近几十年来,胃肠道被认为是人体最大的免疫器官。胃肠道具有多样化的微生物群,已成为疾病治疗的重要靶点( Xu et al.,2023;Li et al.,2024)。实验证据表明,高血压、胰岛素抵抗、肥胖、高血糖、高血脂等代谢紊乱与肠道菌群密切相关(Shao et al.,2022;Zhang H. et al.,2023;Ouyang et al.,2024;Li et al.,2024)。Makki et al.(2018)发现高脂饮食会降低微生物多样性,改变肠道微生物代谢,导致代谢综合征的发生。Li et al.(2019)研究通过调节高脂饮食诱导的大鼠的肠道菌群,可预防高脂血症和高胆固醇血症,提示改善胃肠道健康可能是治疗疾病的新策略。益生菌是胃肠道中占主导地位的菌群,有助于改善食物的消化。植物乳杆菌乳酸杆菌、酪丁酸梭菌、青春双歧杆菌、嗜热链球菌是胃肠道中重要的细菌,其中乳酸杆菌为兼性厌氧革兰氏阳性菌,有报道指出,乳酸杆菌可以改善肠道炎症,预防疾病的发生或加重,也可用于治疗精神疾病和
心血管疾病(CVD)仍然是全球死亡率和发病率的主要原因。在美国,中国,东欧和印度,CVD的死亡率特别高(Roth等,2020)。严重的CVD导致患者及其家人的重大经济损失以及身体和精神负担。通过生活方式干预和广泛使用新技术和药物的生存率显着提高了(Fegers-Wustrow等,2022)。然而,CVD的不良预后尚未得到改善,死亡率,发病率,残疾和复发率仍然很高(Bethel等,2018; Arnett等,2019)。骨形态发生蛋白(BMP)是1965年发现的,是一组进化保守的分泌蛋白,它们在生长和发育中起着重要作用(Bone,1965)。所有BMP均属于转化的生长因子-β(TGF-β)超家族(BMP-1)(Kawabata等,1998)。随着研究的进行,除了诱导骨骼和软骨形成外,BMP已被证明可以调节胚胎,肺,肾脏,胃肠道系统,牙齿和其他器官的发展(Zhang and Que,2020)。BMP的消融或过表达通常会导致显着的缺陷或严重的病理。许多研究表明,BMP与CVD密切相关,并且最近已经取得了研究进度。BMP激活通常会导致血管炎症,例如动脉粥样硬化和钙化,而BMP的例子包括先天性肾脏和尿道异常(Dudley等,1995; Luo等,1995; Miyazaki等,2000),嗜血症和微观噬菌体(Dudley等,1995,1995; Luo等,195; achondry and arthimose et aste et an andimi et ail an。 Shao等,2021),Barrett的食管(Palles等,2015)和贫血(Steinbicker等,2011)。
创作者的创作者(S)Ana S. A. Cohen,Emily G. Farrow,Ahmed Abdelmoity,Joseph Alaimo,Shivarajan Manickavasavasagam Amudhavalli,John Anderson,Lalit R. Bansal,Lauren E. ,Shreyasee Chakraborty,Warren A. Cheung,Keith A. Coffman,Ashley M. Cooper,Laura A. Cross,Tom Curran,Thuy Tien T. Dang,Mary M. Elfrink,Kendra Engleman,Erin Day Fecske,Erin Day Fecske,Cynthia Fieser,Cynthia Fieser,Keely M. Fitzgerald,Emily Flemgar,Randi N. jenn n. jenn Et Gibson,Jeffrey Goldstein,Elin Grundberg,Kelsee Halpin,Brian S. Harvey,Bryce Heese,Wendy Hein,Suzanne M. Herd,Susan Starling Hughes,Mohammed Ilyas,Jill Jacobson,Janda L. Jenkins,Shao Jiang,Jeffrey J. Johnston,Kathryn Keeler,Jonas Korlach,Jonas Korlach,Jonnifer ,Michael Lypka,Brittany D. McDonald,Neil Miller,Ann Modrcin,Annapoorna Nair,Shelby H. Neal,Christopher M. Oermann,Donna M. Pacicca,Kailash Pawar,Nyshele L. Ol J. Saunders,Caitlin Schwager,Richard M. Schwend,Elizabeth Shaffer,Craig Smail,Sarah E. Soden,Meghan Strenk,Bonnie Sullivan,Brooke Sweeney、Jade B. Tam-Williams、Adam Walter、Holly Welsh、Aaron M. Wenger、Laurel K. Willig、Yun Yan、Scott T. Younger、Dihong Zhou、Tricia N. Zion、Isabelle Thiffault 和 Tomi Pastinen
* 通讯作者:陈洪生、李世龙、钱浩良,浙江大学信息与电子工程学院量子信息交叉学科中心、现代光学仪器国家重点实验室,杭州 310027,浙江大学;浙江大学-杭州全球科技创新中心、浙江省先进微纳电子器件与智能系统重点实验室,杭州 310027,浙江大学;浙江大学 ZJU-UIUC 学院国际联合创新中心,海宁 314400,浙江大学,电子邮箱:hansomchen@zju.edu.cn (H. Chen)、shilong.li@zju.edu.cn (S. Li)、haoliangqian@zju.edu.cn (H. Qian)。https://orcid.org/0000-0002-5735-9781 (H. Chen)。 https://orcid.org/0000-0003-4200-9479 (H. Qian) 王海腾、牛俊如、陈巧璐、邵华和杨逸浩,浙江大学信息与电子工程学院现代光学仪器国家重点实验室量子信息交叉学科中心,杭州 310027,中国;浙江大学-杭州全球科技创新中心、浙江省先进微纳电子器件与智能系统重点实验室,杭州 310027,中国;浙江大学 ZJU-UIUC 学院国际联合创新中心,海宁 314400,中国 赵思涵,浙江大学物理学院量子信息交叉学科中心、硅与先进半导体材料国家重点实验室、浙江省量子技术与器件重点实验室,杭州 310058,中国。 https://orcid.org/0000-0003-2162-734X
Editor-in-Chief Hongbing Shen Founding Editor George F. Gao Deputy Editor-in-Chief Liming Li Gabriel M Leung Zijian Feng Executive Editor Chihong Zhao Members of the Editorial Board Rui Chen Wen Chen Xi Chen (USA) Zhuo Chen (USA) Gangqiang Ding Xiaoping Dong Pei Gao Mengjie Han Yuantao Hao Na He Yuping He Guoqing Hu Zhibin Hu Yueqin Huang Na Jia Weihua Jia Zhongwei Jia Guangfu Jin Xi Jin Biao Kan Haidong Kan Ni Li Qun Li Ying Li Zhenjun Li Min Liu Qiyong Liu Xiangfeng Lu Jun Lyu Huilai Ma Jiaqi Ma Chen Mao Xiaoping Miao Ron Moolenaar (USA) Daxin Ni An Pan Lance Rodewald (USA) William W. Schluter (USA) Yiming Shao Xiaoming Shi Yuelong Shu RJ Simonds (USA) Xuemei Su Chengye Sun Quanfu Sun Xin Sun Feng Tan Jinling Tang Huaqing Wang Hui Wang Linhong Wang Tong Wang Guizhen Wu Jing Wu Xifeng Wu (USA) Yongning Wu Min Xia Ningshao Xia Yankai Xia Lin Xiao Hongyan Yao Zundong Yin Dianke Yu Hongjie Yu Shicheng Yu Ben Zhang Jun Zhang Liubo Zhang Wenhua Zhao Yanlin Zhao Xiaoying Zheng Maigeng Zhou Xiaonong Zhou Guihua Zhuang
Editor-in-Chief Hongbing Shen Founding Editor George F. Gao Deputy Editor-in-Chief Liming Li Gabriel M Leung Zijian Feng Executive Editor Chihong Zhao Members of the Editorial Board Rui Chen Wen Chen Xi Chen (USA) Zhuo Chen (USA) Gangqiang Ding Xiaoping Dong Pei Gao Mengjie Han Yuantao Hao Na He Yuping He Guoqing Hu Zhibin Hu Yueqin Huang Na Jia Weihua Jia Zhongwei Jia Guangfu Jin Xi Jin Biao Kan Haidong Kan Ni Li Qun Li Ying Li Zhenjun Li Min Liu Qiyong Liu Xiangfeng Lu Jun Lyu Huilai Ma Jiaqi Ma Chen Mao Xiaoping Miao Ron Moolenaar (USA) Daxin Ni An Pan Lance Rodewald (USA) William W. Schluter (USA) Yiming Shao Xiaoming Shi Yuelong Shu RJ Simonds (USA) Xuemei Su Chengye Sun Quanfu Sun Xin Sun Feng Tan Jinling Tang Huaqing Wang Hui Wang Linhong Wang Tong Wang Guizhen Wu Jing Wu Xifeng Wu (USA) Yongning Wu Min Xia Ningshao Xia Yankai Xia Lin Xiao Hongyan Yao Zundong Yin Dianke Yu Hongjie Yu Shicheng Yu Ben Zhang Jun Zhang Liubo Zhang Wenhua Zhao Yanlin Zhao Xiaoying Zheng Maigeng Zhou Xiaonong Zhou Guihua Zhuang
人工智能已经建立了深度学习(DL)的扎实基础,尤其是在引入变压器体系结构的过程中,该体系结构引起了多个学科的研究人员的广泛关注。机器学习(ML)和DL,是人工智能的分支,已经越来越多地改变了各种领域的研究。一个区域受到的影响特别是微生物学(Obermeyer和Emanuel,2016年)。特别是微生物和传染病的复杂性和多样性使它们成为新型ML和DL技术的理想候选者。在此研究主题中,标题为“致病微生物组研究中的机器学习和深度学习应用”,我们收集了11种手稿的集合,这些手稿体现了ML和DL在致病微生物组研究领域的应用。这些收集的手稿主要是原始文章,可提供了解如何使用ML和DL来进一步了解致病微生物组的研究。目前,ML广泛用于预测模型的开发(Collins and Moon,2019年)。通过将ML或DL方法与预测模型相结合,本研究主题中的手稿强调了跨学科整合在理解与致病微生物组相关的疾病中的重要性,并促进了更好的健康以及人类和生态系统的健康。在这个研究主题中,Shao等。在迷你审查中探讨了致病性微生物与各种骨科条件之间的复杂相互作用,“探索致病微生物组在骨科疾病中的影响:机器学习和深度学习方法”。通过分析微生物群的数据集以及与宿主的相互作用,它们突出了ML和DL如何增强对骨质疏松和关节炎等疾病的理解,诊断和治疗。
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Jianwei Zheng, 1,9 Qianqian Wang, 1,9 Jianghe Chen, 1 Guodi Cai, 1 Zhenhua Zhang, 1 Hongye Zou, 2 June X. Zou, 2 Qianqian Liu, 1 Shufeng Ji, 3 Guoli Shao, 3 Hong Li, 4 Sheng Li, 4 Hong-Wu Chen, 2 LinLin Lu, 5,6 Yanqiu Yuan,1, * Peiqing Liu,1,7,8, *和Junjian Wang 1,7,8,10, * 1 1名药学学校,Sun Yat-Sen University,广东,广东,510006,P.R.中国2个生物化学与分子医学系,加州大学戴维斯分校综合癌症中心,加利福尼亚大学,戴维斯分校,戴维斯分校,加利福尼亚州萨克拉曼多,加利福尼亚州,美国3特殊医疗服务中心,南部医科大学,广东,广东510280,南部医科大学中国4个生物医学实验室,广州Jingke Life Science Institute,广州,广东510145,P.R。Yat-Sen University,广东,广东510006,P.R。中国8广东省级省级新药设计与评估省主要实验室,药学学院,Sun Yat-Sen University,广东,广东510006,P.R。 中国9这些作者同样贡献了10个潜在客户联系 *通信:yuanyq8@mail.sysu.edu.cn(Y.Y. ) ),liupq@mail.sysu.edu.cn(P.L. ) ),wangjj87@mail.sysu.edu.cn(J.W。)中国8广东省级省级新药设计与评估省主要实验室,药学学院,Sun Yat-Sen University,广东,广东510006,P.R。中国9这些作者同样贡献了10个潜在客户联系 *通信:yuanyq8@mail.sysu.edu.cn(Y.Y.),liupq@mail.sysu.edu.cn(P.L.),wangjj87@mail.sysu.edu.cn(J.W。)https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024/1015//p>