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噬菌体WO基因wmk的杀伤表型
摘要沃尔巴克氏体是动物体内分布最广泛的细菌内共生体。在节肢动物中，这些母系传播的细菌可以自私地劫持宿主的生殖过程，以提高传播它们的雌性的相对适应度。一种称为雄性杀灭或选择性杀死受感染雄性的生殖寄生形式，通过转基因表达原噬菌体 WO 介导的杀灭 ( wmk ) 基因在一定程度上重现。在这里，我们利用转基因表达表征了果蝇中 wmk 诱导的雄性杀灭的基因型-表型景观。虽然系统发育上遥远的 wmk 同源物不会引起性别比例偏差，但密切相关的同源物表现出复杂的表型，包括不死亡、雄性死亡或所有宿主死亡。我们证明替代起始密码子、同义密码子，尤其是 wmk 中的单个同义核苷酸可以消除杀灭。这些发现揭示了转基因 wmk 诱导杀戮的先前未被认识到的特征，并为转录后过程对雄性杀戮变异的影响建立了新的假设。我们得出结论，同义序列变化在具有生死后果的嵌套内共生相互作用中不一定是沉默的。
绵羊早发胎儿生长限制的表型
胎儿生长限制（FGR）是一种复杂的产科条件，其中胎儿生长在病理上降低，最经常是因为胎盘无法提供足够的氧气和营养素来支持正常的胎儿发育（1，2）。FGR很常见，影响高资源国家的6-9％的怀孕（3、4）。胎盘不足是用于描述胎盘（1）异常发育和功能的伞术，其特征是子宫牙本血流降低，跨胎盘的气体和底物转移降低以及胎儿生长降低。响应胎盘不足，受限制的胎儿经历缺氧（5），通过重新分布心脏输出来对优先提供必需的器官（脑和心脏）产生血流动力学反应（6）。在FGR中，这种适应性反应可以延长，从而导致脑血管补偿（脑部保留）和不对称的胎儿生长，其头部大小相对较弱，但身体较薄和/或较短的身体（7）。十年前，术语FGR或IUGR（宫内生长限制）通常被互换使用，胎龄（SGA）很小。2016年FGR的共识定义为描述病理性FGR的婴儿提供了一个必不可少的框架，并从宪法上很小但健康的SGA婴儿中对死亡率和发病率的敏感性更大。患有FGR的婴儿通常是早产的，尤其是当FGR早期发作（妊娠不到32周的诊断）时（8），而FGR是围产期死亡/死亡的最强风险因素（8，9）。最近的系统评论报告SGA现在用于描述相对于胎龄和性别的估计胎儿体重或出生体重的任何婴儿<10个百分位数，而真实的FGR被定义为估计的胎儿体重<10 th％TH％TH％TH％Theplatial the the％，以及胎儿功能障碍的产前多普勒指数，胎儿功能障碍或估计的胎儿体重<3 rd rd百分位数（2）。婴儿早产可能会暴露于产前糖皮质激素以诱导肺部成熟，但是这些糖皮质激素可能对FGR的器官发育产生不同的影响，并适当生长的胎儿（10，11）。出生后，FGR与新生儿心血管，呼吸道和神经病性病变有关，与胎龄相比，率显着升高（7）。例如，心脏形状和心血管功能发生了变化（12-14），而患有FGR的婴儿在通风和新生儿重症监护术上花费更多的时间，而不是年龄匹配的适当生长的婴儿（15）。尽管在子宫内存在脑部保留率，但在童年时期出生的婴儿的神经发育延迟的可能性增加，包括认知功能不佳和智能商（IQ）得分（3、16、17）的降低，以及发展运动脱落效力的智能（3，16，17）的风险增加。确定与胎盘不足和FGR相关的器官特异性结构和功能变化，需要适当的动物模型，其中重大器官的发育和生理适应性复制了人类FGR中已知的遗嘱。利用大小的动物实验设计，有多种胎盘不足的动物模型，慢性胎儿缺氧和/或FGR（19，20）。
聊天机器人已知任何个人prakriti（表型）
摘要：“ Ayurbot”应用程序是一种开创性的工具，旨在根据用户输入来确定个人的阿育吠陀Prakriti（表型），为健康，生活方式和饮食调整提供个性化建议。植根于阿育吠陀的古老智慧，该智慧将Vata，pitta和kapha视为影响一个人的prakriti的主要dosha类型，这是传统知识与现代技术之间的桥梁。Ayurbot的用户界面旨在直观且用户友好，通过全面的问卷调查指导用户，该问卷考虑了其物理属性，行为倾向和其他印度草药指标的各个方面。该问卷对于构成应用程序核心的“ Prakriti确定”模块至关重要。“ Prakriti确定”模块利用复杂的阿育吠陀算法来分析用户响应并准确识别主要的dosha和总体prakriti类型。此分析构成了Ayurbot提供的个性化建议的基础。Ayurbot的关键特征之一是它能够根据用户的Prakriti为健康，生活方式和饮食调整提供量身定制的建议。这些建议来自阿育吠陀知识的丰富存储库，旨在促进整体福祉。Ayurbot的模块化代码库确保可扩展性和可维护性，从而允许无缝更新和增强。这确保了Ayurbot仍然是一种尖端工具，随着技术和印度草药研究的进步，它继续发展。总而言之，“ Ayurbot”的应用代表了古老的智慧和现代技术的融合，使个人通过根据Ayurveda的原则提供个性化的见解和建议来授权个人负责其健康和福祉。
通过群体脑成像发现表型
神经影像学可以对大脑进行无创的详细研究。通过数据驱动发现大脑群体变异模式，可能对早期疾病诊断和了解大脑非常有价值。由此产生的模式可以用作成像衍生表型 (IDP)，并可以补充现有的专家整理的 IDP。然而，群体数据集包含来自数千名受试者的许多不同结构和功能成像模式，带来了以前从未解决的计算挑战。这里，首次提出了一种多模态独立成分分析方法，该方法可扩展用于完整英国生物库 (UKB) 数据集中体素级神经影像数据的数据融合，该数据集很快将达到 100,000 个成像对象。这种新的计算方法可以估计群体变异模式，从而增强使用来自 UKB 和人类连接组计划的数据预测数千个表型和行为变量的能力。与广泛使用的分析策略、单模态分解和现有的 IDP 相比，高维分解实现了更高的预测能力。在 UKB 数据（14,503 名受试者，47 种不同的数据模态）中，确定了许多与非成像表型的可解释关联，包括与流体智力、惯用手和疾病相关的多模态空间图，在某些情况下，基于 IDP 的方法会失败。
扩大了男性MECP2变体的表型
摘要背景：MECP2变体引起X染色体相关的罕见发育综合征。通常，该突变是零星的，发生在女性中，对男性致命。准确的遗传和临床诊断被认为是症状管理和新疗法的发展所必需的。这些目标可能很难在更多的因素中涉及携带同一MECP2变体的患者的高度可变临床图片中的因素。我们描述了两个兄弟携带相同MECP2变体的临床图片，并将其与文献中发表的病例进行了比较。方法：已知大多数MECP2突变是从头突变，这就是为什么夫妻俩其他孩子中突变的复发的原因。出乎意料的是，我们的常规基因检测表明，一名23岁男子（P1）和他的弟弟（P2）携带同样的半细胞病原失误变体C.419c> t，p。（ALA140VAL）（Transcript NM_004992.3）MECP2的MECP2，MECP2的MECP2是MECP2的，它是从他们的母亲身上遗传而来的。因此，认为有必要进一步的临床评估和与文献案例进行比较。结果：P1患有严重的综合症智力障碍（ID），而他的兄弟的ID基本上限于口头技能问题。P1和他的弟弟都没有被诊断出患有RETT综合征。P1（与他的弟弟不同）有几个舌，社交和运动困难；破坏性行为是治疗最困难的症状。P1对几项医学和非医疗治疗试验的反应仍然不足，因此要求患者长期住院。文献综述表明，除我们的家庭外，还有其他五个家庭，其中一个以上雄性携带相同的MECP2 P.Ala140Val突变，例如P1和P2。来自我们的所有24名男性（n = 2）和其他（n = 22）的表型，大概是非致命的突变显示出很大的可变性。结论：男性MECP2的P.Ala140Val突变与罕见的X染色体发育障碍有关，具有高度可变的表型。需要进一步的研究来更好地理解所有可以解释同一基因型内表型差异以找到最佳药物疗法的影响因素。
NLRP1 炎症小体调节衰老和衰老相关的分泌表型
衰老是一种与细胞老化相关的过程，由不同的应激引发，其特征是分泌各种炎症因子，称为衰老相关分泌表型 (SASP)。在这里，我们提出证据表明，炎症小体传感器 NLRP1 是体外和体内辐射诱导衰老的关键介质。NLRP1 炎症小体通过以 Gasdermin D (GSDMD) 依赖的方式调节 p16、p21、p53 和 SASP 的表达来促进衰老，因为在 NLRP1 不足或 GSDMD 抑制的情况下，这些反应会降低。从机制上讲，NLRP1 炎症小体在细胞质 DNA 传感器 cGMP-AMP (cGAMP) 合酶 (cGAS) 下游被激活，以响应基因组损伤。这些发现为抑制 NLRP1 炎症小体-GSDMD 轴以治疗衰老驱动的疾病提供了理论依据。
与肌萎缩性侧向硬化逆转表型
将来自22名参与者的ALS反转参与者与PGB主要队列（n = 103）和目标ALS验证队列（n = 140）进行了比较。两个遗传基因座符合统计显着性的预定标准（两侧置换p≤0.01），并在绘制细节后仍然是合理的。第一个基因座的铅单核苷酸变体（SNV）为rs4242007（主要同类gwas OR = 12.0，95％CI 4.1至34.6），它在IGFBP7内含子中，并且在近乎完美的链接中与Snnv in in In iN in igfbpp7 spection in igfbp7中。两个SNV都与EQTL数据集中的额叶皮层IGFBP7表达降低有关。值得注意的是，3个反转，但没有一个典型的进步个体（n = 243），对于RS4242007而言。鉴于附近基因转录的相关影响，位于Grip1附近的第二个基因座的重要性是不确定的。
用日本脑炎病毒感染野猪猪
背景：日本脑炎病毒（JEV）是一种蚊子 - 裔人的人畜共患病毒病毒，是亚洲太平洋地区小儿脑炎的主要原因。传输周期主要涉及Culex spp。蚊子和Ardeid鸟类，家养猪（Sus scrofa housea）是从自然流行传播周期进入人口的JEV溢出的传染病来源。尽管许多研究得出的结论是，家猪在JEV的传播周期和人类感染中起着重要作用，但野猪在JEV传播中的作用尚不清楚。由于国内和野性猪是同一物种，并且由于在美国的野猪种群在地理上增加和扩展，因此目前的研究旨在检验以下假设：如果将JEV引入美国，则野猪可能在传输周期中起作用。材料和方法：表现出野性表型的Sinclair微型猪被JEV基因型IB内接种。这些猪是从与四个野猪菌株的交叉杂交家用猪中得出的，并且由于无法获得野猪而被使用。结果：Sinclair微型猪开始了病毒，并显示出与家养猪相似的病理结局。结论：基于这些发现，我们得出结论，如果将JEV引入美国，野猪种群可能有助于建立和维持JEV的传播周期，并可能导致该病毒在美国流行。
研究趋同进化以将基因型与行为表型联系起来
神经科学在利用不寻常的动物进行研究方面有着悠久而丰富的历史。在过去的几十年里，用于神经科学研究的物种一直存在技术驱动的瓶颈。然而，即将到来的适用于多种动物的技术浪潮有望使研究人员能够解决使用传统实验室动物无法解决的具有挑战性的科学问题。在这里，我们讨论了如何利用生理或行为表型的趋同进化来增强研究基因型与表型相互作用的映射。我们介绍了两个使用电鱼和毒蛙的案例研究，并讨论了比较工作如何教会我们了解生物组织各个层面的进化约束和灵活性。我们还就建立神经科学研究中新模型系统的潜力和陷阱提供了建议。最后，我们以讨论魅力动物在神经科学研究中的使用及其在公众宣传中的效用结束。总的来说，我们认为趋同进化框架可以帮助确定神经科学的可推广原则。
Genehapr：基因单倍型统计，表型关联和可视化
ashaplotype。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。4个数据集。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 5 displayVaroneNemodel。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。4个数据集。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5 displayVaroneNemodel。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 div>5 fi lterlargep.link。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>6 fi lterlargevcf。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>8 fi lter_hap。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 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