纤维化,以及四个主要驱动基因(KRAS,TP53,CDKN2A /P16,SMAD4)的改变。结果使用QPCR和ISH将肿瘤内细菌的存在固定在52个肿瘤中(32%)。16S元基因组测序揭示了这些肿瘤内的特征性剖面,包括蛋白质细菌和坚果类的门。比较良好和预后良好的病例之间的细菌核对文件表明,较短的生存时间与厌氧细菌(例如bacte-roides,乳酸杆菌和peptoniphilus)之间存在显着的正相关。这些细菌的丰度与CD4,CD8和CD45RO阳性的肿瘤浸润T细胞的减少相关。结论厌氧菌细菌(例如菌孢子,乳酸杆菌和peptoniphilus)的肿瘤内感染与抑制的抗PDAC免疫和不良预后有关。
上下文。对种马精液的微生物组成知之甚少。目标。描述在健康微型小马种马中检测到的微生物群。方法。精液标本是在一个时间点使用密苏里人的人工阴道收集的。在这些标本上进行了16S rRNA基因的基因组DNA测序 PACBIO(PACBIO(PACICICIENCES),随后进行了下一代微生物组生物信息组平台qiime2用于处理快速Q纤维并分析amplicon数据。 数据分为属,家庭,阶级,顺序和门。 关键结果。 Firmicutes和杀菌植物占主导地位(76%),其次是proteeobacteria(15%)。 杀菌剂,梭菌和心杆菌占据了微生物等级的占主导地位(86%)。 类主要由细菌,梭状芽胞杆菌和γ-杆菌(87%)组成,而家族主要由卟啉单核,family_xi和心杆菌科(62%)组成。 在属的水平上,有80%的丰度由七个属,即卟啉单胞菌,suttonella,peptoniphilus,peptoniphilus,oftidiosipila,ezakiella,petrimonas和一个不知名的分类单元组成。 结论。 发现表明特定的微生物群可能是健康微型小马种马的特征,并且观察到一些个体间的变化。 含义。 本研究可以告知涉及肥沃和不育受试者的较大的马研究,并可以探索精液微生物组与男性生育能力的关系。PACBIO(PACBIO(PACICICIENCES),随后进行了下一代微生物组生物信息组平台qiime2用于处理快速Q纤维并分析amplicon数据。数据分为属,家庭,阶级,顺序和门。关键结果。Firmicutes和杀菌植物占主导地位(76%),其次是proteeobacteria(15%)。杀菌剂,梭菌和心杆菌占据了微生物等级的占主导地位(86%)。类主要由细菌,梭状芽胞杆菌和γ-杆菌(87%)组成,而家族主要由卟啉单核,family_xi和心杆菌科(62%)组成。在属的水平上,有80%的丰度由七个属,即卟啉单胞菌,suttonella,peptoniphilus,peptoniphilus,oftidiosipila,ezakiella,petrimonas和一个不知名的分类单元组成。结论。发现表明特定的微生物群可能是健康微型小马种马的特征,并且观察到一些个体间的变化。含义。本研究可以告知涉及肥沃和不育受试者的较大的马研究,并可以探索精液微生物组与男性生育能力的关系。
111图2:Isala观察性研究中的性交和伙伴关系对阴道微生物组的影响(n = 3,043 112名参与者,其中439名最近发生了性交)。面板从左到右:(a)对β多样性的影响(即样品之间的多样性113),(b)对α多样性的影响(即样品中的多样性),以及(c)对特定细菌的相对丰度114的影响。每个细胞中的数量是指差分丰度方法的数量,对给定的分类单元显示115个显着效果。分类单元效应大小来自Maaslin2。(d)阴道样品和内衣样品之间ASV 116的Genedoe差异丰度,以及在阴道和内衣样品中分别在阴道和内衣样品中分别进行性交(比较第1、3、4、5和7天,第2天和第6天)。单元格中的数量表示统计方法118(Maaslin2,limma和CLR转换丰度上的线性回归)的数量,标称P值为119显着(p <0.05)。所示的效果大小来自Maaslin2。(E)在7天内阴道样品中潜在的120个驱动型分类群的中心对比比率转化(CLR)。peptoniphilus ASV1,葡萄球菌ASV1和链球菌ASV4(分别为右,左和121个中间面板)。122