浸润到实体瘤中，并易于合成；因此，它们是免疫检查点抑制的关键竞争者。然而，肽治疗剂的临床效用是由2个主要障碍物所影响的：生理环境内的酶促降解和次优的口服生物利用度。已经实施了各种方法，以避免递归降解，包括使用非天然氨基酸，环化修饰和镜像噬菌体
SARS-COV-2的蛋白质和主要蛋白酶作为双抑制剂 用于乳腺癌治疗的聚合物纳米颗粒 类型，合成，表征和应用 生物污染和缓解方法：评论 用有机硫和类黄酮化合物的虚拟筛查和分子对接研究，靶向雌激素受体蛋白的大蒜 基于传感器的添加剂制造技术 重新利用针对Covid-19的尖峰受体的药物进行治疗：一种计算机方法 环境生物修复的极端微生物 在FDA批准的青蒿素的硅药物中重新利用
重组蛋白在治疗几种疾病中作为药物发挥了重要作用。这些蛋白质主要分为天然类似物和蛋白质融合[1-4]。人类胰岛素（Humulin R）[3，5]和Etanercept（Enbrel）[6，7]在1982年和1998年被两组（类似物和融合）批准为1982年和1998年的生物药物剂（FDA）。输注蛋白，一个结构域提供特定的生物学活性，例如酶活性（例如，凝结因子），靶向激活或失活（例如，受体的配体）和毒性（例如，二胚蛋白毒素）。以及其他领域传达了更通用的功能，例如延长半衰期，提高效率，降低免疫原性[8-11]，提高溶解度，折叠，稳定性和/或热稳定性以及提供新的靶向和递送途径[12-14]。