结肠腺癌(COAD)是第三常见的癌症,是全球癌症死亡的第二大主要原因,这已成为全球公共卫生挑战(1)。随着癌症检测技术的发展,早期诊断的率有所提高,但是COAD的诊断迅速转移到年轻,更高级的阶段(2)。 开发从息肉到腺癌的COAD需要十多年的时间,这一长期进展为干预提供了防止其发展为高级阶段的机会(3)。 近年来,高通量测序技术和生物信息学的快速发展促进了COAD的探索(4,5)。 因此,从生物信息学分析的肿瘤分子靶标的角度了解COAD的发病机理对于治疗和预防COAD具有很大的意义。 细胞外基质(ECM)是由各种蛋白质组成的复杂结构,该结构通过调节细胞间串扰来调节生物学功能(6-8)。 ECM是肿瘤微环境(TME)的重要组成部分,其异常表达促进了肿瘤的形成,进展和转移(9,10)。 临床病理学分析证实,ECM在肿瘤患者中的过度沉积与预后不良有关(11,12)。 最近,高通量测序分析表明,与ECM相关的基因在肿瘤进展过程中异常表达(13,14)。 ECM的积累诱导缺氧和代谢应激,进而激活肿瘤中的抗凋亡和药物抗性途径(15)。随着癌症检测技术的发展,早期诊断的率有所提高,但是COAD的诊断迅速转移到年轻,更高级的阶段(2)。开发从息肉到腺癌的COAD需要十多年的时间,这一长期进展为干预提供了防止其发展为高级阶段的机会(3)。近年来,高通量测序技术和生物信息学的快速发展促进了COAD的探索(4,5)。因此,从生物信息学分析的肿瘤分子靶标的角度了解COAD的发病机理对于治疗和预防COAD具有很大的意义。细胞外基质(ECM)是由各种蛋白质组成的复杂结构,该结构通过调节细胞间串扰来调节生物学功能(6-8)。ECM是肿瘤微环境(TME)的重要组成部分,其异常表达促进了肿瘤的形成,进展和转移(9,10)。临床病理学分析证实,ECM在肿瘤患者中的过度沉积与预后不良有关(11,12)。最近,高通量测序分析表明,与ECM相关的基因在肿瘤进展过程中异常表达(13,14)。ECM的积累诱导缺氧和代谢应激,进而激活肿瘤中的抗凋亡和药物抗性途径(15)。此外,ECM的高密度阻碍了免疫细胞的内化,这会影响肿瘤免疫疗法的作用(16-18)。因此,基于与ECM相关基因的预后模型将为预测COAD患者的复发提供基础。瘦素是瘦素基因(LEP)的糖蛋白产物。流行病学研究支持LEP与COAD风险增加有关(19)。研究表明,COAD组织中LEP mRNA的表达水平上调,这与COAD患者的预后不良有关(20,21)。周围神经形成复杂的肿瘤微环境,由多种细胞类型和因子组成,包括神经生长因子(NGF)。NGF在几种实体瘤的生长,侵袭和转移中起重要作用。Lei等。 发现,胰腺癌细胞分泌的NGF诱导了Schwann细胞的自噬,这反过来参与了胰腺肿瘤的增殖和转移(22)。 Hayakawa等。 表明,NGF的过表达显着加速了胃肿瘤的生长和侵袭(23)。 procollagen C-耐肽酶增强剂2(PCOLCE2)是一种ECM糖蛋白,可作为功能性胶原蛋白C蛋白酶增强剂(24)。 PCOLCE2参与EMT,并在促进Coad转移中起关键作用(25)。 他等人。 证明PCOLCE2是一种基于生物信息学分析的COAD患者临床预后的特征基因(26)。 我们验证了LEP,NGF和PCOLCE2在肿瘤组织中使用COAD临床高度表达Lei等。发现,胰腺癌细胞分泌的NGF诱导了Schwann细胞的自噬,这反过来参与了胰腺肿瘤的增殖和转移(22)。Hayakawa等。 表明,NGF的过表达显着加速了胃肿瘤的生长和侵袭(23)。 procollagen C-耐肽酶增强剂2(PCOLCE2)是一种ECM糖蛋白,可作为功能性胶原蛋白C蛋白酶增强剂(24)。 PCOLCE2参与EMT,并在促进Coad转移中起关键作用(25)。 他等人。 证明PCOLCE2是一种基于生物信息学分析的COAD患者临床预后的特征基因(26)。 我们验证了LEP,NGF和PCOLCE2在肿瘤组织中使用COAD临床高度表达Hayakawa等。表明,NGF的过表达显着加速了胃肿瘤的生长和侵袭(23)。procollagen C-耐肽酶增强剂2(PCOLCE2)是一种ECM糖蛋白,可作为功能性胶原蛋白C蛋白酶增强剂(24)。PCOLCE2参与EMT,并在促进Coad转移中起关键作用(25)。他等人。证明PCOLCE2是一种基于生物信息学分析的COAD患者临床预后的特征基因(26)。我们验证了LEP,NGF和PCOLCE2在肿瘤组织中使用COAD临床在这项研究中,我们鉴定了与WGCNA和Lasso-Cox回归相关的三个与ECM相关的基因(LEP,NGF和PCOLCE2)。
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肠道菌群与其宿主共同发展,深刻塑造了免疫系统的发育和功能。这种共同进化导致了动态关系,其中微生物代谢产物和分子信号影响免疫成熟,耐受性和防御机制,突出了其在维持宿主健康方面的重要作用。最近,细菌外囊泡(BEV),细菌产生的膜纳米颗粒已成为肠平衡和有效的免疫调节剂的重要参与者。这些囊泡反映了细菌膜的特征,并含有核酸,蛋白质,脂质和代谢物。他们可以调节免疫过程,并参与神经系统和代谢性疾病,因为它们在肠道中局部分布和系统地分布,从而影响两个级别的免疫反应。本综述提供了BEV的特征和功能性概述,详细介绍了营养如何影响这些囊泡的产生和功能,抗生素如何破坏或改变其组成以及这些因素如何集体影响免疫力和疾病的发展。It also highlights the potential of BEVs in the development of precision nutritional strategies through dietary modulation, such as incorporating prebiotic fi bers to enhance bene fi cial BEV production, reducing intake of processed foods that may promote harmful BEVs, and tailoring probiotic interventions to in fl uence speci fi c microbial communities and their vesicular outputs.
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我们的方法利用非病原性大肠杆菌在递送和呈递抗原时模仿细胞内病原体的布鲁氏菌融合体来刺激TH1和CTL反应。大肠杆菌通常是细胞外的,而布鲁氏菌是细胞内细菌。因此,我们启动了大肠杆菌(DH5α),以表达含有耶尔森氏菌的INV基因的质粒,单核细胞增生李斯特氏菌的基因和HLY基因[31]。通过结合αβ1-整合素异二聚体来引入宿主细胞的大肠杆菌侵袭。整合素的聚类后,Inva-sin激活了信号级联。一种信号通路会导致局灶性粘附组分的激活,包括SRC,局灶性粘附激酶和细胞乳蛋白蛋白,导致形成伪足,使细菌吞噬细菌进入宿主细胞。侵入蛋白与β1-整合蛋白的结合是必要的,并且足以诱导细菌的吞噬,即使是非专业的吞噬细胞。第二个途径,包括Rac1,NF-κB的激活和有丝分裂原激活的蛋白激酶,导致促炎细胞因子的产生[32]。互隔化后,将大肠杆菌带入发生细菌裂解的吞噬体/溶酶体。HLY基因产物以及其他细菌蛋白被释放到乳胶囊泡中。硫酸激活的Hly,也称为李斯特氏蛋白酶O(LLO)是一种在低pH值下的结合和孔形吞噬体膜的孔形成细胞溶胶蛋白酶。此批判步骤将抗原从大肠杆菌出口到细胞质细菌的细胞质含量可以通过LLO产生的孔中逃脱到乳腺细胞的胞质区室。
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