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IDH wildType胶质母细胞瘤的纵向多模式分析揭示了预后不同的治疗反应的分子进化和细胞表型
抽象背景。尽管在IDH-WildType胶质母细胞瘤的生物学上取得了进步，但它仍然是一种毁灭性的疾病，中位生存期不到2年。然而，对当前护理标准治疗方案的异质反应的分子基础包括最大安全切除，辅助辐射和替莫唑胺化学疗法的分子基础仍然未知。方法。对106名患者的配对初始和复发性胶质母细胞瘤试样进行了全面的组织病理学，基因组和表观依赖氏症评估，以研究分子进化和细胞表型，这些分子进化和细胞表型。结果。虽然TERT启动子突变和CDKN2A纯合缺失是通过初始肿瘤和复发性肿瘤共享的神经胶质作用期间的早期事件，但大多数其他复发性遗传改变（例如，EGFR，PTEN，PTEN和NF1）通常是私有的，属于初始或反复发生的肿瘤，表明后期在后球后期的摄取。此外，胶质母细胞瘤表现出异质的表观基因组进化，亚群在全球性高甲基化，低甲基化或保持稳定的情况下变得越来越稳定。进行肉瘤转化的胶质母细胞瘤的复发时间较短，并且在NF1，TP53和RB1改变以及间质表观遗传学类中显着富集。在替莫唑胺治疗后出现体细胞超突变的患者与疾病复发和长时间的总生存期间的间隔明显更长，并且在MGMT启动子区域的4个特定CpG位点上增加了甲基化，这与这种超孕期的发展显着相关。最后，开发了347个关键CpG位点的DNA甲基化水平变化的表观基因组进化特征，与临床结局显着相关。结论。胶质母细胞瘤经历异质的遗传，表观遗传和细胞进化，其基础是预后不同的治疗反应。
转移性乳腺癌的基因组图谱
除了已知的 ESR1 热点突变外，我们还观察到转移性富集了以前未报告的、配体结合结构域中较低流行率的突变，这意味着这些突变也可能具有功能性。此外，单个 ESR1 热点在特定的转移组织和组织学中显著富集，表明这些突变之间存在功能差异。所有转移瘤中富集的其他改变包括 CDK4 调节因子 CDKN1B 的功能丧失和转录因子 CTCF 的突变。在特定转移部位富集的突变通常反映靶组织的生物学，可能是对局部环境生长的适应。这些包括脑转移瘤中的 PTEN 和 ASXL1 改变以及皮肤中的 NOTCH1 改变。我们观察到肺转移瘤中 KRAS 、 KEAP1 、STK11 和 EGFR 突变的富集。然而，这些肿瘤中其他突变的模式表明，这些是被误诊的肺原发性肿瘤而不是乳腺转移瘤。
甲状腺癌中的端粒酶逆转录酶启动子突变：精确肿瘤学的含义 - 叙事评论
v600e），或RAS突变或RET -PTC融合，而大多数FTC具有PAX8 -PPARγ融合或RAS突变，但很少表现出改变的BRAF。同时，BRAF和RAS突变都经常出现在PDTC和ATC中，并且抑制肿瘤抑制剂TP53的失活很常见，尤其是在ATC中（7,9,10）。此外，在大约三分之一和十分之一的ATC中看到了其他肿瘤抑制剂（包括CDKN2A-RB1和PTEN）的畸变（7,9）。与分化的FTC或PTC相比，肿瘤抑制器的失活显然是未分化的PDTC和ATC的定义特征。总体而言，上面的基因组和表观遗传改变以及对患者特定临床特征的认识的越来越多，使TC护理中的精确药物成为疾病诊断，风险分层，预后和治疗决策或靶向治疗药物的实现范式。
M2145 一般基因检测生殖细胞疾病。......
术语 定义 ASCO 美国临床肿瘤学会 ATM 毛细血管扩张性共济失调突变 BRCA1/2 乳腺癌基因 1/2 CAP 美国病理学家协会 CDH1 钙粘蛋白-1 CLIA '88 临床实验室改进修正案（1988 年） CMS 医疗保险和医疗补助中心 CNV 拷贝数变异 CSG 癌症易感基因 ctDNA 环状肿瘤脱氧核糖核酸 FDA 食品药品管理局 EMSO 欧洲肿瘤医学学会 LDTs 实验室开发的测试 LOF 功能丧失 MGPT 多基因面板测试 NCCN 美国国家综合癌症网络 NGS 新一代测序 PALB2 BRCA2 的伴侣和定位器 PTEN 磷酸酶和张力蛋白同源物 PVG 致病性种系变异 smMIPS 单分子分子倒位探针 SNPs 单核苷酸多态性 TP53 肿瘤蛋白 P53
非小细胞肺癌靶向治疗新进展
非小细胞肺癌（NSCLC）的高发病率和死亡率一直是威胁人民健康的重大威胁。随着非小细胞肺癌致癌驱动因素的识别和靶向药物的临床应用，非小细胞肺癌患者的预后大大改善。然而，在大量非小细胞肺癌病例中，致癌驱动因素是未知的。识别基因改变对于NSCLC的有效个体化治疗至关重要。此外，靶向药物难以在临床上应用，癌症药物耐药性是限制靶向药物疗效和应用不可避免的障碍。本综述介绍了靶向药物耐药机制和新发现的非小细胞肺癌靶点（例如 KRAS G12C、NGR、DDR、CLIP1-LTK、PELP1、STK11/LKB1、NFE2L2/KEAP1、RICTOR、PTEN、RASGRF1、LINE-1 和 SphK1）。对这些机制和靶点的研究将推动非小细胞肺癌的个体化治疗，以产生更好的结果。
引用本文：Castillo P、Marginet M、Jares P、García M、Gonzalvo E、Arance A 等。实施 NGS 面板用于临床实践
结果：共对 155 个样本进行了分子分析，但 40 个样本（25.8%）不适合进行测序。在 29 个样本中比较了 BRAF V600 实时聚合酶链反应和靶向 NGS 的临床实用性，观察到非常好的一致性（Kappa = 0.89，95% 置信区间 0.68 ± 1.05）。通过 NGS 在 75 个样本（65%）中发现了致癌突变，其中 53% 是需要个性化治疗的候选人。最常见的突变基因是 BRAF（39%）、TP53（23%）和 NRAS（14%）。其他发生率较低（< 5%）的基因是：PIK3CA、ERBB4、CTNNB1、STK11、FGFR1、SMAD4、KRAS、FGFR3、PTEN 和 AKT。 40% 的样本检测到致癌突变同时发生。在已识别的突变中，TP53 在男性中明显更普遍（男性 31.8% 对比女性 12.2%，P = 0.03），NRAS 在女性中明显更普遍（男性 9.1% 对比女性 24.4%，P = 0.03）。
获得了对KRAS（G12C）抑制癌症
这项研究中总共包括38例患者：27例非小细胞肺癌，10例结直肠癌和1例患有阑尾癌。在17例患者（占队列的45％）中检测到了对Adagrasib的抗性的假定机制，其中7例（共18％的队列）具有多种复合机制。获得的KRAS改变包括G12D/R/V/W，G13D，Q61H，R68S，H95D/Q/R，Y96C和KRAS G12C等位基因的高级扩增。获得的抗性旁路机制包括MET放大；在NRA，BRAF，MAP2K1和RET中激活突变；涉及ALK，RET，BRAF，RAF1和FGFR3的致癌融合； NF1和PTEN中的功能丧失突变。在九名肺腺癌患者中有两名可用，可提供成对的组织生物 - 生物膜样品，在没有任何其他耐药机制的情况下观察到组织学转化向鳞状细胞癌。使用体外深突变扫描屏幕，我们系统地定义了赋予KRAS G12C抑制剂抗性的KRAS突变的景观。
新闻通讯 33
自闭症谱系障碍 (ASD) 是一种复杂的终生神经发育疾病，发病率很高，具有非典型的社会、行为和认知功能，给公共卫生带来了沉重的经济负担。基因型和表型的极度复杂性和异质性是研究 ASD 的主要挑战。尽管病因难以捉摸，但蛋白质合成失调已成为 ASD 潜在机制的交汇点。该项目旨在了解 FMR1、PTEN、TSC1/2 和 RPL10 突变下游的 ASD 病理生理学，这些突变直接影响蛋白质合成。对 ASD 的分子理解将使有效患者分层和识别预测性生物标记物成为可能，从而重新利用现有的针对转化调节剂的疗法。这将通过结合使用现代高通量技术（组学）来量化转录组和蛋白质组，以及对 iPSC 衍生的神经元和含有不同突变的脑类器官进行形态学和功能研究来实现。作为原理验证，我们将筛查深度表型患者的血液样本，以
diagmol（e）_01.02.2025
常规检验α-肌血症（TPSAB1和TPSB2）淀粉样变性（家族性，TTR）AS，Angelman综合征NaApeceped（AIRE）Beckwith-Wiedemann（BWS）恶性。黑色素瘤（CDKN2A）NaEGFR突变（T790M等）在CtDNA上（仅在Streck Bct或Paxgene DNA管中）FG（Keller Clanslome，Med12）NaHblrg，Gilbert综合征（UGT1A1）naHblrg，她差异。胃癌（CDH1）Na na hed，低蛋白外胚性发育不良（EDA）HFE-HH，HERED。
DNA修复缺陷的癌症协会与整个
癌症中抽象的DNA修复缺陷可能会导致特征性突变模式，例如BRCA1/2的缺乏和PARP抑制剂的疗效预测所示。我们基于全基因组突变模式（包括结构变异，Indels和碱基替代特征）的145个单个DNA损伤反应基因的功能丧失（LOF）训练和评估。我们鉴定了24个基因，它们的缺乏症可以很好地预测，包括BRCA1/2，MSH3/6，TP53和CDK12 LOF变体的预期突变模式。cdk12与串联重复相关，我们在这里证明，这种关联可以准确预测前列腺癌的基因缺乏（接收器操作员特征曲线下的面积= 0.97）。我们的新型关联包括ATRX，IDH1，HERC2，CDKN2A，PTEN和SMARCA4的单或双重LOF变体，并且我们的系统方法产生了预测模型的目录，这可能提供了用于进一步研究和开发治疗的目标，并有助于指导治疗。