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核糖体蛋白S1的核酸螺旋螺旋 - 毫无方面的特性，S1在mRNA与核糖体结合的mRNA中的作用
摘要30S核糖体中核糖体蛋白Si的存在对于形成30S启动复合物具有天然mRNA是必不可少的。缺乏Si的30S亚基与AUP作为mRNA保持活性，并且在Phe-tRNA的Poly（Ru）定向结合中也有效。孤立的蛋白质si si si si术法破坏了螺旋和堆叠单链的多核苷酸的二级结构，并将其转换为完全或部分变性的形式。Si的单n-乙基酰亚胺衍生物几乎没有任何RNA螺旋螺旋的特性，但很容易将其纳入Si中缺陷的30S子单位中。所得的N-乙基马雷酰亚胺-S1-孔的30S亚基在MS2 [3H] RNA的结合中是完全不活跃的，并且在形成具有MS2 RNA作为mRNA的启动复合物中。，它们保留了响应三核苷酸AUP的启动剂FMET-TRNA的结合，并在响应于Poly（U）的Phe-tRNA结合中，它们还保留了结合50S亚基并形成70S夫妇的能力。这些结果表明，当蛋白成为30S亚基的一部分时，孤立的Si的RNA螺旋 - 无方向能力与Si在核糖体结合中的功能之间存在相关性。
RNA 组成的最佳生长规律及其通过细菌基因组中核糖体和 tRNA 基因定位的部分实现
细胞资源在细菌蛋白质中的分布已通过现象学生长定律量化。在这里，我们描述了一种补充性的 RNA 组成细菌生长定律，该定律源于细胞资源在核糖体和三元复合物中的最佳分配。预测的 tRNA/rRNA 比率随生长速度下降与实验数据在定量上一致。它的调节似乎部分是通过染色体定位来实现的，因为 rRNA 基因通常比 tRNA 基因更靠近复制起点，因此在更快的生长速度下其基因剂量会越来越高。在大肠杆菌中，在最高生长速度下，基于染色体位置的 tRNA/rRNA 基因剂量比几乎与观察到的、理论上最佳的 tRNA/rRNA 表达比相同，这表明染色体排列已经进化到有利于这种条件下两种类型基因的最大转录。
通过细菌培养和16S核糖体RNA基因测序评估的荷斯坦乳制品小母牛和母牛中怀孕子宫的微生物组
结果：从怀孕生殖道（污染控制）的外表面培养了87种独特的细菌，并从妊娠组织培养的12种细菌物种。10头牛中有6个（60％）在怀孕子宫内的至少一个位置表现出细菌生长。对于元学结果（16S rRNA基因测序），鉴定出低靶向微生物生物量。对检测到的扩增子序列变体（ASV）的分析表明，有：（1）属在外表面和怀孕子宫内都普遍存在； （2）在外表面上盛行但未检测到的属，或者在怀孕子宫内未被检测到非常低的患病率； （3）未检测到的属或在外表面患病率较低但在怀孕子宫内的患病率相对较高。
atoplex metabarcoding库准备用户手册
ATOPLEX METABARCODING用户手册为MGI定制产品平台上的测序进行多个PCR扩增提供了指导。荟萃编码通常用于物种分类，丰度分析和各种生物样品的比较研究。The barcodes frequently used for biodiversity assessment include prokaryotic 16S ribosomal DNA (for bacteria and archaea), eukaryotic 18S ribosomal DNA (for diverse eukaryotes such as plants, protists, and fungi), eukaryotic ITS ribosomal DNA (for fungi), mitochondrial COI gene (for a wide range of eukaryotes including animals and生物）和线粒体12S DNA（专门针对鱼）。This user manual is only applicable to the use of the library construction products described in this document: ATOPlex 16S V3V4 rDNA Primer Pool, ATOPlex 18SV4 rDNA Primer Pool, ATOPlex ITS1 rDNA Primer Pool, ATOPlex COI mtDNA Primer Pool, ATOPlex Ac12S mtDNA Primer Pool, ATOPlex MiFish Primer Pool, and ATOPlex DNA Dual Barcode Library Preparation测序套件。
修订的JBC_2012_400564
总结大多数核糖体蛋白在核糖体生物发生和功能中起重要作用。在此，我们研究了在酵母酵母酿酒酵母中这些过程中必需的核糖体蛋白L40的贡献。删除RPL40A或RPL40B基因以及L40损害60S核糖体亚基生物发生的体内耗竭。多层体剖面分析揭示了半摩尔人的积累和自由60s核糖体亚基的中等减少。脉冲 - 脉冲追踪，北部印迹和底漆扩展分析，清楚地表明，前RRNA加工反应并不是严格必需的L40，但有助于最佳27SB 27SB前RRNA成熟。此外，L40的耗竭阻碍了60年代前核糖体颗粒的核总质出口。重要的是，所有这些缺陷最有可能是NMD3受损和RLP24从细胞质前60年代核糖体释放的直接结果
通过呼吸道感染对肺泡景观的形成和肺免疫的长期后果
简介：核糖体通过将小核糖体亚基与大型核糖体亚基与肽键形成的质体RNA耦合，从而催化所有细胞中的蛋白质合成。由于两个亚基都由核糖体RNA和核糖体蛋白组成，因此这些分子机的组装受到严格控制。在人类细胞中，超过200个核糖体组装因子催化了两个核糖体亚基的成熟。核糖体组装是在核仁中启动的，核仁是通过多价蛋白质 - 核酸相互作用形成的生物分子冷凝物。在该生物分子冷凝物中，形成了小亚基的第一个稳定的真核核糖体组装中间体，小亚基（SSU）造型。在SSU过程中，70多种蛋白质和RNA伴侣，小核仁RNA（SNORNA）U3，共同起作用，可通过RNA Exosome来实现RNA折叠，修饰，重排和裂解以及靶向降解前RNA的降解。与人类疾病相关的核糖体蛋白质和核糖体组装因子突变强调了这一过程的本质。
癌症治疗的新视野
摘要：最近的发现彻底改变了人们将核糖体视为统一的分子机器的观念，揭示了复杂的核糖体异质性。与核糖体实体可互换的传统观念相反，新兴研究强调存在专门的核糖体，每种核糖体都具有独特的组成和功能。细胞和组织特异性、发育和生理状态以及外部刺激（包括昼夜节律）等因素显著影响核糖体的组成。例如，肌肉细胞和神经元分别以不同的核糖体蛋白组和动态行为为特征。此外，核糖体 RNA（rRNA）的替代形式及其转录后修饰为这种异质性增加了另一个维度。这些变化由空间、时间和条件因素协调，使各种专门的核糖体得以表现出来，每种核糖体都具有潜在的不同功能。这种特化不仅影响 mRNA 翻译和基因表达，还对更广泛的生物学背景具有重要意义，尤其是在癌症研究领域。随着对核糖体多样性的理解不断加深，它也为探索细胞功能的新途径铺平了道路，并为翻译的分子复杂性提供了新的视角。
西班牙缅甸猫因 Prototheca 微藻引起的内源性眼内炎
靶标 引物/探针 序列 5′ → 3′ 参考 18S rDNA SSUF1 AACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC ( 1 ) SSUR1 TGATCCTTCTGCAGGTTCACCTACG 28S rDNA 28SF1 AAGCATATCAATAAGCGGAGG ( 2 ) 635 GGTCCGTGTTTCAAGACGG 细胞色素 B cytB_F1 GYGTWGAACAYATTATGAGAG ( 3 ) cytB_R2 WACCCATAARAARTACCATTCWGG 附表 2. 18S rDNA 核糖体亚基、28S rDNA 核糖体亚基 D1/D2 区和部分细胞色素 B 基因的序列分析。使用基本局部比对搜索工具 (BLAST) 查询 NCBI 数据库（访问于 2024 年 7 月）
突变的亨廷顿病倒核糖体和抑制亨廷顿病细胞模型中的蛋白质合成
亨廷顿蛋白（MHTT）的聚谷氨酰胺扩展引起了亨廷顿疾病（HD）和神经变性，但这些机制尚不清楚。在这里，我们发现MHTT促进核糖体失速并抑制小鼠HD纹状体神经元细胞中的蛋白质合成。MHTT的耗竭可增强蛋白质的合成并增加核糖体转移的速度，而MHTT直接在体外抑制蛋白质合成。fmrp是核糖体失速的已知调节剂，在HD中上调，但其耗竭对HD细胞中蛋白质合成或核糖体停滞的影响没有明显的影响。我们发现核糖体蛋白质和将核糖体与MHTT翻译的相互作用。高分辨率全球核糖体足迹（核糖表）和mRNA-seq表明，核糖体占用率向5'和3'端的核糖体占用率广泛转移，并且在HD细胞中选定的mRNA靶标上的独特单轴暂停。因此，MHTT阻碍了翻译伸长过程中的核糖体易位，这是一种可用于HD疗法的机械缺陷。