。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2023年12月6日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2023.02.19.529108 doi:Biorxiv Preprint
即使对于具有极为约束的设计的microRNA(miRNA)基因,生成新基因和遗传信息的机制也是鲜为人知的。所有miRNA主要转录物都需要折叠成干循环结构,以产生与结合和拒绝其mRNA靶标结合和倒置的短基因产物(约22 nt)。虽然大量的miRNA基因是古老且高度保守的,但已证明编码完全新颖的miRNA基因的短次级结构以谱系特异性的方式出现。模板切换是一种与DNA复制相关的突变机制,可以在单个事件中引入复杂的变化并为整个发夹结构生成完美的基础配对。在这里我们表明,模板开关突变(TSM)参与了灵长类动物谱系中6,000多个合适的发夹结构的出现,以产生至少18个新的人类miRNA基因,即自从灵长类动物起源以来就已经出现的miRNA的26%。虽然该机制似乎是随机的,但TSM生成的miRNA富含内含子,可以用其宿主基因表达它们。TSM事件的高频提供了进化的原材料。比从从头创建基因创建的其他机制快的速度要快,TSM生成的miRNA可以使遗传信息的近乎静止状态和快速适应不断变化的环境。
本文通过Eggertsson等人复制了“世俗停滞模型:理论和定量评估模型”的大规模重叠生成模型(OLG)。(2019)使用Dynare的最新版本(5.3)(Aidgemian等,2022),这是一种标准软件,用于模拟和估算在学院,中央银行和其他机构中广泛使用的动态通用平衡模型。原始模型构建了一个具有多种结合约束(OBC)的大型OLG模型,以捕获世俗停滞假设的主要特征(Summers,2015年),重点是利率的长期下降。作者表明,关键驱动因素(例如人口老化和生产率增长速度比美国利率降低)的定量重要性,计算从1970年到2015年的过渡动态。我们的复制练习旨在在三个方面提供宝贵的贡献。首先,它证实了宏观经济学中众所周知的重要贡献的结果。的确,世俗停滞假设
冠状病毒病(Covid-19)大流行已导致2022年10月的600万人死亡。严重急性呼吸综合征2的疫苗和抗病毒药疫苗和抗病毒药2现在可用;但是,有效治疗需要更有效的抗病毒药物。在这里,我们报告说,有效的AMP激活蛋白激酶(AMPK)抑制剂Com-pound c/c/partomorphin抑制了人冠状病毒OC43菌株(HCOV-OC43)的复制。我们检查了对照和AMPK-KNOCKOUT(KO)细胞中的HCOV-OC43复制,并发现AMPK-KO细胞中的病毒复制降低。接下来,我们检查了AMPK抑制剂,化合物C对冠状病毒复制的影响。化合物C治疗有效抑制复制并降低冠状病毒诱导的细胞毒性,进一步抑制自噬。此外,用化合物C与氯喹结合协同抑制冠状病毒复制的治疗。这些结果表明,化合物C可以被视为Covid-19的潜在药物候选者。
丹麦磁共振研究中心,功能和诊断成像与研究中心,哥本哈根大学医院 - 仪表板 - 室友和HVIDOVRE,丹麦B伦敦B伦敦伦敦数学数学学院,英国伦敦,C哥本哈根大学,哥本哈根大学,哥本哈根大学,哥本哈根大学,丹麦哥本哈根,丹麦医院,医院,哥伦比亚大学。哥本哈根,丹麦E临床医学研究所,哥本哈根大学医学和健康科学学院丹麦H丹麦H哥本哈根,沃恩福德医院,牛津大学,牛津大学,牛津大学,英国I辐射科学系,UMEå功能性脑成像中心(UFBI),Umeå大学,Umeå大学,瑞典
视网膜细胞瘤肿瘤抑制蛋白(RB)与多种表观遗传试剂酶在物理和功能上相互作用,以控制转录调控,响应复制应力,促进DNA损伤反应和修复以及调节基因组稳定性。更好地了解RB功能的分裂如何影响基因组稳定性的表观遗传调节,并确定此类变化是否代表了RB功能障碍的癌细胞的极低弱点,我们进行了基于成像的筛查以识别表观遗传抑制剂,以识别DNA损伤并促进RB-定位率损害RB的稳定性。我们发现,单独的RB丢失会导致高水平的复制依赖性聚-ADP核糖基化(Par-ylation),并且通过捕获染色质上的PARP Enbyemes来防止在染色质上捕获RB-DE浓缩细胞,从而在未分解的复制应力下进展到有丝分裂的细胞。这些缺陷将高水平的DNA损伤和细胞活力损害。我们证明了这种敏感性是在针对PARP1和PARP2的一批药物中保守的,可以通过重新表达RB蛋白来抑制。在一起,这些数据表明,靶向PARP1和PARP2的药物可能与RB脱氧癌的临床相关。
Nathalie E Aggenstiner 4,Sebastian Siehl 3,Dorothea L. Floris 1,2.7,亨氏15号,英国16,玛丽尼特17,玛丽·劳雷·佩莱尔·马丁雷尔17.18,托马斯·帕斯23,迈克尔·N。 Smolka 23,Nilatshi 24,Henrik Walter 15,Robert Whelan 25,Schumann 24.26, 1.2,31,成像联盟*Nathalie E Aggenstiner 4,Sebastian Siehl 3,Dorothea L. Floris 1,2.7,亨氏15号,英国16,玛丽尼特17,玛丽·劳雷·佩莱尔·马丁雷尔17.18,托马斯·帕斯23,迈克尔·N。 Smolka 23,Nilatshi 24,Henrik Walter 15,Robert Whelan 25,Schumann 24.26, 1.2,31,成像联盟*
DNA 单链断裂 (SSB) 会破坏 DNA 复制并诱导染色体断裂。然而,SSB 存在于复制叉后还是复制叉前时会诱导染色体断裂尚不清楚。为了解决这个问题,我们利用了缺乏 PARP 活性或 XRCC 1 的 SSB 修复缺陷人类细胞对胸苷类似物 5 - 氯-2 0 - 脱氧尿苷 (CldU) 的极佳敏感性。我们表明,在这些细胞中与 CldU 一起孵育会导致染色体断裂、姐妹染色单体交换和细胞毒性,其机制取决于尿嘧啶 DNA 糖基化酶 (UNG) 的 S 期活性。重要的是,我们表明,在一个细胞周期中 CldU 的掺入仅在下一个细胞周期中才具有细胞毒性,此时 CldU 存在于模板 DNA 中。与此一致的是,尽管 UNG 既能诱导复制叉后新生链中的 SSB,也能诱导复制叉前的模板链中的 SSB,但只有后者会触发叉塌陷和染色体断裂。最后,我们表明 BRCA 缺陷细胞对 CldU 高度敏感,无论是单独使用还是与 PARP 抑制剂联合使用,这表明 CldU 可能具有临床实用性。
此预印本的版权持有人(该版本发布于2023年7月27日。; https://doi.org/10.1101/2023.07.25.550556 doi:Biorxiv Preprint
在ORC和BPR之间作为“ ORC-BPR”相互作用(图1a,第一个面板,虚线框)。使用总内反射荧光(TIRF)显微镜,我们监测了溶液与表面束缚的原点DNA中的ORC C的共定位(23)。在每个ORC-DNA共定位事件中,我们测量了有效的ORC C•+51 FRET效率(E FRET)以检查ORC诱导的DNA弯曲。当兽人到达DNA时,我们一直观察到高兽人C•+51 e fret状态,表明兽人与ACS和BPR结合,并且绑定的DNA弯曲(图。1C-D)。大多数ORC C•+51 E FRET值以0.62为中心(图1d)。尽管它们代表兽人共定位时间的0.5%,但我们还观察到了较低的E fret值的短期(<0.28,图。1C-D,SI附录,图 s1b)。 这些低E FRET值不是由光漂白引起的,因为我们在实验后通过受体激发检查了DNA耦合的荧光团,并将分析限制为将荧光保持到实验结束的DNA分子。 此外,对照实验表明,这些低E fret值不是由沿着DNA滑动而引起的,以远离ACS(SI附录,图。 s2)。 我们排除了在DNA共定位期间任何时候都没有显示高E FRET信号的小部分(约2%)的兽人分子,因为这些可能代表了非特异性的ORC结合。 单个高斯模型在低E fret值下的差(图) 1b)。1C-D,SI附录,图s1b)。这些低E FRET值不是由光漂白引起的,因为我们在实验后通过受体激发检查了DNA耦合的荧光团,并将分析限制为将荧光保持到实验结束的DNA分子。此外,对照实验表明,这些低E fret值不是由沿着DNA滑动而引起的,以远离ACS(SI附录,图。s2)。我们排除了在DNA共定位期间任何时候都没有显示高E FRET信号的小部分(约2%)的兽人分子,因为这些可能代表了非特异性的ORC结合。单个高斯模型在低E fret值下的差(图1b)。1d,插图中的红色曲线表明在弯曲或无形构象状态下存在不同的种群。我们得出的结论是,低E fret值反映了一个无分的状态,其中兽人在ACS处保持绑定,但兽人相互作用丢失(图添加Cdc6会提高DNA上的ORC稳定性,从而导致