XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systempyogenes
SMOOT 文库和噬菌体诱导的 Cas9 定向进化可减少脱靶活性
RNA 引导的核酸内切酶（如 Cas9）可在细胞中提供有效的靶向基因组编辑，但也可能切割整个基因组中的脱靶位点。化脓性链球菌 Cas9 (SpCas9) 的工程变体已被开发出来以全面降低脱靶活性，但个别脱靶可能仍然存在，或者靶向活性可能受到损害。为了在保持强大的靶向编辑的同时对抗特定脱靶的活性，我们开发了一种新颖的 M13 噬菌体介导选择方法。使用这种方法，连续几轮正向和负向选择用于识别增强或减弱特定基因组序列编辑活性的 Cas9 突变。我们还引入了寡核苷酸定向靶标扫描诱变 (SMOOT)，这是一种全面的诱变方法，用于创建高度多样化的 Cas9 变体库，这些库可以通过基于噬菌体的选择进行挑战。我们的平台识别出新的 SpCas9 突变体，这些突变体在生化测定和 T 细胞中减轻了对脱靶的切割，同时保持了比以前描述的变体更高的靶向活性。我们描述了一种进化的变体，S . pyogenes Adapted to Reduce Target Ambiguity Cas9 (SpartaCas)，它由最丰富的突变组成，每个突变的功能未知。这种进化的 Cas9 突变体减少了脱靶切割，同时保留了对多个治疗相关靶标的有效编辑。使用我们的系统对 Cas9 进行定向进化展示了一种改进的结构独立方法，可以有效地设计核酸酶活性。
CRISPR-Cas9 载体
CRISPR/Cas9系统已被广泛应用于基因组编辑，包括基因破坏、定点诱变、表观遗传调控等。化脓性链球菌（SpCas9）是目前最常用的Cas9蛋白。通过SpCas9进行基因组编辑需要在靶位点有一个“NGG”原型间隔区相邻基序（PAM）序列，这限制了CRISPR/Cas9系统的编辑范围。为了扩大编辑位点的范围和优化编辑特异性，各种SpCas9突变体已被研究并成功应用于CRISPR系统。
BioBall在水溶性球中包含精确数量的微生物，以实现定量微生物质量的前所未有的精度
56046 N/A链球菌为链球菌NCTC 12696 ATCC19615，CIP1042.26细胞2年 ^所有Bioball菌株和重新填充流体的产品均至少6个月剩余。^^饥饿在日本药典方法（参考JP G8水4.4.2培养基增长促进测试）后，在22°C的无菌纯净水中进行饥饿。*标准偏差<3.5，**标准偏差<4，***标准偏差<4.5，****的平均值在40至60 CFU之间，标准偏差为7 cfu或更少，*****的平均值为67至83 cfu，标准偏差为≤15％。空白BioBall不是“认证的参考材料”。可用菌株
Euroclox 500mg胶囊2。定量和定性...
Euroclox可用于治疗呼吸道，耳朵，鼻子和喉咙，尿道，胃肠道，皮肤和软组织，败血病，盆腔感染，心内膜炎和矫形性感染，涉及肌肉纤维蛋白 - 敏感的细菌（例如其他晶状体症状），如麦乳头细胞和骨科感染（例如，骨盆感染），如麦乳头状细胞和骨科感染单核细胞增生和革兰氏阴性有机体，例如M. catarrhalis，N。Gonorrhea，N。Meningitidis，E。Coli，P。mirabilis，Salmonella，Shalmonella，Shigella and Shigella and Shigella and H. acthigella and H. higella and Shigella和H. h. threnza）和克罗西克林（Cloxacellin）敏感的可见谷物阳性有机体，包括cAphylocci。它对金黄色葡萄球菌，化脓性链球菌，Viridans链球菌，肺炎链球菌，N。Meningitidis，H。流感>
用于分析汇集的 CRISPR 筛选的算法基准
简介 成簇的规则间隔回文重复序列 (CRISPR) 和 CRISPR 相关 (Cas) 蛋白是一类由细菌编码的、RNA 引导的可编程 DNA 靶向和切割系统。由于其使用可定制的单向导 RNA (sgRNA) 的可编程特性，CRISPR-Cas 已实现强大的汇集筛选，以探索基因组范围内遗传扰动的功能。以最常用的 CRISPR-Cas9 系统为例，化脓性链球菌 Cas9 蛋白可以与 110 个核苷酸 (nt) 的 sgRNA 复合，该 sgRNA 包含一个 20 nt 序列，该序列与目标 DNA 区域互补结合并诱导双链断裂 (DSB)。基因组 DNA 上的这种切割机制会触发宿主非同源末端连接 (NHEJ) 或同源定向修复 (HDR)
痤疮生物膜，粉刺和未来的痤疮治疗方法
摘要：Cutibacterium Acnes（C.Acnes）是一种皮肤共生生物，可控制金黄色葡萄球菌和脓菌链球菌的生长。此外，该生物可能会成为机会性病原体，从而引起痤疮和手术后的假体感染。痤疮的结果取决于cutibacterium subtypes，毒力因子和微生物平衡。这种生物是生物膜形成必不可少的生物胶，但其过多的胶水进入皮脂。这皮脂慢慢地到达了头发单元的上层，以及来自角质形成层的死细胞，导致粉刺。管道中的治疗方法包括肿瘤坏死因子（生物制剂），攻击生物膜生存能力的各种药物，噬菌体治疗以及针对痤疮痤疮蛋白酶产生的毒力因子的疫苗接种。
重组NLS-SPCAS9-NLS（CAS9）核酸酶解决方案
产品描述：Akron的重组NLS-SPCAS9-NLS（CAS9）核酸酶解决方案均遵循所有相关的辅助材料指南。下游纯化过程使用多步矫正方法，不使用亲和力标签，以最大程度地减少外源杂质，并确保提供高度纯化和活性的物质以进行进一步的制造应用。Akron的Cas9核酸酶是单链，162 kDa，非糖基化的DNA核酸内切酶，在大肠杆菌中表达。氨基酸序列来自链球菌链球菌，蛋白质结构已通过在蛋白质的N-和C-末端添加核定位序列（NLS）改变了蛋白质结构。将NLS添加到蛋白质结构中确保您的RNP复合物有效地导入细胞核。
芽孢杆菌益生菌对手术感染的毛状病原体的影响
摘要。研究了pyogenes孤立培养的益生菌制剂的抗菌活性的结果，已经发现益生菌制剂Inoprovet2由BAC.Subtilis，BAC制备。licheniformis具有最早和最高的活性（从6小时开始，链球菌培养的减少39±0.9，24小时后 - 78±2.6，96小时后 - 100％ - 即与其他人相比，破坏了脓液微生物）。Inoprovet1 differed from Inoprovet2 only by the quality of the excipient, but its activity was slightly lower (6 hours - 22 ±1.1, 24 hours - 53 ±3.9 and 96 hours - 100%), the third most active was Vitasporin12B probiotic (6 hours - 21 ±1.8, 24 hours - 51 ±2.3 and 96 hours - 98 hours - 98 ±4.2%), followed by Vetom 1。2（6小时后16±2.9，24小时后51±0.5，96小时后96±1.8％）和益生菌孢子蛋白，在6小时16±2.9，24小时后45±3.3和96小时89±2.6％后杀死链球菌培养的抗菌活性。获得的结果，在临床实践中使用inoprovet2益生菌的可能性不仅用于治疗胃肠道感染，而且还用于伤口感染
迷你评论
大学。东京，日本东京都文京区本乡 7-3-1，邮编 113-0033 通讯作者：Hiroshi Nishimasu，nisimasu@bs.s.u-tokyo.ac.jp 电话：+81-3-5841-4391 收稿日期：2018 年 1 月 8 日/修订日期：2018 年 2 月 17 日/接受日期：2018 年 2 月 17 日 摘要 RNA 引导的核酸内切酶 Cas9 参与原核生物 CRISPR-Cas 过继免疫系统，可与引导 RNA 结合并切割与 RNA 引导互补的双链 DNA。近年来，Cas9 已被用作从基础研究到临床应用等广泛领域的多功能基因组编辑工具。然而，Cas9 识别和切割 DNA 的分子机制尚不清楚，其在基因组编辑中的应用仍有许多问题有待解决。我们阐明了最广泛用于基因组编辑的 S. pyogenes Cas9 与向导 RNA 及其靶 DNA 复合的晶体结构，从而首次深入了解了 Cas9 介导的 DNA 切割机制。此外，我们还解决了来自三种不同细菌的 Cas9 核酸酶和 Cas12a (Cpf1) 核酸酶的晶体结构，它们也用于基因组编辑。总的来说，这些结构研究阐明了 CRISPR-Cas 核酸酶的机制趋同和发散，为
嗜热菌 Cas9 的 HNH 核酸酶中静电接触的破坏会重新连接变构运动并增强高温 DNA 裂解
多结构域蛋白内的变构信号传导是空间上相距较远的功能位点之间通信的驱动因素。了解大型多结构域蛋白中变构耦合的机制是实现系统空间和时间控制的最有希望的途径。最近，CRISPR-Cas9 在分子生物学和医学领域的应用激增，这促使人们需要了解 Cas9 的原子级蛋白质动力学（这是其变构串扰的驱动力）如何影响其生物物理特性。在本研究中，我们使用核磁共振 (NMR) 和计算的协同方法来精确定位热稳定性 Geo Cas9 的 HNH 结构域中的变构热点。我们表明，K597 突变为丙氨酸会破坏盐桥网络，进而改变 Geo HNH 结构域的结构、变构运动的时间尺度和热稳定性。在广泛研究的中温 S. pyogenes Cas9 中，这种同源赖氨酸到丙氨酸的突变同样改变了 Sp HNH 域的动力学。我们之前已经证明，通过突变改变变构是 Sp Cas9 (e Sp Cas9) 特异性增强的来源。因此，这在 Geo Cas9 中可能也是如此。由 AIP Publishing 独家授权发布。https://doi.org/10.1063/5.0128815