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表观遗传读取器 PHF21B 调节小鼠社会记忆和突触可塑性相关基因
简介 哺乳动物大脑中突触连接的形成是一个高度协调的过程，涉及通过各种整合的表观遗传调节器和转录因子精确控制基因表达。突触发育、功能和可塑性失调会导致神经回路缺陷，从而导致多种神经行为障碍 (1, 2)。突触功能障碍是神经发育障碍（如自闭症谱系障碍、智力障碍和精神分裂症）和神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病）的共同特征 (2-4)。例如，NMDA 受体介导 (NMDAR 介导) 和 α -氨基-3-羟基-5-甲基-4-异恶唑丙酸受体介导 (AMPAR 介导) 的传递在自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病中受到不利影响。此外，编码突触后支架蛋白 SH3 和多个锚蛋白重复域 (SHANK) 家族成员的基因突变是自闭症和精神分裂症的风险因素 (1)。此外，患者队列的全外显子组测序和靶向候选基因测序以及家族谱系研究已发现与神经行为障碍相关的罕见变异和遗传风险因素 (2)。虽然这些研究有助于了解与突触失调有关的下游蛋白质，但关于上游调节因子和控制其表达的分子机制仍有许多未知之处。
ELPREP 5中的多线程变体
我们提出ELPREP 5，该5更新ELPREP框架，用于处理使用变体调用的测序对齐/地图文件。ELPREP 5现在可以执行由GATK最佳呼叫的最佳实践所描述的完整管道，该实践由PCR和光学重复标记组成，按坐标顺序排序，基本质量得分重新校准以及使用单倍型呼叫者算法的变体调用。ELPREP 5产生与GATK4相同的BAM和VCF输出，同时通过并行化和合并管道步骤的执行来显着降低运行时。我们的基准测试表明，ELPREP 5在整个exome和全基因组数据上都将变量呼叫管道的运行时加快了，同时使用与GATK4相同的硬件资源。这使ELPREP 5在需要更快的执行时间时，可以合适地替换GATK4。
C-9. 水平扩散器-过滤带 (LS-FS)
在盲沟内，水在 LS 的边缘均匀地上升和下降，从而将水流均匀地分配到 FS。盲沟通常由泥土构成，上面覆盖着草皮或可能衬有护堤。如果 LS-FS 安装在渗透率较低的土壤中，则建议使用暗渠。暗渠将在暴风雨之间排出盲沟，为下一次暴风雨提供容量，防止草皮死亡并避免蚊虫危害。暗渠应排入旁路渠道。另一种选择是将盲沟建造成线性湿地。此选项在三叠纪盆地土壤的地区特别有用，这些地区的渗透率极低，不利于暗渠正常运作。
2020 年 10 月致读者的评论......
对 2050 年前欧盟基于大规模存储的 PtG 转换的 STORE&GO 路线图读者的评论 STORE&GO 项目于 2016 年启动，一直运行到 2020 年 2 月。因此，路线图中的内容和结论反映了在此期间产生的结果。由于欧盟政治层面与此同时也发生了一些根本性进展，例如“欧洲绿色协议” [1]、欧盟能源系统整合战略和氢能文件 [2] [3] 以及 2030 年气候目标计划 [4] 的发布，作者觉得有必要让读者思考一下他们认为这些新发展与 STORE&GO 文件内容的关系，以及它们可能会改变结论。关于 STORE&GO 路线图的文本，最近的发展似乎普遍强调了 STORE&GO 的关键点，即需要采取紧急和渐进的方式实现“分子绿化”，尤其是天然气。 《欧洲绿色协议》中建议的一些行动已经解决了这一问题，因此可以说它们符合路线图的建议。《欧洲绿色协议》2030 年气候目标计划中提到了一个更雄心勃勃的中期减排目标，即 55% 而不是之前的 40% [4]。我们认为，这个新目标不会改变路线图中得出的结论。相反，它强调需要采取战略性和协调性的方法来保证能源市场运转良好、技术高效、可再生气体供应充足，正如路线图“2050 年欧盟能源图景”中所述。在《推动气候中性经济：欧盟能源系统一体化战略》[2] [5] 一文中，该团队还欢迎一些与路线图建议高度一致的建议行动：
ABCDPlace：在多线程 CPU 和 GPU 上加速基于批处理的并发详细布局
摘要 — 布局是现代超大规模集成电路 (VLSI) 设计中的重要步骤。详细布局是整个设计流程中被密集调用的布局细化程序，因此其效率对设计收敛至关重要。然而，由于大多数详细布局技术本质上是贪婪和顺序的，因此它们通常难以并行化。在这项工作中，我们提出了一个并发详细布局框架 ABCDPlace，利用多线程和 GPU 加速。我们为广泛采用的顺序详细布局技术提出了基于批处理的并发算法，例如独立集匹配、全局交换和局部重新排序。实验结果表明，在 ISPD 2005 竞赛基准上，ABCDPlace 可以比使用多线程 CPU 的顺序实现快 2 × - 5 × 的运行时间，使用 GPU 可以比顺序实现快 10 × 以上，而不会降低质量。在更大的工业基准测试中，我们展示了比最先进的顺序详细布局器快 16 倍以上的 GPU 加速。 ABCDPlace 在一分钟内完成一千万个单元的工业设计的详细布局。
掌握染色质阅读器的化学探针
组蛋白翻译后修饰（如甲基化或乙酰化）的动态特性使得通过操纵相关的表观遗传机制来改变与疾病相关的表观遗传状态成为可能。一种方法是通过小分子扰动。表观遗传读取域的化学探针对于提高我们对调节其靶标的生物学后果的理解至关重要，同时也使得开发新的基于探针的试剂成为可能。通过在读取域探针上附加功能句柄，可以创建试剂的化学工具箱，以促进表观遗传复合物的化学沉淀，评估探针选择性，开发体外筛选试验，可视化细胞靶标定位，实现靶标降解并以高度可控的方式将表观遗传机制招募到基因组内的某个位置。
螺纹管接头疲劳寿命预测
在石油和天然气行业，螺纹管接头经常用于连接套管柱、钻杆柱或生产和运输立管和管道。接头通常预紧，以便在使用过程中保持密封和安全连接并避免泄漏。锥形螺纹是一种常见的接头，为了在螺纹接头组装时引入预紧力，需要施加一定的拧紧扭矩。拧紧扭矩加上外部载荷导致接头上出现多轴应力分布，其中螺纹接头充当应力集中器。波浪和洋流等环境会导致动态载荷作用于管道和海上结构。海上结构中最薄弱的环节是管道接头，因为接头螺纹中会产生疲劳裂纹。
螺纹管连接的疲劳寿命预测
在石油和天然气工业中，螺纹管接头经常用于连接套管柱、钻杆柱或生产和运输立管和管道。接头通常预紧，以便在使用过程中保持密封和安全连接并避免泄漏。锥形螺纹是一种常见的接头，为了在组装时对螺纹接头施加预紧力，需要施加一定的拧紧扭矩。拧紧扭矩加上外部载荷导致接头上出现多轴应力分布，其中螺纹接头充当应力集中器。波浪和洋流等环境会导致动态载荷作用于管道和海上结构。海上结构中最薄弱的环节是管道接头，因为接头螺纹中会产生疲劳裂纹。
带有条形码阅读器的自动智能垃圾桶
步骤1. 输入（废弃物）到智能垃圾桶步骤2. 近距离传感器检测到垃圾被倾倒在垃圾桶中，并向微控制器发送信号。步骤3. 微控制器同时启动音箱和条形码扫描仪（持续 10 秒）步骤4. 音箱发出由微控制器提供的音频消息。步骤5. 条形码阅读器读取个人身份条形码并将其发送回微控制器进行记录。