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干细胞生物学和重编程（D012549）
1) Stem cells in the body, stem cell niches 2) Stem cells in vitro (ESC, iPSC MSC) 3) Reprogramming: somatic cell nuclear transfer vs. iPSC 4) Pluripotent stem cells: production, derivation process, efficiency, in vitro culture, pitfalls, challenges 5) Different types (naïve/primed) pluripotent stem cells from human/mouse 6) Signal pathways, transcription networks and epigenetic调节（胚胎）多能干细胞，胚胎干细胞的遗传稳定性，记忆的记忆7）机械生物学，生物材料和干细胞8）Mini器官（Organoid）9）生殖细胞分化 /透明度分化10）
肺癌中的肿瘤代谢重编程...
摘要：代谢重编程是肿瘤细胞的重要特征，肿瘤细胞重新编程其代谢途径以满足快速增殖对物质、能量和氧化还原力的需求。代谢重编程改变细胞内外特定代谢物的水平或类型，通过影响基因表达、细胞状态和肿瘤微环境促进肿瘤生长。葡萄糖代谢、谷氨酰胺代谢和脂质代谢是肿瘤中重要的代谢途径，靶向代谢重编程可显著抑制肿瘤生长并诱导细胞凋亡。代谢重编程在维持肿瘤细胞的生长优势、增强肺癌化疗耐受性方面也发挥着重要作用。本文就肺癌中葡萄糖、脂肪和氨基酸代谢的异常变化及其分子机制进行综述，旨在为肺癌的预防、早期诊断和治疗提供新思路。
线粒体DNA动力学在重编程中
哺乳动物细胞（除红细胞）外，线粒体具有提供能量，中间代谢物的细胞器，以及维持细胞活力，复制和功能的其他活动。线粒体包含称为线粒体DNA（mtDNA）的圆形基因组的多个拷贝，其内部序列很少是相同的（同型），因为遗传或散发性突变会导致多个mtDNA基因型（neteroplasmy）。在这里，我们研究了通过细胞重编程产生的诱导多能干细胞（IPSC）进行的杂质的维持或转移的潜在机制，并进一步讨论可以改变异质质以影响茎和分化细胞性能的杂质。这种额外的见解将有助于开发更强大的基于IPSC的疾病模型和分化的细胞疗法。
通过成年和糖尿病的分支链氨基酸的纵向轨迹
引言肾脏在调节哺乳动物的葡萄糖稳态方面具有重要作用。在肾小球中过滤了大约180克/天葡萄糖，绝大多数被肾近端小管细胞（KPTC）重吸收，主要是通过钠 - 葡萄糖葡萄糖共转运蛋白2（SGLT2）（SGLT2）（SGLT2）（1-3）。在糖尿病中，葡萄糖吸附增加，从而加剧了高血糖症（3）。sglt2抑制剂（SGLT2I）诱导糖尿病，通常用于治疗糖尿病。引人注目的是，大规模试验始终显示SGLT2I有效地防止了肾功能的下降，并改善了有或没有糖尿病患者的充血性心力衰竭的心脏功能；这些改善包括对末期肾脏疾病的进展减慢，心力衰竭的住院时间较少，死亡率降低（4-10）。早期临床研究表明，SGLT2I对非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者也有益（11，12）。有趣的是，SGLT2I Canagliflozin已显示可延长老年男性啮齿动物的寿命（13）。SGLT2I的这些强大的多机构有益作用表明，通过增加糖尿的葡萄糖负荷减少葡萄糖负荷会诱导系统的代谢重编程，从而影响遥远器官的代谢。ferrannini及其同事表明，在2型糖尿病患者中，SGLT2I诱导的糖尿症与内源性葡萄糖产生的增加有关，胰岛素敏感性增强以及从碳水化合物到脂质的底物利用率转移（14，15）；已经假设这种代谢转移介导了SGLT2I的有益心脏作用（2）。根据这一假设，糖尿降低
重新编程受损的免疫细胞来对抗癌症
Kelley 实验室此前的研究表明，在晚期癌症中，当肿瘤表达更多 VISTA 蛋白（调节免疫细胞活性）时，其治疗耐药性会增强。通过增加 VISTA 表达，肿瘤实质上“劫持”了巨噬细胞（一种负责杀死和清除死细胞的白细胞），并招募它们来支持肿瘤的生长。
重编程蓝藻聚球藻的碱基编辑
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2022 年 9 月 6 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.09.05.506134 doi：bioRxiv 预印本
肿瘤代谢重编程在肿瘤免疫中的作用
摘要：肿瘤的发生和发育需要癌细胞的代谢重编程，即通过各种代谢途径以自主方式改变伏布，以满足增加的生物能和生物合成需求。肿瘤细胞消耗大量养分，并通过其代谢产生相关的代谢。这导致肿瘤微环境（TME）的重塑以更好地支持肿瘤生长。在TME重塑期间，免疫细胞代谢和抗肿瘤免疫活性受到影响。这进一步导致肿瘤细胞从免疫监测，因此导致异常增殖。本综述总结了与肿瘤代谢重编程过程中代谢信号分子异常的生物合成和活性相关的调节功能。此外，我们还提供了对TME中营养的免疫细胞和肿瘤细胞之间竞争的全面描述，以及肿瘤代谢所需的代谢物，所涉及的代谢信号通路以及免疫细胞的功能。最后，我们总结了针对肿瘤免疫疗法发展的当前研究。我们旨在为未来研究肿瘤代谢重编程的机制提供新的概念，并探索这些机制与肿瘤免疫的关联。
使用条件重编程细胞，患者来源的...
摘要：前列腺癌死亡率在全球男性癌症死亡率中排名第二。对于精准治疗，尤其是对于已有耐药性前列腺癌的患者，迫切需要一种有效的药物筛选方法。基于细菌细胞培养和药物敏感性测试的概念，传统的癌症药物筛选方法是不够的。本文回顾并讨论了当前和更具创新性的癌细胞培养和体内肿瘤模型在药物筛选中用于潜在个性化抗癌治疗的应用。理想的筛选模型能够识别靶细胞的药物活性，类似于体内环境中发生的活性。基于这一原则，回顾并考虑了三种可用的前列腺癌细胞培养/肿瘤筛选模型。讨论了每种模型的培养条件、优缺点以及最佳利用这些模型的想法。第一种筛选模型使用来自患者癌细胞的条件重编程细胞。虽然这些细胞便于培养和使用，但它们可能具有与原始肿瘤细胞不同的标记和特征，并且
TET 酶的表观遗传重编程影响
摘要 十-十一易位 (TET) 家族酶对 DNA 的氧化对于表观遗传重编程至关重要。5-甲基胞嘧啶 (5mC) 转化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 会通过包括染色质结构变化在内的机制启动发育和细胞类型特异性转录程序。在这里，我们表明转录基因中 5hmC 的存在会促进新生 RNA 与模板 DNA 链的退火，从而形成 R 环。在没有基因表达变化的情况下，TET 酶的消耗会减少整体 R 环，而 CRISPR 介导的 TET 与活性基因的结合会促进 R 环的形成。5hmC 和 R 环的全基因组分布在小鼠和人类干细胞中呈正相关，并且在一半的活性基因中重叠。此外，R 环分解会导致参与干细胞增殖过程中关键事件的一组基因的差异表达。总之，我们的数据表明，通过 TET 活性进行的表观遗传重编程促进了共转录 R 环的形成，揭示了基因表达调控的新机制。
癌症免疫疗法时代的细胞命运重编程
了解癌细胞如何与免疫系统相互作用的进步允许发展免疫治疗策略，从而利用患者的免疫系统来培养癌症。基于树突状细胞的疫苗以重新激活抗肿瘤适应性免疫。免疫检查点抑制剂和嵌合抗原受体T细胞（CAR T）是弹射免疫疗法的治疗成功的主要方法。尽管他们在广泛的人类癌症中取得了成功，但仍有许多挑战在基本的理解和临床进步方面仍然存在，因为只有少数患者受到免疫疗法的好处。此外，细胞免疫疗法面临着由从供体中分离的免疫细胞的可用性和质量施加的重要局限性。细胞命运重编程提供了有趣的替代方案来应对这些挑战。诱导的多能干细胞（IPSC）技术不仅可以研究免疫细胞规范，而且还可以作为分化无数临床上有用的免疫细胞（包括T细胞，NK细胞或单核细胞）的平台。此外，IPSC的利用允许引入遗传修饰和具有增强抗肿瘤特性的T/NK细胞的产生。免疫细胞，例如巨噬细胞和树突状细胞，也可以通过直接的细胞重编程，使用谱系绕过多能阶段的谱系主要调节剂来生成。因此，细胞重编程工具箱现在正在提供解决患者量身定制的免疫细胞类型的潜在癌症免疫疗法的潜力。在这里，并行，用于基因递送的病毒载体的发展为体内重新编程打开了再生医学重编程，这是一种规避当前体外细胞操作的局限性的优雅策略。最近通过体内的汽车T细胞产生了一种类似的范式在癌症免疫疗法中。这些关于内源性重编程的新想法，从再生医学和基因疗法领域进行了交叉施用，为直接调节免疫或肿瘤细胞的原位开辟了令人兴奋的途径，扩大了我们去除癌症免疫疗法障碍的策略。