人类5s,5.8s,18s和28s,45s rRNA前体,线粒体12s和16s rRNA基因。212代表所有门的细菌:5s,16s和23s rRNA基因。
表1:使用Agilent®SureSelect®XT构建的库生成的测序数据,用于库制备和Agilent®Sureselect®XTDMD KIT,用于从5 dbs样品中隔离的DNA,使用Chemagic™360仪器从5BS样品中分离出基于混合捕获的目标富集。
1 法国巴黎西岱大学、索邦大学、法国国家健康与医学研究院、科德利埃研究中心,2 法国巴黎乔治蓬皮杜欧洲医院 AP-HP 生物化学系肿瘤和癌症基因组医学系,3 法国土伦圣穆斯医院肿瘤医学科,4 法国巴黎科钦医院 AP-HP 肿瘤科,5 法国南特大学医院皮肤科,6 法国尼姆卡勒莫大学医院细胞遗传学和医学遗传学科,7肿瘤科——法国普瓦捷大学医院、8 法国图卢兹 IUCT Oncopole 肿瘤内科、9 法国维尔瑞夫 Gustave Roussy DITEP、10 法国巴黎城大学、INSERM U976 人体免疫学、病理生理学、免疫疗法 (HIPI)、11 法国巴黎圣路易斯医院分子肿瘤科 UF、AP-HP、12 法国巴黎 Paul Brousse 医院生物化学和肿瘤遗传学——INSERM UMRS 1193、AP-HP、13 法国克莱蒙费朗埃斯坦大学医院皮肤科、14 医院早期癌症试验中心欧洲乔治·蓬皮杜中心,法国巴黎,15 法国克雷泰伊市立医院肺病学系,16 法国巴黎圣路易斯医院肿瘤基因组学和药理学系,AP-HP,17 法国里昂临终关怀院肿瘤肺病学,18 法国南锡跨地区癌症研究所 Gentilly 肿瘤中心,19 法国布洛涅比扬古罗氏公司医疗数据中心,20 法国布洛涅比扬古罗氏公司医疗事务部,21 法国波尔多贝尔戈尼研究所早期研究部
最近发现N-酰基牛磺酸盐(NAT)是一类内源性生物活性脂质,其可能的药理应用的观点刺激了基于质谱的方法的发展,用于其在生物组织和液体中的定量测量。我们首次根据uplc-esi-QQQ分析在肝替代基质和纯溶剂(MEOH)中进行了验证,以鉴定和定量生物组织提取物中的NAT。The LC-MS method was based on five representative lipid analogues, including saturated, monounsaturated and polyunsaturated species, namely N - palmitoyl taurine (C16:0 NAT), N -oleoyl taurine (C18:1 NAT), N -arachidonoyl taurine (C20:4 NAT), N -docosa noyl taurine (C22:0 NAT)和N -nervonoyl牛磺酸(C24:1 NAT),并评估了特异性,线性,基质效应,恢复,可重复性和中间精度和准确性。在MEOH中通过三元标准方法(D 4 -C20:4 NAT)在MEOH中验证的方法在1 - 300 ng/ml的范围内显示出极好的线性性,所有NAT的R始终≥0.9996;日内和日期的精度和准确性始终在可接受的范围内。特异性,在通过的BEH C18 UPLC条件下,将两个诊断性MRM离子离子过渡的确认率和M/z 80和m/z 107的产品离子的确认率与真实样品的确认率。对于所有化合物,检测限(LOD)和定量极限(LOQ)分别为0.3 - 0.4和1 ng/ml。NAT水平从十二指肠到结肠升高,证明了C22:0 NAT的大肠的显着流行,通常主要发生在中枢神经系统中。该方法已成功地用于评估小鼠肝脏中的NAT水平,并且首次在肠道(duodenum,jejunum,ileum和colon)的各个部分中。这些发现促使进一步的研究揭示了该类别各个外围组织中该类别成员的生物学功能。
- Sars-Cov-2 PCR(辅助测试名称:2019 年新型冠状病毒或 COVID-19) - RSV PCR - 登革热/比丘恩 RT-PCR - 寨卡 RT-PCR - 流感 A/H799 - MERS RT-PCR(辅助测试:中东呼吸综合征 RT-PCR) - 非天花 Pcr(辅助测试名称:非天花正痘病毒)GG - 寨卡病毒 Igm - NGDs 战士面板(埃博拉病毒、马尔堡病毒、炭疽杆菌冠状病毒 Hku1、冠状病毒 NL63、冠状病毒 OC43、严重急性呼吸道综合征冠状病毒 2 (Sars-Cov-2)、人类偏肺病毒、人类鼻病毒/肠道病毒、流感 a 病毒、流感 a
- Sars-Cov-2 PCR(辅助测试名称:2019 年新型冠状病毒或 COVID-19) - RSV PCR - 登革热/比丘恩 RT-PCR - 寨卡 RT-PCR - 流感 A/H799 - MERS RT-PCR(辅助测试:中东呼吸综合征 RT-PCR) - 非天花 Pcr(辅助测试名称:非天花正痘病毒)GG - 寨卡病毒 Igm - NGDs 战士面板(埃博拉病毒、马尔堡病毒、炭疽杆菌冠状病毒 Hku1、冠状病毒 NL63、严重急性呼吸道综合征冠状病毒 2 (Sars-Cov-2)、人鼻病毒、流感 A/H1、流感 a 病毒 A/H3、流感 a 病毒 A/H1-2009、流感 b
胰腺癌(PC)和胆道癌(BTC)是恶性胆道狭窄的主要原因。但是,仅通过成像测试来区分良性和恶性胆道狭窄通常是具有挑战性的。胆汁样品可以在内镜逆行胆管造影术(ERCP)中进行内镜下获得,并用于细胞学诊断。ever,据报道,胆汁细胞学对恶性胆道狭窄的敏感性低至6-32%[1]。此外,已经报道了其他内窥镜诊断的其他内窥镜技术,例如使用ERCP,EUS引导的细针吸入(EUS-FNA)和多骨胆管镜检查(POCS)进行病理或细胞学诊断,例如组织采样(EUS引导的细针吸入(EUS-FNA))。但是,这些恶性胆道狭窄的这些方法的诊断精度也仍然不令人满意[2-4]。此外,PC和BTC标准血清标记的灵敏度和特异性(例如CEA和CA19-9)也不足以在良性和恶性胆道狭窄之间提供鉴别诊断[5,6]。最近,由于其生物稳定性并与癌变密切相关,microRNA(miRNA)已被用作癌症生物标志物[7]。miRNA是由18-25个核苷酸组成的简短非编码RNA,它们通过靶向特定的mRNA部分进行转化抑制或降解,从而调节几个生物学过程,包括细胞增殖,迁移,侵袭,存活和转移[8,9]。因此,在PC和BTC诊断中评估胆汁样品中特定miRNA的实用性仍然未知。迄今为止,很少有关于利用胆汁样品用于基于miRNA的PC和BTC诊断的报道,并且已将各种试剂用于miRNA分离[10-14]。胆汁中miRNA的定量可能会克服用ERCP,EUS-FNA和Peroral POC的常规组织诊断中观察到的诊断限制。本研究的目的是评估对胆汁中选定的miRNA与胆汁细胞学结合的定量分析是否可以提供PC和BTC的精确诊断。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证未通过同行评审获得证明)是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。它是制作
粪便样品分析提供了一种简单的,无创的方法,用于检测多种引起疾病的微生物,生物标志物检测消化道的癌症,以分析肠道微生物组及其对生理健康和疾病的影响。对肠道微生物组的分子检查可以为细菌组成提供宝贵的见解,并可以作为预测胃肠道疾病治疗结果的早期筛查工具。但是,由于存在多酚,腐殖酸,脂质和其他抑制PCR的化合物,因此粪便是一个复杂的样品源。为了实现其巨大的临床潜力,需要从粪便中提取高质量的DNA,不含PCR抑制剂,以自动化的高通量格式提取。为了满足这一需求,Omega Bio-Tek开发了一种用多种磁珠的试剂盒,称为Mag-Bind®通用病原体96套件,用于从包括粪便在内的各种样本类型的病原体检测。在本申请说明中,我们使用Mag-Bind®通用病原体96套件在Chroma Ate的MagXtract 3200上提供了从粪便样品中提取DNA的自动工作流程。下表1中描述了Chroma Ate的MagXtract 3200系统的产品规格。申请说明还讨论了使用实时PCR的DNA产量,质量和扩增潜力的自动化工作流程的性能。
b'Abstract:先兆子痫是一种异质和多器官心血管疾病的怀孕。在这里,我们报告了一种基于灯笼的侧面转换纳米颗粒的新型基于带状的横向流量测定法(LFA)的开发,该纳米颗粒与靶向两个不同的生物标志物的抗体相结合,以检测前启示性的前子症。使用ELISA,我们首先测量了早期发作前脱位(EOPE)的个体的循环血浆FKBPL和CD44蛋白浓度。我们确认CD44/FKBPL比在EOPE中降低,具有良好的诊断潜力。使用我们的快速LFA原型,我们获得了提高的检测下限:FKBPL的10 pgml 1,CD44的15 pgml 1,比标准ELISA方法低一个以上。使用临床样本,CD44/FKBPL比的截止值为1.24,可提供100%的正预测值,而负预测值为91%。我们的LFA表现为子痫前期快速且高度敏感的护理测试。