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棉叶卷曲疾病抑制的微生物群移植⠎核心微生物组和转录组动力学
微生物群移植是管理植物性疾病的强大工具。这项研究研究了微生物群移植对棉叶毛皮疾病（CLCUD）抗性的影响，该物种长度良好，但对生物胁迫的敏感性很高。分析了抗clcud抗性物种gossypium arboreum的v3-v4 16S rRNA基因扩增子，来自根际和腓骨层的微生物馏分以及易感棉花品种。已经确定了与疾病抗性相关的独特细菌分类群。进行了种间和种内微生物群移植，然后进行CLCUD发病率分析。可以看出，从G. arboreum fdh228中移植的根际微生物群体显着抑制了G. hirsutum品种中的Clcud，表现优于外源水杨酸的施用。虽然浮游移植也降低了疾病的发生，但它们的效率不如根际移植。差异表达分析DESEQ2用于识别与Clcud抑制相关的关键细菌属，包括pseudoxanthomonas和stenotrophomonas在G. arboreum fdh228的根际中。功能途径分析揭示了耐受物种中应力反应和代谢的上调。转录组学揭示了与蛋白质磷酸化和种间根际微生物群移植中有关的基因上调。这项研究强调了微生物群移植是一种可持续的方法，用于控制CLCUD以及有助于Clcud耐药性的特定微生物和遗传机制。
CRISPR/Cas9 介导的 SlATG5 诱变降低番茄果实对灰葡萄孢的抗性
摘要：番茄果实在贮藏期间极易受到主要病原菌灰葡萄孢（B. cinerea）的侵染。最近的研究表明，自噬在植物防御生物和非生物胁迫中至关重要。自噬相关基因5（ATG5）在自噬体的完成和成熟中起关键作用，并被灰葡萄孢菌快速诱导，但ATG5在番茄采后果实抗灰葡萄孢菌中的潜在机制尚不清楚。为了阐明SlATG5在番茄果实抗灰葡萄孢菌中的作用，本研究采用CRISPR/Cas9介导的SlATG5敲除技术。结果表明，slatg5突变体对灰葡萄孢菌的感染更加敏感，病害症状更加严重，抗病酶几丁质酶（CHI）、β-1,3-葡聚糖酶（GLU）、苯丙氨酸解氨酶（PAL）、多酚氧化酶（PPO）等活性降低。此外，研究还观察到接种灰葡萄孢菌后，slatg5突变体中水杨酸（SA）信号相关基因SlPR1、SlEDS1、SlPAD4、SlNPR1的相对表达量高于WT，而茉莉酸（JA）信号相关基因SlLoxD和SlMYC2的相对表达量低于WT。这些结果表明，SlATG5 通过抑制 SA 信号通路和激活 JA 信号通路正向调控番茄果实对灰霉病菌的抗性反应。
开发生物传感器，用于检测酿酒酵母中苯甲酸衍生物
4-羟基苯甲酸（PHBA）是粘酸和液晶聚合物的重要工业前体，其生产基于石化工业。为了减少我们对化石燃料的依赖并提高可持续性，微生物工程是一种更具吸引力的方法，用于替代传统的化学技术。但是，微生物菌株的优化仍然受筛选阶段的高度限制。生物传感器通过减少筛选时间并实现更高的吞吐量来帮助减轻这一问题。在本文中，我们构建了一个名为SBAD的合成生物传感器，由R. palustris的HBAR的PHBA结合结构域组成，N-terminus的Lexa DNA结合结构域和C-Terminus的反式激活域B112。在存在不同的苯甲酸衍生物的情况下测试了SBAD的响应，并通过流量细胞仪测量细胞荧光输出。除了其他羧酸（包括P-氨基苯甲酸），水杨酸，蒽，阿司匹林和苯甲酸在内的其他羧酸之外，还发现了生物传感器通过培养基中外部添加PHBA激活。此外，我们能够证明该生物传感器可以检测到遗传修饰的酵母菌菌株中PHBA的体内产生。在生物传感器荧光和PHBA浓度之间观察到了良好的线性。因此，该生物传感器将非常适合作为高吞吐量筛选工具，可通过代谢工程生产苯甲酸衍生物。
农业化学与生物技术杂志
微生物对植物病的控制是指生物控制。在这项研究中，三种细菌菌株pantoea groclomerans b1，serratia plymuthica b2和proteus mirabilis b3是最初从饮用水来源分离出的细菌菌株，埃及埃及的El-Gharbia省的饮用水。孤立的细菌菌株的起源包含三种饮用水来源：尼罗河，水龙头和地面。这种水产养殖具有细菌的商业化产生了经济利润，而水含有细菌产生的拮抗材料对土壤传播的真菌产生不利影响。这些水源在农业中非常重要，尤其是在灌溉作物时。在体外，pantoea grogmerans b1，serratia plymuthica b2和proteus mirabilis b3检查了其针对土壤传播的真菌根源索拉尼的拮抗活性，这是几种工厂的幼苗湿润的真菌。serratia plymuthica b2表现出对真菌生长的高水平。另外，评估了三种细菌菌株的生产裂解酶（几丁质酶，β-1,3 - 葡萄糖酶），铁质酸（SA）和氢氰化氢（HCN）。所有拮抗材料生产分别记录了菌株B2和B1的高级值。观察到了三种细菌菌株对R. solani的拮抗潜力与其ß-1,3 - 葡萄糖酶，SA和HCN的水平之间的最高关系。提到的细菌菌株的抗真菌代谢产物被认为有助于这些细菌的拮抗活性。
1个教学工作考试
csir净生活科学问题与解决方案Q1。关于植物植物植物（PHY），蓝细菌植物色素1（CPH1）和细菌植物色素样蛋白（BPHP），以下哪种陈述中的哪一种是不正确的？（a）PHY在C末端部分中有两个PRD域。（b）CPH1和BPHP在N末端部分具有组氨酸激酶结构域。（c）GAF结构域存在于PHY，CPH1和BPHP的N末端部分中。（d）形成连锁的半胱氨酸残基位于诸如PHY和CPH1之类的规范植物色素中的GAF结构域中。Q2。 以下哪一项称为结核酸？ （a）甲基甲酸酯（b）顺式 - 果酮（C）jasmonoyl-1-β-葡萄糖（d）12-羟基 - （+） - 7- iSojasmonate Q3。 大米，SD-1的主要半障碍基因中的缺陷导致具有短而厚的浮雕和改善的住宿耐药性的品种。 该基因与以下哪种植物素有关？ （a）gibberellins（b）脱甲酸（c）茉莉酸（d）水杨酸Q4。 在模型植物拟南芥中，蛋氨酸是生物合成中的前体氨基酸：（a）生物碱（b）葡萄糖醇酸盐（c）苯酚（C）酚（d）萜类化合物Q5。 在每个正常的人类红细胞中大约存在多少血红蛋白？ （a）19 pg（b）29 pg（c）39 pg（d）49 pg Q6。 涉及以下涂层坑的颈部捏合以形成突触前末端的内吞囊泡的夹克中的哪一项？ （a）Synaptojanin（b）AP2（C）网格蛋白（D）DynaminQ2。以下哪一项称为结核酸？（a）甲基甲酸酯（b）顺式 - 果酮（C）jasmonoyl-1-β-葡萄糖（d）12-羟基 - （+） - 7- iSojasmonate Q3。大米，SD-1的主要半障碍基因中的缺陷导致具有短而厚的浮雕和改善的住宿耐药性的品种。该基因与以下哪种植物素有关？（a）gibberellins（b）脱甲酸（c）茉莉酸（d）水杨酸Q4。在模型植物拟南芥中，蛋氨酸是生物合成中的前体氨基酸：（a）生物碱（b）葡萄糖醇酸盐（c）苯酚（C）酚（d）萜类化合物Q5。在每个正常的人类红细胞中大约存在多少血红蛋白？（a）19 pg（b）29 pg（c）39 pg（d）49 pg Q6。涉及以下涂层坑的颈部捏合以形成突触前末端的内吞囊泡的夹克中的哪一项？（a）Synaptojanin（b）AP2（C）网格蛋白（D）Dynamin
柑橘类基因的全基因组分析...
柑橘类水果因其营养价值而受到尊敬，面临着诸如柑橘溃疡之类的疾病的显着威胁，尤其是在巴基斯坦影响全球柑橘种植。这项研究深入研究了类似NPR1的基因，水杨酸（SA）的真正受体，在针对Xanthomonas axonopodis PV的防御机理中。citri（XCC）。通过进行全面的全基因组分析和系统发育研究，阐明了柑橘类基因的进化动力学。结构预测揭示了保守的结构域，例如BTB结构域和Ankyrin重复域，对防御机理至关重要。基序分析揭示了必不可少的保守模式，而顺式调节元素表明它们参与转录，生长，对植物激素的反应和压力。主要的细胞质和类似NPR1的基因的核定位强调了其在赋予对各种柑橘种类的耐药性方面的关键作用。对KS/Ka比率的分析表明，纯化NPR1样基因的选择，强调了它们在不同物种中的重要性。同义和染色体图提供了有关柑橘类物种重复事件和直系链接的见解。值得注意的是，XAC感染刺激了NPR1样基因的表达，揭示了它们对致病挑战的反应。有趣的是，XAC感染后QRT-PCR填充揭示了易感和抗柑橘类品种中表达的品种特异性改变。检查防御基因（NPR1）和植物的影响除了遗传因素之外，生理参数，例如过氧化物酶，总可溶性蛋白和二级代谢产物对SA依赖性PR基因的反应，造成植物特征。
通过顶空气相色谱法
摘要：在这项研究中，它旨在通过经过验证的静态静态顶空气体色谱法（GC-MS）方法研究番茄酱，胡椒粉，番茄酱，蛋黄酱，蛋黄酱和烧烤酱样品中的苯甲酸（BA）和丝氨酸（SOA）浓度。水杨酸（SALA）用作内标，测量值分别在BA和SOA的宽线性浓度范围内进行，分别为2.5-5000和12.5-5000。确定检测限为1.5和4.5 mg/kg，而BA和SOA的定量极限（LOQ）分别为2.5 mg/kg。在开放的番茄酱样品中发现BA和SOA的平均回收％值分别为98.5％和98.7％，而在蛋黄酱样本中，这些值分别为98.7％和100.3％。确认了所提出的方法的准确性。在实际样品中，发现合适的番茄酱和工业酱样品的结果，但在某些番茄和胡椒粉产品中以传统或自制的名称出售，尽管禁止在糊剂中使用保留剂。对于公共卫生来说，防止在土耳其美食以及在世界上普遍消费的糊状物中掺假，这是必不可少的。因此，由于其可靠性和消耗较小的毒性化学试剂，因此提出的方法可用于食品控制实验室。
植物防御信号通路之间的串扰
植物暴露于非常不同的攻击者，包括微生物病原体和草食昆虫。为了保护自己，植物已经发展了防御策略，以抵消潜在的入侵者。植物防御信号研究的最新进展表明，根据遇到的入侵者的类型，植物能够差异激活诱导，广谱防御机制。植物激素水杨酸（SA），茉莉酸（JA）和乙烯（ET）是防御信号通路网络中的主要参与者。在SA-，JA-和ET依赖性信号通路之间的串扰被认为与对防御反应进行微调有关，最终导致了防御反应的最佳组合以抵抗入侵者。这些信号化合物的生物合成途径的基因工程以及模仿其作用方式的保护化学物质的开发为开发新策略的作物保护提供了有用的工具。但是，有证据表明，对微生物病原体的抗药性与对草食昆虫的抗药性之间的抗性：一旦植物的条件表达对微生物病原体的抗性，它可能会更容易受到食草动物的攻击，而反之亦然。然而，病原体和抗昆虫抗性之间的贸易证据是矛盾的。本综述集中于有关SA-，JA-和ET依赖性诱导对微生物病原体和草食性昆虫的抗性的最新实验证据。此外，我们将解决以下问题，无论是通过基因工程或通过使用防御信号的植物保护剂来操纵国防信号通路，是否会增强植物对潜在入侵者的免疫力，还是将成为作物保护策略的负担。
计算机视觉支持的 GWAS 识别出大量毛果杨植物再生的候选调控因子
植物再生是植物繁殖的一个重要方面，也是转基因植物生产的关键步骤。然而，不同基因型和物种的再生能力差异很大，其分子基础在很大程度上是未知的。全基因组关联研究 (GWAS) 等关联作图方法早已证明能够帮助揭示植物性状变异的遗传基础；然而，这些方法的性能取决于表型分析的准确性和规模。为了对模型树杨树的植物愈伤组织和芽再生进行大规模 GWAS，我们开发了一个涉及语义分割的表型组学工作流程，以量化再生植物组织随时间的改变。我们发现得到的统计数据高度非正态分布，因此采用了变换或排列以避免违反 GWAS 中使用的线性模型的假设。我们报告了超过200个统计学上支持的数量性状基因位点（QTL），其中基因包含或接近顶级QTL，包括细胞粘附、应激信号和激素信号通路的调控因子，以及其他多种功能。我们的研究结果鼓励植物再生过程中激素信号转导模型除了通常考虑的生长素和细胞分裂素途径外，还应考虑应激相关信号（例如涉及茉莉酸和水杨酸）的关键作用。我们鉴定的假定调控基因和生物学过程为理解植物再生的生物学复杂性提供了新的见解，并可能成为改善顽固基因型和物种再生和转化的新方法。
npr1样基因可可瘤：进化洞察力和增强对植物含量的抗性性的潜力
与发病机理相关1（NPR1）的非XPRessor对于通过信号分子水杨酸（SA）激活植物免疫系统至关重要，这会触发拟南芥的全身性获得性（SAR）。在这项研究中，已经在Cacao的基因组中鉴定出了三个与NPR1相关的假定基因，即TCNPR1，TCNPR2和TCNPR3，这表明这三个基因实体之间的功能多样化表明。系统发育分析表明，TCNPR1和TCNPR2与它们的拟南芥直系同源物NPR1和NPR2一起分支，表明这些基因在不同物种的SA信号传导途径中保持了保守的作用。相比之下，TCNPR3存在于单独的进化枝中，表明了独特的功能作用和进化差异。对这些TCNPR的生理化学特性的比较分析显示出不同的亚细胞定位，因为TCNPR1在细胞质中持续存在，而TCNPR3在细胞核中发现，与其在SA信号传导和转录性调节中的作用保持一致。此外，我们确定了针对TCNPR3的microRNA，这表明P. Megakarya可能会利用转录调节网络绕过植物防御激活。通过RNA干扰介导的基因沉默对TCNPR基因的瞬时过表达或抑制可能足以研究对其他分子的产生的影响，例如SA，某些PR蛋白表达以及对巨疟原虫的抗性。由TCNPRS编码的蛋白质与P. megakarya的细胞蛋白质之间的相互作用将提供有关Patho Gen是否操纵宿主防御的洞察力。最后，P。Megakarya响应感染TCNPR基因的表达提供了有关防御反应过程中时间和空间激活的有价值的信息。