#!/bin/bash #sbatch -job-name = tutorial2_r_container #sbatch-time = 00-00:01:00 #sbatch -mem = 4g #sbatch -partition = main #sbatch -patch -parth-yaim #sbatch -eartput -eartput -eartput = r_container-% -mail-user = your_email_address #sbatch -mail-type = begin,end,eend,fail,time_limit_80 #sbatch -account = accounting_group
●管理和操作HPC设施方面的经验是加号。●以前的起草和实施政策,尤其是在技术驱动的环境中,将是有利的。●具有群集管理和诸如Slurm之类的工作调度系统的经验是加号。
- 避免浪费资源(分配但未使用) - 增加资源可用性 - 允许其他用户的工作运行 - 提高Slurm Scheduler的效率 - 减少工作等待时间 - 更好的FairShare优先级,以便将来提交工作。
云基础设施:OpenStack、K8s、OpenShift 代码存储库、容器注册表、GitOps、Agile Infra 监控:Open Search、Kafka、Grafana、InfluxDB、Kibana 文档存储库//Web:Indico、Drupal、WordPress 分析:HTCondor、Slurm、Jupyter Notebooks、Apache Spark
Prinect Micro−6i 格式 102/105 Dipco 11.0i (pdf) © 2011 海德堡印刷机械股份公司 BCMYXZ slurZ slurB BCMYXZ 0 B 20 B 40 B 80 BCMYXZCMYCMYCMYCMYBCM YXZC 20 C 40 C 80 BCMYXZ slurC slurM BCMYXZ 0 BCMYXZBCMYXZCMYM 20 M 40 M 80 BCMYXZ slurY slurX BCMYXZ 0 Y 20 Y 40 Y 80 BCMYXZCMYCMYCMYCMYBCM YXZCMYX 20 X 40 X 80 BCMYXZCMCYMYCMYBCMYXZ 0 Z 20 Z 40 Z 80 BCMYXZCMYCMYCMYCMYCMC YMYCMYBCMYXZ 0 B 20 B 40 B 80 BCMYXZCMYCMYCMYCMYBCM YXZCMYC 20 C 40 C 80 BCMYXZ slurZ slurB BCMYXZ 0 BCMYXZBCMYXZCMYM 20 M 40 M 80 BCMYXZ slurC slurM BCMYXZ 0 Y 20 Y 40 Y 80 BCMYXZCMYCMYCMYCMYBCM YXZX 20 X 40 X 80 BCMYXZ slurY slurX BCMYXZ 0 Z 20 Z 40 Z 80 BCMYXZCMYCMYCMYCMYBCM YXZ
和来自 NGC 的应用程序(NVIDIA GPU Cloud) • • 完整的 AI 用户环境(Kuberne- tes (K8s) 支持、SLURM 支持、监控、科学库、编译器、分析器、调试器) • • 通过开放云 API 控制基础设施 • • 从单一界面管理整个基础设施,包括计算、存储和网络。• • 全面监控和警报 全面监控和警报 • • 支持虚拟机(用于培训和 POC)以及裸机配置 • • Web UI 门户支持文件传输、工作负载管理以及按需 VNC、RStudio 和 Jupyter 支持。按需 VNC、RStudio 和 Jupyter 支持。• • 无单点故障/零接触 无单点故障/零接触配置/滚动升级/零配置/滚动升级/零停机时间
6 讲:高性能计算架构和并行编程模型。 1 讲:学习使用 Northeastern Discovery 集群 1 讲:Linux Essentials 1 讲:超级计算集群作业调度系统 SLURM 简介 4 讲:Python 中的并行性 4 讲:并行机器学习 1 讲:高性能深度学习简介 1 讲:GPU 和 CUDA 简介 1 讲:PyTorch 简介 4 讲(或更多):PyTorch 中的并行深度学习 2 讲:HPC、机器学习、深度学习会议和讨论(这取决于会议是否可用) 4-6 讲:项目流程 注意:此时间表可能会更改,并将在整个学期根据需要进行调整。详细信息显示在 Canvas 上的教学大纲中
2个学时课程描述植物病理学实用研究应用的生物信息学培训。分析有关病毒,真菌和卵形植物病原体的OMICS数据,开发了用于大型数据集分析的定制管道,并得到了实际案例研究的支持。先决条件假设对生物学和遗传学的基本理解,尤其是在植物病原体和宿主分子相互作用的背景下。虽然对介绍性生物信息学概念和unix/linux命令行的知识很有帮助,但这并不是严格的要求。提取前培训的学生参加与集群,文件传输,基本UNIX命令和Slurm提交脚本的连通性的小型讲习班。(https://help.rc.ufl.edu/doc/training)。完成本课程后的课程目标,学生将能够:
拟议职位简介 项目工程师将负责设计、开发和优化高性能计算 (HPC) 系统,管理基于 Linux 的 HPC 集群,并集成 GPU 加速和量子计算模拟器等先进技术。该职位包括配置和管理 SLURM 等资源管理工具,通过分析和调试确保系统性能,以及维护 Lustre 或 GPFS 等并行文件系统。工程师还将参与软件开发,利用 C、C++、Fortran 和 Python 等编程语言,同时实施干净、优化代码的最佳实践。此外,候选人将探索量子计算原理、混合 HPC-量子集成,并支持容器化和虚拟化技术以增强系统功能。强大的问题解决能力、协作能力和适应能力对于成功担任这一充满活力和创新的角色至关重要。
缩写 解释 AI 人工智能 API 应用程序编程接口 ASIC 专用集成电路 CPU 中央处理单元 DDA 数据驱动算法 EC2 弹性计算云 FPGA 现场可编程门阵列 eduroam 教育漫游 FTP 文件传输协议 GPU 图形处理单元 HPC 高性能计算 HW 硬件 IaaS 基础设施即服务 LPDNN 低功耗深度神经网络 LSF 负载共享设施 ML 机器学习 NLP 自然语言处理 NNM 神经网络模型 NPU 神经处理单元 PaaS 平台即服务 POSIX 便携式操作系统接口 QoS 服务质量 SME 中小型企业 SoC 片上系统 SLURM 简单的 Linux 资源管理实用程序 SSD 固态硬盘 SSH 安全外壳协议 WebDAV 基于 Web 的分布式创作和版本控制 WP 工作包