海洋生物地球运动员组碳固隔机制中的碳泵。最初创建了这一问题,目的是解释在全球海洋45中观察到的DIC浓度增加,因此没有考虑有机碳在沉积物中的储存。后来将碳泵应用于海洋碳固换,在这种情况下,其定义包括有机碳转运到海洋内部,可能是沉积物。的确,IPCC 7对海洋碳泵的定义如下:溶解度泵是“一种物理化学过程,将溶解的无机碳从海面传递到其内部[…]的内部[...]驱动,主要由二氧化碳的溶解度驱动(CO 2)[CO 2)[…]和大型,热量,热氢键模式的海洋循环”;碳酸盐泵由“碳酸盐的生物形成,主要是由浮游生物产生的生物矿物质颗粒,这些颗粒沉入海洋内部,可能是沉积物[…]伴随着CO 2释放到周围的水,后来又释放到了大气中”;这是本研究的重点,生物碳泵将POC和DOC运送到“海洋内部,可能是沉积物”。
背景寡核心(大理石小核心)是英国非常相似的寡寡头物种的三人之一。应安全地识别O. strigilis,O。Latruncula或O. versicolor,应检查生殖器。大理石小的小趋势尤其是用白色和棕色/黑色标记的,但与其他物种的外观有很多重叠,而在这三种物种中均经常出现黑色素形式。雄性生殖器是独特的,在O. strigilis中具有长而薄的竖琴(或“ clasper”),而女性则由bursae和antrum的尖锐的交界处鉴定出来(参见Townsend等人,2010年)。基因组组装来自雄性,并通过生殖器检查以及通过DNA条形码确认了鉴定。南(南部,1907年),在他对英国飞蛾的影响力很大(Grb在开始捕获时,它在开始捕获时很广泛,尽管他还不太老),将这三个物种视为一个物种,大理石大小,并且它们经常被混合在一起以录制,作为一种物种,是一种物种。南(南部,1907年),在他对英国飞蛾的影响力很大(Grb在开始捕获时,它在开始捕获时很广泛,尽管他还不太老),将这三个物种视为一个物种,大理石大小,并且它们经常被混合在一起以录制,作为一种物种,是一种物种。
体细胞变体检测是癌症基因组学分析的组成部分。尽管大多数方法都集中在短阅读测序上,但长阅读技术现在在重复映射和变体相位方面具有潜在的优势。我们提出了一种深度学习方法,一种深度学习方法,用于从短读和长阅读数据中检测体细胞SNV,插入和缺失(indels),具有用于全基因组和外显子组测序的模式,并且能够以肿瘤正常,唯一的肿瘤正常,ffpe pppe的样本进行运行。为了帮助解决公共可用培训的缺乏和基准测试数据以进行体细胞变体检测,我们生成并公开提供了一个与Illumina,Pacbio Hifi和Oxford Nanopore Technologies的五个匹配的肿瘤正常细胞线对的数据集,以及基准的变体。在样本和技术(短读和长阅读)中,深度态度始终优于现有呼叫者,特别是对于Indels而言。
digitalis purpurea(foxglove)是一种广泛分布的装饰植物,也是生物医学复合地高辛的生产商。在这里,我们提出了一个长期读取测序的基于测序的基因组序列,该基因组序列和基因模型的相应预测。高组装连续性由4.3 Mbp的N50表示,并且发现约96%的完整BUSCO基因支持完整性。这种基因组资源为对D. purpurea的花色素沉着的深入研究铺平了道路。鉴定了花色苷生物合成的结构基因和相应的转录调节剂。 红色和白色开花植物的比较显示,白色开花植物中花青素合酶基因的插入很大,很可能使该基因具有非功能性,并且可以解释花青素色素沉着的丧失。 此外,花青素生物合成激活剂MYB5在白色开花植物中显示了18 bp的缺失,导致蛋白质中6种氨基酸损失。 此外,我们发现在DPTFL1/CEN基因中插入大量插入,负责大末端花的发展。鉴定了花色苷生物合成的结构基因和相应的转录调节剂。红色和白色开花植物的比较显示,白色开花植物中花青素合酶基因的插入很大,很可能使该基因具有非功能性,并且可以解释花青素色素沉着的丧失。此外,花青素生物合成激活剂MYB5在白色开花植物中显示了18 bp的缺失,导致蛋白质中6种氨基酸损失。此外,我们发现在DPTFL1/CEN基因中插入大量插入,负责大末端花的发展。
热解转化是通往碳基纳米构造的最有希望的可持续途径之一,包括碳点(CDS)。然而,功能化碳点的分子组成仅限于杂原掺杂,并掺入了几个单一金属前体。此外,大多数这些修改都是通过剧烈的后移植程序进行的,需要有机溶剂来用于碳扩散,并且由于不兼容的实验条件而占据了大型潜在反应物的库。在与知名文献的显着差异中,我们在这里披露了一种创新且高度用途的方法,以丰富碳点功能。这种简单的方法将壳聚糖作为碳前体和金属烷氧化物融合为陶瓷前体,并通过碳水化合物溶液的热液转化来探索两个不同的“金属氧化物@碳点”相的双胞胎生长。由于壳聚糖朝金属烷氧化物前体的结构导向效应,一组晶体金属氧化物,包括二氧化钛,氧化钛和氧化铁簇,在原位形成的氮含量碳框架中直接融合。独特的方法,以下方法将水作为溶剂和可再生生物量作为碳源,并有望阐明废弃的生物废物在工程功能性纳米材料方面的隐藏才能。
结果:通过元分析记录有利于哌醋甲酯的显着结果,用于五种认知结果指标之一(Trail Make Make Meagry Test a)(P = 0.005,CI [-5.19,-0.91]),以及抑郁域以及抑郁域(P <0.00001,CI [-0.78,-0.39]和patip <0. 0.98,-0.67])。数据不足,在侵略性,冷漠,躁动,记忆,运动功能,脑抑制综合征和睡眠结构域中可用于荟萃分析。对这些领域中证据的定性审查发现,在小型的随机研究中,在这些各个领域中证明了哌醋甲酯疗效的有限和混合证据。25项研究中有11项被认为包含一些偏见的高风险。 然而,本综述确定了哌醋甲酯对TBI成年人改善抑郁和疲劳的有益作用的支持证据,对认知和其他症状有一些可能的好处。 异质性很高,偏见的风险在整个研究中有所不同,在某种程度上限制了结果的可信度。25项研究中有11项被认为包含一些偏见的高风险。然而,本综述确定了哌醋甲酯对TBI成年人改善抑郁和疲劳的有益作用的支持证据,对认知和其他症状有一些可能的好处。异质性很高,偏见的风险在整个研究中有所不同,在某种程度上限制了结果的可信度。
françoisestanke-labesque,elodie gautier-vevenret,斯蒂芬妮·乔恩(Stephanie Chhun),罗曼·吉尔豪穆(Romain Guilhaumou)。燃料是药物代谢酶和转运蛋白的主要调节剂:药物治疗个性化的后果。药理学和治疗学,2020,215,pp.107627。10.1016/j.pharmthera.2020.107627。hal-03598618
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图2:与替代性DSB测序技术相比,诱导seq表现出无与伦比的灵敏度和动态范围。(a)诱导seq同时检测高度复发的诱导DSB和低级内源性DSB,并以高分辨率。基因组浏览器视图(IgV)诱导seq读取映射到HEK293T细胞的10MB部分,随后与限制性核酸内核酸内切酶Hindiii进行原位裂解。(顶部面板)高度复发性酶诱导的断裂表示在低分辨率(10MB,0-1000读物)时的绝大多数读数。(底部面板)高分辨率视图(粉红色的亮点,500kb,0-20读取)显示出未处理样品中存在的低水平的单源性断裂,以及在复发性印度诱导的突破(绿色亮点)中。(b)诱导seq读取的映射在Hindiii目标位点显示了断裂两侧的单核苷酸断裂映射的精度。(c)对经过治疗和对照样品的每个细胞测量的断裂定量。诱导seq在样品之间的3个数量级上定量检测到每个细胞的断裂。(d和e)通过酶Hindiii和ecorv检测体外裂解限制位点时诱导seq和dsbapture之间的比较。(d)使用诱导seq映射到测序和对齐基因组的读取和对齐基因组的比例更大。(e)使用少800倍的细胞,诱导seq鉴定了与DSBCAPTURE确定的ECORV(93.7%)相似的Hindiii限制位点(92.7%)。(f)使用诱导seq的诱导DSB检测的动态范围。除了在印度内目标序列(AAGCTT)上鉴定出的断裂外,还确定了多个1BP和2BP不匹配靶向位点。诱导seq测得的诱导的休息事件,跨越了8个数量级,从在印度内靶标地点确定的约1.5亿次断裂到最少频繁的脱离目标的5个断裂。(g)在检测ASISI诱导的活细胞中诱导的疾病,DSBCAPTURE和BLISS之间的比较。将测序的读取数(顶部面板)与每个实验(底部面板)识别的ASISI位点的数量进行了比较。诱导seq使用比DSBCAPTUE少的40倍读数检测到最大数量的ASISI位点,而读取的读数比Bliss少23倍。
结果:我们表明,我们的Enzbert Transformer模型通过蛋白质语言模型的专业化而受过训练,可预测酶佣金(EC)数量,仅基于序列而优于单功能酶类预测的最先进的工具。在EC40基准上的第二级预测EC数量的预测中,精度从84%提高到95%。为了评估第四级的预测质量,这是最详细的EC数字,我们构建了两个新的基于时间的基准测试,以与最先进的方法ECPRED和DEEPEC进行比较:Macro-F1分别从41%提高到54%,从20%提高到20%。最后,我们还表明,使用一个简单的注意力图与EC预测任务上的其他经典性方法相当,或者比其他经典性方法更好。更具体地,注意图鉴定出的重要残基倾向于对应于已知的催化位点。量化,我们报告的最高F-GEAIN评分为96.05%,而经典的可解释性方法最多达到91.44%。