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加州橡树死亡率特别工作组报告 2024 年 8 月
经过两个潮湿的冬天，红杉疫霉菌蔓延到洪堡红杉州立公园。这个州立公园是加州州立公园系统中最大的公园之一，直到最近，它还是洪堡县南部 101 号公路走廊沿线红杉疫霉菌持续侵染的最北范围，已确认的感染仅限于公园核心区、布尔溪南部和东部以及南福克鳗鱼河沿岸的树木。然而，在这个冬天结束时，人们在溪流北侧的檀香树上发现了症状。这些症状与该地区的草原群落接壤，多年来，积极的计划烧荒通过杀死侵占的花旗松保持草原开放（图 1）。在草原系统底部附近进行初始 P. ramorum 采样之后，州立公园、加州大学合作推广中心和加州消防局的工作人员于五月下旬进行了一次地面调查，以确定 P. ramorum 向上蔓延的程度，以及是否有症状的森林区域可以纳入长期重复规定燃烧计划。
议程项目8-谢菲尔德
1.1公园和乡村的树木和林地团队直接或间接地管理着位于理事会土地上的270万棵树木，包括公园，林地，开放空间，公墓和租户农场。住房服务土地上的树木是由团队通过服务水平协议管理的。不包括街道，因为它们是通过当前的PFI协议由前方/AMEY管理的。1.2树木是根据理事会同意的公司树风险管理策略来管理的，这又基于当前的国家指导。理事会团队确定的所有补救工作均由外部树木文化承包商通过当前理事会合同常规订单后的竞争引号进行。1.3引入新的害虫和疾病（例如Ash Dieback和Ramorum疾病）以及由于气候变化而引起的风暴的规律增加，导致了与进行基本安全有关的补救工作的数量和相关成本的显着增加。1.4由于这一增加，总的支出现在远高于2015年公共合同条例（以及《 2023年采购法》）阈值，因此，有必要提供服务以确保理事会合规行事。1.5理事会的树木和林地战略2028-2033致力于确保高水平的树木文化工作，并且只雇用已获得植树植物协会批准的承包商身份的公司 - 该措施得到了理事会的树木官员和健康和安全团队的强烈支持。2。建议
krisp：一个Python包，可帮助设计CRISPR和基于扩增的诊断测定法的设计
最近的大流行素（例如Covid-19）强调了快速开发诊断方法检测不断发展的病原体的重要性。CRISPR-CAS技术最近已用于开发诊断测定，以针对DNA或RNA的序列特异性识别。这些测定法对黄金标准QPCR具有相似的敏感性，但可以将其部署为易于使用和廉价的测试条。然而，发现可以设计底漆的基因组的诊断区域需要广泛的生物信息学分析。我们开发了Python软件包KRISP，以使用未对准的基因组序列或变体调用格式（VCF）文件作为输入来帮助彼此区分样本组的引物和诊断序列的分解。KRISP已通过使用有效的算法在几乎线性时间内运行，使用最小RAM并在可用时利用并行处理来处理大型数据集。在实验室证明了KRISP结果的有效性，通过成功设计CRISPR诊断测定法，以区分突然的橡木死亡病原体Phytophthora ramorum和密切相关的植物菌种类。KRISP根据宽松许可发布开源，并具有快速设计CRISPR-CAS诊断测定所需的所有文档。
允许移动活植物害虫，生物防治生物，
1）进口，州际运动和环境释放已经过基因工程的列出的监管生物可能需要根据第340部分第7 CFR颁发的不同许可。任何未经授权的进口，州际运动或环境释放（包括意外释放）的受管制有机体违反这些法规。在移动基因工程生物之前，请在：https：//www.aphis.usda.gov/aphis/aphis/ourfocus/biotechnology上联系APHIS生物技术监管服务（BRS）。如果BR不需要许可证，请联系害虫，病原体和生物防治许可单元，以获取进一步的指导：pest.permits@usda.gov 2）如果在发货中确定了动物病原体，以确保适当的保障，请参考http://www.aphis.usda.gov/import_export/animals/animal_import/animal_import/animal_imports_anproducts.shtml 3）如果确定了人类病原体国家监管机构。请联系适当的机构，例如美国环境保护局，美国鱼类和野生动物服务局，美国食品和药物管理局，疾病控制与预防中心，Aphis兽医服务部门，Aphis Biotechnology监管服务或您所在州的农业部确保正确许可。5）如果您考虑续签本许可证，则应在本许可到期日之前的90天提交申请，以确保继续承保。要求需要遏制设施的许可可能需要更长的时间来处理。6）当受调节的材料包括国内土壤时，您必须遵守所有当地检疫，请参见：http：//wwwww.aphis.usda.gov/planthealth/pests_and_and_disease，特别关心土壤从某些大陆区域移动的特殊关注：进口消防蚂蚁： Golden Nematodes：http：//www.aphis.usda.gov/planthealth/gn;土豆/苍白的囊肿线虫：http：//www.aphis.usda.gov/planthealth/pcn; phytophthora ramorum（突然的橡木死亡）：http：//www.aphis.usda.gov/plant-health/sod
关于控制Kauri DieBack
1引言世界各地的本地森林物种对于维持多种生态系统服务，在维持生态平衡和支持生物多样性方面起着至关重要的作用。然而，植物性疾病暴发的流行率正在上升，这是由于非生物气候变化引起的压力的频率和强度的增加，以及病原体和害虫的生物威胁不断升级。理解和缓解这些风险已成为紧迫的优先事项，因为更频繁的植物疾病暴发的后果超出了生态问题，影响了农业，经济和人类的福祉。在新西兰，Kauri Trees（Agathis Australis）由于其文化，生态和经济重要性而具有很高的意义。这些标志性的树木作为本地景观不可或缺的组成部分，对土著人口也具有深厚的文化价值。Kauri Dieback（KD）疾病已迅速扩散在新西兰，对这些本地树木构成了重大威胁。该疾病表现为广泛的根腐，树冠变薄和树皮的脱落，最终导致感染树木的衰落和死亡。将被感染的土壤无意转移到以前未感染的地区一直是该疾病在新西兰迅速传播的关键因素，影响了全国各地的Kauri种群（Bradshaw等人，2020年）。随着气候模式的变化和疾病向量的扩展，Kauri树的脆弱性被放大。在农业领域，Breukers等。他们的潜在损失不仅在生态上而且在社会上都带来了深远的后果，鉴于它们是保护工作的文化符号和催化剂的作用。此事也在经济上回荡，因为Kauri Trees在新西兰的经济中发挥了作用，影响了林业和旅游等部门。尽管Kauri的生态价值得到了很好的认可，但对全面量化这一价值仍然是一项复杂的努力。KD的缓解措施通常集中于降低进入或离开受影响地区时疾病蔓延的风险。控制措施，例如预防人行道清洁站和步行板等土壤预防方法，通常被用作第一响应者动作。尽管罕见，但在替代缓解措施被证明无效或疾病差异较高的情况下，自然区域闭合可以用作有效措施，尤其是在涉及通过土壤运动传播的疾病的情况下（Bradshaw等人，2020年）。一些例子包括加利福尼亚的暂时关闭公园和自然区域，以响应植物疫霉菌的存在，导致突然的橡木死亡（例如Alexander＆Lee，2010年）。此外，日本在松树林中实施了临时关闭，以抵抗负责松木纤维疾病的Bursaphelenchus Xylophilus的传播（例如，Futai，2008年）。尽管如此，关闭自然区域的决定的特征是复杂而具有挑战性的过程，而相关的社会和经济后果不容易量化。在流行病学和疾病控制领域中，这些概率方法已用于管理暴发。在流行病学和疾病控制领域中，这些概率方法已用于管理暴发。1.1先前的文献概率方法在成本效益分析（CBA）中的应用已经看到了随着时间的流逝，各个学科的发展有重大发展。（2012）开发了一种用于进行CBA的方案，该方案是针对控制害虫和疾病发病率的控制的。通过案例研究（包括英国的Palmi（瓜））的案例研究来举例说明该方案，