XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemseque
通过聚合酶链式反应生成单链 DNA 及其在 HLA-DQA 基因座直接测序中的应用
摘要 通过聚合酶链式反应，可以从基因组 DNA 中酶促扩增单拷贝序列。通过使用两种不同摩尔量的扩增引物，只需一个步骤即可扩增单拷贝基因并产生所选链的过量单链 DNA，用于直接测序或用作杂交探针。此外，可以使用等位基因特异性寡核苷酸在扩增反应中或作为测序引物直接测序杂合子中的单个等位基因。通过使用这些方法，我们研究了 HLA-DQA 基因座的等位基因多样性及其与血清学定义的 HLA-DR 和 -DQ 类型的关联。该分析揭示了总共八个等位基因和三个额外的单倍型。该方法在筛查人类基因突变方面具有广泛的应用，并有助于将基因的酶促扩增与自动测序联系起来。
改进单链 DNA 病毒的测序
Malathi VG、Renuka Devi P. (2019) SsDNA 病毒：全球病毒组中的关键参与者。病毒性疾病。 30：3–12。 https://doi.org/10.1007/s13337-019-00519-4
美国对人工智能的不平衡态度及其后果
世界海洋陷入困境。全球变暖导致海平面上升，减少了海洋中的食物供应。入侵物种和霍乱破坏了海洋的生态平衡。农业中使用的许多杀虫剂和营养物质最终流入沿海水域，导致氧气耗尽，杀死海洋植物和贝类。与此同时，由于过度捕捞，鱼类供应正在减少。然而，人类要繁荣发展，就需要健康的海洋；我们呼吸的氧气有一半来自海洋，而且在任何特定时刻，海洋都包含着世界上 97% 以上的水。海洋提供了人类食用的动物蛋白的至少六分之一。活海洋吸收大气中的二氧化碳，减少气候变化的影响。许多民间社会团体 (NGO) 正在努力保护这一共享资源。例如，OceanMind 使用卫星
比较宏基因组的下一代测序和血液培养以诊断血液感染
结果：使用血液作为MNGS测试样品，宿主DNA的比例为99.9％，只有三种细菌，未检测到真菌。在MNG中使用血浆时，宿主DNA的比例约为97％，检测到84个细菌和两种真菌。值得注意的是，分别在43对血液和血浆样品中检测到16S rRNA NGS。血液培养物检测到49种细菌（23个革兰氏阴茎和26克阳性球菌）和4种真菌，其中14种细菌被临床微生物学家视为污染物。对于所有血液培养物，血浆CFDNA MNG检测到78.26％（19/23）革兰氏阴性杆，17％（2/12）革兰氏阳性球菌，没有真菌。与血液培养物相比，血浆CFDNA MNG的敏感性和特异性检测细菌和真菌分别为62.07％和57.14％。
基于椰子的农业生态系统用于碳螯合
摘要椰子（Cocos nucifera L.）是一种多年生作物，可提供主食，并在许多发展中国家用作经济作物。其生产主要受气候，土壤和疾病的影响。温室气体（GHG）排放构成的威胁，尤其是负责全球变暖和气候变化的二氧化碳（CO 2），呼吁迫切需要减轻气候变化，通过探索环境友好的方式来隔离气氛。椰子养殖及其农业生态系统是可以通过固存存储CO 2的方法之一，并有助于减少大气中存在的CO 2的当前增加。尽管椰子种植园具有与热带森林相似的特征和功能，但它的能力比热带森林更好。除了椰子种植还改善了农民的收入和生计外，这对于利用基于椰子的农业生态系统的潜力来碳固存，以及碳交易所需的投资机会，以及帮助气候变化适应和缓解计划所需的投资机会。
植物地理学
我们的目标是解决Apis Labiosa和Apis Dorsata亚种之间的系统发育关系A. d。 Dorsata，A。D。 Binghami和A. d。 Breviligula，几位作者提出了最后两个物种。我们使用用最大似然方法分析的线粒体COX1和COX2基因序列对巨型蜜蜂进行了系统发育分析。在广义上，我们在多萨塔（A. dorsata）内获得了四个进化枝的支持：上面提到的三个亚种或物种，以及来自南部的第四个谱系。但是，我们的分析并未解决四个谱系之间的系统发育关系。在印度存在两个遗传区分开的“ A. dorsata”群体的存在与存在两个空腔巢蜜蜂的存在，即A. Cerana Cerana和A. c。印度（分别是黑山蜜蜂和黄色平原蜜蜂）。这表明过去的气候或地质事件可能暂时将印度人口与亚洲大陆的人群暂时隔离，从而导致分歧，并可能将印度巨人和空腔巢蜜蜂的物种形成，然后是东亚形式对印度的重新殖民化。对这些独特的谱系的认识对于保护计划很重要，因此可以考虑它们的各个分布，生态和迁移模式，因此可以维持它们所代表的遗传多样性。
宏基因组二代测序在传染病诊断中的应用
宏基因组新一代测序 (mNGS) 是诊断传染病的一种变革性方法，它利用无偏高通量测序直接检测和表征临床样本中的微生物基因组。本综述全面概述了 mNGS 技术的基本原理、测序工作流程和平台。该方法的骨干包括对从不同样本类型中提取的总核酸进行散弹枪测序，能够在不了解传染源的情况下同时检测细菌、病毒、真菌和寄生虫。mNGS 的主要优势包括它能够识别稀有、新型或不可培养的病原体，与传统的基于培养的方法相比，可以更全面地了解微生物群落。尽管有这些优势，但数据分析复杂性、高成本以及需要优化样品制备方案等挑战仍然是重大障碍。mNGS 在各种全身性感染中的应用凸显了其临床实用性。本综述中讨论的案例研究说明了其在诊断呼吸道感染、血流感染、中枢神经系统感染、胃肠道感染等疾病方面的功效。通过快速识别病原体及其基因组特征，mNGS 有助于及时和有针对性的治疗干预，从而改善患者的治疗结果和感染控制措施。展望未来，mNGS 在传染病诊断领域的前景看好。生物信息学工具和测序技术的进步有望简化数据分析、提高灵敏度和特异性并缩短周转时间。与临床决策支持系统的集成有望进一步优化 mNGS 在常规临床实践中的利用。总之，mNGS 代表了传染病诊断领域的范式转变，为微生物多样性和发病机制提供了无与伦比的见解。尽管挑战依然存在，但持续的技术进步具有巨大的潜力，可以巩固 mNGS 作为现代医学武器库中的关键工具的地位，使临床医生能够精确、快速、全面地检测病原体。
SARS-cov-2 感染后急性后遗症与病毒变异和疫苗接种状况的关系：一项多中心横断面研究
1 瑞士圣加仑州立医院，传染病和医院流行病学分部；2 瑞士东部儿童医院，传染病和医院流行病学部，瑞士圣加仑；3 瑞士库尔格劳宾登州立医院，传染病分部；4 瑞士圣加仑州（南部）精神病服务中心；5 瑞士圣加仑州（北部）精神病服务中心；6 Clienia Littenheid，瑞士利滕海德；7 瑞士齐尔施拉赫特神经康复中心；8 瑞士格拉布斯 Rheintal Werdenberg Sarganserland 医院集团；9 瑞士维尔 Fuerstenland Toggenburg 医院集团；10 瑞士苏黎世 Hirslanden 诊所； 11 瑞士明斯特林根图尔高医院集团传染病和医院流行病学部；12 瑞士国家感染预防中心 (Swissnoso)，瑞士伯尔尼；13 瑞士圣加仑老年诊所，瑞士圣加仑；14 加拿大多伦多西奈医疗系统；15 瑞士布克斯 Labormedizinisches Zentrum Dr Risch Ostschweiz AG；16 列支敦士登私立大学，特里森， ———————————————————————————————————————————— *SPK 和 PK 对本文的贡献相同。 **研究组团队成员列于致谢部分 通讯作者。 Philipp Kohler，医学博士，理学硕士，圣加仑州立医院，传染病和医院流行病学科，Rorschacherstrasse 95，9007 St. Gallen，瑞士，电子邮件 philipp.kohler@kssg.ch © 作者 2023。由牛津大学出版社代表美国传染病学会出版。这是一篇开放获取文章，根据知识共享署名-非商业-禁止演绎许可条款分发（https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/），允许以任何媒介非商业性复制和分发作品，前提是原始作品未以任何方式更改或转换，并且正确引用作品。如需商业再利用，请联系 journals.permissions@oup.com
2024 05土壤碳固执
●土壤碳固化是捕获并存储在土壤中的大气二氧化碳的过程，形成了自然全球碳循环的一部分。●在不受干扰的天然生态系统中，碳可以存储在土壤中数千年。然而，自然土地向农田的转化使土壤有机碳库存枯竭，并将这种存储的碳释放到大气中。●牲畜放牧系统负责在过去的六十年中损失大量土壤碳。●再生放牧 - 涉及在短时间内在陆地上旋转牲畜 - 已提议作为改善土壤碳储备和抵消牲畜养殖排放的解决方案。●最近的估计表明，改善放牧管理可能会在植被和土壤中占据约63千吨（十亿吨）的碳。●但是，一旦考虑了放牧动物的甲烷和氧化氧化物的排放，估计需要135吉甘吨的碳吸收物来抵消这些排放。●依靠土壤碳固执来抵消放牧系统的排放，因为碳存储是有限的和可逆的，并且甲烷和一氧化二氮的排放量增加可能会抵消土壤中碳固相机的任何收益。再生放牧的影响也高度依赖于上下文。●尽管有不确定性，但在世界某些地区，土壤中的碳中的碳可能导致中期降低气候变化。●旨在维持或改善土壤碳的管理实践还提供其他好处，例如改善土壤健康，侵蚀控制和减少排放强度，产量和农民的收入有积极的结果。