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癌症免疫疗法早期临床开发相关生物标志物的统计方法概述
在过去十年中，出现了一种利用免疫系统对抗肿瘤的癌症治疗新模式。这些免疫疗法的新作用机制也给药物开发带来了新的挑战。生物标志物在免疫疗法早期临床开发的几个领域中发挥着关键作用，包括作用机制的证明、剂量确定和剂量优化、不良反应的缓解和预防以及患者丰富和适应症优先排序。我们讨论了在早期开发研究中建立一组生物标志物的预后、预测方面以及将生物标志物的变化与临床疗效联系起来的统计原理和方法。所讨论的方法旨在避免偏见并得出可靠且可重复的结论。本综述针对对免疫疗法背景下的生物标志物的战略使用和分析感兴趣的药物开发商和数据科学家。
组合技术和相关图像处理，用于弹性体中包含物的定量统计表征
1 ENSTA B RETAGNE , UMR CNRS 6027, IRDL, F-29200 B REST , F RANCE 2 V IBRACOUSTIC – CAE D URABILITY P REDICTION D EPARTMENT , 44474 C ARQUEFOU , F RANCE 3 N ANTES U NIVERSITÉ , E COLE C ENTRALE N ANTES , CNRS, G E M, UMR 6183, F-44000 N ANTES , F rance摘要弹性材料的特性受到成分和详细过程所产生的夹杂物的强烈影响。提出了一种方法，以根据其化学性质区分弹性体中对疲劳有害（大于几µm）的夹杂物，并使用足够的统计数据进行定量表征它们。使用三种技术并进行了比较：数字光学显微镜（OM），与能量分散X射线光谱相关的扫描电子显微镜（SEM）和X射线微计算机层析成像（µ-CT）。六种材料用于挑战该方法。除了通常的金属氧化物和碳黑色附聚物外，突出显示了三种非典型夹杂物，从而产生了特定的检测困难。与经典的阈值方法相比，开发了一个相关的图像分析过程，以自动和准确地检测获得的图像的包含物。不同夹杂物种群的形态和空间分布。µ-CT是包含物的分类和统计表征的最全面，最准确的方法。此外，可以使用反向散射电子（SEM-BSE）或数字OM获得有关包含物尺寸分布的相关数据。SEM-BSE比数字OM提供了更准确的结果。简介橡胶部分的性能与化合物中成分的分散质量有关。该分散剂取决于所用的成分以及详细过程（混合，注射和固化）1。用于橡胶零件的典型成分包括碳黑色（CB）或二氧化硅填充剂和ZnO。对成分的良好分散对于获得均匀的混合物，良好的机械性能以及批处理和批处理之间的性质的一致性很重要。此外，夹杂物和团聚物在这些材料的机械性能中起关键作用。例如，疲劳损伤通常以CB的聚集体2或在二氧化硅聚集体3或金属氧化物2,4处引发。因此，重要的是能够表征填充物分散体和橡胶化合物中的夹杂物。的确，这种分散在空间和大小上的知识允许检查混合物的质量，优化过程参数，并在微观结构和感兴趣的属性之间建立链接。*通讯作者。matthieu.le_saux@ensta-bretagne.fr在文献中已经提出了许多技术，以分析橡胶材料中成分（基本上是CB）的微或宏分散因素：•通过透射光学显微镜（OM）5,6的材料（厚度上的几微米至几千微米）观察材料的材料（厚度几英尺）的效果。观察到的较暗和较明亮的区域分别对应于CB团聚物，并在切割过程中脱离了聚集体；该方法在1960年代被用作标准（ASTM D-2663方法B）。
内含子编辑可以使谱系特异性表达与HSPC基因治疗相关的治疗剂
基因编辑的造血茎和祖细胞（HSPC）的自体移植可以在不久的将来作为选择的多种遗传疾病（包括溶酶体储存疾病（LSD））的选择。HSPC的传统基因治疗方法基于慢病毒载体对转基因的整合，而最近靶向的盒式磁带的整合通常由设计器核酸酶支持。无论哪种情况，转基因的表达通常都由外源无处不在的启动子维持，该启动子可能会改变或失调周围的原始癌基因和/或肿瘤抑制器的表达。此外，普遍存在的启动子在干细胞水平上诱导所需转基因的表达，这可能会影响其功能性，因为已建议将半乳糖脑脑苷酶（Krabbe）或葡萄糖脑苷酶（Gaucher）的过表达表达。，我们基于将剪接功能的盒式集成到谱系特异性基因座的内含子中的集成基于HSPCS的新型基因编辑系统。这种方法旨在防止转基因在干细胞水平上的表达，仅在细胞分化后触发转基因表达。作为概念证明，我们编辑了CD11b在HSPC中的内含子，并诱导转基因（用于治疗I型I型的GFP或IDUA）在体外分化和体内髓细胞塑料插入后的髓样含量I型）中的髓样特异性表达。我们证明了这种方法对CD20和CD4基因的可运输能力。
解锁分子领域：识别临床和环境相关细菌的高级方法
临床和环境细菌病原体的快速，有效和特定鉴定对其控制至关重要。传统上，通过基于形态学，生化和代谢特性的表型方法鉴定了细菌。尽管这些方法在临床实践中非常有用，但它们的局限性包括在物种内部和耗时工作和耗时的工作流中差的能力差。新开发的分子方法可以极大地提高分类表征的准确性，从而确定医学或环境重要性的特定菌株。但是，由于高昂的成本和对训练有素的专业人员的需求，这些方法在诊断实验室中尚未常规。因此，传播有关分子识别技术进步的知识是使这些方法可访问的关键。这项工作的目的是审查和讨论细菌识别的当前分子技术，旨在跟踪和监测临床和环境样品中的微生物剂。
专为女高中生设计的以社会相关的 AI 课程
从历史上看，女学生对计算机科学领域的兴趣不高。以前的计算机科学课程未能解决缺乏以女性为中心的计算机科学活动的问题，例如与社会相关的应用和现实生活应用。我们的新夏令营课程介绍了人工智能 (AI)、机器学习 (ML) 和其他现实世界主题，通过将课程与相关和前沿技术联系起来，让高中女生参与计算。主题范围从社交媒体机器人、不同媒体中自然语言的情感以及人工智能在刑事司法中的作用，并重点关注 NetsBlox 和 Python 编程语言中的编程活动。夏令营教师参加了为期一周的教学法和以同伴教学为中心的专业发展计划，他们同时学习和练习向彼此教授课程。然后，在为期半天、两周的夏令营中，两位老师带领学生通过动手实践的 AI 和 ML 活动进行学习。在本文中，我们讨论了课程的开发和实施，以及来自教师和学生的调查反馈。
硫还原地杆菌在环境相关浓度下对半胱氨酸相关硫醇化合物的代谢周转
已知低分子量 (LMM) 硫醇化合物对各种生物体的许多生物过程都很重要，但 LMM 硫醇在厌氧菌中的研究不足。在这项工作中，我们研究了模型铁还原细菌 Geobacter sulphurreducens 对具有与半胱氨酸相关化学结构的纳摩尔浓度 LMM 硫醇的产生和周转。我们的结果表明，G. sulphurreducens 根据细胞生长状态和外部条件严格控制硫醇的产生、排泄和细胞内浓度。内源性半胱氨酸的产生和细胞输出与 Fe(II) 的细胞外供应相结合，这表明半胱氨酸排泄可能在细胞向铁蛋白的运输中发挥作用。添加过量的外源性半胱氨酸导致细胞将半胱氨酸快速大量地转化为青霉胺。添加同位素标记的半胱氨酸的实验证实，青霉胺是由半胱氨酸 C-3 原子二甲基化形成的，而不是通过对半胱氨酸暴露的间接代谢反应形成的。这是首次报道该化合物的从头代谢合成。青霉胺的形成随着外部暴露于半胱氨酸而增加，但该化合物并未在细胞内积累，这可能表明它是 G. 硫还原菌维持半胱氨酸稳态的代谢策略的一部分。我们的研究结果强调并扩展了严格厌氧菌中介导半胱氨酸样 LMM 硫醇稳态的过程。青霉胺的形成尤其值得注意，这种化合物值得在微生物代谢研究中引起更多关注。
癌细胞系中临床相关蛋白的药物反应的大规模表征
扰动生物学是一种建模定量细胞行为并理解详细疾病机制的有力方法。然而，癌细胞系对扰动的大规模蛋白质反应资源不可用，从而导致临界知识差距。在这里，我们使用逆相蛋白阵列在> 12,000个癌细胞系样品中生成了〜170种药物化合物的〜210个临床相关蛋白的扰动表达谱。我们表明，整合扰动的蛋白质反应信号提供了对耐药性的机理见解，增加了药物敏感性的预测能力，并有助于识别有效的药物组合。我们构建了“蛋白质 - 药物”连接性的系统地图，并为社区使用开发了一个用户友好的数据门户。我们的研究提供了丰富的资源来研究癌细胞的行为和治疗反应的依赖性，从而实现了广泛的生物医学应用。
相关资金机会纳米科学纳米，奥尔胡斯大学，2014年7月31日
January – 2024 -Innovation Fund Denmark - Innoexplorer internal AU deadline 05/01/24 -Lundbeckfoundation - Collaborative Projects Neuroscience 10/01/24 -Novo Nordisk Foundation - Tandem-Programme-Translational Research Collaboration 10/01/24 -Novo Nordisk Foundation Industrial & Environmental Biotech - Emerging Investigator 10/01/24 -NOVO NORDST基金会工业和环境生物技术 - 升高研究员10/01/24 -Novo Nordisk基金会植物科学，农业，农业，食品生物技术 - 新兴研究员10/01/24 -NOVO Nordisk Nordisk Nordisk Nordisk Nordisk基金会植物科学，Food Biotech，Food Biosceention -appenditor -bioss bioscor nord oscortor niter nitordornos -biosd nord nord -24 -24 -24-24 -24 -24 -24 -Nnord -24 -NOM -24 -NNOV新兴调查员11/01/24 -novo Nordisk Foundation Bioscience/Biomed -Aspending研究者11/01/24 -Novo Nordisk Foundation Bioscience/BioMED-杰出研究员11/01/24-NOVO NOVO NORDISK FOUNDAND -DOSTOC -DOSTOC -DOSTOC。福克斯基金会 - 帕金森病研究26/04/22Fellowships abroad, Bioscience and Basic Biomedicine 11/01/24 -Novo Nordisk Foundation - Research Infrastructure, large equipment 11/01/24 -Novo Nordisk Foundation – Exploratory Research Instrumentation 11/01/24 -Novo Nordisk Foundation – Equipment Upgrade Programme – invited applicants 11/04/24 -Novo Nordisk Foundation – Starting Package Grants-Faculty recruitment Q1 23/01/24 -EUopSTART 24/01/24 -Novo Nordisk Foundation - Postdoctoral Fellowship Oxford University 29/01/24 -Novo Nordisk Foundation - Visiting Scholar Fellowship (Postdoc) Stanford BIO-X 29/01/24 -Novo Nordisk Foundation - Postdoctoral Fellowship Weizmann Institute of Science 29/01/24 - Novo Nordisk基金会 - 马萨诸塞州理工学院的博士后奖学金研究所29/01/24 -Innovation Fund丹麦-InnoExplorer IFD截止日期截止日期（如果由AU批准）31/01/24 2月24日至2月 - 2024年2月24日 - 2024年-Danish Cancer Society -Danish Cancer Society -exp＆Cline -Clin＆Cline Epidem。
国际社会相关的微生物学教育和微生物学知识的概念
执行摘要：微生物在分布和对人类的功能和福祉，一般生活和地球的功能和福祉方面都普遍存在。基于微生物的技术为我们依赖的重要商品和服务的供应做出了巨大贡献，例如提供食物，药物和清洁水。他们还提供了缓解和解决各级人类面临的广泛问题和危机的机制和策略，包括联合国制定的可持续发展目标（SDG）中封装的问题。例如，微生物技术可以通过多种方式做出脱碳，因此面对全球变暖，为数十亿人缺乏它们的人提供清洁和清洁水，改善土壤的生育能力，从而提高粮食生产，从而开发疫苗和其他药物，以减少并在某些情况下减少并消除致命的感染。它们是生物技术的基础，这是一个越来越重要且不断增长的业务和就业来源，也是生物经济，绿色交易等的中心。但是，由于微生物在很大程度上是看不见的，因此大多数人都不熟悉，因此他们提供的机会有效预防和解决问题通常会被决策者遗漏，这会带来负面影响。为了理解这种缺乏重要知识，国际微生物学素养计划（IMILI）是从全球微生物学界招募的，并免费提供了社会相关微生物学课程的资源，可以在所有水平学习中使用。课程教学它的目标是建立一个具有相关微生物学的社会的发展，因此，能够充分利用微生物的潜力并最大程度地减少其负面活动的序列。除了教授微生物外，几乎每一堂课都提出了他们对可持续性和可持续发展目标的影响以及它们解决社会不平等问题紧迫问题的能力。
从全局表示对象跟踪中读取相关功能
来自模板或历史框架的参考特征对于视觉对象跟踪至关重要。先验工作利用固定模板或内存的所有功能进行视觉对象跟踪。然而，由于视频的动态性质，在不同时间步骤下，不同搜索区域所需的参考历史信息也不一致。因此，使用模板中的所有功能和内存都会导致冗余并损害跟踪性能。为了减轻此问题，我们提出了一种新颖的跟踪范式，包括相关的注意机制和全球表示记忆，可以自适应地帮助搜索区域从参考特征中选择最相关的历史信息。具体来说，这项工作中提出的相关性注意机制与以前的方法不同，因为它可以通过在全球访问跨框架信息来动态选择和构建当前帧的最佳全局表示内存。此外，它可以灵活地读取构造记忆中的相关历史信息，以减少冗余并抵消有害信息的负面影响。广泛的实验验证了所提出的方法的有效性，并在71 fps的五个挑战数据集上实现了竞争性能。