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一步库准备方法支持Skim-Seq ...
2.0自定义高强度公式，一种单步库制备方法，用于脱离人类样品基因型插补的方法。ExpressPlex 2.0自定义高强度公式用于在四个不同的总质量输入处处理两个单独的人基因组DNA，从而产生一个归一化的8个PLEX库池。在NextSeq 2000 P3上运行2 x 150 bp，将Expressplex库测序为≥2000万个配对末端读数。对每个样品的配对末端读取均与GRCH38人参考基因组对齐，确定了SNP调用的精度和准确性22。使用默认设置执行的插补的开源瞥见管道。我们的结果表明，AxpressPlex 2.0定制高强度公式的常规低通WGS应用程序的实用性，在其中我们表征了参考样品集合中的多重均匀性和基因型插定精度。
用新材料概念重新思考护照
科思创通过新材料组合提供高耐磨、高抗撕裂的 TPU 电子封面，从而提供设计灵活性。护照电子封面表面极其坚固，几乎坚不可摧。通过数字印刷技术可以创建各种表面纹理、颜色和设计。复杂的图形和安全功能可以轻松集成到护照电子封面中。
＃638使用COSMX空间分子成像
摘要：COSMX TM人类全转录组成像面板（WTX）的开发为18,985-plex，涵盖了人类的完整蛋白质编码转录组。详细的滴定研究表明，可以使用每个蛋白质编码基因的2-杂交瓷砖获得高灵敏度整个转录组成像，从而导致一个单细胞（和亚细胞）杂交面板，其中包含37,990多个成像型钢筋。成像条形码以156位（每码4个循环和35个深色循环）编码，每个成像探针均互相敲打距离= 4，从而导致非常低的假代码检测。将单细胞成像推进到整个转录组水平上，为完成所有单细胞转录组实验（成像和非成像）提供了一种统一的方法。取决于所研究的样品类型（从固定细胞到整个组织切片），每个细胞的转录本和每个细胞基因smi整个转录组成像方法，这些方法甚至由最高分辨率的单细胞RNA-SEQ获得，最大分辨率为每个细胞，每个细胞最多可达3,000个基因，并且每个细胞中最多可达10,000个基因。为了更好地将整个转录组分为单个细胞，SMI已被扩展，以允许在与整个成像的整个转录组完全相同的幻灯片上进行高plex蛋白成像（高达〜75-PLEX）。这允许使用质膜，核室和细胞质的高分辨率图像开发高级数据驱动的细胞分割软件。以这种方式，可以将整个转录组准确地放入（原点）中。将显示跨越单细胞实验范围的数据，从中文化到解离组织样品再到多个1x1 cm 2 FFPE组织切片。整个转录组数据的第三级分析将包括细胞分型，配体受体检测，途径枚举和邻里分析。高维的整个转录组和多摩变蛋白数据直接流到基于云的ATOMX TM空间信息平台上。
学习药物-靶标相互作用词汇
基于序列的药物-靶标相互作用预测有可能通过补充实验筛选来加速药物发现。这种计算预测需要具有通用性和可扩展性，同时还要对输入的细微变化保持敏感。然而，目前的计算技术无法同时满足这些目标，往往以牺牲一个目标的性能来实现其他目标。我们开发了一种深度学习模型 ConPLex，成功地利用了预训练蛋白质语言模型（“PLex”）的进步，并采用了一种新颖的蛋白质锚定对比共嵌入（“Con”），其性能超越了最先进的方法。ConPLex 实现了高精度、对未知数据的广泛适应性以及对诱饵化合物的特异性。它根据学习到的表示之间的距离来预测结合，从而能够在海量化合物库和人类蛋白质组的规模上进行预测。此外，ConPLex 是可解释的，这使我们能够可视化药物靶标词典并使用嵌入来描述人类细胞表面蛋白的功能。我们预计 ConPLex 将通过在基因组规模上实现高度灵敏且可解释的计算机药物筛选来促进新药发现。ConPLex 可在 https://github.com/samsledje/ConPLex 上开源获取。
将TMTPRO试剂扩展到32-PLEX，用于Orbitrap平台上的高通量定量蛋白质组学
Thermo Scientific™TMTPRO试剂使研究人员能够在单个LC-MS/MS实验中同时识别和量化许多样品中的蛋白质和肽。当前的TMTPRO同质质量标签结合了13 C＆15 N稳定的同位素，以通过高分辨率MS/MS分析并行对多达18个样品进行定量分析。为了进一步提高多路复用能力，我们开发了17种同位素的同型同位同位素集，该集合在记者组上包含一个2 h同位素，以产生不同的记者离子质量，与3 MDA的现有集合不同。与传统的试剂集合结合使用，氘化试剂可以对Thermo Scientific™Orbitrap平台上多达35个样品进行多重定量分析。在这里，我们表征了新型的TMTPRO变体，并评估了它们的32个PLEX定量的性能。
挖掘血浆蛋白质组；一种新型的超敏感和高质子液体活检平台揭示了生物学上重要的低丰度生物群
两个高质子nulisa面板：开发并在疾病队列中开发并测试了一个250质子炎症面板和一个120个Plex中枢神经系统（CNS）疾病面板。炎症面板在单个面板中具有最全面的细胞因子和趋化因子和其他与免疫相关的蛋白质的覆盖范围，并且在检测高准确精度的低肥大蛋白方面表现出了较高的敏感性，从而可以检测到难以检测但具有生物学上重要的低利差生物标记物和cov cov cov and cov and cov and cov and cov and coimune and coim amune and coimmune and coimm and coimm and的敏感性。中枢神经系统面板是专门针对包括阿尔茨海默氏症的所有关键标志的神经退行性疾病设计的最大的多重图案，并且已经证明了与以前在血液中检测到具有挑战性挑战的各种神经退行性疾病相关的已建立蛋白和新型蛋白质的潜力。
化石和现今的叠层石鲕粒含有甘氨酸和铁的陨石聚合物
1 哈佛大学分子与细胞生物学系，52 Oxford St.，剑桥，MA 02138，美国 2 高能物理部，史密森天体物理观测台，哈佛与史密森天体物理中心，60 Garden St，剑桥，MA 02138，美国 3 LRL-CAT，礼来公司，先进光子源，阿贡国家实验室，9700 S. Cass Avenue，莱蒙特，伊利诺伊州，60439，美国 4 钻石光源，哈威尔科学与创新园区，迪德科特，OX11 0DE，英国 5 哈佛大学纳米系统中心，11 Oxford St，LISE G40，剑桥，MA 02138，美国 6 蒙大拿州立大学地球科学系，226 Traphagen Hall，PO Box 173480，博兹曼，MT 59717，美国 7 PLEX 公司，275 Martine St.，美国马萨诸塞州福尔里弗 02723 100 室 通讯作者：Julie EM McGeoch；电子邮件：Julie.mcgeoch@cfa.harvard.edu
真实和模拟驾驶和导航中的眼球运动...
几十年来，系统一直是研究的对象。数字时代日益复杂的情况使得系统与人类操作员之间的交互优化变得尤为必要。在本专题中，介绍了十篇典型文章，从观察性实地研究到高度复杂的导航模拟器中的实验工作。对于人类操作员来说，注意力过程起着至关重要的作用，这在本专题中列出的贡献中通过眼动追踪设备捕捉到了。
分类药：我们需要一个新的定义吗？
将代谢产物作为后生物学以及这种方法的弱点和局限性的观点一直是最近出版物的重点。3现有的术语可以在简单，完全特征的代谢物（例如丁酸酯）或集体名称（例如填充物或无细胞的上清液）的情况下使用，可用于更多不受限制的代谢物的综合制剂。这种方法阻止了令人困惑的情况，即微生物衍生的代谢产物或代谢物混合物被称为“后生元”，但相同的化学合成制剂却不是。一些作者提出了使用“代晶剂”一词
具有恶性形态和 COL6A2-USP6 融合的结节性筋膜炎：病例报告（一名 10 岁男孩）Tomassen, T.；Ven, C. van de；Anninga, J.；
摘要 结节性筋膜炎通常是一种良性病变，其遗传学特征为泛素特异性蛋白酶 6 (USP6) 重排。我们介绍了一个 10 岁男孩的病例，该男孩右胸壁有无痛肿块，已切除，病史为 1.5 周。观察到组织形态学恶性肿瘤，具有明显的多形性、非典型有丝分裂图和肌样免疫表型。甲基化谱与结节性筋膜炎一致，荧光原位杂交证实了 USP6 重排。随后使用 Archer Fusion Plex（肉瘤面板）和 RNA 测序，鉴定出胶原蛋白 VI 型 alpha 2 (COL6A2) - USP6 基因融合。此外，DNA 聚类分析也显示与结节性筋膜炎相匹配。在 22 个月的随访中，没有出现复发或转移。总之，我们描述了一种临床上良性、组织形态学上恶性的间充质肿瘤，具有肌样免疫表型，遗传和表观遗传特征与结节性筋膜炎一致。在这种情况下，分子分析是一种有用的辅助手段，可以避免不必要的过度治疗。