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启动在马铃薯领域种植鸡蛋蛋白
分子农民Maya Sapir-Mir（左）和Raya Liberman-Aloni正在接受全球烹饪的最爱，并将其转变为低成本生物反应器以生产卵子蛋白。他们在2022年建立了Polopo，以设计土豆植物以生产蛋清蛋白质，而无需昂贵的生物反应器。该公司位于以色列的内斯Ziona，已开始首次实地试验，种植了富含蛋白质的块茎。Ovalbumin是蛋清中的主要蛋白质，是食品制造商作为成分所追捧的，因为它有助于提高营养价值并延长包装产品的保质期。团队通过将整个卵蛋白DNA序列插入叶片，从而设计了马铃薯，因此，该序列包含了产生功能齐全的蛋白质的指令，该蛋白质在营养和化学上与鸡蛋中的蛋白质相同。将养分从叶子移到块茎的韧皮部运输了工程化的椭圆蛋白产品。遗传改性的polopo马铃薯看起来与原始的polopo相同，具有其优势，并将蛋白质储存在块茎中，实际上像迷你抗反应器一样有效地发挥作用。这些植物的生长快且廉价地培养，并且由于它们在遗传上与第一个
摘要 背景与目的：Isthmin 2 (ISM2) 属于分泌蛋白家族。其功能和在肿瘤发病机制中的作用仍不清楚。
摘要背景与目的：Isthmin 2 (ISM2) 属于分泌蛋白家族。其功能和在肿瘤发病机制中的作用仍不清楚。我们打算研究 ISM2 在结直肠癌 (CRC) 中的潜在生物学作用和临床重要性，例如免疫治疗。方法：获取来自基因表达综合 (GEO) 以及癌症基因组图谱 (TCGA) 的数据集以估计 CRC 中 ISM2 的表达水平。ROC 曲线计算 ISM2 的诊断价值。TIMER 2.0 用于研究 ISM2 表达与免疫细胞和主要免疫检查点之间的关联。京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 富集分析和基因本体论 (GO) 进一步用于研究相关途径。最后，进行了几个体外和体内试验，例如异种移植生长试验，以验证 ISM2 在免疫治疗和 CRC 进展中的作用。结果：ISM2 在 CRC 患者中高表达。此外，ISM2 是一个依赖性危险因素。ISM2 高表达与不良预后显着相关。更重要的是，一些体外和体内试验证实了 ISM2 在 CRC 进展中的重要意义。此外，ISM2 的沉默可诱导更多的 CD8 + T 细胞在肿瘤中浸润并增强 PD1ab 治疗。结论：ISM2 与 CRC 的临床病理特征和肿瘤微环境密切相关。关键词：Isthmin 2、结直肠癌、CD8 + T 细胞、免疫检查点阻断资金：无*本作品已根据 CC BY-NC-SA 许可发表。版权所有©作者引用本文为：王 Y，王 P，刘 J，钟 L。ISM2 是一种新型预后生物标志物，与结直肠癌的肿瘤免疫微环境相关。伊朗红新月会医学杂志 2024,96.1-11。1. 引言
RNA-Seq基因融合检测工具的荟萃分析
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月7日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.07.636955 doi：Biorxiv Preprint
2025; 15（6）：2229-2249。 doi：10.7150/thno.104883研究论文细胞外基质蛋白优化胰腺器官的微环境fr
的原理：对操纵信号通路的当前理解，以产生所有分泌激素的内分泌细胞类型（即，从诱导的多能干细胞（IPSC）中）具有所有主要分泌激素的内分泌细胞类型（即α，β，β，δ和γ细胞）的理解。但是，供体胰岛短缺需要我们在体外产生功能性胰岛。在这项研究中，我们旨在找到脱细胞的胰腺外基质（DPECM）蛋白，以利用信号通路并促进功能性IPSC胰岛胰岛器官发生。方法：我们进行了蛋白质组学分析，以识别猪和大鼠DPECM的关键胰岛促进因子。这样，我们将II型胶原蛋白（COL2）确定为一种潜在的生物材料提示，可以认可IPSC的胰岛发育。使用全球转录组分析，基因集富集分析，免疫荧光显微镜，流式细胞术，蛋白质印迹和葡萄糖刺激的激素分泌分析，我们检查了COL2在调节IPSC胰腺pancreatic谱系规范和信号通路方面的作用，对等初学和等级有机化和形成。结果：我们发现COL2充当了一种功能性生物材料，可增强IPSC的胰岛发育，类似于胶原蛋白型V（COL5），如我们先前的研究中所报道的。col2基本上刺激了内分泌祖细胞和随后的胰岛类器官的形成，其胰腺签名基因和蛋白质表达显着升高。此外，它增强了胰岛对激素分泌的葡萄糖敏感性。结论：我们证明了DPECM在精炼干细胞分化微环境中的至关重要的作用，以进行器官发育和成熟。与各种信号通路相关的基因表达簇，包括但不限于氧化磷酸化，胰岛素分泌，细胞周期，规范WNT，缺氧和干扰素反应，受到Col2和Col5提示的极大影响。我们关于干细胞规范，器官发生和成熟的生物材料刺激信号传导的发现，为增加内分泌组织的分化疗效提供了一种新方法，这可以有助于生物学功能性胰岛的产生。
工程弓形虫Gondii分泌系统用于细胞内多种大型治疗蛋白向神经元的细胞内递送
在诸如血脑屏障之类的生物屏障中传递大分子，限制了它们在体内的应用。先前的工作表明，弓形虫弓形虫是一种自然从人肠道传播到中枢神经系统（CNS）的寄生虫，可以将蛋白质传递给宿主细胞。在这里，我们设计了T. gondii的内源性分泌系统，晶状体和致密颗粒，通过转化为毒素和gra16，将多个大型（> 100 kDa）治疗蛋白传递到神经元中。我们证明了使用成像，下拉测定，SCRNA-SEQ和荧光记者的培养细胞，脑器官和体内的递送以及探针蛋白活性。我们证明了小鼠腹膜内给药后的强大分娩，并表征了整个大脑的3D分布。作为概念证明，我们证明了GRA16介导的MECP2蛋白的大脑递送，MECP2蛋白是RETT综合征的假定治疗靶标。通过表征系统的潜在和当前局限性，我们旨在指导更广泛应用所需的未来改进。
2025.01.31.635872.full.pdf
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该预印本版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月5日。 https://doi.org/10.1101/2025.01.31.635936 doi：Biorxiv Preprint
真空型制动液和恢复机的设计和开发
新兴证据表明，除了其在抗病毒RNA沉默中得到良好认可的功能外，dsRNA还引发了触发免疫力（PTI），还可能导致植物抵抗病毒感染。然而，与细菌和真菌诱导剂介导的PTI相比，DSRNA诱导的防御的行动方式和信号传导途径的性质仍然很差。Here, using multicolor in vivo imaging, analysis of GFP mobility, callose staining, and plasmodesmal marker lines in Arabidopsis thaliana and Nicotiana benthamiana , we show that dsRNA-induced PTI restricts the progression of virus infection by triggering callose deposition at plasmodesmata, thereby likely limiting the macromolecular transport through these单元格通信通道。The plasma membrane-resident SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR-LIKE KINASE 1, the BOTRYTIS INDUCED KINASE1/AVRPPHB SUSCEPTIBLE1-LIKE KINASE1 kinase module, PLASMODESMATA-LOCATED PROTEINs 1/2/3, as well as CALMODULIN-LIKE 41 and Ca 2+ signals are involved in the dsRNA-induced signaling leading to callose deposition at浆膜和抗病毒防御。与经典的细菌诱发剂鞭毛蛋白不同，dsRNA不会触发可检测到的活性氧（ROS）爆发，从而证实了不同的微生物模式触发具有不同特征的部分共享免疫信号传导框架的观念。可能是一种反策略，来自不同病毒的病毒运动蛋白抑制了DSRNA诱导的宿主反应，从而导致callose沉积以实现感染。因此，我们的数据支持一个模型，在该模型中，植物免疫信号传导通过诱导浆果膜上的callo糖沉积来限制病毒运动，并重新使用病毒抵消这种免疫力。
紧密连接蛋白在胶质肿瘤发展和进展中的作用
紧密连接在上皮细胞和内皮细胞中形成细胞旁屏障，并调节液体、分子的扩散以及细胞在组织隔室中的渗透。紧密连接由一组整合膜蛋白组成，包括紧密连接蛋白家族、紧密连接相关 Marvel 蛋白家族、连接粘附分子家族以及锚定细胞骨架的蛋白质，例如小带闭合蛋白和扣带蛋白家族。神经递质或细胞因子等多种因素以及缺血/缺氧、炎症、肿瘤发生、磷酸化/去磷酸化、泛素化和棕榈酰化等过程调节紧密连接蛋白。紧密连接蛋白参与导致神经胶质瘤形成的肿瘤发生过程。在神经胶质瘤中，紧密连接蛋白、闭合蛋白和小带闭合蛋白-1 丰度明显失调，并且已观察到它们的错位。细胞间粘附力减弱和细胞分离是导致神经胶质瘤渗入周围组织的原因。此外，血脑屏障的旁细胞通透性（由紧密连接蛋白参与形成）会影响肿瘤周围水肿的发展，同时也会影响药物向神经胶质肿瘤的输送速度。了解脑肿瘤中的连接和旁细胞环境对于预测神经胶质肿瘤进展和化疗药物输送的可行性至关重要。这些知识也可能阐明高级别和低级别神经胶质瘤之间的差异。
NMR光谱窗口对SARS-COV-2感染对循环细胞因子的血浆脂蛋白和代谢产物的系统性影响
摘要：为了研究SARS-COV-2感染的全身代谢效应，我们分析了人类血浆中的1 H NMR光谱数据，并与多个血浆细胞因子和趋化因子和趋化因子和趋化因子（并行测量）共同建模。因此，在从SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者（n = 15，具有多个样本时间点）和年龄相匹配的健康对照（N = 34的CORMED-CCR）中，在SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者（n = 15，n = 15，n = 15）中记录的血浆中收集了600 MHz 1 h溶剂抑制的单脉冲，自旋回波和2D J分解光谱。测试了SARS-COV-2阴性的Uenza样临床症状（n = 35）。我们将单脉冲NMR光谱数据与体外诊断研究（IVDR）的信息进行了比较，以了解从原始1D NMR数据中提取的定量脂蛋白促蛋白（112个参数）。所有NMR方法都对使用单个NMR方法的对照组和SARS-COV-2阴性患者对SARS-COV-2阳性患者进行了高度显着歧视，从而给出了有关疾病诱导的现场版本的不同诊断信息。选定患者的纵向轨迹分析表明，在恢复阶段没有可检测的病毒的个体中，代谢恢复是不完整的。我们观察到四个血浆细胞因子簇，它们表达了与多种脂蛋白和代谢产物的复杂统计关系。IL-18，IL-6和IFN-γ与IP-10一起，RANTES与LDL1-4亚构件表现出很强的正相关性，并且与多个HDL亚段的负相关性。包括以下内容：群集1，包括MIP-1β，SDF-1α，IL-22和IL-1α，与多个增加的LDL和VLDL亚隔离相关；群集2，包括IL-10和IL-17A，仅与脂蛋白蛋白相关。群集3，包括IL-8和MCP-1，与多种脂蛋白成反比。总体而言，这些数据表明了与SARS COV-2感染的多级细胞免疫反应与血浆脂蛋白相互作用的多级免疫反应，从而使疾病的强烈和特征性免疫代谢表型相互作用。我们观察到，呼吸道恢复阶段和无测试病毒的一些患者在代谢上仍然是高度异常的，这表明这些技术在评估全身恢复中的新作用。关键字：血浆，Covid-19，Sars-Cov-2，NMR光谱，单脉冲，自旋回波，IVDR，代谢表型，生物标志物，诊断模型，脂蛋白■简介
编程巨核细胞以生产用于传递非本地蛋白质的工程血小板
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年1月27日。 https://doi.org/10.1101/2023.10.13.562311 doi：Biorxiv Preprint