diaphorin是由“ candidatus profftella armatura”(伽马马环状)产生的聚酮化合物,这是重要的农业害虫的强制性互助者,亚洲柑橘cyllid psyllid-ina-ina citri- citri(hemiptera)。我们先前的研究表明,diaphorin在d的生理浓度下。citri,抑制枯草芽孢杆菌(Firmicutes)的生长和细胞分裂,但促进了大肠杆菌(γ-蛋白酶菌)的生长和代谢活性。这种独特的diaphorin特性可以帮助D。citri,可能会影响“念珠菌自由杆菌属”的传播。 (字母杆菌),最具破坏性柑橘疾病的病原体。此外,可以利用该特性来促进微生物生产工业材料的效率。但是,此活动的基础机制尚不清楚。diaphorin属于Pederin-型化合物的家族,该家族通过与真核生物核糖体结合来抑制真核生物中的蛋白质合成。因此,作为评估diaphorin对细菌基因表达的直接影响的第一步,这项研究检查了使用b的核糖体使用diaphorin对体外翻译的影响。枯草和e。大肠杆菌,量化绿色荧光蛋白的产生。结果表明涉及b的基因表达。枯草和e。大肠杆菌核糖体以及五毫米透明蛋白分别为29.6%和13.1%,而不是对照。这表明diaphorin对b的不良影响。枯草液至少部分地归因于其对基因表达的抑制作用。此外,由于翻译系统的成分是常见的,除了核糖体以外,b骨出现了更大的抑制作用。枯草核糖体暗示核糖体是diaphorin的潜在靶标之一。另一方面,结果也暗示diaphorin对E的积极影响。大肠杆菌是由于转录和翻译的核心机制以外的目标。这项研究首次进行了pederin同类体影响细菌基因表达的情况。
表 2. 支持基因注释的证据。手工注释的柑橘木虱 Wnt 通路基因。总共有 24 个基因模型。每个基因模型都分配了一个标识符,并列出了用于验证或修改基因模型结构的证据。还列出了最能支持手工注释的 MCOT 转录组标识符。当存在从头转录组、Iso-Seq、RNA-Seq 和直系同源物支持的证据时,表中会标记“X”。MCOT:基于基因组 MAKER、Cufflinks、Oases 和 Trinity 转录本预测的综合转录组;MAKER:基因预测;从头转录组:使用 Iso-Seq 长读和 RNA-Seq 数据的独立转录组;Iso-Seq 转录本:用 Pacific Biosciences 技术生成的全长转录本; RNA-Seq:映射到基因组的读取也用作剪接点的支持证据;直系同源物证据:来自相关半翅目物种和果蝇的蛋白质。