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利用抗菌肽和孢子形成因子的靶向基因编辑对短小芽孢杆菌菌株进行表征
摘要：许多芽孢杆菌属物种因能够产生可防止疾病生长的抗菌肽而对植物有益。在本研究中，我们研究了芽孢杆菌3-19菌株及其衍生物在靶向基因组编辑后的拮抗活性。利用CRISPR-Cas9系统特异性地失活了芽孢杆菌3-19基因组中的两个具有抗菌作用的肽基因——芽孢杆菌素 (bac) 和细菌素 (bact)，以及编码孢子形成西格玛因子的sig F基因。由于芽孢杆菌3-19基因组中靶基因的失活，对蜡状芽孢杆菌和布伦纳泛菌的抗菌活性降低，其中对芽孢杆菌素的影响明显。当 bac 、 bact 和 sig F 基因失活时，培养物的生长动态发生变化，并且变异菌株的蛋白水解活性较低。通过失活 sig F 基因获得了 B. pumilus 3-19 的无孢子突变体。已经证明，bacilysin 在 B. pumilus 3-19 对土壤微生物的拮抗作用的形成中起着独特的作用。
将环糊精作为人造伴侣来通过超分子
在基于序列的元基因组生物透镜中鉴定出了芽孢杆菌属的水解酶（NCBI登录号：WP_034624255.1）。简要地，我们筛选了海洋宏基因组MARREF数据库，其中1个包含约470万个蛋白质编码序列。通过使用Diamond BlastP查询输入序列，以默认参数（身份百分比> 60％；对准长度> 70; e-e-value <1×10 −5）对215个氨基酸脂肪酶的bacillus pumilus pumilus pumilus（NCBI辅助编号：wp_1066666668777777777777777777777; morecrect da） Point，9.77），一种具有工业潜力的多功能脂肪酶。与来自B. pumilus的脂肪酶相比，总共检索了33个序列（从2,821×10 -105到3.24×10 -12）。证实，分配给芽孢杆菌细菌的一个这样的序列（GenBank登录号，WP_034624255.1）被证实，可以编码预测的全长长度215氨基酸长脂肪酶（E-vorue 2,821×10 -136和92.1％相似的cat catue catue catsy cate cate cate catsy cate catsy cate catsy cate cate cate catemanty） D167，H189），被选为进一步研究的目标。在MARREF数据库中，序列WP_034624255.1起源于从韩国Seongsan-Ri前面的海水海绵中分离出的微生物组（ENA BioSame samn06016472; Ena Bioprodroprodrodryprodeion prjna3555555554555455543535554353555435355543535554353555435355555543555555543535535355353553535553535535355353553535535355353553535535355.一旦确定，编码野生型酶的215个氨基酸序列（GenBank登录号WP_075743487; Molecular Mose，23,102.65 Da;等电点，9.77）用作基因合成的A模板。s1）在与Ni-Nta His-Bind树脂结合后。合成后，获得了215个氨基酸序列，编码分子质量为21,974.60 DA的酶，以及8.0的等电点。生产并纯化了可溶性N末端六位苯二胺（His6） - 使用SDS-PAGE分析> 98％；图。该酶称为LIP MRD9（唇部指脂肪酶； MRD指的是MARREF数据库）。
产生物膜芽孢杆菌的分子鉴定
众所周知，发酵食品中的微生物含有代谢产物，可能改善人类和动物的健康。然而，尽管对发酵食品的功能作用进行了一些研究，但有效芽孢杆菌菌株的分离和鉴定仍在进行中。本研究的目的是从分子上鉴定发酵食品来源中产生生物膜的芽孢杆菌属 (BPB) 和酵母，并研究它们与 Lysinibacillus louembei 菌株的相互作用。共获得 133 个芽孢杆菌分离株以及 32 个酵母分离株，以进行详细鉴定和研究。根据使用 fibE 聚合酶链式反应 (PCR) 多重和 ITS-PCR 技术的表型和分子表征，芽孢杆菌属的种类被鉴定为短小芽孢杆菌 (12%)、枯草芽孢杆菌 (12%)、萨法芽孢杆菌 (6%)、解淀粉芽孢杆菌 (6%)、地衣芽孢杆菌 (6%) 和酿酒酵母 (0.05%)。使用多重 PCR 扩增了枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌和短小芽孢杆菌中参与生物膜形成过程的 yfi Q、eps H、ymc A 和 tas A 基因，并对其进行了鉴定和确认。作为表型结果，使用刚果红琼脂法 (CRA) 鉴定了 45% 的 BPB 分离株。使用乳化指数 (EI24) 测试了芽孢杆菌和酵母生产生物表面活性剂的能力。65% 和 69% 的芽孢杆菌和酵母分离株能够乳化汽油。56% 的芽孢杆菌分离株生物表面活性剂粗提取物对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和沙门氏菌表现出抗菌活性。在芽孢杆菌属、酿酒酵母和 L. louembei 之间进行了培养。结果，在酵母菌株 V3 与 B. pumilus 菌株 VB15 以及 L. louembei 与解淀粉芽孢杆菌中获得了类共生相互作用，在酿酒酵母菌株 P3 和芽孢杆菌属中获得了类竞争相互作用。菌株 VP11，以及与 B. pumilus 和 S. cerevisiae 以及芽孢杆菌属菌株 VP34 和 S. cerevisiae 菌株 P1 的类反式相互作用。这些结果表明，微生物在发酵过程中保持着不同的关系。关键词：芽孢杆菌、酿酒酵母、Lysinibacillus louembei、发酵食品、微生物相互作用、生物表面活性剂、生物膜。引言微生物对各种食品的发酵是最古老的食品生物保存形式之一（Diaz-
如何引用Madsen AM，Moslehi-Jenabian S，Frankel M，White JK，Frederiksen MW。空气中的细菌在室内空气中与物理
这项研究的目的是获得有关房屋中室内空气中存在哪些可栽培细菌物种的知识，以及空气传播细菌的浓度和多样性是否与不同的因素相关。在五个房屋的不同房间内和52套房屋中一次进行了整整一年的测量。在房屋内，发现了空中细菌浓度的房间对房间的变化，但是在整个房间中发现了细菌物种的重叠。发现了11种非常常见的物种，其中包括：lowffii，巨芽孢杆菌，B。pumilus，kocuria carniphila，K。Palustris，K。Rhizophila，Rhizophila，Micrococcus flavus，M.Luteus，M。Luteus，Moraxella oslaensis and paracococcus yei。通常，革兰氏阴性细菌的浓度和物种叶过与季节显着相关，春季浓度最高。P. Yeei，K。Rhizophila和B. pumilus的浓度与相对湿度（RH）呈正相关，而K. rhizophila的浓度与温度和空气变化速率（ACR）负相关。微球菌浓度与ACR负相关。总体而言，这项研究确定了房屋中室内空气中通常存在的物种，并且某些物种的浓度与这些因素有关：季节，ACR和RH。
探索拮抗性内生细菌的潜力...
摘要：药用植物拥有各种具有巨大经济价值的内生微生物。因此，本研究的重点是分离和鉴定来自阿拉什（埃及）干旱地区的药用植物的细菌内生菌，及其作为增强番茄植物生长的生物调节剂的潜在作用。在这项研究中，八个内生细菌分离株显示了对测试真菌的直接广泛拮抗作用。根据拮抗活性，研究了这些分离株，以根据其16S rRNA基因序列进行识别，例如lysinibacillus fusiformis，pumilus pumilus，siamensis，siamensis，paenibacillus peoriae，paenib，paenib。polymyxa，铜绿假单胞菌A，Brevundimonas diminuta和Providencia vermicola。筛选菌株的各种植物生长促进（PGP）属性，包括吲哚-3-乙酸（IAA），氨，铁载体，磷酸酶，水解酶产生和磷酸盐溶解。孤立的细菌菌株具有可变的植物生长促进活性。评估了两种选择的内生细菌菌株，其生物控制潜力针对由氧气孢子菌和溶孢菌引起的番茄真菌根腐病疾病，以进一步评估其在温室条件下的PGP能力。在温室下，B。bumilusnaw4和铜绿假单胞菌A NAW6被证明有效地赋予在压力下以及在正常生长条件下的西红柿上带来积极的好处。
伍德街 100 号码头
根据 1973 年《濒危物种法》（经修订）第 7 条的规定，工程兵团已审查了该项目，并根据项目位置和现有信息，以下物种可能存在于工作所在县：美洲木鹳 (Mycteria americana)、东部黑秧鸡 (Laterallus jamaicensis jamaicensis)、环颈鸻 (Charadrius melodus)、红冠啄木鸟 (Picoides borealis)、红腹滨鹬 (Calidris canutus rufa)、大西洋鲟 (Acipenser oxyrinchus)、短鼻鲟 (Acipenser brevirostrum)、长须鲸 (Balaenoptera physalus)、座头鲸 (Megaptera novaeangliae)、露脊鲸 (Eubalaena glacialis)、塞鲸 (Balaenoptera borealis)、抹香鲸 (Physeter macrocephalus)、西印度海牛 (Trichechus manatus)、海莓 (Lindera melissifolia)、海滩苋菜 (Amaranthus pumilus)、绿海龟 (Chelonia mydas)、肯普氏丽龟 (Lepidochelys kempii)、红海龟 (Caretta caretta)
枯草芽孢杆菌作为生物合成基因簇的自然产品发现和工程的宿主
枯草芽孢杆菌是一种革兰氏阳性细菌，属于多功能枯草芽孢杆菌基团，以及pumilus芽孢杆菌，扁豆芽孢杆菌和阿甘洛氏芽孢杆菌。1,2它表现出一种出色的遗传多样性，使其能够适应各种生态壁ni，范围从深海热液通风口到土壤和人类胃肠道。3,4其形成对恶劣条件有抵触的孢子的能力进一步有助于枯草芽孢杆菌在这些具有挑战性的环境中的生存。5为了在其特定栖息地中获得选择性优势，枯草芽孢杆菌还产生了广泛的生物活性代谢物库，包括聚酮化合物（PKS），非尖型体肽（NRPS），核糖体合成和后变性型eDi peptides（ripps）和terpials ant portials and terpent ant potport potport potpotirimicrip portimirimicrip。6,7该物种还用作农业中的生物防治药物，用于打击植物病原体并促进植物生长。6,8
表1。世界上橡木衰落的分布，包括橡木物种和生物/非生物因子
Loranthus europseus (plant / midgetoe) Biscogniaxia Mediterranea (Fungus) Obolarina Peaches (Fungus), Krawtzewii (Fungus) epicoccum black (fungus) Chaetomium (fungus) Kalmusia variispora (fungus) Petriella dirty (fungus) NeocaMarosporium Obiones （真菌）Sordaria Fimicola（真菌）Paecilomyces Fair（真菌）Phaeoacremonium Tuscanicum（Fungus）Ocean（真菌）Armillaria Mellea（真菌）Dematophora sp。 div> （蘑菇）fusarium sp。 div> （蘑菇）替代属。 div> （蘑菇）植物菌（卵骨）pythium（Oomycetes）Megopis scabrigornis（昆虫）（昆虫）acmaeodera（昆虫）laimaphelenchus（nematode）l. hyrcanus（nematode）l. B. Roseae亚种 div> 玫瑰（细菌）stenotrophomonas一个友好（细菌） div> div>Loranthus europseus (plant / midgetoe) Biscogniaxia Mediterranea (Fungus) Obolarina Peaches (Fungus), Krawtzewii (Fungus) epicoccum black (fungus) Chaetomium (fungus) Kalmusia variispora (fungus) Petriella dirty (fungus) NeocaMarosporium Obiones （真菌）Sordaria Fimicola（真菌）Paecilomyces Fair（真菌）Phaeoacremonium Tuscanicum（Fungus）Ocean（真菌）Armillaria Mellea（真菌）Dematophora sp。 div>（蘑菇）fusarium sp。 div>（蘑菇）替代属。 div>（蘑菇）植物菌（卵骨）pythium（Oomycetes）Megopis scabrigornis（昆虫）（昆虫）acmaeodera（昆虫）laimaphelenchus（nematode）l. hyrcanus（nematode）l. B. Roseae亚种 div>玫瑰（细菌）stenotrophomonas一个友好（细菌） div> div>
校正：üubkowska等。分析工业芽孢杆菌作为饮食补充剂的潜在益生菌。微生物2023，11，488
开发益生菌制备。六种不同物种（B. uttilis，B。B. atrophaeus，B。cereus，B。cereus，B。licheniformis，B。pumilus，B。amyloliquefaciens），如图1.对于经过测试的产品，温度45℃被用作最适当的。环境杆菌菌株在一系列温度范围内进行定量计数（补充表S1），而对其生长的定量分析取决于温度，如图2A – F所示。在40℃的温度下，芽孢杆菌菌株的数量较少，并且被鉴定为发烧物种。在这里，枯草芽孢杆菌占主导地位，其次是B. licheniformis和B. cereus。有趣的是，在54℃，枯草芽孢杆菌和蜡状芽孢杆菌的温度下，最丰富，尽管它们的形状模糊和较小的菌落大小，但表明其疗养的嗜热特征。杆菌菌株均未在57°C下生长，此外，在37℃至57℃的温度下，菌落特征评估的最佳培养时间被证明为17小时。较长的孵育时间（24小时）导致菌落的大小更大。”