本文档介绍如何通过使用 DECIPHER 包中的 DesignPrimers 函数设计组特异性引物。作为案例研究,本教程重点关注链霉菌属不同物种的全测序基因组的内部转录间隔区 (ITS)。ITS 位于编码 16S 和 23S 核糖体 RNA 的基因之间的染色体上。本文档中的示例旨在从多种密切相关的链霉菌物种中寻找针对单一链霉菌物种的引物。但是,任何一组分成组的比对序列都可以使用类似的策略。例如,使用此程序设计的针对 16S 基因的属特异性引物可在 http://DECIPHER.codes 在线获取。分成组的比对 DNA 序列数据库用作该程序的输入。首先,使用 TileSeqs 函数将序列预处理为重叠的图块,这些图块将作为引物设计的模板 DNA。其次,DesignPrimers 函数确定满足某些设计约束的所有可能引物集,例如在特定实验条件下有效扩增目标组的能力。接下来,对完整的引物集进行评分,以确定其与属于
纽约州致力于通过可再生能源产生其50%的电力,到2030年,温室气体排放量减少了40%。为了加速市场采用可再生能源,Nyserda正在投资于解决方案和方法,这些解决方案将产生更好的性能,降低成本,更大的可再生能源托管能力以及改善与电网的集成。
cfh f gctgtatgcactgaatctgga 136 r actgggtacgtgtgatttcatctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 123 r acgtttttttttcgctgcctgagtc cd44 f acacgagaagaagaagagagagcaggac 135 ttatctgcagtggatcgagttc 150 r gtagcttttcctttcctatgccaaacc oct4 f gagaatttgtgttgtcctggagtgc150 r tcgttgtgtgtgcatagtgctgtcgctgtcgcgtcggctg sox2 TTCGGGTAGTGGAAAACCAG 108 R AGTAGAAATACGGCTGCACC Klf4 F ACCTACACAAAGAGTTCCCATC 136 R TGTGTTTACGGTAGTGCCTG EpCAM F CAGACAAGGACACTGAAATAACC 134 R TGTGATCTCCTTCTGAAGTGC ALDH1A3 F cttctgccttagagtctggaac 138 r tcacttctgtgtgtattcggcc abcg2 f aggtctgtgtgtggtggtcaatctcac 142 r tcctgttgcattgagtcctg nanog nanog nanog f gaaatacctcctcctcagcctcctcctccctccagc149 ggatcgggttaagggaaagag 139 r aggagacataggcgagaggggggggggggg epas1 f cccatgtctccaccttcaag 136 r aaggcttgcttcttcattccttcatctcccccccccccccccccccacacaagcaagactc146 r gggggggggtccgtccccccctccctcctcccctcct4 105 r tcttcacggaaacagggttc ptprj f caagcaggctcaggactatg 142 r ggaggtgaAatggaAtggaActgtct myo6 f acgtgctccaaagtctgtgttac12 atccatgagcttttttccccagβ-肌动蛋白f cccagcacaatgaagatcaag 136 r gactcgtcatcatactcctgcttg abcg2,atp biding cassette cassette subfimily g ement g ement 2; Aldh1a3,醛脱氢酶1家族成员A3; CFH,补体因子H; CXCR4,C-X-C基序趋化因子受体4; EPAS1,内皮PAS结构域蛋白1; Epcam,上皮细胞粘附分子; EPB41L3,红细胞膜蛋白带4.1样3; GJA1,间隙连接蛋白α1; KLF4,KLF转录因子4; Myo6,肌球蛋白VI; PTPRJ,蛋白酪氨酸磷酸酶受体类型J
Cogentech S.R.L.福利公司的成员属于IFOM的管理和协调 - 分子肿瘤学基金会通过Adamello 16,20139年意大利米兰 - 股本€1,100,000 i.v.本地单位:C/O SICILIL S.C.P.A.的科学和技术公园-Z.I。 Palma I Block,V。Lancia,57-95121 Catania P. Iva,C。F。和在米兰公司,Monza,Brianza和Lodi的公司登记册中注册。 04641450962 -R.E.A. MI-1763886 www.cugentech.it |序列service@cogentech.it | ph。 +39 02 57430 3210/3207-Z.I。Palma I Block,V。Lancia,57-95121 Catania P. Iva,C。F。和在米兰公司,Monza,Brianza和Lodi的公司登记册中注册。 04641450962 -R.E.A.MI-1763886 www.cugentech.it |序列service@cogentech.it | ph。+39 02 57430 3210/3207
收到日期:2022 年 4 月 14 日;修订日期:2022 年 5 月 31 日;接受日期:2022 年 5 月 31 日,出版日期:2022 年 5 月 31 日 DOI:10.6026/97320630018471 出版伦理声明:作者声明他们遵守 COPE 出版伦理指南,如 https://publicationethics.org/ 其他地方所述。作者还承诺,他们与任何其他第三方(政府或非政府机构)无关联,且与本出版物有任何形式的不道德问题有关。作者还声明,他们没有隐瞒有关本文的任何误导出版商的信息。 官方电子邮件声明:通讯作者声明,并非所有作者都可以获得其机构的终身官方电子邮件 许可声明:这是一篇开放获取文章,允许在任何媒体中不受限制地使用、分发和复制,前提是对原始作品进行适当的归功于。本文章根据 Creative Commons 署名许可条款发布。读者评论:BIOINFORMATION 上发表的文章开放供相关发表后评论和批评,这些评论和批评将立即发布,并附有原始文章的链接,无需支付开放获取费用。评论应简洁、连贯且具有批判性,字数不得超过 1000 字。
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