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将环境DNA与遥感变量相结合，以绘制沿着大河的鱼类分布
河流生态系统中的生物多样性丧失速度要比限制系统更快，更严重，并且需要空间保护和恢复计划来停止这种侵蚀。关于生物多样性和物种分布的状态和变化的可靠且高度解决的数据对于有效措施至关重要。的高分辨率图仍然有限。与全球卫星传感器的耦合数据具有广泛的环境DNA（EDNA）和机器学习可以实现河流生物分布的快速而精确的映射。在这里，我们研究了使用沿瑞士和法国Rhone River的110个地点的埃德纳数据集组合这些方法的潜力。使用Sentinel 2和Landsat 8图像，我们产生了一组生态变量，描述了河走廊周围的水生栖息地和陆地栖息地。我们将这些变量与基于EDNA的存在和29种鱼类的不存在数据相结合，并使用了三种机器学习模型来评估这些物种的环境适用性。大多数模型表现出良好的性能，表明从遥感中得出的生态变量可以近似鱼类分布的生态决定因素，但是水衍生的变量比河流周围的陆地变量具有更强的关联。物种范围的映射表明该物种沿着瑞士的物种占用物的显着转移，从其瑞士阿尔卑斯山的来源到法国南部的地中海出口。我们的研究消除了将遥感和EDNA结合到大河中物种分布的可行性。该方法可以扩展到任何大河以支持保护方案。
评估单独X射线和与放射性敏感器在皮下和颅内肿瘤模型中的功效
在这项研究中，通过应用X射线辐射评估了13个肿瘤细胞系衍生的皮下模型和一个颅内肿瘤模型。通过使用该设备（X-RAD225，PXI Precision，USA）评估辐射水平对不同肿瘤类型和不同肿瘤模型的响应，从而直接在局灶性肿瘤部位上传递靶向辐射。此外，我们研究了放射线和化学疗法药物（吉西他滨）在H22鼠肝癌细胞中的综合益处，源自皮下造型模型。研究了辐射治疗对NCI-H1975-LUC，人类非小细胞肺癌内颅内模型与人类检查点激酶共济失调 - 毛细血管症杂交（ATT）激酶抑制剂AZD0156结合的影响。此外，还评估了血脑屏障的完整性以及AZD0156的药效学标记PRAD50的存在。研究结果表明，X射线辐射在所有研究的模型中都具有抗肿瘤作用，并且还与放射性敏感剂，吉西他滨或AZD0156结合处理。我们认为，这项研究表明，有很多潜在的完全利用辐射平台来识别辐射敏化器或化学候选者，以使肿瘤学会的管理受益。
癌细胞系中药物敏感性的两步多词建模，以识别驾驶机制
人类癌细胞系的药物敏感性预测模型构成了在临床前环境中识别潜在反应性因素的重要工具。整合从一系列异质数据中得出的信息至关重要，但仍然是不平凡的，因为数据结构的差异可能会阻碍拟合算法将足够的权重分配给不同的OMIC数据中包含的互补信息。为了抵消这种效果，该效果倾向于仅导致一种数据类型主导所谓的多摩斯模型，我们开发了一种新颖的工具，使用户能够在第一步中分别训练单摩尼斯模型，并在第二步中将它们集成到多摩s模型中。进行了广泛的消融研究，以促进对奇异数据类型及其组合的各自贡献的深入评估，从而有效地识别它们之间的冗余和相互依赖性。此外，单词模型的集成通过一系列不同的分类算法实现，从而可以进行性能比较。被发现与药物敏感性显着转移相关的分子事件和组织类型集可以返回，以促进对药物反应性潜在驱动因素的全面而直接的分析。我们的两步方法产生了一组实际的多媒体泛 - 批处理分类模型，这些模型对GDSC数据库中的大多数药物具有很高的预测。在具有特定作用模式的有针对性药物的背景下，其预测性能与将多词数据合并到简单的一步方法中的分类模型相比。此外，案例研究表明，它在正确识别已知的特定药物化合物的关键驱动因素以及为其他候选者提供其他药物敏感性因素方面取得了成功。
比较记忆诊所队列中阿尔茨海默氏病诊断的血液基淀粉样生物标志物的超敏和质谱定量
©作者2023。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
高敏性流式细胞术对急性白血病中移植最小残留疾病动力学动力学的影响
在造血细胞移植（HCT）之前检测到的最小残留疾病（MRD）与高危急性白血病患者的不良结局有关。然而，在这种情况下，移植后MRD评估的理想时间点以及残留疾病的临床意义尚不清楚。我们对77名急性白血病患者进行了移植前后（第30、60和100天）之前和之后进行的高敏性流式细胞仪MRD进行了前瞻性现实分析。目的是评估消除疾病的动力学，并将其与移植结果相关联。前移植MRD为42（MRD-）为阴性，35例患者（MRD+）为阳性。移植后MRD评估在第30天（n = 30，38.9％），第60天（n = 27，35.0％）和第100天（n = 60，77.9％）时可行。复发发生在MRD +组的8例中（22.9％），在MRD阴性组中发生3例（7.1％），p = 0.02。前移植MRD与总生存率降低（OS； MRD; MRD+54.0％MRD+）和无事件生存期（EFS; 85.3％MRD- vs. 51.1％MRD+）相关，P = 0.001。复发的累积发生率（CIR）为17.5％，在MRD-中为2.6％（p = 0.049）。非释放死亡率（NRM）为31.4％，在MRD-中为12.1％（p = 0.019）。在D100下MRD阴性的患者（92.4％，95％CI：0.81-0.971）的一年OS高于阳性D100 MRD（53.3％，95％CI：0.177–0.796），p <0.0001。疾病状态和D100 MRD与OS，EFS和CIR有关。 还观察到白血病类型之间的NRM差异（所有：MRD-vs. 50％MRD+和AML 0％MRD- vs. 21.7％MRD+，P = 0.0158）。疾病状态和D100 MRD与OS，EFS和CIR有关。还观察到白血病类型之间的NRM差异（所有：MRD-vs. 50％MRD+和AML 0％MRD- vs. 21.7％MRD+，P = 0.0158）。总而言之，通过高度敏感的流式细胞术评估了移植前的MRD准确鉴定出不良预后的患者。HCT后持续的MRD可以通过高特异性和临床灵敏度预测复发。 这些结果强调了将移植周围的MRD动力学纳入急性白血病的常规治疗，尤其是在低/中收入国家的常规治疗中的重要性。HCT后持续的MRD可以通过高特异性和临床灵敏度预测复发。这些结果强调了将移植周围的MRD动力学纳入急性白血病的常规治疗，尤其是在低/中收入国家的常规治疗中的重要性。
发光眼镜，光纤和光子应用和光子应用的复合材料
这项工作探讨了用于光学传感和光子技术的发光玻璃材料和复合材料的设计，合成和应用。该研究的重点是使用适合纤维图的氧化物玻璃基质（例如校尿石和磷酸盐玻璃）来开发新型的光学活性材料，这些玻璃是经过修改以改善其光学和热性能的。引入网络修饰符，尤其是氟化物，导致具有透明度和适当化学稳定性的玻璃系统。这些矩阵用稀土离子（RE 3+）和纳米颗粒掺杂，它们还用作发光配位聚合物（LN-CP）生长的底物，从而使新玻璃@LN-CP复合材料产生具有化学传感潜力的重要潜力。采用系统方法来使用诸如X射线衍射（XRD），拉曼光谱，固态核磁共振（NMR）和吸收光谱的技术来表征这些玻璃基质，从而提供了对其结构，光学，光学和热特性的见解。与RE 3+共掺杂的光学活性磷酸盐玻璃的合成证明了促进上转换（UC）发光的能力，突出了它们的光子应用潜力。这项研究还强调了玻璃@LN-CP复合材料的发展，该复合材料通过玻璃基板和光纤上的原位生长合成。这些复合材料对丙酮和2-戊酮等羰基化合物表现出强烈的发光响应，证明了它们的化学传感潜力。此外，涂层的光纤可以在长距离内传输发光信号，从而促进了分析物的实时和远程检测。因此，本文有助于开发新的发光材料和基于光纤的传感器，为创新的光学传感器和光子设备提供了多功能平台。
在生命科学中共享敏感数据：集中和联合方法的概述
玛丽亚·鲁贾诺（Maria A. Rujano），格罗宁根大学医学科学博士学位，在埃克林（Ecrin）担任项目经理，为欧盟医疗保健数据研究倡议做出了贡献。凭借细胞和神经发育生物学的专业知识，她曾在著名的研究中心工作，包括Curie Institute和Institute Pasteur。化学博士学位Jan-Willem Boiten是Lygaturation的高级计划经理。 拥有超过20年的跨生命科学合作经验，他正在协调荷兰和欧洲一级的大规模生物医学数据基础设施计划。 克里斯蒂安·奥曼（Christian Ohmann）拥有数学博士学位，医学临时检查和“理论手术”领域的关联。 他是德国海因里希海因大学杜塞尔多夫医学院临床试验中心（KKS）的负责人（1999- 2014年），目前与ECRIN有关临床试验数据共享和ECRIN网络委员会的咨询。 ECRIN的高级数据经理Steve Canham具有18年的临床试验数据系统和管理方面的专业知识。 以前，他领导伦敦癌症研究所的IT团队（2002-11）。 Sergio Contrino是ECRIN数据项目的负责人。 是培训的电子工程师，曾在剑桥大学，遗传学系和欧洲生物信息学研究所（EBI）担任高级软件开发人员。 Romain David，海洋学和数据挖掘博士学位，是Erinha的研究人员和数据管家。 他是研究数据联盟（RDA）的共同主席（例如，化学博士学位Jan-Willem Boiten是Lygaturation的高级计划经理。拥有超过20年的跨生命科学合作经验，他正在协调荷兰和欧洲一级的大规模生物医学数据基础设施计划。克里斯蒂安·奥曼（Christian Ohmann）拥有数学博士学位，医学临时检查和“理论手术”领域的关联。他是德国海因里希海因大学杜塞尔多夫医学院临床试验中心（KKS）的负责人（1999- 2014年），目前与ECRIN有关临床试验数据共享和ECRIN网络委员会的咨询。ECRIN的高级数据经理Steve Canham具有18年的临床试验数据系统和管理方面的专业知识。以前，他领导伦敦癌症研究所的IT团队（2002-11）。Sergio Contrino是ECRIN数据项目的负责人。是培训的电子工程师，曾在剑桥大学，遗传学系和欧洲生物信息学研究所（EBI）担任高级软件开发人员。Romain David，海洋学和数据挖掘博士学位，是Erinha的研究人员和数据管家。他是研究数据联盟（RDA）的共同主席（例如，拥有20年的环境信息系统专业知识，他专门研究数据挖掘，图形方法和合适的数据管理。敏感数据）。Jonathan Ewbank于2021年加入Erinha担任总干事，在担任Marseille-Luminy免疫学中心（法国）25年后。Claudia Filippone是一名病毒学家，在Erinha担任高级科学计划经理。她的研究经验着重于欧洲和非洲的病毒出现和人畜共患病。Erinha的欧洲项目经理Claire Connellan专注于传染病爆发研究（Isidore）项目的综合服务，旨在增强大流行的准备。拥有项目管理和政策制定方面的专业知识，她拥有伦敦国王学院的国际和平与安全硕士学位。Ilse Custers是一名药物化学家（VU阿姆斯特丹）和卫生经济学家（庞贝·法布拉大学）。她目前正在担任Lygature的项目经理，管理项目建立基础架构的健康和基因组数据共享。Rick Van Nuland博士是专注于卫生研究基础设施的Lygature计划经理，并在UTRECHT大学医学中心和斯坦福大学接受了分子癌生物学家的培训。 Michaela Th。 Mayrhofer是培训的社会科学家。 她的博士学位研究了生物库治理的模式。 她的研究重点在于GDPR的合规性，人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。 自2019年以来，她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Rick Van Nuland博士是专注于卫生研究基础设施的Lygature计划经理，并在UTRECHT大学医学中心和斯坦福大学接受了分子癌生物学家的培训。Michaela Th。 Mayrhofer是培训的社会科学家。 她的博士学位研究了生物库治理的模式。 她的研究重点在于GDPR的合规性，人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。 自2019年以来，她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Michaela Th。Mayrhofer是培训的社会科学家。她的博士学位研究了生物库治理的模式。她的研究重点在于GDPR的合规性，人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。自2019年以来，她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Petr Holub是Masaryk大学计算机科学副教授。自2015年以来，他已成为BBMri-Eric的首席IT官。他具有科学的背景（2001年计算量子化学专业的MSC）和计算机科学（2005年的博士学位，专门研究计算机网络，自组织和多媒体处理）。evaGarcíaálvarez在BBMRI-ERIC担任IT科学家和项目经理。她从圣地亚哥大学（De Santiago de Costela）获得了分子医学博士学位，在那里她研究了癌症中体细胞病毒整合的基因组景观。Emmanuel Bacry毕业于écoleNormaleSupérieure（ENS），并拥有数学博士学位。他目前是巴黎 - 杜普大学的CNRS研究主任，也是法国健康数据中心的科学总监。他领导了Ecole Polytechnique的大数据与数据科学计划超过4年（2016-19）。收到：2024年2月6日。修订：2024年4月19日©作者2024。牛津大学出版社出版。这是根据Creative Commons Attribution许可条款（https://creativecommons.org/licenses/4.0/）分发的一篇开放访问文章，该文章允许在任何媒介中不受限制地重复使用，分发和再现，前提是适当地引用了原始工作。
使用瞬态场测量的钢条的磁性表征：从机器学习的角度来看的全局灵敏度分析和回归
摘要。在此贡献中，使用田间梯度瞬变的合成数据研究了钢条的磁性表征，这些瞬态是通过有限的集成技术（FIT）生成的。使用Jiles-Atherton（JA）模型描述并参数化了材料定律。然后，使用两种全局方法分析相关磁指标相对于材料参数的敏感性：SOBOL的指标和δ-敏感指标。为了加速对这些数量的评估，使用模拟数据集中的机器学习技术构建了快速的元模型。基于量身定制的学习框架的逆问题解决方案已针对不同提出的标识符进行了测试，并最终讨论了它们对所讨论材料的磁性表征的适用性。
靶向TOPK将肿瘤细胞敏感到辐射 - ...
抽象T-LAK原始的蛋白激酶（TOPK）过表达是多种癌症的特征，但在大多数表型正常组织中都没有。因此，Topk表达效果和靶向TOPK靶向药剂的发展增强了对目标疗法发展的未来潜力的希望。在本文中提出的结果证实了TOPK作为治疗实体瘤的潜在目标，并证明了与放射治疗结合使用时TOPK抑制剂的效率（OTS964）。使用H460和CALU-6肺癌异种移植模型，我们表明，TOPK的药物抑制作用增强了分馏辐射的效率。此外，我们还提供了体外证据表明，在S阶段，TOPK在迄今为止扮演着未知的作用，表明TOPK耗竭会在复制应力和外源性DNA损伤的条件下增加叉子的失速和塌陷。显示TOPK的瞬时敲低可损害叉子失速中的恢复，并增加与H460肺癌细胞中复制相关的单链DNA灶的形成。我们还表明，TOPK与CHK1和CDC25C直接相互作用，这是检查点信号传导路径中的两个关键参与者在复制叉倒塌后激活。因此，这项研究提供了对TOPK活性支持癌细胞存活的机制的新见解，从而促进了对复制应力和DNA损伤的响应检查点信号传导。