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CFIm25 独立于其在 mRNA 替代多聚腺苷酸化中的作用来调节人类干细胞功能
。CC-BY 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本（未经同行评审认证）下提供的，作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2021 年 12 月 8 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2021.12.08.471721 doi: bioRxiv preprint
原始文章生物信息学分析和热休克蛋白中的替代多腺苷酸化70（HSP70）家庭成员
摘要：目的：热休克蛋白70（HSP70）家族是一组高度保守的分子助力者，对于维持细胞稳态必不可少。这些蛋白质对于蛋白质折叠，组装和降解是必需的，并且涉及从应力条件中恢复细胞。HSP70蛋白质因热休克，氧化应激和致病性感染而上调。他们的主要作用是防止蛋白质聚集，重新折叠错误折叠的蛋白质以及靶向不可损害的蛋白质的降解。鉴于它们参与了基本细胞过程和应激反应，HSP70蛋白对于细胞存活和调节癌症，神经变性和其他病理的疾病结局至关重要。本研究旨在了解各种HSP70成员的主要结构，物理化学特性，磷酸化，泛素化和替代聚腺苷酸化位点预测。方法：SMART和Internoscan软件用于域分析。分别使用Protparam，NetPhos 3.1服务器DTU和Mubisida进行物理化学分析，磷酸化和泛素化站点分析。使用EST数据库研究了替代聚腺苷酸化。结果：域分析表明，某些HSP70成员中存在盘绕圈和核苷酸结合结构域。五个HSP70家庭成员在其3'UTR中具有替代的聚腺苷酸化位点。结论：确定工作为其结构，功能，相互作用组和聚腺苷酸化模式提供了宝贵的见解。研究其在癌症等疾病中的治疗潜力可能会有所帮助。
TDP-43聚腺苷酸化位点选择的失调是RNA在ALS/FTD和相关疾病中进行错误处理的定义特征
通讯作者：Albert R. La Spada，医学博士，博士病理学与实验室医学，神经病学，生物化学和神经生物学与行为UCI UCI神经治疗学中心加利福尼亚州Irvine University of California Irvine Universion，CA，美国加利福尼亚州92697 Alaspada@uci.edu.edu /div>
营养依赖性RNA聚合酶II延伸率控制通过选择性多聚腺苷酸化调节特定基因表达程序
RNA 聚合酶 II (RNAPII) 转录是一个动态过程，延伸率经常变化。然而，RNAPII 延伸动力学变化的生理相关性仍不清楚。我们在此表明，在酵母中，降低转录延伸率的 RNAPII 突变体会导致替代性多聚腺苷酸化 (APA) 发生广泛变化。我们揭示了 APA 影响慢突变体中基因表达的两种机制：3 ′ UTR 缩短和上游干扰非编码 RNA 的过早转录终止导致的基因去抑制。令人惊讶的是，受这些机制影响的基因富含涉及磷酸盐吸收和嘌呤合成的功能，这些过程对于维持细胞内核苷酸池至关重要。由于核苷酸浓度调节转录延伸，我们的研究结果表明 RNAPII 是核苷酸可用性的传感器，并且对核苷酸池维持很重要的基因已采用响应降低转录延伸率的调节机制。