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长期发展：利用长读长测序技术对牲畜进行群体规模结构变异研究的观点
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跨大西洋种群的遗传分化tigepod tigriopus brevicornis
摘要：竖琴型copepod tigriopus brevicornis属于潮间带岩池的Meiofauna，并沿着欧洲海岸广泛分布。从爱尔兰海到西班牙海岸采样了16个地点。我们使用ITS1标记来分析种群之间的关系，因为它显示出较低的插孔内变化（平均成对差异：1.00±0.8）和高插室差异（平均成对差异：16.38±7.39）。在433个bp中，总共57 bp被认为是分析的61个个体中的信息核苷酸。对遗传关系的分析强调了自然种群分布的南北分裂，并显示了吉伦德河口周围的遗传断裂点，这可能是由于该河口两个不同边的沿海地区的地貌特征差异。分离了各种种群，ITS1序列表明这些人群中存在特定的遗传特征。沿着大型岩石海岸线采样的北部人群具有一个种群的结构，并在地理位置接近人群之间以及地理上远处的人口之间进行了遗传交流。在大沙滩上的小岩石游泳池中采样了南部人口，由于该地区的地貌显示了孤立的种群。
许多赢家，很少的失败者：在气候变化中的非洲山地上的稳定鸟类种群
山区的生物经常暴露于极端气候，并且最容易受到气候变化的影响。对沿着海拔梯度的鸟类的长期研究，对于理解物种动态至关重要，在热带山脉中很少见，这限制了面对气候变化时了解其人口趋势的能力。我们在13年（2011 - 2023年）中建模了地下鸟类物种（n = 18）的局部丰度。Kasigau，肯尼亚，使用沿高度梯度收集的雾网数据。 我们的模型在研究期间显示出相对稳定的鸟类丰度。 但是，我们发现两次不同的人口崩溃影响了2015年和2022年大多数物种，这表明局部动态的变化可能导致山区鸟类种群的大量下降。 大多数物种在研究期间具有稳定的局部丰富性，但是参数引导显示一些趋势的下降趋势，包括一个流行的威胁物种。 我们强调了山区在面对全球环境转变（例如气候变化带来的）方面维持相对稳定的人群中的重要性，以及相对较小的空间变化的鸟类种群的活力。 面对温暖的气候，山区生态系统被视为潜在的生物多样性避难所，但需要进一步的研究来了解较高海拔高度的鸟类种群中短期和长期下降的驱动因素，尤其是在热带非洲。Kasigau，肯尼亚，使用沿高度梯度收集的雾网数据。我们的模型在研究期间显示出相对稳定的鸟类丰度。但是，我们发现两次不同的人口崩溃影响了2015年和2022年大多数物种，这表明局部动态的变化可能导致山区鸟类种群的大量下降。大多数物种在研究期间具有稳定的局部丰富性，但是参数引导显示一些趋势的下降趋势，包括一个流行的威胁物种。我们强调了山区在面对全球环境转变（例如气候变化带来的）方面维持相对稳定的人群中的重要性，以及相对较小的空间变化的鸟类种群的活力。面对温暖的气候，山区生态系统被视为潜在的生物多样性避难所，但需要进一步的研究来了解较高海拔高度的鸟类种群中短期和长期下降的驱动因素，尤其是在热带非洲。
高致病性 H5N1 禽流感病毒爆发前及爆发期间，城市野生鸭群的传播和免疫力
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将环境DNA用于种群遗传学的机会和固有的局限性
fi g u r e 2合成17项研究，报告组织样品与其他类型的样品（EDNA，散装，粪便或乙醇样品）之间的直接比较，用于研究种内多样性。（a）用组织样品鉴定的单倍型数量是用EDNA和其他类型的样品检测到的单倍型数量的函数。两个变量都是对数转换的。DOT表示在现场进行的比较，而三角形则用于在受控实验室环境中进行比较。虚线和虚线分别表示场（y = 1.247x -0.125）和实验室（y = 0.776 x + 0.836）研究的线性回归。灰线表示1：1相关性。（b）仅在其他类型的样品中仅在组织样品中鉴定出的单倍型的比例，或在目标研究中使用的两种样品类型中常见。
Banque Populaire 10140CréditMuni的状况
CIB面额10057 BANQUE CIC SUD OUEST 10096 LYONASIS DE BANQUE 10107繁殖 - Banque Populaire 10140 CareCréditManicipal de Marseille 10160CréditMobilier de Monaco De Monaco 10188 Banque Chalus Chalus Chalus 10206 ReciathCréditCréditnqueand pariive and du nord du nord Ances SA 10278联邦Craisse Mutuel 10383 10548 BANK OF SAVOIE 10773 Title market-France (MTS France) 10783 PROREALTIME 10807 BANQUE POPULLE BOURGOGNE Franche-Comté 10900 DIFFUCO 10907 BANQUE Populaire Aquitaine Atlantique Center 10918 CHOLET DUPONT OUDART 10930 Regional Haut de France Guarantee Fund 10983 STELLIUM INVEST 11006 CAISSE REGIONAL OF CRAGNOLE MUTUAL 11078 BAIL ACTEA IMBILIER 11083 NEXO CACHATE 11128 BPCE租赁11138 BPCE因子11188 RCI BANK 11206区域CréditCréditCréditAgricole Mutuel Nordi Midi-Midi-Pyrénées1238 Pargne Cepac 11353 Prantureux及关联11380 C.R.H.- 住房再融资基金11383 EPSENS 11408 WALLIS和FUTUNA BANK 11425节省和远见Normandy 11438 Hottinguer Bank
野生型骨髓细胞重新填充组织驻留巨噬细胞并逆转纯合 CSF1R 突变的影响
适应子宫外生存是哺乳动物生命中的关键事件。集落刺激因子 1 受体 (Csf1r) 基因 (Csf1rko) 纯合突变的大鼠缺乏巨噬细胞，这会严重损害断奶前体细胞生长和器官功能成熟。断奶时移植野生型骨髓细胞 (BMT) 可挽救组织巨噬细胞群，使其正常发育和长期存活。为了剖析巨噬细胞在出生后发育中的表型和功能，我们生成了断奶时野生型和 Csf1rko 大鼠所有主要器官的转录组谱，以及 BMT 挽救后的选定器官的转录组谱。转录组谱揭示了巨噬细胞缺乏对所有主要器官发育的微妙影响。网络分析揭示了 CSF1R 依赖性常驻组织巨噬细胞的共同特征，其中包括补体 C1Q 的成分 (C1qa/b/c 基因)。在 Csf1rko 大鼠中，循环 C1Q 几乎检测不到，在 BMT 后迅速恢复到正常水平。还鉴定了组织特异性巨噬细胞特征，特别是淋巴结中的窦巨噬细胞群。通过 CD209B (SIGNR1) 的免疫组织化学定位证实了 Csf1rko 大鼠中巨噬细胞的丢失。到 6-12 周时，Csf1rko 大鼠死于与间质巨噬细胞选择性丢失和粒细胞增多相关的肺气肿样病理。这种病理被 BMT 逆转。除了生理救援外，BMT 还精确地再生了驻留巨噬细胞的丰度和表达谱。脑是例外，其中 BM 衍生的类小胶质细胞与驻留小胶质细胞相比具有不同的表达谱。此外，转移的 BM 未能恢复血液单核细胞或 CSF1R 阳性骨髓祖细胞。这些研究为人类 CSF1R 突变的病理学和治疗以及与早产相关的先天免疫缺陷提供了模型。
景观水平的人类干扰导致热带森林中哺乳动物种群的丧失和收缩
Ilaria Greco ID 1 *，Lyelic Beaudrot 2.3，Chris Sutherland 4，Simone Tenan 5，Syone 2.3，Daniel Gorzynski 6，Ahumada 13，Rajan Amin 14，Megan Baker-Watton 1 Cremonesi 1 Cremonesi 1 Cremonesi 1 Cremonesi 1 Cremonesi 23：Adeline Fayolle 22:28，Adeline Fayolle 22:28，Davy Fonty Harry 31 22 Alys Granados 32.33，Patrick A. Jansen 34.35，Jayasilan Mohd-Azlan 11，Caspian Johnson Marcelo Magio 21：41,42，Emanuel H. Martin 43，Adriano Martinole版本28，Patrics C. Wright C. Wright C. Wright 25.50，C.
DNA 修复功能对于细菌应激防御至关重要，但长期治疗后，抗生素耐受亚群对环丙沙星和庆大霉素敏感
。CC-BY 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供（未经同行评审认证），作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2025 年 2 月 4 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2025.02.03.636342 doi：bioRxiv 预印本
基因组学，人口差异和世界上最大和濒危蝴蝶的历史人口统计学，亚历山德拉女王的鸟翼
世界上最大的蝴蝶是微观的巴布亚新几内亚鸟鸟鸟。尽管有多年的保守努力来保护其栖息地并繁殖最大的28厘米蝴蝶，但该物种仍然存在着在IUCN红色列表中濒临灭绝的人，并且只有两个同种群中仅占据了总共约140公里的同种异体种群。在这里，我们旨在组装涉及该物种的涉及基因组，以研究其基因组多样性，历史人口统计学，并确定人口是否是结构化的，这可以为试图培育这两个种群的保护计划提供指导。使用长和短的DNA读取和RNA测序的组合，我们组装了tribe troidini的六个参考基因组，与O. alexandrae的四个带注释的基因组和两个相关物种的基因组和相关物种的基因组，鸟翅目priamus priamus and Troides and rorides and robones gromongomaculatus。我们估计了这三种物种的基因组多样性，并使用两种基于多态性的方法来考虑了低多形形态无脊椎动物的特征。的确，染色体尺度的组件显示，整个Troidini的核杂合性非常低，O. alexandrae（低于0.01％）似乎异常低。人口分析表明，在整个O. Alexandrae历史上，NE稳定下降，大约10，000年前的两个不同人群的分歧。这些结果表明O. alexandrae的分布已经很长时间了。它还应使本地保护计划意识到这两个人群的基因组差异，如果试图跨越两个人群，则不应忽略。