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研究文章的结构共同点由物理化学原理确定
1实验和临床生物医学科学系“ Mario Serio”，佛罗伦萨大学生物化学部分，意大利佛罗伦萨50134； 2 de Biotecnologia I d de Biomedicina（IBB）和DeBioquímicaI Biogia Molecular，Universitatautònomade Barcelona，08193，西班牙巴塞罗那贝尔特拉（Bellaterra）； 3比利时3000卢文的大脑和疾病研究中心开关实验室； 4比利时3000卢文的卢文库文，卢文的蜂窝和分子医学系Switch Laboratory； 5比利时3000卢文的AI和计算生物学中心开关实验室； 6物理与天文学系“ G. Galilei”，帕多瓦大学，意大利帕德沃35131； 7帕多瓦大学帕多瓦大学国家核物理研究所（INFN），意大利帕多瓦35131； 8英国CB21EW剑桥大学，Yusuf Hamied化学系错误折叠疾病中心，英国
FOXO和Tribbles蛋白的结合表达预测神经胶质瘤的存活
3博士学位生物医学科学课程，阿尔加维大学，阿尔加维大学，法罗，葡萄牙）4当地的阿尔加维健康部门（URSALG）。 LeãoPenedoStreet，8000-386 Faro，葡萄牙3博士学位生物医学科学课程，阿尔加维大学，阿尔加维大学，法罗，葡萄牙）4当地的阿尔加维健康部门（URSALG）。LeãoPenedoStreet，8000-386 Faro，葡萄牙
表面蛋白再次检测抗体
细胞表面蛋白。细菌培养物被离心，并在磷酸盐缓冲盐水中剧烈搅拌，或者没有进一步的甘氨酸处理和硫酸铵沉淀。兔子用黑腿疾病疫苗皮下进行了两次，间隔为两周。免疫血清。酶联免疫吸附测定（ELISA）。Bradford分析结果显示，第二种方法中的蛋白质浓度更高。 十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳分析显示，在第一种方法中，C. chauvoei的细胞表面蛋白的多个条带，在第二种方法中与鞭毛蛋白相等的鲜明条带。 ELISA结果表明，纯化的蛋白质能够检测针对黑腿疾病疫苗的抗体。 纯化的蛋白质将是间接ELISA的替代抗原，以监测接种疫苗的农场动物的免疫反应。Bradford分析结果显示，第二种方法中的蛋白质浓度更高。十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳分析显示，在第一种方法中，C. chauvoei的细胞表面蛋白的多个条带，在第二种方法中与鞭毛蛋白相等的鲜明条带。ELISA结果表明，纯化的蛋白质能够检测针对黑腿疾病疫苗的抗体。纯化的蛋白质将是间接ELISA的替代抗原，以监测接种疫苗的农场动物的免疫反应。
生物分子冷凝物的固有无序蛋白质的构象熵
最近已经发现，真核细胞宿主具有多种生物分子冷凝水。这些冷凝水通常包含具有内在无序区域（IDR）的蛋白质和/或RNA成分。虽然已经提出并证明了IDR在冷凝物生物学中扮演许多角色，但我们在这里建议IDR的另外至关重要的作用，这是将不需要的“入侵者”排除在冷凝水之外。这种排除效应来自IDR的较大构象熵，即，占用空间的自由能成本很高，否则IDR将可以使用。通过将聚合物理论与贴纸模拟相结合，我们表明，相关的插入自由能随着冷凝水中的IDR浓度以及入侵者的大小而增加，从而使大型入侵者的表面积达到线性缩放。我们发现，在逼真的IDR浓度下，颗粒的颗粒与平均蛋白质的大小（直径为4 nm）可以超过97％，将其排除在冷凝水之外。要克服这种熵屏障，分子必须与凝聚力成分相互作用，以招募作为客户进入冷凝水。将开发的尺寸排斥理论应用于生物冷凝水中表明，冷凝水IDR可能在生物体和冷凝物类型中起一般的排他性作用。
自杀念头的行为和社会预测指标以及青少年和年轻人的尝试
多宿主病原体犀牛Equi是一种巨噬细胞的寄生虫，可防止吞噬体的成熟，从而创造了一个热情好客的环境，支持细胞内生长。有毒r。equi分别是宿主特异性的毒力质粒，PVAPA，PVAPB和PVAPN，它们编码了属于七个单属进化枝的17个VAP蛋白的家族。我们检查了所有17种VAP蛋白，以补充A R的细胞内生长的能力。equiδVAPA菌株，并显示仅VAPK1，VAPK2和VAPN支持该菌株的鼠巨噬细胞的生长。我们表明，只有进化枝-1蛋白vapa，vapk1，vapk2和vapn位于r上。Equi细胞表面。PVAPB质粒编码三个进化枝-1蛋白：VAPK1，VAPK2和VAPB。后者无法支持细胞内生长，并且不在细胞表面。我们先前表明，无序的N末端VAPA序列与VAPA的细胞表面定位有关。我们在这里表明，尽管17个VAP蛋白的无序N末端的长度和序列高度可变，但它在进化枝内是保守的，这与我们的观察到，即进化枝-1 VAP蛋白的N末端在细胞表面定位中起作用。
树突状细胞1型控制癌症中三级淋巴样结构的形成，维持和功能
酪氨酸磷酸化是一种重要的翻译后修饰，可调节多细胞生物中许多生化信号网络的作品。迄今为止，在人类蛋白质中观察到了46,000种酪氨酸，但对大多数这些位点的功能和调节知之甚少。为了测试磷酸化的作用，主要挑战是产生重组磷酸蛋白。 mu-对酸性氨基酸的标记通常无法复制磷酸化的酪氨酸残基的大小和电荷，而合成氨基酸掺入的成本很高，产量相对较低。 在这里，我们展示了一种方法，灵感来自于如何通过二次焦油互动来发现细胞中的天然玫瑰氨酸激酶，从而增强了酪氨酸激酶的先天催化特异性，而无需过多。 我们设计了用于多种方法的多种方法，用于在大肠杆菌中产生高产量的磷酸蛋白产物。 在这里，我们测试磷酸化作为靶向相互作用（SH3-聚丙烯序列）的函数的函数，该磷酸化是跨不同特异性山脉激酶的不同反应方法。 该系统提出了一种廉价且可拖动的系统，用于产生磷蛋白和磷酸肽，我们演示了如何用于测试EGFR和PD-1靶标的抗体特异性。 这种方法是通过体外反应和共表达方法的灵活性来增强重组蛋白上的重组蛋白的共同作用的一种概括方法。 我们将其称为SISA-KIT，用于信号启发的合成增强激酶工具包。主要挑战是产生重组磷酸蛋白。mu-对酸性氨基酸的标记通常无法复制磷酸化的酪氨酸残基的大小和电荷，而合成氨基酸掺入的成本很高，产量相对较低。在这里，我们展示了一种方法，灵感来自于如何通过二次焦油互动来发现细胞中的天然玫瑰氨酸激酶，从而增强了酪氨酸激酶的先天催化特异性，而无需过多。我们设计了用于多种方法的多种方法，用于在大肠杆菌中产生高产量的磷酸蛋白产物。在这里，我们测试磷酸化作为靶向相互作用（SH3-聚丙烯序列）的函数的函数，该磷酸化是跨不同特异性山脉激酶的不同反应方法。该系统提出了一种廉价且可拖动的系统，用于产生磷蛋白和磷酸肽，我们演示了如何用于测试EGFR和PD-1靶标的抗体特异性。这种方法是通过体外反应和共表达方法的灵活性来增强重组蛋白上的重组蛋白的共同作用的一种概括方法。我们将其称为SISA-KIT，用于信号启发的合成增强激酶工具包。
白血病蛋白PHF6和PHIP形成一种染色质复合物，抑制髓样白血病
髓样白血病是具有多种突变景观的异质性癌症。尽管许多突变的基因属于普通蛋白质复合物，但有些缺乏已知的功能伙伴，并且具有不清楚的作用。pHF6是一种良好的染色质结合蛋白，复发突变赋予急性和慢性髓样白血病的不利预后。在这里，使用人PHF6敲除和救援，我们表明PHF6是一种转录阻遏物，可结合活性染色质并抑制茎基因程序。我们剖析了九个临床错义突变，并表明所有人都会产生不稳定的，肌莫尔的或非功能性的PHF6蛋白。在收敛的证据线指导下，我们将PHIP（一种新认识的AML突变蛋白）视为PHF6的功能合作伙伴。我们表明PHIP损失表PHF6损失，并且PHF6需要PHIP占据染色质并发挥下游转录效应。我们的工作将两个不同的白血病蛋白统一的PHF6和PHIP统一成为一种抑制AML茎的常见功能复合物。
人类抗体针对可变的疟疾蛋白
疟疾是一种由疟原虫属寄生虫引起的血液传播感染，仍然是全球健康威胁。在 2022 年的 2.49 亿疟疾病例中，超过 60 万例死亡（见 go.nature.com/48ummr6）。大多数疟疾死亡病例发生在撒哈拉以南非洲感染恶性疟原虫的儿童中。在第 182 页，Reyes 等人 1 深入了解了抗体如何靶向关键的寄生虫蛋白。与恶性疟原虫感染相关的严重疾病的一个标志是一种称为隔离的现象（图 1），其中寄生虫感染的红细胞粘附在小血管（微血管）上。这可以防止脾脏中这些血细胞被破坏。隔离会导致血流受阻、炎症、器官损伤和危及生命的并发症，例如一种称为脑型疟疾的临床病症。隔离是由多域寄生虫蛋白家族 PfEMP1 中的特定相互作用介导的，这些蛋白在受感染的红细胞表面表达。这些蛋白质与血管内皮细胞上的受体相互作用 2–4 。
strpsearch：快速检测结构化串联重复蛋白
动机：结构化串联重复蛋白质（Strps）构成以重复性结构基序为特征的串联重复的子类。这些蛋白质表现出不同的二级结构，形成了重复的第三级排列，通常会导致大分子组件。尽管序列高度可变，但STP可以执行重要和多样的生物学功能，并保持一致的结构，并具有可变数量的重复单元。随着蛋白质结构预测方法的出现，现已公开可用的数百万个蛋白质的3D模型。但是，由于缺乏准确性和较长的执行时间，因此使用当前的最新工具对Strp的自动检测仍然具有挑战性，从而阻碍了他们在大型数据集上的应用。在大多数情况下，手动策展仍然是检测和分类strp的最准确的方法，使其对注释数百万个结构不切实际。
氯胺酮对心脏手术中TNF-Alpha和IL-6的影响在FLT3/RAS/RAS/RAF/MEK/ERK途径中确立胸喹酮作为突变癌蛋白的潜在抑制剂的作用
FLT3中的突变迅速迅速激活RAS/RAF/MEK/ERK生长信号。FLT3-D835Y突变赋予对急性髓样白血病（AML）治疗的FLT3抑制剂的抗性。KRAS-G12C和BRAF-V600E是几种癌症的频繁突变。虽然可以使用对RAS，RAF，MEK和ERK的抑制剂，但它们通常对BRAF或KRAS突变的毒性率通常没有成功。这项研究评估了从Nigella sativa Seed获得的胸喹酮（TQ）的潜力（TQ）作为FLT3-D835Y，KRAS-G12C，BRAF-V600E，MEK，MEK和ERK和ERK和ERK的抑制剂的作用，并以Ras/ras/raf/raf/raf/raf/raf/eRK的方式调整了ras/raf/ras/eRK的表达。细胞与TQ孵育，我们利用RT-QPCR测量靶基因的mRNA水平。对FLT3-D835Y，KRAS-G12C，BRAF-V600E，MEK和ERK蛋白的TQ和参考抑制剂的分子对接进行了检查。TQ显着下调K-RAS，B-RAF，MEK1和ERK2表达式。TQ也停靠在FLT3-D835Y，KRAS-G12C，BRAF-V600E，MEK1和ERK2上，具有较高的结合亲和力和低对接分数。该研究将TQ鉴定为多个靶突变的抑制剂，这些突变可以抵抗对FLT3-D835Y，KRAS-G12C和BRAF-V600E抑制剂的抵抗力，从而有助于改善AML治疗。