,我们在年初准备了暂时替换玛尔塔(Marta)的暂时替换,这是她的孕妇(以及盖亚(Gaia of Gaia)(盖亚(Gaia of Gaia)的诞生),一个全胡子的“ rossetta”,给我们带来了美丽的阳光阳光,在thi-ck和威胁性的云层中)。我们选择了这个职位的人,并在最后一个星期一的工作中支持Marta,突然在她开始产假后几周就让我们空白了。在创纪录的时间里,我们发现了一个进一步的替代者,他们从未出于个人原因在公司中全面运作。此外,正如我们正在努力扩大员工一样,我们必须管理两个同事的离职,他们决定重新转向自己的出生地并做出不同的专业选择。这虽然我们需要大量精力来开发新服务(CSRD,CBAM,碳中立性)或遵循现有的服务(ETS)的演变。
修改目标 DNA 的基因组编辑工具是基因和细胞治疗的有力工具。目前主要的基因组编辑工具是CRISPR-Cas,应用最为广泛;其次是TALEN;最后是ZFN,应用最少。其中CRISPR-Cas和TALEN的基本专利将持续到2030年甚至更晚,因此在医疗领域使用需要高额的授权费用。另一方面,ZFN的基本专利已于2020年到期,它是一种可免许可使用的基因组编辑工具。通过将识别DNA的Zinc Finger与切割DNA的FirmCutND1 Nuclease(由广岛大学自主开发)相结合,可以制作出名为“Zinc Finger-ND1”的纯国产基因组编辑工具。然而,构建功能性ZFN并提高其基因组编辑效率极具挑战性。 [研究成果总结] 传统上,创建ZFN的主流方法是从随机重排的ZF中筛选与目标DNA结合的ZF。然而,创建功能性 ZFN 大约需要两个月的时间,这需要大量的时间和精力。另外,人们设计了一种称为“模块化组装”的方法,用于将 ZF 在基因上连接起来,但在制作三指 ZFN(三个 ZF 连接在一起)时,获得功能性 ZFN 的概率约为 5%,由于生产效率低,该方法无法使用。我们假设,手指数量少导致可识别的碱基数量减少,从而导致产生功能性 ZFN 的效率降低。因此,在本研究中,我们采用模块化组装的方式构建了一个6指ZF-ND1(图1),以增加其识别的碱基数量。结果,我们构建的10个ZF-ND1中,有两个被证实具有基因组DNA切割活性,这意味着我们以20%的概率成功获得了功能性ZFN。为了进一步完善ZF-ND1的功能,我们使用结构建模技术(AlphaFold、Rossetta和Coot的分子建模)来模拟ZF和DNA之间的相互作用(图2)。通过与 Zif268(一种与 DNA 结合的天然 3 指 ZF)的 DNA 相互作用模型进行比较,确定了五种候选突变。此外,通过比较与 Zif268 的 DNA 糖磷酸骨架结合的氨基酸,确定了四个突变候选者。当将这九个候选突变逐一引入功能性 ZF-ND1 时,发现其中三个突变(图 3)可提高基因组 DNA 切割活性。 V109K突变使裂解活性提高了5%,并且我们成功在结构建模的基础上增强了ZF-ND1的功能。