生物时间序列观测对于更好地理解生态过程并确定人类对海洋的影响至关重要(Ducklow等,2009;BáLint等,2018; Takahashi等,2023)。有效进行了有效的海洋监测计划,有时使用数十年来收集的时间序列(Fontaine and Rynearson,2023年)。环境DNA(EDNA)从水样品中进行的元法编码越来越多地用于监测沿海生物多样性并检测随着时间的推移生物群落的变化(Deiner等,2017; Mathieu等,2020)。现在,通过使用EDNA METABARCODING或其他生物分子技术(https://obon-ocean.orgean.org/about/),建立了诸如海洋生物分子观测网络(OBON)之类的程序,以通过全球规模的合作和长期研究来增强海洋生物监测。为了确定在不同的时间尺度和环境条件上是否存在稳定的,复发的EDNA检测,对环境中的埃德娜(Edna)如何随物种物候(例如,生命阶段,生殖和代谢)和物理过程(例如水动力学,温度,uv)(seymour,uv)(Seymour,2019; des souza; de 22; eve and and and 2016; eve; et e and; et e and and;这种知识对于对长期EDNA数据趋势的有意义解释也至关重要。越来越多的研究报告了EDNA检测峰在短季节内的窗口中,并将这种模式归因于生物学因素(Laramie等,2015; Sigsgaard等,2017; Stoeckle等,2017; Handley等,2019; Handley等,2019; 2019; Troth et al。,2021; 2021; Sevellec et al。虽然有几项研究报道了用埃德娜(Edna)检测到的社区的显着年度变化(Closek等,2019; Laporte等,2021; di Capua等,2021; Carvalho等,2024),2024年),很少有短期变量(Kelly et al。,2018 al。等人,2024年)以及自然的短期可变性如何影响我们解释沿海EDNA数据以评估社区结构随时间变化的能力。水的时间系列edna metabarcoding提供了沿海北极生物监测的重要潜力。北极海洋正经历着由物理转变驱动的深刻气候和相关的生物变化,包括海冰熔化,海温升高和运输活动增加(Garcia-Soto等,2021; Murray等,2024)。尽管对北极生物群进行测量的后勤挑战,其中许多是地方性的,但已经记录了海洋社区的快速变化(Post等,2009; Koenigstein,2020)。Edna Metabarcoding跨多个营养水平检测生物的能力使其成为这个广阔而偏远地区的宝贵工具(Lacoursière-Roussel等,2018; Leduc等,2019; Sevellec等,Sevellec等,2021; Geraldi等,Geraldi等,2024)。这种非侵入性方法也是生物监测海洋社区的最伦理方法之一,使其在敏感的北极地区特别有价值。为了充分表征生物多样性中的长期闪烁,我们仍然需要理解北极地区海洋生物多样性的季节性和季节性季节性模式。在这里,我们比较了使用加拿大北极丘吉尔港作为案例研究的不同时间抽样策略,以监测埃德娜的后生社区,目的是
一项与样本收集有关的法案;修改爱达荷州法典第 19 篇第 25 章,增加爱达荷州法典第 19-2512A 节,规定在某些情况下收集 DNA 样本和指纹印记;修改爱达荷州法典第 19-5501 节,修订立法结果;修改爱达荷州法典第 19-5502 节,定义术语;修改爱达荷州法典第 19-5506 节,修订有关须接受样本收集的罪犯的规定;废除爱达荷州法典第 19-5507 节,有关样本收集的责任、时间和地点;修订爱达荷州法典第 19 篇第 55 章,增加爱达荷州法典第 19-5507 节,制定有关样本收集的责任、时间和地点的规定;宣布紧急状态并提供生效日期。
抽象背景:神经生理信号处理中的一个常见问题是从高维,低样本量数据(HDLSS)中提取有意义的信息。我们提出了Roldsis(低维跨度输入空间的回归),这是一种基于降低性降低的回归技术,将解决方案限制在可用观测值所跨越的子空间中。这避免了收缩回归方法中需要的回归过程中的正则参数。结果:我们将Roldsis应用于语音识别实验中收集的EEG数据。在实验中,连续/da/–/ta/中的变形音节作为声学刺激显示给参与者,并记录与事件相关的电位(ERP),然后通过离散小波转换在时间频率结构域中作为一组特征表示。从参与者执行的初步识别任务中选择每组刺激。身体和心理物理属性与每个刺激有关。roldsis推断与每个属性相关的特征空间中的神经生理轴。我们表明,这些轴可以可靠地估计,并且它们的分离与语音分类的个体强度相关。Roldsis提供的结果在时频域中可以解释,可用于推断语音分类的神经物理学相关性。通过交叉验证进行了与常用的正则回归技术的比较。结论:Roldsis获得的预测误差与脊回归获得的预测误差相当,并且比用Lasso和SPLS获得的预测误差较小。然而,Roldsis无需交叉验证就可以实现这一目标,该程序需要从数据中提取大量观测值,并且在平均试验时,降低了信噪比的降低。我们表明,即使Roldsis是一种简单的技术,它也适用于神经生理信号的处理和解释。关键字:脑电图,事件相关电位,线性回归,高尺寸低样本量问题,尺寸减小,音素分类,离散小波转换
无细胞的生物传感器是医学诊断的有前途的工具,但是它们的性能可能会受到样本本身或外部组件产生的基质效应的影响。在这里,我们使用两个记者系统(SFGFP和荧光素酶)系统地评估血清,血浆,尿液和唾液中无细胞系统的性能和鲁棒性。在所有情况下,临床样品都具有强大的抑制作用。,只有RNase抑制剂减轻基质效应。但是,我们发现RNase抑制剂的恢复潜能因从商业缓冲液中包含的甘油的干扰而部分突出。我们通过设计产生RNase抑制剂蛋白的菌株来解决此问题,不需要额外的提取准备。此外,我们的新提取物比以前的条件和与基质效应相关的脾气暴躁的室内变异性产生的记者水平更高。在许多类型的临床样本中统一的无细胞系统鲁棒性的这种系统评估和改进是朝着各种疾病开发无细胞诊断的重要一步。
在2021年夏季,北美太平洋西北部受到极端热浪的影响,该热波将以前的温度记录打破了几个程度。这一事件对人类的生命和生态系统造成了严重影响,并与并发驱动因素的叠加有关,驱动因素的影响会因气候变化而扩大。我们评估了这种破纪录的热浪是否可以在观察之前预见,气候变化如何影响北美太平洋西北最差的热浪场景。为此,我们使用具有经验重要性抽样的随机天气发生器。发电机使用循环类似物模拟了极端温度序列,该温度序列是根据记录最极端影响的区域的每日最高温度而选择的重要性采样。我们展示了如何获得事件的某些大规模驱动因素,即使没有直接给出随机天气生成器的信息,也可以形成循环类似物。
摘要背景 美国注射毒品使用的增加导致注射部位感染增加。我们对吸毒者进行了一项全国性调查,以评估常见的吸毒准备、减少伤害的做法以及注射部位感染的经历。方法 2021 年至 2022 年,向关键线人患者调查计划的成员分发了一项调查,并分发给 18 岁或以上的新进入美国 68 个物质使用障碍治疗计划之一的患者,其主要诊断为阿片类药物使用障碍。调查对象接受了有关准备和使用药物时的做法以及自我报告的感染和药物使用并发症的调查。结果 1289 名参与者回复了调查。性传播感染很常见,37.6% 的人报告曾经患过任何性传播感染。注射相关感染影响了 63.4% 曾经使用过注射毒品的参与者。许多受访者表示没有寻求专业医疗帮助进行感染管理,其中 29% 的人在没有寻求医疗护理的情况下引流脓肿,22.8% 的人通过非医疗来源获得抗生素。非无菌注射做法包括与发烧或生病的人共用针头 (18%)、使用之前用于引流伤口/脓肿的针头 (9.9%) 进行后续注射毒品,以及舔针头 (21.2%)。结论 接受阿片类药物使用障碍治疗的患者报告了很高的传染病负担。确定了许多易于改变的导致注射相关感染的高风险行为。需要努力向 PWID 传播有针对性的减害教育,了解如何降低注射相关感染的风险。关键词 物质使用障碍、减害、注射毒品患者
• Double-stranded high molecular weight DNA with an OD 260/280 ≥ 1.8-2,0 and an OD 260/230 ≥ 1,8-2,2 • Preferably dissolved in RNAse-, DNAse- and protease-free Tris-HCl buffer (pH 8.0 – 8.5) • “Ready to load” genomic libraries, ready to load PCR products or PCR products without sequencing adapters must be column purified从低分子量的杂质(例如底漆和核苷酸)和反应缓冲液中,应在琼脂糖凝胶上以单条带的形式出现。请注意,除了特定频段之外,“涂片”将干扰以下准备步骤。在咨询时,欧罗芬基因组学可以执行额外的珠子纯化步骤(以额外的费用),以便在进行进一步处理之前优化样品质量。•该溶液不得包含任何杂质,例如生物学大分子(例如蛋白质,多糖,脂质),螯合剂(例如EDTA),硫代金属阳离子(例如,MG2+),脱位剂(例如,变性)(例如Triton-X100)。
简介:微生物在牙髓疾病的发病机制中起着重要作用。在提高牙髓样本中微生物检测、鉴定和计数的灵敏度方面取得了重大进展。本研究的目的是比较培养和全基因组扩增(WGA)随后进行 PCR 检测在根管化学机械制备(CMP)之前和之后的细菌检测中的效果。方法:分析了 10 颗患有原发性牙髓感染的单根牙。在 CMP 之前和之后用纸尖收集微生物样本,将其分成两组:(i)将培养测定样本接种到含有 5% 脱纤维羊血、甲萘醌和血红素的布鲁氏菌琼脂上,并在 36°C 下厌氧孵育 14 天; (ii) 从分子测定样本中提取 DNA,并用 Phi29 DNA 聚合酶通过等温链置换进行 WGA,然后进行 PCR 以确定细菌的存在。结果:在两种测定中,CMP 之前的样本都显示所有 10 颗牙齿中都存在细菌。然而,在 CMP 之后,在进行的测定中细菌检测有所不同(p = 0.0198)。通过 WGA 随后的 PCR 在 70%(10 个中的 7 个)的样本中检测到细菌的存在,而只有 10%(10 个中的 1 个)在培养方法中显示细菌生长。结论:在使用 NaOCl 作为 CMP 冲洗剂进行根管治疗后,WGA 随后的 PCR 相结合增加了从根管样本中检测到的微生物。因此,这种技术组合可以成为一种重要的工具,以提高根管研究中的微生物检测率。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2025年1月27日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.01.27.635018 doi:Biorxiv Preprint