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将适体修饰的纳米移液器与神经元介质和离体脑组织连接起来
摘要：适体功能化的生物传感器在监测复杂环境中的神经递质方面表现出高选择性。我们将纳米级适体修饰的纳米移液器传感器转化为检测体外和离体内源性多巴胺的释放。这些传感器采用具有纳米级孔（直径约 10 纳米）的石英纳米移液器，其用适体功能化，从而能够通过目标特定的构象变化选择性捕获多巴胺。多巴胺结合后适体结构的动态行为导致纳米孔内表面电荷的重排，从而导致可测量的离子电流变化。为了实时评估传感器性能，我们设计了一个流体平台来表征纳米移液器传感器的时间动态。然后，我们通过在生物环境中部署用非特异性 DNA 修饰的对照传感器以及多巴胺特异性传感器来进行差异生物传感。我们的研究结果证实了适体修饰的纳米移液器可用于直接测量未稀释的复杂流体，特别是在人类诱导多能干细胞衍生的多巴胺能神经元的培养基中。此外，传感器植入和急性脑切片中的重复测量是可能的，这可能是由于纳米级 DNA 填充孔内的受保护传感区域，最大限度地减少了非特异性干扰物的暴露并防止堵塞。此外，背外侧纹状体通过电刺激释放的内源性多巴胺的差异记录表明适体修饰的纳米移液器具有以前所未有的空间分辨率和减少的组织损伤进行体外记录的潜力。关键词：生物传感器、DNA、多巴胺、流体学、诱导多能干细胞衍生的神经元、纳米孔■简介
罗氏集团研发管线
RG6421 TMEM16A 增效剂 粘膜阻塞性呼吸道疾病 RG7828 Lunsumio SLE CHU 抗 HLA-DQ2.5 x 麸质肽 乳糜泻 CHU 抗 C1s 免疫学 RG6237 抗潜伏性肌生长抑制素 (GYM 329) 肥胖症 RG6652 GLP-1 RA (CT-996) 肥胖症 +/- T2D RG6035 Brainshuttle™ CD20 多发性硬化症 RG6182 MAGL 抑制剂 多发性硬化症 RG6434 - 神经退行性疾病 RG6120 zifibancimig nAMD RG6209 - 视网膜疾病 RG6351 - 视网膜疾病 RG7921 - RVO RG6006 zosurabalpin 细菌感染 RG6436 LepB 抑制剂 复杂性尿路感染 CHU REVN24 急性疾病 CHU BRY10 慢性疾病
UKMFC 提出的第 1 版生物信息学流程设计
本次竞赛旨在识别故意生产和/或释放生物有机体的特征。技术方法有可能识别样本中的生物体是否具有实验室传代/生长的表型证据（例如在表观遗传学、转录组学、蛋白质组学水平上）。先前的研究强调了这种分析技术在调查生物材料滥用方面的潜力（1、2）。为了识别可靠的特征，供应商应考虑使用环境菌株（即之前很少或没有实验室培养的菌株）进行传代实验。预计在实验室传代实验中，经过相对较少的培养“代”后（即在反复传代不到 10 次后出现）即可识别出特征。
基因组规模的社区建模揭示了表皮细菌群社区中保守的代谢交叉进食
海洋微生物形成了相互作用的相互作用的复杂群落，这些群落影响了中央生态系统在海洋中的功能，例如主要的生产和营养循环。确定控制其组装和活动的机制是微生物生态学的主要挑战。在这里，我们整合了Tara Oceans Meta-Omics数据，以预测兴奋海洋中原核生物组合中的基因组规模社区相互作用。一个全球基因组分辨的共同活性网络揭示了各种系统发育距离之间存在显着数量的谱系关联。鉴定的共同活性群落包括显示较小基因组的物种，但编码更高的群体感应，生物膜形成和次生代谢的潜力。 社区代谢建模揭示了共同活性群落中相互作用的较高潜力，并指向保守的代谢交叉进食，特别是特定的氨基酸和B组B族维生素。 我们综合的生态和代谢建模方法表明，基因组的精简和代谢可营养噬菌体可能充当塑造全球海洋表面细菌群社区组装的联合机制。鉴定的共同活性群落包括显示较小基因组的物种，但编码更高的群体感应，生物膜形成和次生代谢的潜力。社区代谢建模揭示了共同活性群落中相互作用的较高潜力，并指向保守的代谢交叉进食，特别是特定的氨基酸和B组B族维生素。我们综合的生态和代谢建模方法表明，基因组的精简和代谢可营养噬菌体可能充当塑造全球海洋表面细菌群社区组装的联合机制。
双氢青蒿素哌喹和青蒿琥酯阿莫地喹间歇性预防治疗对学龄儿童抗六种血型恶性疟原虫抗原 IgG 应答的影响
在疟疾高发地区，已经实施了几种干预策略，其中包括间歇性预防治疗 (IPT)，这是一种阻断传播并降低疾病发病率的策略。然而，实施 IPT 策略引起了真正的担忧，因为它干预了对疟疾的自然获得性免疫的发展，而这种免疫需要与寄生虫抗原持续接触。本研究调查了在学童中应用二氢青蒿素-哌喹 (DP) 或青蒿琥酯-阿莫地喹 (ASAQ) IPT (IPTsc) 是否会损害对六种疟疾抗原的 IgG 反应性。坦桑尼亚东北部的一项 IPTsc 试验以四个月的间隔施用了三剂 DP 或 ASAQ，并对学童进行了随访。本研究使用酶联免疫吸附试验 (ELISA) 技术比较了干预组和对照组中 IgG 对恶性疟原虫红细胞膜蛋白 1 (PfEMP-1) 的 GLURP-R2、MSP1、MSP3 和 CIDR 结构域 (CIDRa1.1、CIDRa1.4 和 CIDRa1.5) 的反应性。研究期间，共有 369 名学童参与分析，对照组、DP 组和 ASAQ 组分别有 119 名、134 名和 116 名参与者。在干预期期间和干预期后，疟疾抗原识别的广度显著增加，且研究组间并无差异（趋势检验：DP，z 分数 = 5.92，p < 0.001，ASAQ，z 分数 = 6.64，p < 0.001 和对照组，z 分数 = 5.85，p < 0.001）。在所有访视中，对照组和 ASAQ 组对任何测试抗原的识别均无差异。然而，在 DP 组中，干预期期间 IPTsc 不会削弱针对 MSP1、MSP3、CIDRa1.1、CIDRa1.4 和 CIDRa1.5 的抗体，但会削弱针对 GLURP-R2 的抗体。
链球菌突变体调节细菌 - 真菌相互作用中白色念珠菌的泛素修饰
植物病毒对全球农业构成了重大威胁，并需要有效的工具才能及时检测。我们提出了AutoPvprimer，这是一种创新的管道，该管道整合人工智能（AI）和机器学习以加速植物病毒引物的发展。管道使用Biopython从NCBI数据库自动检索不同的基因组序列，以增加后续引物设计的鲁棒性。design_-primers_with_tuning模块使用随机森林分类器，可优化参数并为不同的实验条件提供灵活性。质量控制措施，包括评估Poly-X含量和熔化温度，提高了引物的可靠性。AUTOPVPRIMER独有的是Visualize_primer_dimer模块，它支持引物二聚体的可视化评估，这是其他工具中缺少的功能。引物特异性通过引物爆炸验证，这有助于管道的整体效率。AutoPvprimer已成功地应用于番茄镶嵌病毒，证明其适应性和效率。模块化设计允许用户自定义，并将适用性扩展到不同的植物病毒和实验场景。管道代表了引物设计的重大进展，并为研究人员提供了加速分子生物学实验的有效工具。未来的发展旨在扩展兼容性并纳入用户反馈，以巩固AutoPvprimer，作为对生物信息学工具箱的创新贡献，也是提高植物病毒学研究的有希望的资源。
创新管道 2024.pdf
SESAR JU 的数字欧洲天空研究和创新计划利用最新的数字技术（“SESAR 解决方案”）来提高空中交通管理的自动化、网络安全数据共享和连通性水平，并实现其基础设施和空中交通服务在所有类型空域（包括超低空和高空运行）的虚拟化。通过这样做，这些技术使系统变得更加可扩展和灵活，同时增强了对中断、交通需求变化和飞行器多样性的适应能力。这些属性都是以智能和可持续的方式为系统提供未来保障的关键。
Parapipe：处理寄生虫NGS数据集的管道及其应用于隐孢子虫
隐孢子虫是一种严重公共卫生问题的原生动物寄生虫，是严重的腹泻疾病，特别是在资源有限的环境中的免疫功能低下的个体和幼儿中。分析整个基因组下一代测序（NGS）数据是提高我们对隐孢子虫流行病学，传播动力学和遗传多样性的了解的关键下一步。但是，对公共卫生环境中NGS数据的有效分析需要开发可靠的，经过验证的生物信息学工具。在这里，我们提出了Parapipe，这是一种模块化的ISO认证生物信息学管道，旨在用于高通量处理和隐孢子虫NGS数据集的高通量处理和分析。使用NextFlow DSL2构建并用奇异性进行了容器，Parapipe是便携式，可扩展的，并且能够端到端分析，包括质量控制，变体呼叫，感染多样性（MOI）研究（MOI）研究和系统基因组群集分析。
Metapipeline-DNA：综合种系和体细胞基因组学NextFlow Pipeline
Yash Patel 1,2,3*，Chenghao Zhu 1,2*，Takafumi N. Yamaguchi 1,2,3*，Nicholas K. Wang 1,2，Nicholas Wiltsie 1,2,3 Mohammed Faizal Eeman Mootor 1,2,3 , Timothy Sanders 1,2,3 , Cyriac Kandoth 1,2 , Sorel T. Fitz-Gibbon 1,2,3 , Julie Livingstone 1,2,4 , Lydia Y. Liu 1,2,4 , Benjamin Carlin 1,2,3 , Aaron Holmes 1,2 , Jieun Oh 1,2 , John Sahrmann 1,2 , Shu Tao 1,2,3 , Stefan Eng 1,2 , Rupert Hugh- White 1,2 , Kiarod Pashminehazar 1,2 , Andrew Park 1,2 , Arpi Beshlikyan 1,2 , Madison Jordan 1,2 , Selina Wu 1,2 , Mao Tian 1,2 , Jaron Arbet 1,2 , Beth Neilsen 1,2 , Yuan Zhe Bugh 1,2，Gina Kim 1,2，Joseph Salmingo 1,2，Wenshu Zhang 1,2，Roni Haas 1,2，Aakarsh Anand 1,2，Edward Hwang 1,2，Anna Neiman-Golden 1,2，Anna Neiman-Golden 1,2，Philippa Steinberg 1,2，Wenyan Zhao 1,2 Boutros 1,2,3,4,5，§
b“ Quralis正在应用精确药物来推进新型的治疗管道，以治疗肌萎缩性侧面硬化症AL，额颞痴呆ftd和其他神经退行性疾病。针对大多数患者的ALS的小分子计划，以及世界一流的领导者，药物开发人员和患者的拥护者，我们成长中的团队是神经退行性研究和开发的领先地位。神经退行性疾病生物学，干细胞和反义寡核苷酸ASO技术，生物标志物和小分子设计。我们对我们的患者社区，科学，同事和我们自己诚实和同情，分享了共同的热情，以紧急发现ALS和FTD的新药物。我们代表了各种各样的背景和价值协作。我们认为，可以通过精确来治疗神经退行性疾病的成功 - 瞄准合适的患者，确定正确的疾病机制，并精心发展疾病调整，临床上有意义的疗法
b“ Quralis正在应用精确医学来推进新型的治疗管道，用于治疗肌萎缩性侧面硬化症ALS，额颞痴呆ftd和其他神经退行性疾病。我们的干细胞技术可以测试各种疗法的功效，并为诊所提供过渡桥，从而实现目标验证，发现和分子选择。我们正在推进三个反义和小分子计划，以解决大多数患者的ALS的子形式。与世界一流的思想领导者，药物开发人员和患者倡导者一起，我们的成长团队处于神经退行性研究和开发的领先地位。我们很荣幸能在新英格兰的创业生态系统中赢得了凶猛的15和新英格兰风险投资协会的最佳新兴生命科学公司Nevy奖。我们是神经退行性疾病生物学，干细胞和反义寡核苷酸ASO技术，生物标志物和小分子设计的先驱。我们对我们的患者社区，科学，同事和我们自己诚实和同情，分享了一种共同的热情，以紧急发现ALS和FTD的新药物。我们代表了各种背景和价值协作。我们认为，可以通过精确靶向正确的患者，确定正确的疾病机制，并精心开发疾病改良的临床有意义的疗法来改善患者生活，从而实现治疗神经退行性疾病的成功。QULARIS的立场摘要正在寻求一位积极进取的副科学家来领导和管理我们的复合管理系统。该职位将与团队成员紧密合作，以学习到适当的跟踪和组织决策实验中使用的化合物。主要职责”