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在计算机特征中
我们研究了短长核苷酸序列的硅硅表征，这些核苷酸序列在死亡应力诱导的转录组分析中差异表达。他们表现出与C末端旋转肽和防御素样蛋白的同源性，从而揭示了它们的抗菌活性。他们的预测纤维印刷显示出与抗菌肽有关的蛋白质特征。这些短长的RGA已显示具有结构性基序，例如APLT P型ATPase，酪蛋白激酶II（CK2），蛋白激酶3，蛋白激酶C（PKC）和N-糖基化位点，它们是抗病基因的属性。在配体对接分析中活跃结合位点精氨酸和赖氨酸残基的预测将它们作为抗菌肽预测，因为它们与抗菌活性的密切关系。硅结构 - 功能表征已经预测了它们在抗微生物病原体的抗性中的作用。此外，预测的抗菌肽区域显示了它们与Pr-5样蛋白和AMP家族Thaumatin
体外和计算机研究 心房尿液肽的类似物（C-ANP4-23）调节人分化脂肪细胞中的葡萄糖代谢 双酚A暴露会影响特定的肠道分类单元，并驱动儿童肥胖症中的微生物群 量子机学习实现：建议和实验 研究基于电阻开关设备的量化硬件深神经网络，常规方法和卷积方法 在与数字社会交流时，人脑面临一些挑战 Sigma-1受体 蔗糖溶液中的一个等离子体传感器 文章在大学生中有问题的互联网使用及其与社交技能的关系 Agassi模型的数字量子模拟 孕妇外周血的表观基因组广泛的研究鉴定了潜在的代谢 开放量子系统用于量子机学习的好处 寡核苷酸合成的P（V）平台 微生物接种剂和有机肥料的联合应用改善了不利的土壤条件下的植物生长 结合了上的1/F斜率和脑模拟
摘要：通过乙酰胆碱酯酶（ACHE）和丁酰基胆碱酯酶（Buche）抑制增强胆碱能功能被认为是治疗阿尔茨海默氏病的有价值的治疗策略。这项研究旨在评估锌390718的体外效应，锌390718先前使用计算方法对胆碱酯酶进行了研究，并使用分子动力学（MD）仿真来表征该化合物内部胆碱酯酶酶内部的结合模式。还使用富含星形胶质细胞的神经胶质细胞培养研究了体外细胞毒性效应。ZINC390718在高度旋转范围（IC 50 = 543.8 µm）和对Buche（IC 50 = 241.1 µM）的体外双重抑制活性以浓度依赖性方式对ACHE表示，具有较大的活性，具有较大的活性。MD模拟显示锌390718与两个靶标上的催化残基位点形成了重要的疏水性和H键相互作用。促进ACHE靶标的疏水相互作用和H键的残基是Leu67，Trp86，Phe123，Tyr124，Ser293，Phe295和Tyr341，以及在Buche目标上，它们是ASP70，Tyr332，Tyr332，Tyr128，ile442，trp82，trpy197。通过细胞活力评估的Z390718的细胞毒性作用表明该分子的体外毒性低。体外和计算机结果表明，锌390718可以用作对新的双胆碱酯酶抑制剂优化和鉴定的化学型。
Silico Inc.的Veritas
在本文档中对未来的业务活动和绩效的陈述是前瞻性的陈述。前瞻性陈述包括但不限于“目标”，“预期”，“假设”，“信任”，“继续”，“尝试”，“尝试”，“估算”，“预期”，“预期”，“措施”，“预期”，“”，“项目”，“项目”，“”，“ 5月，”，“ PLAN”，“ PLAN”，“ PLANS”，“潜在”，“可能性，” Project，“ Project”，“““风险”，“”，“应该”，“”，“”，“”，“”，“” “目标”或其他类似的表达方式，以描述未来的业务活动，绩效，事件或情况前瞻性陈述是基于管理层的假设和信念，鉴于准备这些材料时可用的信息，并涉及许多风险和不确定性。因此，这些前瞻性陈述受到各种风险和不确定性的影响，这些风险可能会导致实际的未来业务运营，结果与此类前瞻性陈述所表达或暗示的陈述具有重大差异。因此，您警告不要对前瞻性陈述不过时。
药学中使用的计算机方法
计算机模拟方法的优点在于能够根据分子结构预测药物特性 [13]。此外，它们还可以预测吸收、分布、代谢和排泄 (ADME) 特性 [13,14]，从而减少进行大量体内研究的需要，并节省大量时间和成本，最终加速药物生产 [15,16]。通过识别和预测药物对生物系统的影响，可以改善临床使用，避免副作用，并更好地选择和开发治疗方法 [17]。一些官方机构已经推荐甚至提供了用于评估化学品危害识别、风险评估和人类健康安全评估方面的计算机模拟工具。已经建立了工作流程来指导这些计算机模拟工具在化学品风险评估和计算毒理学中的应用 [10]。
通过计算机模拟分析 admet 特性和抑制...
1 犹他大学生物化学系，犹他州，美国 2 拉各斯州立大学理学院化学系，拉各斯，尼日利亚 3 拉各斯州立大学理学院生物化学系，拉各斯，尼日利亚 *通讯作者电子邮件地址：zechariaholuwadamilola@gmail.com 摘要：不同类别的生物碱已证明具有抗癌治疗功效。干扰素诱导的四肽重复序列 5 蛋白 (IFIT5) 与肾细胞癌 (RCC) 的发病机制有关。人们对这些药理相关类别的生物碱对 IFIT5 的抑制作用知之甚少。因此，我们确定了这些生物碱的 ADMET 特性，以及它们对 IFIT5 的抑制潜力。从 PubChem 中检索到 50 种生物碱。IFIT5 的结构是从蛋白质数据库中获得的，并使用 Biovia Discovery Studio 进行处理以消除非标准分子。使用 PyRx 进行分子对接以评估蛋白质-配体复合物的结合亲和力，而使用 AdmetSAR 和 swissADME 进行 ADMET 分析。对接结果显示，所有 50 种选定的生物碱均表现出较高的 IFIT5 结合效果，范围从 -7.1 到 -11.0 kcal/mol，超过二（羟乙基）醚共结晶配体（-3.9 kcal/mol），其中 nortopsentin A 成为最有希望的候选药物。此外，前五种 IFIT5 结合生物碱中的四种（nortopsentin A、stylopine、氧化苦参碱和脱氧微管蛋白）表现出良好的类药物特性。这些生物碱（尤其是 nortopsentin A）表现出的良好类药物特性和强大的 IFIT5 结合影响凸显了它们在开发用于靶向 RCC 治疗的选择性 IFIT5 抑制剂的临床前/临床试验中的潜力。关键词：肾细胞癌，IFIT5，生物碱，结合亲和力，药代动力学，毒性介绍肾细胞癌 (RCC) 是一种隐匿性肿瘤，约占全球癌症诊断和死亡的 2% (Padala 等人，2020 年)。RCC 的一个独特特征是许多患者通常无症状；据估计，超过 50% 的患者在因无关问题进行影像学检查时被偶然诊断出患有 RCC (Rosner 等人，2021 年)。与 RCC 相关的几个主要风险因素包括吸烟、体重过重、饮酒、高血压、糖尿病、慢性肾病，以及遗传因素，例如 von Hippel-Lindau (VHL) 肿瘤抑制基因突变 (Al-Bayati 等人，2019 年)。大多数肾细胞癌发生在肾脏皮质，由肾小球、肾小管和集合管组成（El-Zaatari 等人，2020 年）。发达国家的肾细胞癌病例通常通过影像学诊断，只有 10% 的患者出现经典的三联症状，包括血尿、腰痛、可触及的肿块、发热、体重减轻和白细胞增多（Satwikananda 等人，2023 年）。
在构成菌落刺激因子-1受体
AIM：小分子CSF1R抑制剂在临床开发中，针对癌症治疗剂的临床开发和潜在的铅优化在临床开发中对基于结构的抑制作用抑制菌落刺激因子-1受体（CSF1R），因为CSF1R是一种新型的预测性生物标记物，用于癌症的免疫疗法。方法：化合物是在分子工作环境中通过诱导的拟合对接方案建模的硅（Moe，Moe.V.2015）。CSF1R激酶（蛋白质数据库，ID 4R7H）的3维（3D）X射线结晶结构是从结构生物信息信息学（RSCB）蛋白数据库的研究合作中获得的。Edicotinib，DCC-3014，Arry-382，BLZ-945，Chiauranib，Dovitinib和Sorafenib的3D构象体是从PubChem数据库中获得的。这些结构在Amber10：EHT分子力场中进行了建模，并使用快速准备应用来纠正和优化缺失残基，H-Counts，Termini限额和交替的结构。在CSF1R激酶的共结晶配体附近定义了结合位点。这些化合物通过三角匹配器的放置方法对接，并通过伦敦DG评分函数进行排名。通过诱导的合适方法进一步完善了对接的姿势。使用最低结合评分（ΔG）的姿势用于模拟Discovery Studio Visualer V17.2中的配体相互作用曲线。共结晶的配体以其APO构象对接，并计算出根平方的偏差以验证对接协议。结果：除edicotinib以外，所有7个CSF1R抑制剂与残基MET637相互作用。抑制剂通过与ASP-Phe-Gly（DFG）基序的ASP797相互作用和/或阻碍GLU633和LYS616之间形成的保守盐桥，以自动抑制构象的构象保持CSF1R。DCC-3014，Arry-382，BLZ-945和Sorafenib与CSF1R激酶与最低的结合能结合。结论：嘧啶是与CSF1R残基相互作用的有效抑制剂。DCC-3014和Arry-382具有出色的药物潜力，具有巨大的结构稳定性和亲和力。
在硅和体外抗凝活性检测...
抽象因子Xa是开发新抗凝剂的重要目标。本研究旨在研究与利伐沙班对激活的人凝结因子X（PDB ID：2W26）相比，与Rivaroxaban相比，三种化合物（槲皮素及其衍生物rutin和troxerutin）的影响。分子对接，以预测其抗激活因子X活性和自动库克Vina软件以检查形成的键。接下来，研究了对PT和APTT凝血时间的体外生物学作用。troxerutin和rutin与2W26酶显示最佳相互作用值，并且使用igemdock分别为[（-185.743 kcal/mol）和（-178.034 kcal/mol）]；利伐沙班的结合能为（-149.661 kcal/mol）。体外研究的结果表明，与阴性和阳性对照相比，研究化合物对延长PT（APTT）具有作用。然而，曲毒素给出了评估的凝血时间的最高延长，与计算机研究的结果一致。
在硅氧基硅烷基硅胶和体外筛选中基于吡咯的夹层...
虚拟筛选正在作为一种高度应用的技术出现，并作为广泛使用的搜索和识别潜在命中的方法获得了突出，与高插入率筛选相比，发现了发现新颖和有效的化合物所需的时间。最近，与单个软件对接相比，具有多个程序的模拟优越性已被解散。这项工作的目的是应用共识对接，分子力学/广义出生表面积（MM/GBSA）游离结合能量重新计算，并在最近合成的基于吡咯的内部基于吡咯的夹层 - 氢氮化物区域的内部数据集中进行体外评估，以搜索新型乙酰基烯基烯酶（ACHETYLCHOLCHOLINERTERASE）（ACHEER）（ACHEE）。使用了两个许可的软件 - 金5.3和滑行，用于虚拟筛选，并确定了几个化学治疗势命中率。此外，还提供了MM/GBSA的无结合能重计重估算以增强硅成果中的鲁棒性。前十名基于吡咯的氢氮化物hydrazones的MM/GBSA得分范围从-60.44到-70.93 kcal/mol。随后对最高排名化合物的体外评估表明，12D表现出最高的ACHE抑制活性，抑制速率为55％，浓度为10μM。此外，这种基于吡咯的ACHE抑制剂与酶的活性位点形成了稳定的复合物。与活性氨基残基Tyr72和Tyr286的相互作用表明12D位于酶的外围阴离子位点附近。此外，在使用Qikprop进行的硅ADME研究中，12D具有最佳的药代动力学特性。总而言之，这项研究通过计算和实验发现的结合确定了一种新型基于吡咯的ACHE抑制剂12D。