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将环境时间序列纳入物种分布模型
动机。给定一个字符串S，最小化方案是由三重（k，w，o）定义的算法，该算法从字符串s采样了k -mers（k -long substring）子集的子集。具体来说，它根据s中w连续k -mers的每个窗口中的o来采样最小的k -mer。由于连续的窗口可以采样相同的k -mer，因此采样的K -mers的集合通常比s小得多。这使最小化器成为多种工具，可在生物信息学中减少多个应用程序的内存足迹和处理时间，例如序列比较，组装，压实的de bruijn图形结构和序列索引。更一般地，我们考虑尊重窗口保证的基因带抽样算法：必须从连续k -mers的每个窗口中对至少一个k -mer进行采样。作为采样k -mer的绝对位置在s中的绝对位置唯一识别，我们可以将采样算法的密度定义为不同采样位置的比例。良好的方法具有低密度，通过尊重窗口保证，将限制为1 /w。但是，很难设计具有最佳密度的序列敏捷算法。实际上，通常使用伪随机哈希函数实现O级O，以获得所谓的随机最小化器。此方案非常易于实施，即使以流方式进行计算也非常快，并且易于分析。然而，它的密度几乎距离下限的大窗口几乎有2倍。先前的工作集中在理论和实践中，与随机最小化的密度相比，其密度较低的方法。尽管如此，这些方法仍然很难分析和直观地理解，并且并不总是像随机最小化器那样通用。
通过分离行为相关的神经信号揭示运动皮层中意想不到的复杂编码但简单的解码机制
摘要 在运动皮层中，行为相关的神经反应与不相关的信号纠缠在一起，这给编码和解码机制的研究带来了复杂性。目前尚不清楚行为无关信号是否可能隐藏一些关键真相。一种解决方案是在单神经元和单次试验水平上准确分离行为相关和不相关信号，但由于行为相关信号的实际情况未知，这种方法仍然难以实现。因此，我们提出了一个框架来定义、提取和验证行为相关信号。通过分析三只执行不同伸手任务的猴子的分离信号，我们发现以前被认为包含很少信息的神经反应实际上以复杂的非线性方式编码了丰富的行为信息。这些反应对于神经元冗余至关重要，并揭示了运动行为占据了比以前预期更高维的神经空间。令人惊讶的是，当结合经常被忽略的神经维度时，行为相关信号可以线性解码，其性能与非线性解码相当，这表明线性读出可以在运动皮层中进行。我们的研究结果表明，分离行为相关信号可能有助于发现更多隐藏的皮层机制。
基于简单模型的脑肿瘤分类取得了良好的结果...
无论是在分割还是分类的情况下，脑肿瘤疾病都已成为研究课题。对于分类的情况，分组的脑肿瘤类型通常包括高级别胶质瘤 (HGG) 和低级别胶质瘤 (LGG)。在这项研究中，我们提出了一种使用卷积神经网络 (CNN) 算法对两种类型的肿瘤（即 HGG 和 LGG）进行分类的方法，该算法经过训练并将针对 2018 年和 2019 年脑肿瘤分割 (BRATS) 数据集进行测试，该数据集具有 4 种模式，即流体衰减反转恢复 (FLAIR)、T1、T1ce 和 T2，共计 2048 张图像。之所以选择 CNN 算法，是因为它可以直接接收磁共振图像 (MRI) 形式的输入，并进行特征提取过程以及分类算法。通过形成一个仅具有3个卷积层的简单CNN算法架构，其输入层的形式为尺寸为240×240×3的完整MRI图像，我们获得了94.14％的相对较高的准确率结果，甚至可以说比具有更复杂架构的类似方法更好。
arh。农场。 2024; 74：105 - 117评论文章/溶解概况的pregledni rad定量评估 - 从简单的方法到高级CH
许多形式的药物旨在在口服给药时溶解。此过程的动力学和效率是要控制的关键参数。其评估方法在食品和药物管理局（FDA），欧洲药品局（EMA）和世界卫生组织（WHO）发布的官方准则中描述。已经提出了许多比较方法，因为这些准则不仅限于特定的数学方法。本评论总结了该主题的当前状态，涵盖了与模型依赖性和独立于模型的方法以及多元思想。参考文献已被选为该领域中最重要的论文，因此可以将其视为读者作为进一步阅读的最佳建议。
Janelia Atalanta质粒为果蝇提供了一个简单有效的CRISPR/CAS9介导的同源性修复平台
。cc-by 4.0未经同行评审获得的未获得的国际许可证是作者/筹款人，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（该版本发布于2024年5月11日。; https：//doi.org/10.1101/2023.06.17.545412 doi：biorxiv preprint
肥胖对NK细胞的抑制作用SITC临床免疫肿瘤网络（SCION）...表达IL
抽象背景胶质母细胞瘤（GBM）是一种高度免疫抑制且通常是致命的原发性脑肿瘤，缺乏有效的治疗选择。GBM包含GBM干细胞（GSC）的亚群，这些细胞（GSC）在肿瘤起始，进展和治疗耐药性中起着核心作用。溶瘤病毒，尤其是单纯瘤疱疹病毒（OHSV），在癌细胞中选择性地复制并触发抗肿瘤免疫力 - 这种现象称为“原位疫苗”作用。尽管Talimogene laherparepvec（T-VEC）是由粒细胞巨噬细胞 - 粘合式刺激因子（GM-CSF）配备的OHSV，是食品和药物管理（FDA）的黑色素瘤批准，其在GBM患者中的使用尚未报道。白介素2（IL-2）是另一种已建立的免疫疗法，可刺激T细胞生长并策划抗肿瘤反应。IL-2是黑色素瘤和肾细胞癌的FDA批准，但尚未在GBM中进行广泛评估，IL-2治疗受其短期寿命，最小的肿瘤积累和明显的全身毒性的限制。我们假设通过OHSV对IL-2的局部肿瘤内表达将避免系统性IL-2相关的治疗缺陷，同时产生有益的抗肿瘤免疫力。方法我们使用Flip-Flop HSV BAC系统开发了G47Δ-MIL2（A OHSV表达IL-2），以在肿瘤微环境（TME）内局部传递IL-2。然后，我们测试了其在原位小鼠GBM模型（005 GSC，CT-2A和GL261）中的功效，并通过流式细胞仪和免疫组织化学评估了处理过的肿瘤和脾脏中的免疫谱。结果G47Δ-MIL2显着延长了中位生存期，而没有任何可观察到的全身性IL-2相关毒性在005和CT-2A模型中，而在GL261模型中没有GL261细胞对HSV感染的非耐受性。在005 GBM模型中G47Δ -MIL2的治疗活性与CD8 + T细胞的肿瘤内浸润增加有关，严格依赖于TME内IL -2的释放，而CD4 + T细胞完全消除了治疗效果。使用抗PD-1免疫检查点阻滞并不能改善G47Δ-MIL2的治疗结果。结论我们的发现表明，G47δ -MIL2有效，刺激抗肿瘤免疫力针对原位GBM，并且也可能针对GSC。OHSV表达IL-2可能代表了一种值得在GBM患者中进一步探索的药物。
Daron Acemoglu 撰写的《变革性人工智能的简单宏观经济学》
保护人工智能领域的竞争可以刺激个人和公司更快地采用该技术，从而更快地传播生产力收益。采用该技术需要公司内部的交易成本（员工培训、流程创新等）。强大的人工智能提供商可能会倾向于设计策略来锁定客户，并使在人工智能提供商和/或多宿主之间的切换成本更高，从而减缓采用速度。使用本质上可扩展的云服务可能会减轻公司对前期 IT 投资的需求，但可能会使它们面临云超大规模提供商的潜在有害做法。8
b'let g =（v，e）是一个简单，无方向性和连接的图。一个连接的主导集S \ Xe2 \ X8A \ x86 V是一个安全连接的G的g，如果对于每个U \ Xe2 \ X88 \ X88 \ X88 V \\ s，则存在V \ Xe2 \ X88 \ X88 \ x88 s，使得（u，V） \ xe2 \ x88 \ xaa {u}是G的连接统治集。 \ xce \ xb3 sc（g）表示的安全连接的g的最小尺寸称为g的安全连接支配数。给定图G和一个正整数k，安全连接的支配（SCDM）问题是检查G是否具有最多k的安全连接主导组。在本文中，我们证明SCDM问题是双弦图（弦弦图的子类）的NP完整图。我们研究了两分图的某些子类的复杂性，即恒星凸两分部分，梳子凸双方，弦弦两分和链图。最小安全连接的主导集（MSCD）问题是\ xef \ xac \ x81nd在输入图中的最小尺寸的安全连接的主导集。 We propose a (\xe2\x88\x86( G )+1)- approximation algorithm for MSCDS, where \xe2\x88\x86( G ) is the maximum degree of the input graph G and prove that MSCDS cannot be approximated within (1 \xe2\x88\x92 \xc7\xab ) ln( | V | ) for any \ xc7 \ xab> 0，除非np \ xe2 \ x8a \ x86 dtime | V | o（log log | v |）即使对于两分图。最后，我们证明了MSCD为\ xe2 \ x88 \ x86
b'let g =（v，e）是一个简单，无方向性和连接的图。A con- nected dominating set S \xe2\x8a\x86 V is a secure connected dominating set of G , if for each u \xe2\x88\x88 V \\ S , there exists v \xe2\x88\x88 S such that ( u, v ) \xe2\x88\x88 E and the set ( S \\ { v }）\ xe2 \ x88 \ xaa {u}是G的主导集。由\ xce \ xb3 sc（g）表示的安全连接的g的最小尺寸称为g的安全连接支配数。给出了图G和一个正整数K，安全连接的支配（SCDM）问题是检查G是否具有最多k的安全连接的统治组。在本文中，我们证明SCDM问题是双弦图（弦弦图的子类）的NP完整图。我们研究了该问题的复杂性，即两分图的某些亚类，即恒星凸两分部分，梳子凸两分部分，弦弦两分和链图。最小安全连接的主导集（MSCD）问题是\ xef \ xac \ x81nd在输入图中的最小尺寸的安全连接的主导集。我们提出a（\ xe2 \ x88 \ x86（g）+1） - MSCD的近似算法，其中\ xe2 \ x88 \ x86（g）是输入图G的最大程度）对于任何\ xc7 \ xab> 0，除非np \ xe2 \ x8a \ x86 dtime | V | o（log log | v |）即使对于两分图。最后，我们证明了MSCDS对于\ Xe2 \ x88 \ x86（g）= 4的图形是APX-Complete。关键字：安全的统治，复杂性类，树宽，和弦图。2010数学主题classi \ xef \ xac \ x81cation：05c69，68q25。
用于现实的微生物组数据的快速而简单的模拟器
midasim 0.5793 0.8617 0.6252 0.0019 <0。0001 <0。0001 Midasim（参数）0.0058 0.0010 0.0495 0.1607 <0。0001 <0。0001 D-M <0。0001 <0。0001 0.0028 <0。0001 <0。0001 <0。0001 MESASPARSIM <0。0001 <0。0001 0.6341 <0。0001 <0。0001 <0。0001 sparsedossa <0。0001 <0。0001 <0。0001 <0。0001 0.0002 0.0015 ∗β多样性比较使用Permanova进行。∗ *α多样性比较是使用t检验和kolmogorov-smirnov（KS）测试进行的。
简单算术处理过程中人脑连续激活的时空动态
研究文章 | 行为/认知 简单算术处理过程中人脑连续激活的时空动态 https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.2118-22.2024 收稿日期：2022 年 11 月 14 日 修订日期：2024 年 2 月 16 日 接受日期：2024 年 3 月 3 日 版权所有 © 2024 作者